Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name AGPAT5
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase 5
Also known as 1AGPAT5|LPAATE|LPLAT5
Coordinate chr8:6708587-6761503
Strand +
Gene summary This gene encodes a member of the 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase family. This integral membrane protein converts lysophosphatidic acid to phosphatidic acid, the second step in de novo phospholipid biosynthesis. A pseudogene of this gene is present on the Y chromosome. [provided by RefSeq, Aug 2014]

Retrocopy(s) from AGPAT5

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
AGPAT5P1 chrY:3293887-3294485 + Intergenic
ENSG00000234652 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_018361.5_2
GGAGCTCGCTGCCGCCGAGCTGAGAAGATGCTGCTGTCCCTGGTGCTCCACACGTACTCCATGCGCTACCTGCTGCCCAGCGTCGTGCTCCTGGGCACGGCGCCCACCTACGTGTTGGCCTGGGGGGTCTGGCGGCTGCTCTCCGCCTTCCTGCCCGCCCGCTTCTACCAAGCGCTGGACGACCGGCTCTACTGCGTCTACCAGAGCATGGTGCTCTTCTTCTTCGAGAATTACAccggggtccagATATTGCTATATGGAGATTTGCCAAAAAATAAAGAAAATATAATATATTTAGCAAATCATCAAAGCACAGTTGACTGGATTGTTGCTGACATCTTGGCCATCAGGCAGAATGCGCTAGGACATGTGCGCTACGTGCTGAAAGAAGGGTTAAAATGGCTGCCATTGTATGGGTGTTACTTTGCTCAGCATGGAGGAATCTATGTAAAGCGCAGTGCCAAATTTAACGAGAAAGAGATGCGAAACAAGTTGCAGAGCTACGTGGACGCAGGAACTCCAATGTATCTTGTGATTTTTCCAGAAGGTACAAGGTATAATCCAGAGCAAACAAAAGTCCTTTCAGCTAGTCAGGCATTTGCTGCCCAACGTGGCCTTGCAGTATTAAAACATGTGCTAACACCACGAATAAAGGCAACTCACGTTGCTTTTGATTGCATGAAGAATTATTTAGATGCAATTTATGATGTTACGGTGGTTTATGAAGGGAAAGACGATGGAGGGCAGCGAAGAGAGTCACCGACCATGACGGAATTTCTCTGCAAAGAATGTCCAAAAATTCATATTCACATTGATCGTATCGACAAAAAAGATGTCCCAGAAGAACAAGAACATATGAGAAGATGGCTGCATGAACGTTTCGAAATCAAAGATAAGATGCTTATAGAATTTTATGAGTCACCAGATCCAGAAAGAAGAAAAAGATTTCCTGGGAAAAGTGTTAATTCCAAATTAAGTATCAAGAAGACTTTACCATCAATGTTGATCTTAAGTGGTTTGACTGCAGGCATGCTTATGACCGATGCTGGAAGGAAGCTGTATGTGAACACCTGGATATATGGAACCCTACTTGGCTGCCTGTGGGTTACTATTAAAGCATAGACAAGTAGCTGTCTCCAGACAGTGGGATGTGCTACATTGTCTATTTTTGGCGGCTGCACATGACATCAAATTGTTTCCTGAATTTATTAAGGAGTGTAAATAAAGCCTTGTTGATTGAAGATTGGATAATAGAATTTGTGACGAAAGCTGATATGCAATGGTCTTGGGCAAACATACCTGGTTGTACAACTTTAGCATCGGGGCTGCTGGAAGGGTAAAAGCTAAATGGAGTTTCTCCTGCTCTGTCCATTTCCTATGAACTAATGACAACTTGAGAAGGCTGGGAGGATTGTGTATTTTGCAAGTCAGATGGCTGCATTTTTGAGCATTAATTTGCAGCGTATTTCACTTTTTCTGTTATTTTCAATTTATTACAACTTGACAGCTCCAAGCTCTTATTACTAAAGTATTTAGTATCTTGCAGCTAGTTAATATTTCATCTTTTGCTTATTTCTACAAGTCAGTGAAATAAATTGTATTTAGGAAGTGTCAGGATGTTCAAAGGAAAGGGTAAAAAGTGTTCATGGGGAAAAAGCTCTGTTTAGCACATGATTTTATTGTATTGCGTTATTAGCTGATTTTACTCATTTTATATTTGCAAAATAAATTTCTAATATTTATTGAAATTGCTTAATTTGCACACCCTGTACACACAGAAAATGGTATAAAATATGAGAACGAAGTTTAAAATTGTGACTCTGATTCATTATAGCAGAACTTTAAATTTCCCAGCTTTTTGAAGATTTAAGCTACACTATTAGTACTTCCCTTTGTCTGTGCCATAAGTGCTTGAAAACGTTAAGGTTTTCTGTTTTGTTTTGTTTTTTTAATATCAAAAGAGTCGGTGTGAACCTTGGTTGGACCCCAAGTTCACAAGATTTTTAAGGTGATGAGAGCCTGCAGACATTCTGCCTAGATTTACTAGCGTGTGCCTTTTGCCTGCTTCTCTTTGATTTCACAGAATATTCATTCAGAAGTCGCGTTTCTGTAGTGTGGTGGATTCCCACTGGGCTCTGGTCCTTCCCTTGGATCCCGTCAGTGGTGCTGCTCAGCGGCTTGCACGCAGACTTGCTAGGAAGAAATGCAGAGCCAGCCTGTGCTGCCCACTTTCAGAGTTGAACTCTTTAAGCCCTTGTGAGTGGGCTTCACCAGCTACTGCAGAGGCATTTTGCATTTGTCTGTGTCAAGAAGTTCACCTTCTCAAGCCAGTGAAATACAGACTTAATTTGTCATGACTGAACGAATTTGTTTATTTCCCATTAGGTTTAGTGGAGCTACACATTAATATGTATCGCCTTAGAGCAAGAGCTGTGTTCCAGGAACCAGATCACGATTTTTAGCCATGGAACAATATATCCCATGGGAGAAGACCTTTCAGTGTGAACTGTTCTATTTTTGTGTTATAATTTAAACTTCGATTTCCTCATAGTCCTTTAAGTTGACATTTCTGCTTACTGCTACTGGATTTTTGCTGCAGAAATATATCAGTGGCCCACATTAAACATACCAGTTGGATCATGATAAGCAAAATGAAAGAAATAATGATTAAGGGAAAATTAAGTGACTGTGTTACACTGCTTCTCCCATGCCAGAGAATAAACTCTTTCAAGCATCATCTTTGAAGAGTCGTGTGGTGTGAATTGGTTTGTGTACATTAGAATGTATGCACACATCCATGGACACTCAGGATATAGTTGGCCTAATAATCGGGGCATGGGTAAAACTTATGAAAATTTCCTCATGCTGAATTGTAATTTTCTCTTACCTGTAAAGTAAAATTTAGATCAATTCCATGTCTTTGTTAAGTACAGGGATTTAATATATTTTGAATATAATGGGTATGTTCTAAATTTGAACTTTGAGAGGCAATACTGTTGGAATTATGTGGATTCTAACTCATTTTAACAAGGTAGCCTGACCTGCATAAGATCACTTGAATGTTAGGTTTCATAGAACTATACTAATCTTCTCACAAAAGGTCTATAAAATACAGTCGTTGAAAAAAATTTTGTATCAAAATGTTTGGAAAATTAGAAGCTTCTCCTTAACCTGTATTGATACTGACTTGAATTATTTTCTAAAATTAAGAGCCGTATACCTACCTGTAAGTCTTTTCACATATCATTTAAACTTTTGTTTGTATTATTACTGATTTACAGCTTAGTTATTAATTTTTCTTTATAAGAATGCCGTCGATGTGCATGCTTTTATGTTTTTCAGAAAAGGGTGTGTTTGGATGAAAGTAAAAAAAAAAATAAAATCTTTCACTGTCTCTAATGGCTGTGCTGTTTAACATTTTTTGACCCTAAAATTCACCAACAGTCTCCCAGTACATAAAATAGGCTTAATGACTGGCCCTGCATTCTTCACAATATTTTTCCCTAAGCTTTGAGCAAAGTTTTAAAAAAATACACTAAAATAATCAAAACTGTTAAGCAGTATATTAGTTTGGTTATATAAATTCATCTGCAATTTATAAGATGCATGGCCGATGTTAATTTGCTTGGCAATTCTGTAATCATTAAGTGATCTCAGTGAAACATGTCAAATGCCTTAAATTAACTAAGTTGGTGAATAAAAGTGCCGATCTGGCTAACTCTTACACCATACATACTGATAGTTTTTCATATGTTTCATTTCCATGTGATTTTTAAAATTTAGAGTGGCAACAATTTTGCTTAATATGGGTTACATAAGCTTTATTTTTTCCTTTGTTCATAATTATATTCTTTGAATAGGTCTGTGTCAATCAAGTGATCTAACTAGACTGATCATAGATAGAAGGAAATAAGGCCAagttcaagaccagcctgggcaacatatcgagaacctgtctacaaaaaaattaaaaaaaattagccaggcatggtggcgtacactgagtagtttgtcccagctactcgggagggtgaggtgggaggatcgcttcagcccaggaggttgagattgcagtgagccatggacataccactgcactacagcctaggtaacagcacgagaccccaactcttagaaaatgaaaaggaaaTATAGAAATATAAAATTTGCTTATTATAGACACACAGTAACTCCCAGATATGTACCACAAAAAATGTGAAAAGAGAGAGAAATGTCTACCAAAGCAGTATTTTGTGTGTATAATTGCAAGCGCATAGTAAAATAATTTTAACCTTAATTTGTTTTTAGTAGTGTTTAGATTGAAGATTGAGTGAAATATTTTCTTGGCAGATATTCCGTATCTGGTGGAAAGCTACAATGCAATGTCGTTGTAGTTTTGCATGGCTTGCTTTATAAACAAGATTTTTTCTCCCTCCTTTTGGGCCAGTTTTCATTACGAGTAACTCACACTTTTTGATTAAAGAACTTGAAATTACGTTATCACTTAGTATAATTGACATTATATAGAGACTATGTAACATGCAATCATTAGAATCAAAATTAGTACTTTGGTCAAAATATTTACAACATTCACATACTTGTCAAATATTCATGTAATTAACTGAATTTAAAACCTTCAACTATTATGAAGTGCTCGTCTGTACAATCGCTAATTTACTCAGTTTAGAGTAGCTACAACTCTTCGATACTATCATCAATATTTGACATCTTTTCCAATTTGTGTATGAAAAGTAAATCTATTCCTGTAGCAACTGGGGAGTCATATATGAGGTCAAAGACATATACCTTGTTATTATAATATGTATACTATAATAATAGCTGGTTATCCTGAGCAGGGGAAAAGGTTATTTTTAGGAAAACCACTTCAAATAGAAAGCTGAAGTACTTCTAATATACTGAGGGAAGTATAATATGTGGAACAAACTCTCAACAAAATGTTTATTGATGTTGATGAAACAGATCAGTTTTTCCATCCGGAT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