Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name VTA1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr6) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name vesicle trafficking 1
Also known as 6orf55|C6orf55|DRG-1|DRG1|HSPC228|LIP5|My012|SBP1
Coordinate chr6:142147263-142224685
Strand +
Gene summary C6ORF55 encodes a protein involved in trafficking of the multivesicular body, an endosomal compartment involved in sorting membrane proteins for degradation in lysosomes (Ward et al., 2005 [PubMed 15644320]).[supplied by OMIM, Mar 2008]

Retrocopy(s) from VTA1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
VTA1P2 chr8:87575814-87576470 - Intergenic
ENSG00000253401 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001286371.2
AGGAAGTGGTGAGTTCGGAGTAGAGATGGCCGCGCTTGCACCGCTGCCCCCGCTCCCCGCACAGTTCAAGAGCATACAGCATCATCTGAGGACGGCTCAGGAGCATGACAAGCGAGACCCTGTGGTGGCTTATTACTGTCGTTTATACGCAATGCAGACTGGAATGAAGATCGATAGTAAAACTCCTGAATGTCGCAAATTTTTATCAAAGTTAATGGATCAGTTAGAAGCTCTAAAGAAGCAGTTGGGTGATAATGAAGCTATTACTCAAGAAATAGTGGGCTGTGCCCATTTGGAGAATTATGCTTTGAAAATGTTTTTGTATGCAGACAATGAAGATCGTGCTGGACGATTTCACAAAAACATGATCAAGTCCTTCTATACTGCAAGTCTTTTGATAGATGTCATAACAGTATTTGGAGAACTCACTGATGAAAATGTGAAACACAGGAAGTATGCCAGATGGAAGGCAACATACATCCATAATTGTTTAAAGAATGGGGAGACTCCTCAAGCAGGCCCTGTTGGAATTGAAGAAGATAATGATATTGAAGAAAATGAAGATGCTGGAGCAGCCTCTCTGCCCACTCAGCCAACTCAGCCATCATCATCTTCAACTTATGACCCAAGCAACATGCCATCAGGCAACTATACTGGAATACAGATTCCTCCGGGTGCACACGCTCCAGCTAATACACCAGCAGAAGTGCCTCACAGCACAGGGGATGTTCGTCTAACCCCAGAAGACTTTGCTAGAGCTCAGAAGTACTGCAAATATGCTGGCAGTGCTTTGCAGTATGAAGATGTAAGCACTGCTGTCCAGAATCTACAAAAGGCTCTCAAGTTACTGACGACAGGCAGAGAATGAAGCCTTTGTATGACAGACCCATGTATTTTTGGCATGAGGAACTAACAGTCCATTACTCTATCTTCAGCCTATCAGGATCACAGTTTTAAGGAAGACTTGGTTTTGTTGAATATGACAATGAAATCTGTGTGTATCAGATTTTTATTGAAGCATTCATCAGCAGCCTCAACCAGTTTTCATTGTCCATTTACTAGATTCAATCGTCTCTGAGTATATAGGGCTGATGTTAGCAAGACCCTAAAAATGTCCATTGAACCCTGCTTCAAAAAATGAAAACACACCTCTATAAAATGTGTACTGGGAATAAGCTTTGTATTTACATACATTAGGGGAATTTTTTAAAATCTGTAATGTTTGGACAAACAGATGATATTACTTTGCTATAAAATTATAAATGTAACTTTTAATAAAGATAGCCAGAATATTCTAAATTAGAAATTACGTTTTTGTTTCCCTCAAGACATAAAACAAATATAAACATTCTAAACTGCTGGATGAATCTGAAAAGACATTAAGTTCAAATTTTAATTTATTCTCATATTAAATATAACTCCATTAAAAGTTTAAAATTTCATGGGAGAAAATATAATAAGGTAAAGAGGTAGAATCACTTTCAGACTTAAGAATAATGTTGATTTCCCAAGTGCTTTACCTTATCTGTTAAAGCGTAAGATGAATTGGTATTTGCTTCATAGGCAGTTTGACTGCATGTATTAGAGAATGAAAAGAAGATATTTGTAGTAATGCCTGGAAACTTGGTGCTTTAAATTAAGGTACTCCTCTGCTGCTGTAGAATGGATTCCACACAGTGGATAGCTATGGGTGATTCAGAATATTATGTTTAGATTCCCATTTGTTAAGTTTATAAGTTTTGTGGGGAATTATGAACTTACTGTGTACTACCTGCATTTGTGCTGTGTGAAAAATAAATACAAGGATTCGTTTAGCTAATTCAACTTACTACAAAGACAAATGTCTGTTTTTATTTGCCTGCTAGGATTGTCTTTTTTAAAAGTCATTTTTATTTATAGGAATATGGGTGTTTCTATAGGAAGAAACAGGTTTTTTGTTTTTTGTTTTTTAAGATAAATTTGACAAAGTTAACTGAAATTTATCTGGTCCATTTTATTCATGCTACTAAGATGGGAATCTTTAAACAcaagggtcagcaagctttggcccatggattggccacctgttacgtaaataaagtttctttgaaacaagcctacactcattcatttatgttttgtctgtggttgctttccacaactgcagagttgtatggcttgcaagtctaaaaacatttactatttggccctctaagaaaaagttAAGACACCTAGTCTAATGGCCTTTTGGGAAAAAACAAATCACTAACTCATAATCATTTATATCCATTATTTTCTGCATAAATGTAATGCTATTGTACAGGGTTTGGTAGAATAAATATTCAGACTGACTAAACTGTTCTAAATCCTCACAAAAAAGTCCCCAAACAACATGCCTCCTAAAAAACATTTTCCTATCTTTTACAAGAGGTATGAACATTTGTAGGGTTCCACATTTGCATCTAGAAATCCAATGCTCTTTAGAATGTTATTACGAATAGAAAGATGGCCAGGATGACCTTTAGTGTTACATGATGTTCAGCAAATTTTAATTCAAACCTTGATATGCCTGGACACTGAAAAGTAAACGCATCACCTCCTATTTTATACCCTACCTTCTGGTTCCCAATTGGGAGAGCACATAGAGGGAAGGAGACAATATAGAAACTACGGAGTCCGCTGGTAGTGGGCTGCATGGTGTGACAGAGCccttctctgtaaaatggaaatgacaccactagccatctcaatagttacaagaattaaaagagatacagtacctgaagtgcttagcgcatggtagcatttcataaatgtttagtgtcaatactaatgctctaataATGTAAATTGTTAATAATTTATTTCCCTAATATCAGGAAATCCCAGTTGTCTATGTGGCCCAGTGCTTAAAAACGCCTTCTTGCATGAGGGGATTGAACTATACAATGTTTGTTAACTTTGTATTTGTATTTTTTCCTATAAAATCTTAAAATAAAATTAGGAGATGTGTTCTGATGTAACAGTAGGATTAGCAATTTTCatttattccttccatatatatttactgaatggctactatatgcctggtattgttctttgaaagcagaaacagcaggaaaaaaagtccctccctcatagagtttacattctaaaagggaggaaatagataataaaATATACATTACATTTAATCAGTGGCTCTCCGAGTGTGAttagaaatacaaattttgggccccacctgtcctacccaatcagaaactctagggatgggtcccagccttctgagttttaagagacacttaaggtggtccctaaagttcgagTGGTTTAGCTCTACCCAAATCAGAAATATTGCAAGTCTGAGAAAAGAGATTCTCCTCAAACCggttctcaaaggtgtctctggacgaccggcatcagcatcacctgcgaacttgctagaaagttctggggaccACACTATGGGAACTTCtgtattaaatagtgataaatgctatggaggaaacattgaggacaggataggagatgcttaggtgtgtacagacatatgcatatttcaatagaatagccaggatagacctccctgaggtaacatttgagcaaagaaggaaaagagtaactagtatgcagatacatacatggaggaagagcattcccaacaggtagacagaaatcaggtcagagggtaaaagcaggagaaaggctggtgagggagctaaaagcttaggatcataaagcttttttgtaagacacttgactgggagctatatggaaaggttttcagaagaaacgtagcctgatgtgacttaacttttgaaataatcatattggctcctatgttgagaatagaccgtaaggtgggtggtaagtaagggaggaagctgggagaccagttaaaaagagtattaacaataggccgggggcggtggttcgcacctgcaatcccagcactttgggagccaaggcaggcggatcatctgaggtcaggagtatatatttattaatatataaatatgtatttatatataaatcataaatatattaataaatatataatatatatattagcctggcatggtggcacatacctctaatctcagctactgaagaggctgaggcaggagaatcgcttgaacccaggaggcggaggttgcagtgagccgagatcgtgccactgcactccagcctgggcgacagagcgagactccttctcaaaaaaaaaaaaagtattacaataatcaaggtgagatattatgatgtcttagtccaggagtagccttggaggtaataaaacgggattggtttctggcggcttttttttaggtagagccacaggatttctgtaaactggatgtgaggtacgaacataagagaaggagtaaaggttgactccagatttttcacctgaatgcctgaaaggaatgagtaatcatgtactgcagtagggaaagttgCCGAATTCCTCTCTCACTTAGACTGAAGTACAATGTTTCCAAGTTTTTGTGACCAGCCCAAGTGAAACTGATAACGGTGTTTTGTCAATGCGGCAGAGGGAGAAGAAGAAATAAGGTTCTGCTGACAATGATTGCCACAGATATCTCACCAAATCACTGCTGAACTGGAGCTGCAAGCCAAGAATAGTTCCCATGGTTAGCATGGCCTAGGAAGTTTACTGACATCAGGACTACACCAAGAAAAAGACTCCAGTTATGGGTCTTGAAAATTAATATCCTCAGATGTTTTTAGAATTTATATATGACTTGTAATTCTAGAAATTTGAGAATTCTATGTATGCATTGAAAGATTATATACTGTCTTTTCTAAAGAAACACCCTAATAGCAGCATTGTACAAATATTTTCAACTCTAAAAGAATAATAGCTAATGGAGTTGATGGGTTTTGGTTTTCATATGAGAAGTATCCTTCCCTGGTTGGTTGTAATCTTTGAAGTCTATGTGGAATTCTAAGACTGCAGGCTTGTTCATTGGAGTACACTTAAGTAGGACAAATTCTAAGTA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