Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Styx
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr14) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name serine/threonine/tyrosine interaction protein
Also known as 0610039A20Rik|hStyxb
Coordinate chr14:45588534-45614608
Strand +
Gene summary Predicted to enable F-box domain binding activity and pseudophosphatase activity. Acts upstream of or within spermatogenesis. Located in cytoplasm. Orthologous to human STYX (serine/threonine/tyrosine interacting protein). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Styx

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
StyxP1 chr7:107802257-107806273 + Intergenic
ENSMUSG00000108916 UCSC
StyxP2 chrX:67864701-67868924 + Intergenic
ENSMUSG00000071748 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_019637.3
GGAGACGGTTATGGGCTCGTGCCTGGGTCGGATCCCGGCTCTCTGAGGGGCGCGGAGACCTGCGGGAGGGACACGGCCGCAGCATGGCGGCCGGCAGCGCACCGCCCTGCCCTCCGCCTTCCTGTCGCAGCCGCTTGGATCCTGTGGTCCGCGAGTGCTTGCTGTGAGCCTGCCGCGCGTCAGCCCCCCCACCgctcgcccgcccgcccgccctccTTCCCTTGTCGCCTCTGCCAGCCCGGAGGGCGGCCGGGCGCACCGCGCCCACCCACCGGGGCCCTGGGACCATGGAGGACGTGAAACTGGAGTTCCCCTCGCTCCCGCAGTGCAAAGACGACGCCGAGgAGTGGACTTACCCTATGAGACGAGAGATGCAGGAAGTTTTGCCTGGATTGTTCTTAGGCCCATACTCTTCTGCTATGAAAAGCAAGCTACCTATACTTCAGAAACATGGCATAACTCATATAATTTGCATACGGCAAAATATTGAAGCAAACTTTATTAAACCAAACTTTCAACAATTATTTAGATATTTAGTTTTGGATATTGCTGATAATCCAGTTGAAAACATAATACGTTTTTTCCCTATGACTAAAGAGTTTATTGATGGAAGCTTACAAAATGGAgGAAAAGTTCTTGTCCATGGGAATGCAGGTATCTCTAGAAGtgctGCCTTTGTCATTGCATACATCATGGAGACGTTTGGGATGAAATACAGAGATGCATTTGCTTATGTCCAAGAAAGGAGATTTTGTATTAATCCTAATGCTGGATTTGTCCACCAACTTCAGGAATATGAAGCCATCTACTTAGCAAAATTAACAATACAGATGATGTCACCACTCCAAATAGAAAGGTCCTTAGCTGTTCATTCTGGTACCACAGGTAGTGTGAAGAGAACACATGAGGAAGATGACGACTTTGGAAACATGCAAGTGGCAACCGCACAGAACGGCTGACCTGTGAGGACTGTTACATGGGTGTGAGCTTCCATCTGGAAAGGAGAGGATCCTAGTGATGATAATGTGAAATGGTAAACTCACAAATACTTTCTTTTCAATTATACATTGCTTCCAGACATGTTTCTCTGCAACACTTTAAGATGTTGGACTTATGCAGTAGATGGCACTGATGGGTGATGggtttacttaaaaaaaagagaaaaaaagaaacaaaaaaacctttatgGTTTTATTATAAACCAAGAATTTTGGACTTGCAAAGAGGTATTATTGCAATAATGCACTTTTCATACTTGAAATTTATTTGTATGATATAAAGTTATTACTTTAAACAAAATACAAGTTAGGGGGATTTGTTTATAGATTTTGGATAATTTATAACAAAAAAATTTCCTAATGTTTCCTAAAAACTCATTTTgtgttatatatattacatttaagGTAATTTTACAGTTCAATTTTATGATGAAGCCTCTTACAAAAACATTAACAAAATGTAGAACTTGTCCACATTTTTTAGTATAATTCAGTAACTTGAttaccatttttttaaacttcttggTCCCGTATCTTTAAATCATGACTTTAGCCAACTAGCCTACTTTACAATTTAATACAGTTAATACTTCCTTTCTAATTGCCTCCCTTATTCTAAATGAGAAAAGTTGAAATGATTAAAGAAAGAGGTCTTACTTTCTAAAACCAGATACTCCAAAAAATAAGGATAGTGTTATATTTTCCACATGACttttttctctttgctgtttAAGCCAAATGTAGACTTGGTCTTTTCAGAGTTGCTGAGCTCTTCTAACTTTTGTCCAAAATGGTTCAAAGTAGACCAAACCAATGTAGCACTGTTTCTTCAATATGAAACCCCCAAAAGAAAAGTGCCTTGcatcaacaaacaagcaaatcctCATGACTTCTAAATTAGTATATAAAGCAGTGAACAGCTATTAACGTTTTTCTGtaatttcttgttttaaaatcataaattaaATCTGATGCTTGAAGAAAGTAAATTATTTGGAATGAGACACTTCCTTCTATTTTCTGTTAATTATTTCTCTGAGGTTCAGCTGACAGCTTTGCTTTGAAGATGTATCCATTGGGGAAAGCAATTTGTGGGTGGCTTCAGTGTATTGTAGATTACTGTTTTAACTTGTTCCTAAATTAATTCAAATTTGTACCATAATTTGCATTAGCAAAATCATTTTATGGCTCTTTAGTTTTCCATGTTTTTATCTATATGTATAAAAGTTGTTCTACAAAAAACATTTTACTACTGTAAATGTGATGTGCAGAAGAGAGAAGTGTTTTTAACTTTTGTACATGATGACTTTAGGGTAGCACAAACACAgctcctttatatatatatagctcaCGTGTCTCAGCCCTCTTTCGAGGTGCTTTACGGTTGGGAATGATGCCCGCACACTCCCAGGGTACCATGAGGCACTGTGTAAGGTAACAGGTTGCACTTAAGTTCCTTGCTTTGCTCACCACCCTATGACATCAACAGTATAGAAAGGTTCTTTGTCCTTCACAGTAGGAGCCTGAATATAAACCAGAATTACTGTTACCTTGATTTCTAGCCTCTTCTGGTTTCCCATCCCATCTCCTATCTTTCAGCTCTGAAAAAAAGCATTGCTTTTAATTCTGTTGTGTCACAGGCATGGTGGTCTAGCAGAGCCAAGATTACATTGGGTATTCAAAAATCCCTGTATACATACAGGCCAACAAAGATCTCTCTTGGAGTCAACCCATAATCCATGGCTCACTGAACAGAAATTGTGATTAAAGCaatctctattttaaaaaaattggatttTCAAGATGAGACATGTgaagtaactttttaaaataagttttataaaaatacatgttCCTCTTTAAATAGGAGTCTGTCCAAAAACAGAGGTTATTGACATTCATTTGTAGCTggtaattttccatttttctatccactgtcatttttttcttctcacataAAGTGCCTATCCAGCACGATATACTGGAGACAGTCTCAGACACTAGGGACTGCCACCATGTTGAGCACAGTTGATGTGGACAGATGAAGTTTGTCCTTTCATAAGAAGCCTccaagtttcttttcttcctctgtatttACTGTCAGTAGCTGTCTTAGGTTCCATTTCTAGTGATGTTTTGTAAGTTAACTATGATAAATTTATCCAATCATGATTTATTCTCTAGACAACTTGAATAATGTATGAATGTCCACCCAGTTTCAGTATTAAATATGAAAGCTGGGTTCATAATTAAAACTATACATTTTCTTATCAAAACTTAGGGAACTTCATTACTCCCCATTTGAAAGTTTGAGACAGCTCCTGGAAACTGGAGTGGAGAAGGGAGTCTTCTCCTAGTTTAACTGATTCATGCTAGTTTCTTGTCTATTAGATGTTATACCAACTCTATAGTAGGAATGTTCAAGTGTGATAACTTTGCTACCAACTTTCAACCGCTTGTAGAACAGAATATTCATTTGAAGGGGTGTAGGGCTGTACTTAATCTACTTAATCTGAGTCTAGAAGTAATGTCAGAAAATGCTAAGCATGTCCTTTGTAATAAAACATAAGGTTCTTAATTGTTTAACTGCTATGGAATTCACATGAATTAGAAGTATTTAAGTGCAATCTTGAATTATGAAGTTGGATGTATATATTAGGATGTCAACTTGATGTAAAGTAAATGAGCAGTTACCTGATGGATCTTTTTAAATAACCGGTTTAATTCACAATCCTAAAGCATAACTTCACGTCAGTATTTACAGTATCTTTGTCCATTCAACAACACTCCAATGAGCAAATAGTAGGAAATAGCTGAGAATTACTCaaggattttgtttatttatttttattaggaaaATAAGTTTCTAGAGTCTTGAGTGCTGGATAATTCTTTTGTCTTTCCCATCCAtggcagctaaaaaaaaaatcactcaaaatATTCAGGTTTACATGTTCTGCTCTCTTACAGGGAGCTACCATACCTCACAGTTCAAAGTGTTTTCTCAATCAGTAACATGATACTGACATGTAATTGCAATTTACTATGCAGCAAAAATGACTCAAGAACAGTAACATATGTGTCTCTTTACCTCTGTATAGGCAATTGCTTACGTTATTCTACTTTTAACATTTGTACTCAGATAAAATGCTTATGTATGTATAGGAATGTCACAGTGCAAGATGCTGCTAGCCTGGGCACaaagtattaaaattattttgtgaagACTGGTGGTTGTATTAAAACTCTTGTGCCATTGT