Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CTDSPL2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr15) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name CTD small phosphatase like 2
Also known as HSPC058|HSPC129|SCP4
Coordinate chr15:44427329-44529038
Strand +
Gene summary Enables RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat phosphatase activity. Predicted to act upstream of or within negative regulation of BMP signaling pathway; positive regulation of protein export from nucleus; and protein dephosphorylation. Located in nucleoplasm. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from CTDSPL2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CTDSPL2P2 chrX:106072836-106073608 + Intergenic
ENSG00000230788 UCSC
CTDSPL2P1 chrX:100149204-100151535 - Intergenic
ENSG00000236988 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_016396.3
GCAGCAGGTCGGTAGGCGGGAAATGGCGACTGGCTGAAGGAGCTGGTTCTGTTGCTGCTGCGGGGTAAGCGGGAAAGACACCACACATTGCGCAGTCGGGACCATCGCCGGAGCCTGAGGACACTTCTCTGTCGTCACAGTTAGttttacATGTGGCACCCATAAAAGATGAGGCTGAGAACACGGAAAGCTTCTCAGCAGTCAAATCAAATCCAAACACAACGCACTGCCAGAGCAAAGAGGAAATATTCAGAGGTTGATGATAGCCTGCCTTCAGGAGGAGAAAAACCATCGAAGAATGAAACCGGCTTGTTGTCTTCAATTAAAAAATTTATTAAAGGAAGCACACCTAAGGAAGAGAGAGAAAATCCTTCAAAACGGAGTAGAATTGAACGTGATATAGATAACAATTTGATCACGTCAACACCAAGAGCAGGAGAAAAACCTAACAAACAGATATCTCGAGTAAGACGGAAAAGTCAAGTAAATGGAGAAGCTGGTAGTTATGAAATGACAAATCAACATGTAAAACAAAATGGAAAATTAGAAGATAATCCTTCCTCTGGCAGTCCTCCAAGGACTACTTTGTTGGGGACCATATTTTCACCTGTCTTCAACTTTTTTTCACCAGCAAATAAAAATGGAACGTCAGGATCAGATTCTCCAGGACAGGCTGTGGAAGCTGAAGAAATAGTAAAACAACTTGATATGGAACAGGTGGATGAGATCACTACCAGTACTACTACATCAACTAATGGAGCAGCTTACTCAAATCAAGCAGTTCAAGTGAGACCATCACTAAACAATGGTTTAGAAGAAGCAGAAGAAACAGTTAATCGTGATATCCCACCCCTTACAGCACCAGTAACTCCAGATAGTGGTTATTCATCAGCCCACGCGGAGGCCACCTATGAAGAAGACTGGGAAGTATTTGACCCCTATTATTTCATCAAACATGTCCCGCCACTGACAGAAGAACAACTAAATAGGAAACCTGCTCTTCCGTTGAAAACAAGAAGCACACCGGAATTCTCCCTAGTTTTAGACTTGGATGAAACACTAGTGCATTGTAGTCTAAATGAGCTAGAAGATGCAGCACTTACTTTTCCAGTCCTTTTCCAAGATGTCATTTATCAGGTTTATGTGAGATTAAGACCATTTTTCAGGGAATTCCTGGAACGAATGTCTCAGATGTATGAGATCATTCTTTTTACTGCTTCTAAGAAGGTGTATGCAGACAAGTTACTGAACATACTAGACCCTAAAAAGCAACTGGTCAGGCACCGGCTTTTCCGTGAACATTGTGTTTGTGTACAAGGAAACTATATAAAGGACTTAAATATTCTTGGAAGAGATCTTTCAAAAACTATAATAATTGACAACTCACCACAAGCCTTTGCATATCAGCTTTCTAATGGAATCCCTATAGAAAGTTGGTTTATGGATAAAAATGACAATGAACTCCTAAAATTGATTCCATTCCTGGAGAAGCTTGTAGAACTGAATGAAGATGTTCGACCACACATCAGAGACAGATTTCGCTTGCATGATTTGCTGCCCCCAGATTAAGTACAAAGACTTGTCAAATCACTGAAGGGGGAGAGAATGCAGGACCCTTTTGGACTAAGACAAAAACATTGCCATTACTGTTGAAATTTTGCATTTTTGTACCCCGTCTTGCTTTTCTTATCTTTGGTGCCCAATAATAATTAAGGGTTACAGAAAGAGACTTTATCTATCTCAGATCGAATACATATAGTAGGTAGGCTAAAACAGAAGAGTCTTTAGAACTAGTGCAACTCCAGTGAAATTTTTTATGTACAGGACATCTGCAGTTTATAAAGAATTCTGTTTCTGCCACCAGCAGTTTGACCTGTAGTCACACAGGATTTTATGATAATAACAGAGATGAAAATGGACTTTTATTTTCTCTCTGTTTGGTGCTCTAAGTGGGTTTGTAGCCACTTTTCTGTTACTTTATGATTCTCATTTCAACAGGAATGGCCAGTAAAAGTTGTTTTATTTTTCCTGTTAAGGTTTATAACCTTTTTACATTTTTGACCTGTATTAGATTAGAATTTCATTATGCATTCCTTTTAGTTGAGGCGCTTCATAGTTTTCTGGAGATAGTCAATTTTTAGTTTTTTATTATACATTTGAATGGCCGTTTTCCTGCTTTGTCTGCCTGCACATTGTATATTTGTTTAAAAATATTCTCTACTTTTAGTCTATGTAAGTTTCATTTAGAAAGACATGCATTTATATTTTGTTTCTGTAATATTCTACTGTAGGTGAAATCTTTTCAAAAATCAAGAGACTGGGTAGATAAGAATATATGAATGACTAATATACAAAAGATTTAAACCATTGTGATGGCGTATATTCTCAAATGGTAATATCTTGCAATGGCACACAGATTTAATGGATAAAGGTATACCTCAGACTTCACTGTGCTCACAAATCTTTGAGGAGAAAGTTTGGTCACCTGTTTGGCTTGATTTAGTTACTGCTGCCTTTGGTTTTCTCCAGGAATGAAGTATTCAGCACAGTGACTCAGTATTTTTAGTTATTTTGCATGGGCTGGTAGTACCTCTGTTATGCTCTCAGTTACAATCAATTTAAAACTGTATAACAGTCTTGGTACCTAACAGTAGCTATGCATAATCCTGTGGCACAGTACACTCCCAAGCCACCAATGCAGTTAATATGCTCTCATAGTGGTTTTTCTATGCTATATGAAAATAGTCTTCAAGCCTTGGTTCTCTAATGCAGCTACCACAAGAGGTTGATATTTTTATAGTGGCGTGTAATCTCCTTTTCGGGAGGCTTTTTATGGAAGGTAGAATTTGTAAAAGTTCGTATGCTTTGCCTCTCAACTGCATTAACATGCCACAGGCTCAGACTGTTTTTGTGTAAAGGATGTCAAAGAACGGCACTTTTTCTAAAGAGAAGTTTGATATTTTGTATGCTTGTTAAGAAAGTACAGTATTGGAAATTAAAGGTGGACAACTGATAATTGAGGAGTATGTCAATTAATTTTTTATGTATATTACCTGTTTACTTGTACAACTTACTGTACAAATTACATGCAGCTTCATTTTCAAATGAATCCTTAAAATAAGGAAATCTTTTTAGGAAAACATTTAATTTTTGTATTTTTGATTTTAAAGGCATGAGTTATGTCAATTTTCAGTGTATTAATGAAGATTTTAACTTTTCATCAGGTTGAGTGTTTTCTTACTATATTATCTGTTGTGTATGTAGTTAGCATATTGTGTCACTGAACTGTTTAAAAATCTAGCATGTAGAGCAAGCCTGTTTTGTGGAAAATCCTTATTCATTAAAAAAATAATCATGGCAGATTTTCTGCAAAAAAAAAACAAAAGCATTTGCAATTCAGAATACTGATTTTTTTAATTTTATTTAAAGAAAGGTATTTTGCTTGCAGGAAAAAAATACTACAGATTCATTTTAATGAGAATCTTTGAAATGTATTTATCTTTAGGGCATCTGGGCATCTTTATGCTGTTTGTCTTCTGTCTTTCTTGAAATAAAATGTACATACGTTACCTTTACATATGCTCTTGCTCAAAATTGTGAACCTAGTTACATTTCTCCCTGCTCCCTTCCTTTTTATGCTCAAACAGCGAAACCCAAAACTTAAAAGATCTGAACTTTCAGCATGCATTCTGATTGCTGAAAGATTTCCTGATTTAGTGCATTCTCAAAAGGGCTTTCCCATAATCTAAAGGGAAATGTAAGCACCTATACTCTTGTGCCTGTGGGCACTTCAATAATAAAAACCAACTTTTTAAACTAATCATCTTTTATCAATGATAAAGTTGTTTTCAGTCCCACACTAGGAGAGTTCCTTTAAGTCAGCTGATCAAGCATAAGATACTTCCGTAAAGAAATAAACTAAGAAAATTTTTTATGGCTTGAGAAAATTCCTTGAGGCCAAATTAATATATTTTTCTTTGTTATTTTATTTGAGTCATTTTAAATTTGTTAATACAAAATTTAAGATAATTTACAGAGACAATTTATCCAGCTTCCTTCTACCTTAATACAATGTTTTGTCTTCCCATTATCCTCTCTTTTCTTTATCTGTTGGTAGATGTAAAAAACTTCCATTTAGTTAATCGGAGGTGTGTATTTTTTAAATTGAAATGTGCCCAGCCCCTTCAGCTCACACAGGAAACATGAACTCTTAAAAAACTGACTAGTAAATGCAGGAGAGGTGGATACCTGATGAGACACAGCGAAAGTGACCTGTATACACATTACAACTCTGGAGTACATATTAAAGTCGTGCTATTTCCAGTGGTAAATGTCTGACTTTTAAGACATTCTTTTAAATATTTGTATCATTGTTAGGATGTTTTAATCAGTTGTTTTTTAATTCCATGTAATATATGTAGCCCTCATCAGATTTATATCACCATATTTCTCCTTGTGTCCTAAGAGAATTGATGACAATTCGTAACCATAAATTGTTTTATATTAGCTAGTATGTATATTTATTTTTACCCAATGGCTTTATCTGTTTCCCAAAATTTGTTTGGGATTTGTTGAAAGCATTGTGTAACTTCTATAAACGGCTATTTTCTTGTAACTGTCAGTGAAATGAATGTGTACATTGTTTTCTTGTATTTCTCTGGGTTGTTTTTTGTTTTTTTTTCCAAGGGTTAACATAGAATGTTTTTTTTAAAAAATTATCTTTGGCCAATGACTTTTTCATCTAGATCTTACTTTCATTCAACCTTCTAAAGAAGTTCGTTTCTCATTGTTTTGTTCTGTCAACTTGCCTGAAAAACAGAGACTTCATCTCATCAATGAAGAAAGCATTTCATTATTCCTACAGATCTTTCCTGCGAGCACAGAATTCTTCATAAGGACCAGATCTCTTCCATGTCTGTGTCAATCACATAAAGCTAAAATGTAAAGGACATTGAAGCCTTTATTTAATTGTACTAATATGATGGTGTTATATACTACAT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>XM_011521665.2
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