Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name TDRD1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr10) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name tudor domain containing 1
Also known as CT41.1
Coordinate chr10:114174442-114232669
Strand +
Gene summary This gene encodes a protein containing a tudor domain that is thought to function in the suppression of transposable elements during spermatogenesis. The related protein in mouse forms a complex with piRNAs and Piwi proteins to promote methylation and silencing of target sequences. This gene was observed to be upregulated by ETS transcription factor ERG in prostate tumors. [provided by RefSeq, Sep 2018]

Retrocopy(s) from TDRD1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
TDRD1P1 chr4:92884733-92885537 + Intragenic
ENSG00000248750 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001385366.1
GCACTGGGGATTGGAGGCGAGGGAAGTGCAGGGCGCATCCCAGGCGGCAGGGCTCCCAGCATCGGCAGTCGCCATCACCGCCAGACCGCAGAGACAGGTTCGGATCCGCGGTCCTCTTGCCTCTTTCCAGGCCTCGATGAGTGTTAAATCGCCATTTAATGTGATGTCAAGAAATAATTTGGAAGCACCTCCTTGTAAGATGACAGAGCCATTTAATTTTGAGAAAAATGAAAACAAGCTTCCACCACATGAGTCTTTAAGAAGTCCTGGAACACTTCCTAACCACCCTAATTTCAGGCTGAAAAGCTCAGAGAATGGAAATAAAAAGAACAATTTTTTGCTTTGTGAGCAAACCAAACAATATTTGGCTAGTCAGGAAGACAATTCAGTTTCTTCAAACCCGAATGGCATCAACGGAGAAGTAGTTGGCTCCAAAGGAGACAGGAAAAAATTGCCAGCAGGAAACTCAGTGTCACCACCAAGTGCTGAAAGTAATTCACCACCCAAAGAAGTGAATATTAAGCCTGGAAATAATGTACGTCCTGCAAAATCAAAAAAACTAAACAAGTTGGTCGAGAATTCCTTGTCCATAAGTAATCCAGGGCTCTTCACCTCCTTAGGACCTCCTCTTCGGTCCACAACTTGCCATCGCTGTGGCCTATTTGGATCGCTGAGGTGCTCTCAGTGCAAGCAGACCTACTATTGCTCCACAGCATGTCAAAGAAGAGACTGGTCTGCACACAGCATCGTGTGCAGGCCTGTTCAGCCAAATTTCCACAAACTTGAAAATAAATCATCTATTGAAACAAAGGATGTGGAGGTAAACAATAAGAGTGACTGTCCACTTGGAGTTACTAAGGAAATAGCCATTTGGGCTGAGAGAATAATGTTTTCTGATTTGAGAAGTCTACAACTCAAGAAAACCATGGAAATAAAGGGTACGGTTACCGAATTCAAACACCCAGGGGACTTCTACGTGCAGTTATATTCTTCAGAAGTTTTAGAATACATGAACCAACTCTCTGCCAGCTTAAAAGAAACATATGCAAATGTGCATGAAAAAGACTATATTCCTGTTAAGGGGGAAGTTTGTATTGCCAAGTACACTGTTGATCAGACCTGGAACAGAGCAATCATACAAAACGTTGATGTGCAGCAAAAGAAGGCACATGTCTTATATATTGATTATGGAAATGAAGAAATAATTCCATTAAACAGAATTTACCACCTCAACAGGAACATTGACTTGTTTCCTCCTTGTGCCATAAAGTGCTTTGTAGCCAATGTTATCCCAGCAGAAGGGAATTGGAGCAGTGATTGTATCAAAGCTACTAAACCACTGTTAATGGAGCAGTACTGCTCCATAAAGATTGTCGACATCTTGGAAGAGGAAGTGGTTACCTTTGCTGTAGAAGTTGAGCTGCCAAATTCAGGAAAACTTTTAGACCATGTGCTTATAGAAATGGGATATGGCTTGAAACCCAGTGGACAAGATTCTAAGAAGGAAAATGCAGATCAAAGTGATCCTGAAGATGTTGGAAAAATGACAACTGAAAACAACATTGTCGTAGACAAAAGTGACCTAATCCCAAAAGTGTTAACTTTGAATGTAGGTGATGAGTTTTGTGGTGTGGTTGCCCACATTCAAACACCAGAAGACTTCTTTTGTCAACAACTGCAAAGTGGCCGAAAGCTTGCTGAACTTCAGGCATCCCTTAGCAAGTACTGTGATCAGTTGCCTCCACGCTCTGATTTTTATCCAGCCATTGGTGATATATGTTGTGCTCAGTTCTCAGGAGTAAAGCCATCATTAGGAATTTGGACTCCAGAAGCTATTTGTCTCATGAAAAAACTTGTACAGAACAAAATAATCACAGTGAAAGTGGTGGACAAGTTGGAAAACAGTTCCCTGGTGGAGCTTATTGATAAATCCGAGACGCCTCATGTCAGTGTTAGCAAAGTTCTCCTAGATGCAGGCTTTGCTGTGGGAGAACAGAGTATGGTGACAGATAAACCCAGTGACGTGAAAGAAACCAGTGTTCCCTTGGGTGTGGAAGGAAAAGTAAATCCATTGGAGTGGACATGGGTTGAACTTGGTGTTGACCAAACAGTAGATGTTGTGGTCTGTGTGATATATAGTCCTGGAGAATTTTATTGCCATGTGCTTAAAGAGGATGCTTTAAAGAAACTCAATGATTTGAACAAGTCATTAGCAGAACACTGCCAGCAGAAGTTACCTAATGGTTTCAAGGCAGAGATAGGACAACCTTGTTGTGCTTTTTTTGCAGGTGATGGTAGTTGGTATCGTGCTTTAGTCAAGGAAATCTTACCAAATGGACATGTTAAAGTACATTTTGTGGATTATGGAAACATCGAAGAAGTTACTGCAGATGAACTCCGAATGATATCATCAACATTTTTAAACCTTCCCTTTCAGGGAATACGGTGCCAGTTAGCAGATATACAGTCTAGAAACAAACATTGGTCTGAAGAAGCCATAACAAGATTCCAGATGTGTGTTGCTGGGATAAAATTGCAAGCCAGAGTGGTTGAAGTCACTGAAAATGGGATAGGAGTTGAACTCACCGATCTCTCCACTTGTTATCCCAGAATAATTAGTGATGTTCTGATTGATGAACATCTGGTTTTAAAATCTGCTTCACCACATAAAGACTTACCAAATGACAGACTTGTTAATAAACATGAGCTTCAAGTTCATGTACAGGGACTTCAAGCTACCTCTTCAGCTGAGCAATGGAAGACGATAGAATTGCCAGTGGATAAAACTATACAAGCAAATGTATTAGAAATCATAAGCCCAAACTTGTTTTATGCTCTACCAAAAGGGATGCCAGAAAATCAGGAAAAGCTGTGCATGTTGACAGCTGAATTATTAGAATACTGCAATGCTCCGAAAAGTCGACCACCCTATAGACCAAGAATTGGAGACGCATGCTGTGCCAAATACACAAGTGATGATTTTTGGTATCGTGCAGTTGTTCTGGGGACATCAGACACTGATGTGGAAGTGCTCTATGCAGACTATGGAAACATTGAAACCCTGCCTCTTTGCAGAGTGCAACCAATCACCTCTAGCCACCTGGCGCTTCCTTTCCAAATTATTAGATGTTCACTTGAAGGATTAATGGAATTGAATGGAAGCTCTTCTCAATTAATAATAATGCTATTAAAAAATTTCATGTTGAATCAGAATGTAATGCTTTCTGTGAAAGGAATTACAAAGAATGTCCATACAGTGTCAGTTGAGAAATGTTCTGAGAATGGGACTGTCGATGTAGCTGATAAGCTAGTGACATTTGGTCTGGCAAAAAACATCACACCTCAAAGGCAGAGTGCTTTAAATACAGAAAAGATGTATAGGATGAATTGCTGCTGCACAGAGTTACAGAAACAAGTTGAAAAACATGAACATATTCTTCTCTTCCTCTTAAACAATTCAACCAATCAAAATAAATTTATTGAAATGAAAAAACTGTTAAAAAGTTAAGTAAGTTAAATCGTATGTTTTCGCCTCTTCTGTGATCACCAATAGGACATCTTCAGGCATATTGGCAGGATAGAGCTAATGGAGTGAAACCTATTGTAAGGCTGTACTTTCGTGATTTAATGACCTGAGGTTTGGTCATAATGCTTCTGCTGTTTTTGTAGGTTTATCTGATCGTTTTCCTTTGCTACTGCTAATGGAACTGAACCCCCAGGGGTATTCCAGTTGTAATAGCCTTTCCTTACTGTTGTTTGGTTCTGTGAATGCCTATGTTATTGATATGTGGAGGGACTTGTAAAACTTGTTGTGACATAAAGCTTAGCCTCAGATTTTTTGTCTAGATCTGAAATTAACTCAGAGCTCACTTATGCACATTGCTGTAAATATGTTTAGCACTTTTTGCGAGGGGTATCTAAAGGGCCAAGAACGGAAAGTGGATCTAAAGGGCCAAGAACGGAAAGTGGGCTGCACTGAGGGTATTTTTCATTTAAAAACAAAACATACTCCCTGCTTTTGGCTGTGGTGATTCTAGTGTCTAAAGAACATACTGGTGAGTTTTAAACCAGTGTTCCTCCCCACCCCACCCCCATATTTTAAATGTCTGGGATCCTTTGTTGTAAGATGGTTCTCAGAAATAAatttttgattaagagccaattagaacttctgatcagggctgggggtggtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgggcagatcacctgagcccaggcgttcgaagtcagcctggccaagatggcgaaacactgcctctacttaaaatacaaaattagctgggcatggtggtgcacacctgttaacccagctacttgggaggctgagacaggagaatcgcttgaatccaggaggcggcggttgcagtgagccaagactgctattatactccagcctgggtgacagagtgagagtttgtctcaaaaacaaaacaaaacaaaacaaaaaaaaaaacaacctctaatctcagaataaagttgtctctcctcaccactttgagttgttacagttccagccaaaagcaaaggaactttgatttacttaatatgtgcacttttgttggttaacaaatttatattaaactgtttggaaataGTTCAAGAGGTGGCTATAATACTCTTCATGAATCTTTTATGGGTGTAGTAACTCTCAAGTAGGAACCAACTGCCAACTGTGTTAAAACATATCTTTCATGTGGTAATAGACCGTTTCTTTGCGTTTTAAGAAAGGTCAATTGAATTATAAGCTAAATGTAATTAATGCAAGATCAACTATCTTGACTCTCATGTTTCCTTTTACAAATTTTGGGTTATTACAACTTTCAGTCCTTTCTAATACATTGTCTTAATACTGACTGTTTTGTATGTTTAAGCTTAAAATCTTTTAATCttttttttttttttttttggagacggagtcttgctctgtcacccaggctggagtgcaatggcgtgatctcggctcactgcaagctccacctcccaggttcacgcaattctcccacatcagcctcccaagtagctgggactacaggcgcacactgccacacccggctaatcttAAACTTAATGGTGATTTTAATTTCATAGATCAAGGAACATGCAATGACATGGATTTCTGGAATTTAGTCCTAGTATCAAGTCACTATATATATATATATTTtttttttattttttatttttatttttttttgagacagtctcgctctgttgtccaggctggagtgcagtggcgctatctcagctcactacaacctccgcctcccgggttcatgccattctcctgcctcagcttcccaagtagctgggactataggtgcccgccaccacacccagctaatctttttgtatttttagtagagacagggtttcaccgtgttagccaggatggtctcgatctcctgacctcgtgatctgccctcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccactgcgcccggccACCAAGTCATTACATTTTTAACCAAGTTGGTTGGCCTGTATGTTCTTCTTATCTGTGTAACAGGCATTTTTCCTAAGGATATTGAGTGTGCTTACACATAAAACTTAAAGTGAAATTTCATTGTTTCTTGATAGATTTAAGACAGGGCTTAGTAGCTTTCAAAAGAAAACTTGATTTAAAGCATAGTAGTTGAACTGGATTTTTCCTGACTGTGGGAATAAATAGATATTTTATTTACATTTGAATACAGTGCaataccttgtgtttgggtagtacgtatttacaaagcatttttacatctactcacatacttaatcttcacaatgcccttgaaaagaaagtaggacccattttacagttaaggaagctgaggctcagagagggttacatgactgtccaaaatcacataCAGGCTGAAACACTAGGTCTTACGACTTAAAACAGTTGTGTCAACTTCCCTGAGCTGCTACGTGTACAGTATCCTTTTAGATCAGATCAGTTACATAGGGCATGAAACTAGAGGGTTACATTATTAGGAAAAAATAATGTACATGATTGCTTAAGCATTACTTCATTGTGGTGAAAATAGAGCTGAATATTTACTCCTTTAAATTATTCTTTGAGATAGAATGGGTGTAAAAATGTATTTTggctgggcatggtggctcaggcctgtaatcccagcacttttgggaggctgaggagggcaggtcacatgaggcccaggagtttgagaccatcctggccaacatggtgaaactttgtctctaccaaaaaaaatatagaattagccaggtgaggtggcgtgcacctgtagtcccagctactggggaggctgaggcaggagaattgcttgaacccaggagccgaaggttgcagtgagccgagatggcaccactgcactccagcttgggcaacagagtgagaccctgtctcaaaaaaataaaataaaagacaaaCACATGTATTTCATCATCTGGAGAAATTTAATTGTTAGCAATTTAATTGTAAAATTGCTAAAACAGAAGTGCTGTGGTGATATGAACATAAAACCCTCTGTAATCTGTTGCTCAGGTGATGTTTCAACACACAAGTTAATGTCAGATATCTTTTATATATAAGGAGAGTGCAAACAACTATATGTTATATTTGTGAAGGGGAGTATAAACAGCTGTACTTAGCATATATTATGCTATGTTATGGTGGTCATTAATTTTCTTAACTGACAGGTCTGGCTTAAATGCGTAATTTCAGTTAAAAGTGAATATTTTGTTTGCTTGTATTTGAAATTAAAAGCCATAGCAATTGAGTTTTTGTGTAAGGCATAATGATAGTTGATTTTTTTTCTTTTTCAGAAACAGCATCTCTTGGAGGTAAACCCTTATGAGACAGGAAACAGCAAAGGCTAGCTTTAGGAGAGAAAGTACAGCACCTGGTGTTTTTATTTATGAGAACCTTTTCTTTGTCCACTTTCTCTGTAATGACCTTCTATCCCTCCGTTTTTGCCTGCCTGCCATTCTCCTATTAGGTTGGTGGTTTTTATTTTCCTCTAAGTTCCTTCCACCAAATAAATATTACGTAAAAAATTCATACCAAATCAATGAGAATACTGGCAAGGAATACATAGGGACTTTCTGCTATATATGTAACTTTTTATTACTTAAAGGTACCGAAGGAAGgccaggtgcagtggctcacgcccagcactttgggaggctgaggtgggaggatcccttgaggccaggagttcaaggttacagtgagctatgatagtgccactgcactccagcctgggtgacagattttgtcttaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTTGATATGAGTTTTATTTTCTGTCCGTTTGAAATATTTTGTAATATTCCCTGCATTCTCTGTCGTCTGCCTCTTCCACATAATGTCCTTTGCTTTCATGTTTGTTATCTTCTTTTTCTGTTCACTCAGAGGTCATCAATTTCTTTCTCTCCGTCCTTAATTGGATTATTTTTCTTTTGGCCTTTGGGCACAGAGTCTGACCTCTGGACCACTCTAACTGGAGAAGGAACTTTATGTTCCCTCTCCTGCTGTGTCCACAACCTTAGAAATCTGTAGCTAGATTTTTGTTGTTATAGATAGAATTTACTGTTTCTGAAACCCAAATACAGTTATCAGTTTAAGGTTAAAAAAAAAAAAAAAACGAAGAGTGTATATTTTTCCTGAAGCATGAAAATAATCTCAAATTCTCCTAAACCACGCATATGCAGAATTATGGGCTGGCTGACTTTCCTGCCAACCCCAAAGTTTGAATTTTTTTCATGATTTAACTGTCAGACTATGAAACCTAAGATGTTTCTCACCAACTCAGCAGATACTTGAAAGACtttttttttttttttttttttttttGCTTTTACTGGCAATGTACGTTGTCTAATCTGTTAAATGGGATATTTCCTCATGTAAAAAGTTGTTAAAACACTGATGTGCTTCTGTTAGATAAAAGCTCACGCTGCTTTGCCCAATAAAATTATTTCACTTCCCAA