Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name DEPDC1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr1) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name DEP domain containing 1
Also known as DEP.8|DEPDC1-V2|DEPDC1A|SDP35
Coordinate chr1:68474152-68497082
Strand -
Gene summary Predicted to enable GTPase activator activity. Involved in negative regulation of transcription, DNA-templated. Located in nucleus. Part of transcription repressor complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from DEPDC1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
DEPDC1P1 chr15:31764141-31768285 - Intragenic
ENSG00000259358 UCSC
DEPDC1P2 chr9:105758372-105765235 + Intragenic
ENSG00000232486 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001114120.3
GTGCCGAGACTCGCCACTGCCGCGGCCGCTGGGCCTGAGTGTCGCCTTCGCCGCCATGGACGCCACCGGGCGCTGACAGACCTATGGAGAGTCAGGGTGTGCCTCCCGGGCCTTATCGGGCCACCAAGCTGTGGAATGAAGTTACCACATCTTTTCGAGCAGGAATGCCTCTAAGAAAACACAGACAACACTTTAAAAAATATGGCAATTGTTTCACAGCAGGAGAAGCAGTGGATTGGCTTTATGACCTATTAAGAAATAATAGCAATTTTGGTCCTGAAGTTACAAGGCAACAGACTATCCAACTGTTGAGGAAATTTCTTAAGAATCATGTAATTGAAGATATCAAAGGGAGGTGGGGATCAGAAAATGTTGATGATAACAACCAGCTCTTCAGATTTCCTGCAACTTCGCCACTTAAAACTCTACCACGAAGGTATCCAGAATTGAGAAAAAACAACATAGAGAACTTTTCCAAAGATAAAGATAGCATTTTTAAATTACGAAACTTATCTCGTAGAACTCCTAAAAGGCATGGATTACATTTATCTCAGGAAAATGGCGAGAAAATAAAGCATGAAATAATCAATGAAGATCAAGAAAATGCAATTGATAATAGAGAACTAAGCCAGGAAGATGTTGAAGAAGTTTGGAGATATGTTATTCTGATCTACCTGCAAACCATTTTAGGTGTGCCATCCCTAGAAGAAGTCATAAATCCAAAACAAGTAATTCCCCAATATATAATGTACAACATGGCCAATACAAGTAAACGTGGAGTAGTTATACTACAAAACAAATCAGATGACCTCCCTCACTGGGTATTATCTGCCATGAAGTGCCTAGCAAATTGGCCAAGAAGCAATGATATGAATAATCCAACTTATGTTGGATTTGAACGAGATGTATTCAGAACAATCGCAGATTATTTTCTAGATCTCCCTGAACCTCTACTTACTTTTGAATATTACGAATTATTTGTAAACATTTTGGTTGTTTGTGGCTACATCACAGTTTCAGATAGATCCAGTGGGATACATAAAATTCAAGATGATCCACAGTCTTCAAAATTCCTTCACTTAAACAATTTGAATTCCTTCAAATCAACTGAGTGCCTTCTTCTCAGTCTGCTTCATAGAGAAAAAAACAAAGAAGAATCAGATTCTACTGAGAGACTACAGATAAGCAATCCAGGATTTCAAGAAAGATGTGCTAAGAAAATGCAGCTAGTTAATTTAAGAAACAGAAGAGTGAGTGCTAATGACATAATGGGAGGAAGTTGTCATAATTTAATAGGGTTAAGTAATATGCATGATCTATCCTCTAACAGCAAACCAAGGTGCTGTTCTTTGGAAGGAATTGTAGATGTGCCAGGGAATTCAAGTAAAGAGGCATCCAGTGTCTTTCATCAATCTTTTCCGAACATAGAAGGACAAAATAATAAACTGTTTTTAGAGTCTAAGCCCAAACAGGAATTCCTGTTGAATCTTCATTCAGAGGAAAATATTCAAAAGCCATTCAGTGCTGGTTTTAAGAGAACCTCTACTTTGACTGTTCAAGACCAAGAGGAGTTGTGTAATGGGAAATGCAAGTCAAAACAGCTTTGTAGGTCTCAGAGTTTGCTTTTAAGAAGTAGTACAAGAAGGAATAGTTATATCAATACACCAGTGGCTGAAATTATCATGAAACCAAATGTTGGACAAGGCAGCACAAGTGTGCAAACAGCTATGGAAAGTGAACTCGGAGAGTCTAGTGCCACAATCAATAAAAGACTCTGCAAAAGTACAATAGAACTTTCAGAAAATTCTTTACTTCCAGCTTCTTCTATGTTGACTGGCACACAAAGCTTGCTGCAACCTCATTTAGAGAGGGTTGCCATCGATGCTCTACAGTTATGTTGTTTGTTACTTCCCCCACCAAATCGTAGAAAGCTTCAACTTTTAATGCGTATGATTTCCCGAATGAGTCAAAATGTTGATATGCCCAAACTTCATGATGCAATGGGTACGAGGTCACTGATGATACATACCTTTTCTCGATGTGTGTTATGCTGTGCTGAAGAAGTGGATCTTGATGAGCTTCTTGCTGGAAGATTAGTTTCTTTCTTAATGGATCATCATCAGGAAATTCTTCAAGTACCCTCTTACTTACAGACTGCAGTGGAAAAACATCTTGACTACTTAAAAAAGGGACATATTGAAAATCCTGGAGATGGACTATTTGCTCCTTTGCCAACTTACTCATACTGTAAGCAGATTAGTGCTCAGGAGTTTGATGAGCAAAAAGTTTCTACCTCTCAAGCTGCAATTGCAGAACTTTTAGAAAATATTATTAAAAACAGGAGTTTACCTCTaaaggagaaaagaaaaaaactaaaacagTTTCAGAAGGAATATCCTTTGATATATCAGAAAAGATTTCCAACCACGGAGAGTGAAGCAGCACTTTTTGGTGACAAACCTACAATCAAGCAACCAATGCTGATTTTAAGAAAACCAAAGTTCCGTAGTCTAAGATAACTAACTGAATTAAAAATTATGTAATACTTGTGGAACTTTGATAAATGAAGCCATATCTGAGAATGTAGCTACTCAAAAGGAAGTCTGTCATTAATAAGGTATTTCTAAATAAACACATTATGTAAGGAAGTGCCAAAATAGTTATCAATGTGAGACTCTTAGGAAACTAACTAGATCTCAATTGAGAGCACATAACAATAGATGATACCAAATACTTTTTGTTTTTAACACAGCTATCCAGTAAGGCTATCATGATGTGTGCTAAAATTTTATTTACTTGAATTTTGAAAACTGAGCTGTGTTAGGGATTAAACTATAATTCTGTTCTTAAAAGAAAATTTATCTGCAAATGTGCAAGTTCTGAGATATTAGCTAATGAATTAGTTGTTTGGGGTTACTTCTTTGTTTCTAAGTATAAGAATGTGAAGAATATTTGAAAACTCAATGAAATAATTCTCAGCTGCCAAATGTTGCACTCTTTTATATATTCTTTTTCCACTTTTGATCTATTTATATATATGTATGTGTTTTTAAAATATGTGTATATTTTATCAGATTTGGTTTTGCCTTAAATATTATCCCCAATTGCTTCAGTCATTCATTTGTTCAGTATATATATTTTGAATTCTAGTTTTCATAATCTATTAGAAGATGGGGATATAAAAGAAGTATAAGGCAATCATATattcattcaaaagatatttatttagcaactgctatgtgcctttcgttgttccagatatgcagagacaatgataaataaaacatataatctcttccataaggtatttattttttaatcaagggagatacacctatcagatgtttaaaataACAACACTACCCACTGAAATCAGGGCATATAGAATCATTCAGCTAAAGAGTGACTTCTATGATGATGGAACAGGTCTCTAAGCTagtggttttcaaactggtacacattagactcacccgaggaattttaaaacagcctatatgcccagggcctaacttacactaattaaatctgaattttggggatgttgtatagggattagtattttttttaatctaggtgattccaatattcagccaactgtgagaatcaatgGCCTAAATGCTTTTTATAAACATTTTTATAAGTGTCAAGATAATGGCACATTGACTTTATTTTTTCATTGGAAGAAAATGCCTGCCAAGTATAAATGACTCTCATCTTAAAACAAGGTTCTTCAGGTTTCTGCTTGATTGACTTGGTACAAACTTGAAGCAAGTTGCCTTCTAATTTTTACTCCAAGATTGTTTCATATCTATTCCTTAAGTGTAAAGAAATATATAATGCATGGTTTGTAATAAAATCTTAATGTTTAATGACTGTTCTCATTTCTCAATGTAATTTCATACTGTTTCTCTATAAAATGATAGTATTCCATTTAACATTACTGATTTTTATTAAAAACCTGGACAGAAAATTATAAATTATAAATATGACTTTATCCTGGCTATAAAATTATTGAACCAAAATGAATTCTTTCTAAGGCATTTGAATACTAAAACGTTTATTGTTTATAGATATGTAAAATGTGGATTATGTTGCAAATTGAGATTAAAATTATTTGGGGTTTTGTAACAATATAATTTTGCTTTTGTATTATAGACAAATATATAAATAATAAAGGCAGGCAACTTTCATTTGCACTAATGTACATGCAATTGAGATTACAAAATACatggtacaatgctttaataacaaactctgccagtcaggtttgaatcctactgtgctattaactagctagtaaactcagacaagttacttaacttctctaagccccagttttgttatctataaaatgaatattataatagtacctctttttaggattgcgaggattaagcaggataatgcatgtaaagtgttagcacagtgtctcacatagaataagcactctataaatattttactaGAATCACCTAGGATTATAGCACTAGAAGAGATCTTAGCAAAAATGTGGTCCTTTCTGTTGCTTTGGACAGACATGAACCAAAACAAAATTACGGACAATTGATGAGCCTTATTAACTATCTTTTCATTATGAGACAAAGGTTCTGATTATGCCTACTGGTTGAAATTTTTTAATCTAGTCAAGAAGGAAAATttgatgaggaaggaaggaatggatatcttcagaagggcttcgcctaagctggaacatggatagattccattctaacataaagatctttaagttcaaatatagatgagttgactggtagatttggtggtagttgctttctcgggatataagaagcaaaatcaactgctacaagtaaagaggggatggggaaggtgttgcacatttaaagagagaaagtgtgaaaaagCCTAATTGTGGGAATGCACAGGTTTCACCAGATCAGATGATGTCTGGTTATTCTGTAAATTATAGTTCTTATCCCAGAAATTACTGCCTCCACCATCCCTAATATCTTCTAATTGGT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