Gene Name | DPPA4 |
|
Specie | Homo sapiens | |
Full Name | developmental pluripotency associated 4 | |
Also known as | 2410091M23Rik | |
Coordinate | chr3:109326141-109339635 | |
Strand | - | |
Gene summary | This gene encodes a nuclear factor that is involved in the maintenance of pluripotency in stem cells and essential for embryogenesis. The encoded protein has a scaffold-attachment factor A/B, acinus and PIAS (SAP) domain that binds DNA and is thought to modify chromatin. Mice with a homozygous knockout of the orthologous gene die during late embryonic development or within hours after birth. Knockout embryos are normal in size at embryonic day 18.5 but exhibit skeletal and lung tissue abnormalities. This gene, when mutated, is highly expressed in embryonal carcinomas, pluripotent germ cell tumors, and other cancers and is thought to play an important role in tumor progression. Multiple pseudogenes of this gene have been identified. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Feb 2017] |
Retroname | Coord | Strand | Genomic Region | ENSG | |
---|---|---|---|---|---|
DPPA4P4 | chr11:73989840-73991839 | - |
Intergenic |
ENSG00000256189 | UCSC |
DPPA4P5 | chr13:31223765-31223925 | + |
Intragenic |
N/A | UCSC |
DPPA4P1 | chr3:66326247-66327084 | + |
Intragenic |
N/A | UCSC |
DPPA4P2 | chr3:134510488-134511250 | - |
Intragenic |
ENSG00000249691 | UCSC |
DPPA4P3 | chr4:10184805-10185029 | - |
Intergenic |
N/A | UCSC |
>NM_001348928.2 |
ATGTTGCGAGGCTCCGCTTCTTCTACAAGTATGGAGAAGGCAAAAGGCAAGGAGGAACATCAGCAAAGAGAACCAAAGAAAAAATGTCTATCAAAGGCAGTAAAGTGCTCTGCCCTAAGAAAAAGGCAGAGCACACTGACAACCCCAGACCTCAGAAGAAGATACCAATCCCTCCATTACCTTCTAAACTGCCACCTGTTAATCTGATTCACCGGGACATTCTGCGGGCCTGGTGCCAACAATTGAAGCTGAGCTCCAAAGGCCAGAAATTGGATGCATATAAGCGCCTGTGTGCCTTTGCCTACCCAAATCAAAAGGATTTTCCTAGCACAGCAAAAGAGGCCAAAATCCGGAAATCATTGCAAAAAAAATTAAAGGTGGAAAAGGGGGAAACGTCCCTGCAAAGTTCTGAGACACATCCTCCTGAAGTGGCTCTTCCTCCTGTGGGGGAGCCGCCTGCCCTGGAAAATTCCACTGCTCTCCTTGAGGGAGTTAATACAGTTGTGGTGACAACTTCTGCCCCAGAGGCTTTGCTGGCCTCCTGGGCGAGAATTTCAGCCAGGGCGAGGACACCAGAGGCAGTGGAATCTCCACAAGAGGCCTCTGGTGTCAGGTGGTGTGTGGTCCATGGGAAAAGTCTCCCTGCAGACACAGATGGTTGGGTTCACCTGCAGTTTCATGCTGGTCAAGCCTGGGTTCCAGAAAAGCAAGAAGGGAGAGTGAGTGCACTCTTCTTGCTTCCTGCCTCCAATTTTCCACCCCCGCACCTTGAAGACAATATGTTGTGCCCCAAATGTGTTCACAGGAACAAGGTCTTAATAAAAAGCCTCCAATGGGAATAGAATATCAGGAAAAAGGCCACATCTATGGTAATTAATGGCAGAAAAGCTGGAGAGTTGGATTCTGCGGTGCTGCTGACAGGTGAACTCTGGTCCTCTGCACCTGTTTATGGGCCATGCAGACTGGTGGGGTGGCAGATGTTAGCCTAAGACCCCTAGCAGTGCCTGTTGCTTTGTGAGTGGAGATAGAGACTCTTACATTTAAAAATGGAAAAACATTTCACAAATTACCATAAATTGTAGTTAATATGTAGAAAAACTCATTCATACTACTTTTCTAAAATAGACATGACTTCAGCAGCAGCttttttttgttgtattttgagacagtgtctcactgttgcccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagttcagtgcaatctccgcctcctgggttcaaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggtacaggcacctgccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggttggtctcaaactcctggactcaagtgatcaccctcctcagcctcccaaaatgctgggactatgggcatgagcccctgcgcctgaccTTCAACAGCTCTTTTAAGTGAGTTCTTCAGCTAAGCATTGTGATGGACTTGAGTAAAATGGTAGTTGGCTCTTGTGCTCAATTTTCTCTTCCTCTGAACACTGACTACTTTAGGAGCTGCTTCATTCCAATTGCAATTTCATAAAACGTAAAGTATTTTAAGGCAAAGAAAGGCTGTTAATTCCCTCCCTCCCCCAAACACATGATTTTTAATATTCTAAACAATATTTTTCAAAGTTCTCTTAATAACCTGAGATTTCTATGGTTTGACTCCAGGATCAAAACACAAGGGACTTTGTATTATTTCACTTATAATTGTTTTGTATATTTCTGGAGTTTAAAATGTTTAAGGTTGCTTCCCGCTCATAAATACATAATATATTGAATTTAAAATGTGTTTATTAACCGATTCTCCATAAATAAAAATAAGATGTGTATGTAAAATAATTCATCTGTTGTATTTAGAGAACCATATTCATTGCATGCAAATTTTATTGTTAGTGTTCTTAACTCAAGTAGGAGTAAACCAAAAAGTGTGATTTTTCTTTTGTATGACTCGTTTGTTCTTTATTAGTTGGTGGTATGGGTTGGATCATTTGtttttaaaactacttaggtatgattcacatacaaaaagctgcacatatttaatgtatcctattGTGTAATTAATTTTTAATTTTTTTGTGTACTTCCTAAACTTATAGTCCTGCGAGTCTGGGAACAGATCTGTTTTTCACTTATCCTGATTTAATGACAGTTTCCAACATTGTTTTGTTATTACAAGTAGGGGATCTTTTTTTTTGCCCGTTTAATGAAGATACTAAAAATAATGCACtggaaggagtggaagagttggaaaatttgtaaccatcataatacaggtgtaataggtttgggaaagaatcctcaaaaatgttaaagcaagggaggaaagtttgttgagaagcaagatgttCTTCTCTCCTGCCCGCCCCCGCCGTTGGTTGTTGGTGGTCAGAATTATTGTGTAATAAATAATAGAcattttttcttatactatgtgtattgttccttttgtttcctttttaaacttctcccctgctttatttggatgggtcaagtttctgttctgtttccttcctttctattaatttggaaatgtccttggctttacgattctgcttgtagatacttcccctgcttctaacacatttcaataaacttaaatttctctatatacaaaataaattaataattggagtcta |
>NM_001348929.1 |
AAGTGGGAGGAGACTTTGCAAATAGCAATCTTGGGGCAGGGGCCATTTTGGAAGCATGTTGCGAGGCTCCGCTTCTTCTACAAGTATGGAGAAGGCAAAAGGCAAGGAGTGGACCTCCACAGAGAAGTCGAGGGAAGAGGATCAGCAGGCTTCTAATCAACCAAATTCAATTGCTTTGCCAGGAACATCAGCAAAGAGAACCAAAGAAAAAATGTCTATCAAAGGCAGTAAAGTGCTCTGCCCTAAGAAAAAGGCAGAGCACACTGACAACCCCAGACCTCAGAAGAAGATACCAATCCCTCCATTACCTTCTAAACTGCCACCTGTTAATCTGATTCACCGGGACATTCTGCGGGCCTGGTGCCAACAATTGAAGCTGAGCTCCAAAGGCCAGAAATTGGATGCATATAAGCGCCTGTGTGCCTTTGCCTACCCAAATCAAAAGGTGGTGTGTGGTCCATGGGAAAAGTCTCCCTGCAGACACAGATGGTTGGGTTCACCTGCAGTTTCATGCTGGTCAAGCCTGGGTTCCAGAAAAGCAAGAAGGGAGAGTGAGTGCACTCTTCTTGCTTCCTGCCTCCAATTTTCCACCCCCGCACCTTGAAGACAATATGTTGTGCCCCAAATGTGTTCACAGGAACAAGGTCTTAATAAAAAGCCTCCAATGGGAATAGAATATCAGGAAAAAGGCCACATCTATGGTAATTAATGGCAGAAAAGCTGGAGAGTTGGATTCTGCGGTGCTGCTGACAGGTGAACTCTGGTCCTCTGCACCTGTTTATGGGCCATGCAGACTGGTGGGGTGGCAGATGTTAGCCTAAGACCCCTAGCAGTGCCTGTTGCTTTGTGAGTGGAGATAGAGACTCTTACATTTAAAAATGGAAAAACATTTCACAAATTACCATAAATTGTAGTTAATATGTAGAAAAACTCATTCATACTACTTTTCTAAAATAGACATGACTTCAGCAGCAGCttttttttgttgtattttgagacagtgtctcactgttgcccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagttcagtgcaatctccgcctcctgggttcaaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggtacaggcacctgccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggttggtctcaaactcctggactcaagtgatcaccctcctcagcctcccaaaatgctgggactatgggcatgagcccctgcgcctgaccTTCAACAGCTCTTTTAAGTGAGTTCTTCAGCTAAGCATTGTGATGGACTTGAGTAAAATGGTAGTTGGCTCTTGTGCTCAATTTTCTCTTCCTCTGAACACTGACTACTTTAGGAGCTGCTTCATTCCAATTGCAATTTCATAAAACGTAAAGTATTTTAAGGCAAAGAAAGGCTGTTAATTCCCTCCCTCCCCCAAACACATGATTTTTAATATTCTAAACAATATTTTTCAAAGTTCTCTTAATAACCTGAGATTTCTATGGTTTGACTCCAGGATCAAAACACAAGGGACTTTGTATTATTTCACTTATAATTGTTTTGTATATTTCTGGAGTTTAAAATGTTTAAGGTTGCTTCCCGCTCATAAATACATAATATATTGAATTTAAAATGTGTTTATTAACCGATTCTCCATAAATAAAAATAAGATGTGTATGTAAAATAATTCATCTGTTGTATTTAGAGAACCATATTCATTGCATGCAAATTTTATTGTTAGTGTTCTTAACTCAAGTAGGAGTAAACCAAAAAGTGTGATTTTTCTTTTGTATGACTCGTTTGTTCTTTATTAGTTGGTGGTATGGGTTGGATCATTTGtttttaaaactacttaggtatgattcacatacaaaaagctgcacatatttaatgtatcctattGTGTAATTAATTTTTAATTTTTTTGTGTACTTCCTAAACTTATAGTCCTGCGAGTCTGGGAACAGATCTGTTTTTCACTTATCCTGATTTAATGACAGTTTCCAACATTGTTTTGTTATTACAAGTAGGGGATCTTTTTTTTTGCCCGTTTAATGAAGATACTAAAAATAATGCACtggaaggagtggaagagttggaaaatttgtaaccatcataatacaggtgtaataggtttgggaaagaatcctcaaaaatgttaaagcaagggaggaaagtttgttgagaagcaagatgttCTTCTCTCCTGCCCGCCCCCGCCGTTGGTTGTTGGTGGTCAGAATTATTGTGTAATAAATAATAGAcattttttcttatactatgtgtattgttccttttgtttcctttttaaacttctcccctgctttatttggatgggtcaagtttctgttctgtttccttcctttctattaatttggaaatgtccttggctttacgattctgcttgtagatacttcccctgcttctaacacatttcaataaacttaaatttctctatatacaaaataaattaataattggagtctacca |
>NM_018189.3 |
AAGTGGGAGGAGACTTTGCAAATAGCAATCTTGGGGCAGGGGCCATTTTGGAAGCATGTTGCGAGGCTCCGCTTCTTCTACAAGTATGGAGAAGGCAAAAGGCAAGGAGTGGACCTCCACAGAGAAGTCGAGGGAAGAGGATCAGCAGGCTTCTAATCAACCAAATTCAATTGCTTTGCCAGGAACATCAGCAAAGAGAACCAAAGAAAAAATGTCTATCAAAGGCAGTAAAGTGCTCTGCCCTAAGAAAAAGGCAGAGCACACTGACAACCCCAGACCTCAGAAGAAGATACCAATCCCTCCATTACCTTCTAAACTGCCACCTGTTAATCTGATTCACCGGGACATTCTGCGGGCCTGGTGCCAACAATTGAAGCTGAGCTCCAAAGGCCAGAAATTGGATGCATATAAGCGCCTGTGTGCCTTTGCCTACCCAAATCAAAAGGATTTTCCTAGCACAGCAAAAGAGGCCAAAATCCGGAAATCATTGCAAAAAAAATTAAAGGTGGAAAAGGGGGAAACGTCCCTGCAAAGTTCTGAGACACATCCTCCTGAAGTGGCTCTTCCTCCTGTGGGGGAGCCGCCTGCCCTGGAAAATTCCACTGCTCTCCTTGAGGGAGTTAATACAGTTGTGGTGACAACTTCTGCCCCAGAGGCTTTGCTGGCCTCCTGGGCGAGAATTTCAGCCAGGGCGAGGACACCAGAGGCAGTGGAATCTCCACAAGAGGCCTCTGGTGTCAGGTGGTGTGTGGTCCATGGGAAAAGTCTCCCTGCAGACACAGATGGTTGGGTTCACCTGCAGTTTCATGCTGGTCAAGCCTGGGTTCCAGAAAAGCAAGAAGGGAGAGTGAGTGCACTCTTCTTGCTTCCTGCCTCCAATTTTCCACCCCCGCACCTTGAAGACAATATGTTGTGCCCCAAATGTGTTCACAGGAACAAGGTCTTAATAAAAAGCCTCCAATGGGAATAGAATATCAGGAAAAAGGCCACATCTATGGTAATTAATGGCAGAAAAGCTGGAGAGTTGGATTCTGCGGTGCTGCTGACAGGTGAACTCTGGTCCTCTGCACCTGTTTATGGGCCATGCAGACTGGTGGGGTGGCAGATGTTAGCCTAAGACCCCTAGCAGTGCCTGTTGCTTTGTGAGTGGAGATAGAGACTCTTACATTTAAAAATGGAAAAACATTTCACAAATTACCATAAATTGTAGTTAATATGTAGAAAAACTCATTCATACTACTTTTCTAAAATAGACATGACTTCAGCAGCAGCttttttttgttgtattttgagacagtgtctcactgttgcccaggctggagtgcagtggtgcaatctcagttcagtgcaatctccgcctcctgggttcaaatgattctcctgcctcagcctcctgagtagctaggtacaggcacctgccaccacacccagctaattttttgtatttttagtagagatggggtttcaccatgttggccaggttggtctcaaactcctggactcaagtgatcaccctcctcagcctcccaaaatgctgggactatgggcatgagcccctgcgcctgaccTTCAACAGCTCTTTTAAGTGAGTTCTTCAGCTAAGCATTGTGATGGACTTGAGTAAAATGGTAGTTGGCTCTTGTGCTCAATTTTCTCTTCCTCTGAACACTGACTACTTTAGGAGCTGCTTCATTCCAATTGCAATTTCATAAAACGTAAAGTATTTTAAGGCAAAGAAAGGCTGTTAATTCCCTCCCTCCCCCAAACACATGATTTTTAATATTCTAAACAATATTTTTCAAAGTTCTCTTAATAACCTGAGATTTCTATGGTTTGACTCCAGGATCAAAACACAAGGGACTTTGTATTATTTCACTTATAATTGTTTTGTATATTTCTGGAGTTTAAAATGTTTAAGGTTGCTTCCCGCTCATAAATACATAATATATTGAATTTAAAATGTGTTTATTAACCGATTCTCCATAAATAAAAATAAGATGTGTATGTAAAATAATTCATCTGTTGTATTTAGAGAACCATATTCATTGCATGCAAATTTTATTGTTAGTGTTCTTAACTCAAGTAGGAGTAAACCAAAAAGTGTGATTTTTCTTTTGTATGACTCGTTTGTTCTTTATTAGTTGGTGGTATGGGTTGGATCATTTGtttttaaaactacttaggtatgattcacatacaaaaagctgcacatatttaatgtatcctattGTGTAATTAATTTTTAATTTTTTTGTGTACTTCCTAAACTTATAGTCCTGCGAGTCTGGGAACAGATCTGTTTTTCACTTATCCTGATTTAATGACAGTTTCCAACATTGTTTTGTTATTACAAGTAGGGGATCTTTTTTTTTGCCCGTTTAATGAAGATACTAAAAATAATGCACtggaaggagtggaagagttggaaaatttgtaaccatcataatacaggtgtaataggtttgggaaagaatcctcaaaaatgttaaagcaagggaggaaagtttgttgagaagcaagatgttCTTCTCTCCTGCCCGCCCCCGCCGTTGGTTGTTGGTGGTCAGAATTATTGTGTAATAAATAATAGAcattttttcttatactatgtgtattgttccttttgtttcctttttaaacttctcccctgctttatttggatgggtcaagtttctgttctgtttccttcctttctattaatttggaaatgtccttggctttacgattctgcttgtagatacttcccctgcttctaacacatttcaataaacttaaatttctctatatacaaaataaattaataattggagtctacca |