Summary

Gene Name	PTEN
Specie	Homo sapiens
Full Name	phosphatase and tensin homolog
Also known as	10q23del|BZS|CWS1|DEC|GLM2|MHAM|MMAC1|PTEN1|PTENbeta|TEP1
Coordinate	chr10:87863625-87971930
Strand	+
Gene summary	This gene was identified as a tumor suppressor that is mutated in a large number of cancers at high frequency. The protein encoded by this gene is a phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase. It contains a tensin like domain as well as a catalytic domain similar to that of the dual specificity protein tyrosine phosphatases. Unlike most of the protein tyrosine phosphatases, this protein preferentially dephosphorylates phosphoinositide substrates. It negatively regulates intracellular levels of phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate in cells and functions as a tumor suppressor by negatively regulating AKT/PKB signaling pathway. The use of a non-canonical (CUG) upstream initiation site produces a longer isoform that initiates translation with a leucine, and is thought to be preferentially associated with the mitochondrial inner membrane. This longer isoform may help regulate energy metabolism in the mitochondria. A pseudogene of this gene is found on chromosome 9. Alternative splicing and the use of multiple translation start codons results in multiple transcript variants encoding different isoforms. [provided by RefSeq, Feb 2015]

Retrocopy(s) from PTEN

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
PTENP1	chr9:33674359-33677332	-	Intergenic	ENSG00000237984	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001304717.5_2

GTTCTCTCCTCTCGGAAGCTGCAGCCATGATGGAAGTTTGAGAGTTGAGCCGCTGTGAGGCGAGGCCGGGCTCAGGCGAGGGAGATGAGAGAcggcggcggccgcggcccggagcccctctcagcgcctgtgagcagccgcgggggcagcgccctcggggagccggccggcctgcggcggcggcagcggcggcgTTTCTCGCCTCCTCTTCGTCTTTTCTAACCGTGCAGCCTCTTCCTCGGCTTCTCCTGAAAGGGAAGGTGGAAGCCGTGGGCTCGggcgggagccggctgaggcgcggcggcggcggcggcacctcccgctcctggagcgggggggagaagcggcggcggcggcggccgcggcggctgcagcTCCAGGGAGGGGGTCTGAGTCGCCTGTCACCATTTCCAGGGCTGGGAACGCCGGAGAGTTGGTCTCTCCCCTTCTACTGCCTCCAACAcggcggcggcggcggcggcACATCCAGGGACCCGGGCCGGTTTTAAACCTCCCGTGCGCCGCCGCCGCACCCCCCGTGGCCCGGGCTCCGGAGGCCGCCGGCGGAGGCAGCCGTTCGGAGGATTATTCGTCTTCTCCCCATTCCGCTGCCGCCGCTGCCAGGCCTCTGGCTGCTGAGGAGAAGCAGGCCCAGTCGCTGCAACCATCCAGCAGCCGCCGCAGCAGCCATTACCCGGCTGCGGTccagagccaagcggcggcagagcgaggggcatcagctaccgccaagtccagagccaTTTCCATCCTGCAGAAGAAGCCCCGCCACCAGCAGCTTCTGCCATCTCTCTCCTCCTTTTTCTTCAGCCACAGGCTCCCAGACATGACAGCCATCATCAAAGAGATCGTTAGCAGAAACAAAAGGAGATATCAAGAGGATGGATTCGACTTAGACTTGACCTATATTTATCCAAACATTATTGCTATGGGATTTCCTGCAGAAAGACTTGAAGGCGTATACAGGAACAATATTGATGATGTAGTAAGGTTTTTGGATTCAAAGCATAAAAACCATTACAAGATATACAATCTTTGTGCTGAAAGACATTATGACACCGCCAAATTTAATTGCAGAGTTGCACAATATCCTTTTGAAGACCATAACCCACCACAGCTAGAACTTATCAAACCCTTTTGTGAAGATCTTGACCAATGGCTAAGTGAAGATGACAATCATGTTGCAGCAATTCACTGTAAAGCTGGAAAGGGACGAACTGGTGTAATGATATGTGCATATTTATTACATCGGGGCAAATTTTTAAAGGCACAAGAGGCCCTAGATTTCTATGGGGAAGTAAGGACCAGAGACAAAAAGGGAGTAACTATTCCCAGTCAGAGGCGCTATGTGTATTATTATAGCTACCTGTTAAAGAATCATCTGGATTATAGACCAGTGGCACTGTTGTTTCACAAGATGATGTTTGAAACTATTCCAATGTTCAGTGGCGGAACTTGCAATCCTCAGTTTGTGGTCTGCCAGCTAAAGGTGAAGATATATTCCTCCAATTCAGGACCCACACGACGGGAAGACAAGTTCATGTACTTTGAGTTCCCTCAGCCGTTACCTGTGTGTGGTGATATCAAAGTAGAGTTCTTCCACAAACAGAACAAGATGCTAAAAAAGGACAAAATGTTTCACTTTTGGGTAAATACATTCTTCATACCAGGACCAGAGGAAACCTCAGAAAAAGTAGAAAATGGAAGTCTATGTGATCAAGAAATCGATAGCATTTGCAGTATAGAGCGTGCAGATAATGACAAGGAATATCTAGTACTTACTTTAACAAAAAATGATCTTGACAAAGCAAATAAAGACAAAGCCAACCGATACTTTTCTCCAAATTTTAAGGTGAAGCTGTACTTCACAAAAACAGTAGAGGAGCCGTCAAATCCAGAGGCTAGCAGTTCAACTTCTGTAACACCAGATGTTAGTGACAATGAACCTGATCATTATAGATATTCTGACACCACTGACTCTGATCCAGAGAATGAACCTTTTGATGAAGATCAGCATACACAAATTACAAAAGTCTGAATTTTTTTTTATCAAGAGGGATAAAACACCATGAAAATAAACTTGAATAAACTGAAAATGGACCTTTTTTTTTTTAATGGCAATAGGACATTGTGTCAGATTACCAGTTATAGGAACAATTCTCTTTTCCTGACCAATCTTGTTTTACCCTATACATCCACAGGGTTTTGACACTTGTTGTCCAGTTGAAAAAAGGTTGTGTAGCTGTGTCATGTATATACCTTTTTGTGTCAAAAGGACATTTAAAATTCAATTAGGATTAATAAAGATGGCACTTTCCCGTTTTATTCCAGTTTTATAAAAAGTGGAGACAGACTGATGTGTATACGTAGGAATTTTTTCCTTTTGTGTTCTGTCACCAACTGAAGTGGCTAAAGAGCTTTGTGATATACTGGTTCACATCCTACCCCTTTGCACTTGTGGCAACAGATAAGTTTGCAGTTGGCTAAGAGAGGTTTCCGAAGGGTTTTGCTACATTCTAATGCATGTATTCGGGTTAGGGGAATGGAGGGAATGCTCAGAAAGGAAATAATTTTATGCTGGACTCTGGACCATATACCATCTCCAGCTATTTACACACACCTTTCTTTAGCATGCTACAGTTATTAATCTGGACATTCGAGGAATTGGCCGCTGTCACTGCTTGTTGTTTGCGCATTTTTTTTTAAAGCATATTGGTGCTAGAAAAGGCAGCTAAAGGAAGTGAATCTGTATTGGGGTACAGGAATGAACCTTCTGCAACATCTTAAGATCCACAAATGAAGGGATATAAAAATAATGTCATAGGTAAGAAACACAGCAACAATGACTTAACCATATAAATGTGGAGGCTATCAACAAAGAATGGGCTTGAAACATTATAAAAATTGACAATGATTTATTAAATATGTTTTCTCAATTGTAACGACTTCTCCATCTCCTGTGTAATCAAGGCCAGTGCTAAAATTCAGATGCTGTTAGTACCTACATCAGTCAACAACTTACACTTATTTTACTAGTTTTCAATCATAATACCTGCTGTGGATGCTTCATGTGCTGCCTGCAAGCTTCTTTTTTCTCATTAAATATAAAATATTTTGTAATGCTGCACAGAAATTTTCAATTTGAGATTCTACAGTAAGCGTTTTTTTTCTTTGAAGATTTATGATGCACTTATTCAATAGCTGTCAGCCGTTCCACCCTTTTGACCTTACACATTCTATTACAATGAATTTTGCAGTTTTGCACATTTTTTAAATGTCATTAACTGTTAGGGAATTTTACTTGAATACTGAATACATATAATGTTTATATTAAAAAGGACATTTGTGTTAAAAAGGAAATTAGAGTTGCAGTAAACTTTCAATGCTGCACACAAAAAAAAGACATTTGATTTTTCAGTAGAAATTGTCCTACATGTGCTTTATTGATTTGCTATTGAAAGAATAGGGtttttttttttttttttttttttttttttAAATGTGCAGTGTTGAATCATTTCTTCATAGTGCTCCCCCGAGTTGGGACTAGGGCTTCAATTTCACTTCTTAAAAAAAATCATCATATATTTGATATGCCCAGACTGCATACGATTTTAAGCGGAGTACAACTACTATTGTAAAGCTAATGTGAAGATATTATTAAAAAGGTTTTTTTTTCCAGAAATTTGGTGTCTTCAAATTATACCTTCACCTTGACATTTGAATATCCAGCCATTTTGTTTCTTAATGGTATAAAATTCCATTTTCAATAACTTATTGGTGCTGAAATTGTTCACTAGCTGTGGTCTGACCTAGTTAATTTACAAATACAGATTGAATAGGACCTACTAGAGCAGCATTTATAGAGTTTGATGGCAAATAGATTAGGCAGAACTTCATCTAAAATATTCTTAGTAAATAATGTTGACACGTTTTCCATACCTTGTCAGTTTCATTCAACAATTTTTAAATTTTTAACAAAGCTCTTAGGATTTACACATTTATATTTAAACATTGATATATAGAGTATTGATTGATTGCTCATAAGTTAAATTGGTAAAGTTAGAGACAACTATTCTAACACCTCACCATTGAAATTTATATGCCACCTTGTCTTTCATAAAAGCTGAAAATTGTTACCTAAAATGAAAATCAACTTCATGTTTTGAAGATAGTTATAAATATTGTTCTTTGTTACAATTTCGGGCACCGCATATTAAAACGTAACTTTATTGTTCCAATATGTAACATGGAGGGCCAGGTCATAAATAATGACATTATAATGGGCTTTTGCACTGTTATTATTTTTCCTTTGGAATGTGAAGGTCTGAATGAGGGTTTTGATTTTGAATGTTTCAATGTTTTTGAGAAGCCTTGCTTACATTTTATGGTGTAGTCATTGGAAATGGAAAAATGGCATtatatatattatatatataaatatatattatacataCTCTCCTTACTTTATTTCAGTTACCATCCCCATAGAATTTGACAAGAATTGCTATGACTGAAAGGTTTTCGAGTCCTAATTAAAACTTTATTTATGGCAGTATTCATAATTAGCCTGAAATGCATTCTGTAGGTAATCTCTGAGTTTCTGGAATATTTTCTTAGACTTTTTGGATGTGCAGCAGCTTACATGTCTGAAGTTACTTGAAGGCATCACTTTTAAGAAAGCTTACAGTTGGGCCCTGTACCATCCCAAGTCCTTTGTAGCTCCTCTTGAACATGTTTGCCATACTTTTAAAAGGGTAGTTGAATAAATAGCATCACCATTCTTTGCTGTGGCACAGGTTATAAACTTAAGTGGAGTTTACCGGCAGCATCAAATGTTTCAGCTTTAAAAAATAAAAGTAGGGTACAAGTTTAATGTTTAGTTCTAGAAATTTTGTGCAATATGTTCATAACGATGGCTGTGGTTGCCACAAAGTGCCTCGTTTACCTTTAAATACTGTTAATGTGTCATGCATGCAGAT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