Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Syncrip
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr9) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name synaptotagmin binding, cytoplasmic RNA interacting protein
Also known as 2610109K23Rik|4632417O19Rik|GRY-RBP|Nsap1|Nsap1l|hnRNP Q|pp68
Coordinate chr9:88331417-88364645
Strand -
Gene summary Enables poly(A) binding activity. Predicted to be involved in cellular response to interferon-gamma; negative regulation of mRNA modification; and posttranscriptional regulation of gene expression. Predicted to act upstream of or within RNA splicing and mRNA processing. Located in cytoplasm. Part of histone pre-mRNA 3'end processing complex. Is expressed in several structures, including alimentary system; central nervous system; genitourinary system; respiratory system; and sensory organ. Orthologous to human SYNCRIP (synaptotagmin binding cytoplasmic RNA interacting protein). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Syncrip

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SyncripP1 chr16:44623141-44625027 - Intergenic
ENSMUSG00000116605 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001311113.1
GAAGGAAGGACGAAGGCTGAGAGGACAGGGCGGCTAGCGGCCGGCGGAGGTGgcgaggggagaaggaggagctgTCGGAGGGCAGGGGCTGAgctgagggagtgagggagagaagcGGACGcgccagggaggggagggaaggggggtcACGCGGGGGCGCGCGCGCACCGGGAGCGCGCTCGGAGGCGAGTGGAACTGGATCGGGTTTGCTGCCAGCGGCGTGAGCTTCGGCCGCCATTTTACAACAGCTCCACTCGCGCCGGACACAGGGAGCAGCGAGCACGCGTTCCCCGCCAGCCGACCCGGTCGGACAGGATTCCTCGGCCCCAGCCCCGCGGGGAGGGCTAGTTGCACATAGTGATTTAGATGAAAGAGCTATCGAAGCTTTAAAAGAGTTCAATGAAGACGGCGCATTGGCAGTGCTTCAACAGTTTAAAGACAGTGATCTCTCTCATGTTCAGAACAAAAGTGCCTTTTTATGTGGAGTCATGAAGACTTAcaggcagagagaaaaacaggGGACCAAAGTAGCAGACTCTAGTAAAGGACCAGATGAGGCAAAGATTAAGGCACTTTTGGAAAGAACAGGCTACACACTTGATGTGACTACAGGTCAGAGGAAGTATGGAGGACCACCTCCAGATTCCGTTTATTCAGGTCAGCAGCCTTCTGTTGGCACTGAGATATTTGTGGGGAAGATCCCCAGAGATCTGTTTGAGGATGAGCTTGTTCCATTATTTGAGAAAGCTGGACCTATATGGGATCTTCGTTTAATGATGGATCCGCTCACTGGTCTCAACAGAGGTTATGCGTTTGTCACTTTTTGTACAAAAGAAGCAGCACAAGAGGCTGTTAAACTgtaTAATAATCATGAAATTCGTTCCGGGAAGCACATTGGTGTCTGCATCTCAGTTGCCAACAATAGGCTTTTTGTGGGCTCGATTCCTAAGAGTAAAACCAAGGAGCAGATTCTTGAGGAATTTAGCAAAGTGACAGAGGGTCTCACAGATGTCATTTTATACCACCAACCtgatgacaagaaaaaaaacagaGGCTTTTGCTTTCTTGAATATGAAGATCACAAAACAGCTGCCCAGGCAAGACGTAGGCTAATGAGTGGTAAAGTCAAAGTCTGGGGAAATGTTGGAACTGTTGAGTGGGCTGATCCTATTGAAGATCCTGATCCTGAAGTTATGGCAAAGGTAAAAGTGCTGTTTGTACGCAACCTTGCCAACACGGTAACAGAAGAAATTTTAGAAAAGTCATTTAGTCAGTTTGGGAAACTGGAACGAGTAAAGAAGCTAAAAGATTATGCTTTCATTCATTTTGATGAGAGAGATGGTGCTGTCAAGGCTATGGAAGAAATGAATGGTAAAGACTTGGAGggagaaaatattgaaattgtttttgCTAAGCCACCAgatcagaagaggaaagaaagaaaagctcagAGGCAAGCAGCAAAGAATCAAATgtATGATGATTACTACTATTATGGTCCACCTCATATGCCTCCCCCAACAAGAGGTCGAGGGCGTGGAGGTAGAGGTGGCTATGGATATCCTCCAGATTATTATGGATACGAagattattatgattattatggtTATGATTACCATAACTATCGTGGTGGATATGAAGATCCATACTATGgttatgaagattttcaagttggAGCTAGAGGAAGGGGTGGTAGAGGAGCAAGGGGTGCTGCTCCATCCAGAGGTCGTGGGGCTGCTCCTCCCCGTGGTAGAGCCGGTTATTCACAGAGAGGAGGCCCTGGATCAGCAAGAGGCGTTCGCGGTGCGAGAGGAGGTGCCCAACAACAAAGAGGCCGCGGGCAGGGAAAAGGGGTCGAGGCCGGTCCTGACCTGTTACAATGAAGACTGACTTGCTATTGTGGGATTACACCAGAAGCTTGCAGTGGAGTAATGGTAAGGAAAATCAAGCAACCTTAAATATCTCGGATGTATAGGAGCATATTCTATTGCAGAAGACCCTCCTATGAAGATCATGGAATCAAATACGGGACATTGAACTAATACTTGGACTTTGTTATGAATTTCTTTAACAATTTTCTCTGCAGTGCAAGTTATTAAACTAAAGCTACTCTATTTTCCAAATGTGTTCCAAAAAAATCCTTCATAACTTCTAGCATGGTATCTTAATAAAGAATAaagttgttctctttaaaaaatcTGCTCTAAGTAgatttttcccctcttttttaaTTAAGGATCTCAGCAGTGGTATTCTGAAATATTCTCTTGAATTTgtgcatttaaattttattgcagTGATACAGATGCCACTGTTGGTacccttaaatttttatttctgctCACCAAGGTTAATCATGATTGTCTATATCTTTTTTATAGTAATCACTTTTGAATTGTGTTCAGATGCAGTTTCAGGTGTAATCATCAGAGCTGGTTAGTCAGGCATTCCAGATAGTGGTTCTTTTCAGAACCTTTTTTAAAGGGTTGGTTAACTACCTCAGTAGCAGAGGATTGAACTATACCCTGTCTGTACTGTACATAGAAAATCTTTGTAGATAAAAGCAAGGCTTGTTAAATATGATATGAGGGTAAGATTTTAATATACCAAATGTAACATTCTTAGTTGCCTTTAGTTTCAGAGGCTTGTAAGACTTCCTCATGACCATCATAACAGGCCTTGCTTTTGTCGTATTTTGTGGCTGAAAAAGCAGCCTTGCTTCTTCAGATATTGTAGTTATTTGGATGTATAATAGTTTAGCAAGATGTTACTTTTGTAAGACATCAGATGTTCAAAAAAAAAGTGCATCCGAACTTGTACTAAATACTGCAGTGTCCCTTTATAAAAAGTCAGACTAAAACTGACAATTGTACAGCAAAGCCTGACATTTGGATATTTTGAAGTTTTTTCATAAATCATAGAAATTAGTATATGGCTGTAGTTTAGCTTTTTAGGTAAAAGGTATGTTtcattagtgcatttgttattgcTGATCACTATAAAAATGTGAATCAGCTTTCCATTTCTTATGCAGGTCATGATAACTTGTAGAATAGAGTACAATCATTTGTgctatgtttttaattttctaaagcACCTTGATGACAGTGAGTGTTCAGTGGTGAAGCATCCTCTATTGAATCACcctcaaaaaatttttttgccAAGTCCTAAGTTGATAGCTTAaagtcaaaagtaaaattatagttTAAGTAGGACTTGGTGTAAAGAAacaccctcccccttccccaaagGGATACTGCAGTTCTATCACACACCCAGTAGGCACCACGATGACGATCAGAGCTAGACCTGACTAAGGTTTTATACACACCAGTTCCCCAGTAAATGCAAATTTAACAAGAAAATTAGACATGTCATATGTTCAAAATGCTCATGGCAAACAATCATTTTGCATTCCtgcaaataaaattgttttatacTGTAAGCTGGAGGCGAGTGTAACTTATTTTTgtaataaagtttttattttttttatgtgtcaTTAATATAAATGTGTGTTAGTATAGAAAATCTTCTGGTTTAAAAACTTAGAATTGCACACATTTCAGTATGTTCATTTGTACTTACATAATTTTAGAATAGTGGTTGCCAATAGCCTGTATGTTTCccattaattgttttttttttttcctttctttttttttgttaccTTAATAAACCATTTTAGTATGTTGTATGTCAGTTACTGGTATAGCTGGGGCATAGAGTGTAATTTAAAATTTGTCAATAAGTATTCATTGGAATATATGTAAATGTGCCTTGCCGGTTACTGAAACTTACCTACAAAATGAGTATGGGGTGACAAATTTGTTCCTGGTGCTTAATGAAACTTTCTTCCACTGATTTTATATATTACCCTGTGCTTTTTAAAAGTACATCTCTCAAATATTAGTGTAAGTTTGAGGGCTACACAAAACATGTACATTTCATTCTAACATACTGAGTATACTAGGTCGTGGAAAGTGGGTCAGTTAATTGTAGCCTTCAGCAAAATCAAATCTCAGTGTAATCCTTGGTGCTGGCACTTCCCATGTCCAAGGAGTAAAATGATCCTATTTAAGAGGTCATTGCCATGCCTATTGGCACTTAACTGTCATACCATTTTTAACGGACACTGTCAAGGTCTTTTAGTTAATTCCTGGTTTTATTTGTTGGGATATTTGAACAGGTTTGTTAAACCTAACTGCATTGTCAAAGAAAGACGAACACTTTTGTGAGTCCACAAATGTGTTCTTTAAGAAAACATTAAAGTTTGGAGCTCTTTGGGTTTCAAAGACTTGGCTTTTTTAATTTGGGGACGTGGGATGAAACCTTATGATTCAAAGGAAATTGTGAAGAATTGATGGTTATATTTAAGGGTAATGTAAACAGTGATAATGAAATGTAGACTCAAGTGAAAATACTTGACAGTGTTCATTTTAATGACTTTGAATTTAAGCCAttataattacttttaaaattaaatataatttgcaCTGTTCTGATAATGGGTGCAGTTTTTGAGCAATATAATCAGAGCTAAATATGCATGTAGTGATTAGTGATGTGAACAATTAAGTTCTGAGAAGAAATACTAACCGtggtattttaaaacttaaatttctGTAGAAAAATCAGTATCAAACACTTACCAGAAGTCAAGAAAAACAGGCAATGCATATAAACATAATTTTGAATGTTGTGTGGCCTATAAAGCAATAATGCAATTTATATGGAATGTCATGGATATGAGAAATGGAAATGCGAAAATAACTAATCCTTTAGTAAAAATGTCAACATGTTAAAAGGGGGGATGTTAACTAATGTAGGTTATTGCGTTTGTGATTTGTTTATGGGTTCTTGGCTTTGACAGCTTCAAATAATGGACAGATGAGAAGTTAAATTTTGTATATATTGTCaaggaaaggatctttaataGTCAAGTCCCTTCCTTGTggttaaaaaatattaatgaattctGATTGTTAAAAAAGTTA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