Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Ddx6
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name DEAD-box helicase 6
Also known as RGD1564560
Coordinate chr8:48924768-48961394
Strand +
Gene summary Predicted to enable mRNA binding activity and protein domain specific binding activity. Involved in spermatid differentiation. Located in several cellular components, including chromatoid body; concave side of sperm head; and sperm flagellum. Orthologous to human DDX6 (DEAD-box helicase 6). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Ddx6

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Ddx6P1 chr8:24842879-24845651 - Intergenic
N/A UCSC
Ddx6P2 chr8:4139913-4144795 + Intergenic
N/A UCSC
Ddx6P3 chr13:5362791-5373471 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_006242950.2
GGGGCCGGGTGGGGGCGGGCGGAGGTTTCCGAGGAGGAAGGAGCCGCCGCCATTTTGGGAGCTTCGAGTCAACAATAAAGGACCGAGGATTGAAGTGAGTGAATTCAGATATAATTCAAGCTTGTTAGAGCGCTTTAAAAAAATACAAAGTTGATTCGTTGCTTGAGAGCAAGTTAACTACTGCTGCTTACCGGTGAGAGACTTACAGGTGCTTGCCTGAATTGCAATAAAGGACTCATATATTGAGCAAGACTTATTTATCTCTTCATTTTGGAGAGCCTCATAAACTGTTATTACAGTTTCTCTACTGACTTTGAAAAGTTTGAAAGAGACACCTGTGCAGCTAAGAAAGCATGAGCACGGCCAGGACAGAGAACCCTGTTATCATGGGTCTGTCCAGTCAGAACGGCCAGCTGAGGGGCCCTGTGAAGGCCAGTGCCGGCCCTGGAGGAGGGGGCCCACAGACACAGACACAGATGAACCAGTTGAAGAACACCAGCACAATCAATAATGGCACTCAGCAGCAAGCACAGAGCATGGCCGCCACCATTAAACCTGGTGATGACTGGAAAAAGACTTTAAAACTCCCTCCAAAGGATCTAAGAATTAAAACTTCGGATGTGACCTCCACAAAAGGAAATGAGTTTGAAGATTACTGTTTGAAACGAGAGTTGCTAATGGGAATTTTTGAAATGGGCTGGGAAAAACCATCTCCTATTCAGGAGGAGAGCATTCCCATTGCTTTATCTGGTAGGGATATCTTAGCTAGAGCAAAAAATGGAACAGGCAAAAGCGGTGCCTACCTCATCCCCTTACTTGAACGGCTGGACCTGAAGAAGGACAATATTCAAGCAATGGTGATTGTTCCCACTAGAGAACTTGCTCTACAGGTCAGTCAAATTTGCATCCAGGTCAGCAAACACATGGGAGGGGCCAAAGTGATGGCGACCACTGGAGGAACCAATTTACGGGATGACATAATGAGGCTTGACGATACAGTGCATGTGGTGATTGCTACCCCTGGCAGAATCCTGGATCTTATCAAGAAAGGAGTAGCAAAGGTTGATCATGTCCAGATGATAGTATTGGATGAGGCAGATAAGTTGTTGTCACAGGACTTTGTGCAGATAATGGAGGATATTATTCTCACACTACCTAAAAATAGGCAGATTTTACTATATTCCGCTACTTTCCCTCTTAGTGTACAAAAGTTTATGAATTCCCATCTGCAAAAACCCTACGAGATAAACCTGATGGAGGAGCTAACTCTGAAAGGGGTGACCCAGTACTACGCATATGTAACGGAGCGCCAAAAAGTGCACTGCCTCAATACACTCTTCTCCAGGCTTCAGATAAACCAGTCGATCATTTTCTGCAACTCTTCTCAGAGAGTTGAGTTACTGGCCAAGAAGATTTCTCAGCTGGGTTACTCTTGCTTCTATATCCATGCTAAAATGAGGCAGGAACATAGAAATCGTGTCTTTCATGATTTCCGAAATGGCTTATGCCGCAATCTTGTTTGCACTGATCTGTTTACCCGAGGTATTGATATACAAGCTGTGAATGTGGTAATAAACTTTGACTTCCCAAAGCTGGCAGAGACCTATCTTCATCGGATTGGAAGGTCAGGTCGCTTTGGTCATCTTGGCTTAGCCATCAACTTGATCACATATGATGATCGCTTCAACCTGAAGAGTATTGAGGAGCAGCTGGGGACAGAGATCAAACCCATCCCAAGCAACATTGACAAGAGCCTGTATGTGGCAGAATACCACAGTGAGCCTGCAGAAGATGAGAAACCTTAACAAGCACGCTTTGACAAACTACAGAAGGCTCCTTGGATCTGTGACGCATCATTTTTGGGGCGGGGGGTGCTCTTCTCCTTGTGGGTTTTTCATCTTTATTTTGGAACTATGAAGAGTTATATAAGAGCTCAGACATCTTTCTTTTTTTTAACTGGTGAAGAAAAACTGAAAAGAAGAAATGGACCTTTTTTGTTCCCTTGTTTGCACTGTGTGCTGACTGAACGTTTCGTTGCACTAACTGCTGGTTTTTAAAAATGTTTTCTggggaaaggggacaaggaaggaggaaaaagaaagggagaaaCCCTAAAAAGAGAAGAATCTTGGTGGACACGCACCTGTCTACAGTTCTCCGATAGCCGACTCTACTGCATTTCAACTTCTCCCTGGTTACTCATCCGTTTTTAAGCCTGAAGAGCTTACTACTTATTTGTGCAAAGTGCCTTACGCTACGAGACCATTAAGAATATCATCTTTTACCACAGCCCGAGGAATCAACAAAGTCACGTTCTAttttcttttcttttttatttctttgcctcttcatttggtttcAAGTTGAAGTCTTGCTTCCTGTTCTACCAGTACTCATGCCCAGGGCCGGAAGGTGGACTAGTGATGGTAGCGCCATTTTCCTTTTCTTTATATGGAGGAGTTGATTCACAACTGCAGTCCATCCACACTGTAAATACATGTATTTAAAAAAAAAAAACAATACCAAGTAAAATTTTCTTCTGGGCTGAGTAGACGCACCATCGTCGCTCCCAAAGGAAAGAGCAGCCTCTCACTGCAGGAGCCATATGACAAGCCTCTGTGCTCTACGGCGGAACACTAACCTGGCTCACACGCTTCCATGAGCAGTAAGGCACTGGGTGCAAAGACTTGTCGGAGCCTTGACCCTCTTTCCTCTGTGGCAAAGCGCGACCCATAGAAAATTGTATGTGTATACTTGTATAAACTTTGTAAATAAGTTTTTTTCTGGGTTCatatatatatatatataaatatatatatatacatacatatatatatTATTTTTTTTGGATGAAGGTTGCTGGGATTAAGGGATTAGAGTGATTATGGGAGCAGCTAAAGATGAGAGGGGCTCAGTTTTCTGCAACACTAAATTCTAAAAAGTGCTTTGGCCTCTAACTATAGGAAGTAGACCTCTGCAGGGCCTGTGTTGGAAAAGGGCCCAGAAGCCCAGGGCGCCTGTGCGCCACCACACTACTCTTGTAATGTGCATGCAGCGGTCTTAGCAGACAGCAAGGAAGCTTCAGAAGTCTGTGGTCCCTGAGGGCTTCGAGAAGCTCTGTGGTTTGGCTCTCCTGTCCTAAACGTTTGAGGAACTTCCCAAGTTCCTCAAAGGGGAACAAAGATTAATCTTCCTTGGAGTATGAGAAGTGTACGGAGTGCAGTCTTAGAGCAGAGAGTGTGAACATGGATTCGTACTTCACTGGACCAGCCAGTACAGCCTCAGCAGGCTTGGCGGTCGTGGAGCTTAGTTATCTGCGGTCACCTCCTGTAGTGTGTGAGTGAACGAAAGCCCTCTGCCCACCTTGACTTGTACATGTTTGCGGGAATGGGCGACCCCTGAGAGCTGTTAACTCCATGCTGCAGAAAGCTGCTTACCATTCTCGTGCCTGCCGCAGCAAGAATTGCTGTCTGTCCTTTCTTTCGCATTGTAAATTGCCGGCAGATGCTTTAGGTGGGTAGTGTTGCTTTAAATTGTGCCCCTCCCAACATGCTTGATGTTTGGCCTGATCTCCAGGCAAAAGGAGTGAGATGAATCAAAACCAGTGAACTTTTTTTTAAAAAAATGTTTTTAATTCCCTTTTAACCCAGTATACTAGGTCAGGAGGCATCTAGGGaacaaaaaaagcaaaaaacaaaatttaaaaaaaaaaCTGATTTTCATATTCCATCACTTTGAAAACCTTAAACCTATGACAAGGTATGTCACGTGTACGCTGCCATGCTTAACTCACCTGAATAAAGGAGTCCGCTATTCCAAGTTGCTTTTTGACTGTGCCTAGTTCTAAAGCAAAACTATTTGTGACCTGTCCCAAATTCCTTGGGGATCAAAATCCTAAAGATGCCTCCTTACCAGATATAACCCTGACTGTAACAGCTGTAGCAGGAGCTGCACGGTACAAAACCCCAAAAGGCAAGTCCAGTCAGTGTTGGTTACAAAACAGAAACCAAATTAAGGAAGTCACTTTTTTAGGGAGGGTGGGAATGGGGTCTTAAAAATTCTTTGACCAACAGATCTTGCCCTTGTACCGATGCAGTTCTCCTCCTTCCTGCCTTTGGCGAGATGAGAGGGATCTCCATGTAGATCAGCAGCAGGAACGGAGTATAAACAAACGTGCTAGCTCGCCAGAGGACATGTGGGTGAGTCAACAAGGTGCAGTCTCTTGCCAACCTTGGACTGCTCTGCTAGGTGCCACATGCCTATGAGTCCCTCTTAAAGCACAGACTCCACGTGGAGAGTATTCTCAAGTACAGCGTCTGCTGAGCTGTGGCACTTGGACTAGCTGAGCACCCCACTGTCTGGAGAGGCAGCAGTGGGGGTGGTGCTTAGCTCGCTTGAGCTGTTAATGGAAAGATGCCCTACTGACCAGGTCAGAACCTGGTTATCtttttttttttttttttttctttttttcctttttAATCCCTCTTAATAAGGAATATTGCTACTATTGGAAATTGTCTTTCAGGTTCTTTCCAGTAATTTTTAAAGTAATGGTTATGTTTTGTTTTTTCCCAGTAGTTCATTTGGATAAAAACTATGTCCTATTTTTAATATCCACCTCAATGCTTTTAGCCTCTGGTCATAAGCTGTGTAATGAGTCACAGACTGTTACACACCTTGCTGCCTCAGGGCCTGTTTTTTTTCTCTCCCTTAATGTTCTGAACATGAAAAAACTTTCTTAGAAATGGAATACATTTACCATAAAATGTTTTCCCTGAAAAGGAAAACCTAAGTAATTCTAAATTATTTCCAAATGGGTATCAGCATCATAACAATTGGTTGGCCCAAAATGGTGGGGTGGGGTGGGTGGTTGTCATAACTCGTTTTCAGAATGAGATGAGGGCATCTTTCCTTGGCCACCTGCTTTGTGGTTGGACACCATTGTGCTCAGTTAGAGCAGAGCACAGCACAAAGCTTTGAAAAGTGTTGGAAACAAA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>XM_006242954.2
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