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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name PTPN11
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name protein tyrosine phosphatase non-receptor type 11
Also known as BPTP3|CFC|JMML|METCDS|NS1|PTP-1D|PTP2C|SH-PTP2|SH-PTP3|SHP2
Coordinate chr12:112418915-112509918
Strand +
Gene summary The protein encoded by this gene is a member of the protein tyrosine phosphatase (PTP) family. PTPs are known to be signaling molecules that regulate a variety of cellular processes including cell growth, differentiation, mitotic cycle, and oncogenic transformation. This PTP contains two tandem Src homology-2 domains, which function as phospho-tyrosine binding domains and mediate the interaction of this PTP with its substrates. This PTP is widely expressed in most tissues and plays a regulatory role in various cell signaling events that are important for a diversity of cell functions, such as mitogenic activation, metabolic control, transcription regulation, and cell migration. Mutations in this gene are a cause of Noonan syndrome as well as acute myeloid leukemia. [provided by RefSeq, Aug 2016]

Retrocopy(s) from PTPN11

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PTPN11P4 chr6:137705242-137707196 - Intergenic
ENSG00000220412 UCSC
PTPN11P2 chr4:82576463-82581384 - Intergenic
ENSG00000248113 UCSC
PTPN11P1 chr3:107103052-107107165 - Intergenic
ENSG00000239455 UCSC
PTPN11P5 chr8:58420164-58426850 - Intragenic
ENSG00000250031 UCSC
PTPN11P3 chr5:23299469-23305343 - Intergenic
ENSG00000250332 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001330437.2
AGTCTCCGGGATCCCCAGGCCTGGAGGGGGGTCTGTGCGCGGCCGGCTGGCTCTGCCCCGCGTCCGGTCCCGAGCGGGCCTCCCTCGGGCCAGCCCGATGTGACCGAGCCCAGCGGAGCCTGAGCAAGGAGCGGGTCCGTCGCGGAGCCGGAGGGCGGGAGGAACATGACATCGCGGAGATGGTTTCACCCAAATATCACTGGTGTGGAGGCAGAAAACCTACTGTTGACAAGAGGAGTTGATGGCAGTTTTTTGGCAAGGCCTAGTAAAAGTAACCCTGGAGACTTCACACTTTCCGTTAGAAGAAATGGAGCTGTCACCCACATCAAGATTCAGAACACTGGTGATTACTATGACCTGTATGGAGGGGAGAAATTTGCCACTTTGGCTGAGTTGGTCCAGTATTACATGGAACATCACGGGCAATTAAAAGAGAAGAATGGAGATGTCATTGAGCTTAAATATCCTCTGAACTGTGCAGATCCTACCTCTGAAAGGTGGTTTCATGGACATCTCTCTGGGAAAGAAGCAGAGAAATTATTAACTGAAAAAGGAAAACATGGTAGTTTTCTTGTACGAGAGAGCCAGAGCCACCCTGGAGATTTTGTTCTTTCTGTGCGCACTGGTGATGACAAAGGGGAGAGCAATGACGGCAAGTCTAAAGTGACCCATGTTATGATTCGCTGTCAGGAACTGAAATACGACGTTGGTGGAGGAGAACGGTTTGATTCTTTGACAGATCTTGTGGAACATTATAAGAAGAATCCTATGGTGGAAACATTGGGTACAGTACTACAACTCAAGCAGCCCCTTAACACGACTCGTATAAATGCTGCTGAAATAGAAAGCAGAGTTCGAGAACTAAGCAAATTAGCTGAGACCACAGATAAAGTCAAACAAGGCTTTTGGGAAGAATTTGAGACACTACAACAACAGGAGTGCAAACTTCTCTACAGCCGAAAAGAGGGTCAAAGGCAAGAAAACAAAAACAAAAATAGATATAAAAACATCCTGCCCTTTGATCATACCAGGGTTGTCCTACACGATGGTGATCCCAATGAGCCTGTTTCAGATTACATCAATGCAAATATCATCATGCCTGAATTTGAAACCAAGTGCAACAATTCAAAGCCCAAAAAGAGTTACATTGCCACACAAGGCTGCCTGCAAAACACGGTGAATGACTTTTGGCGGATGGTGTTCCAAGAAAACTCCCGAGTGATTGTCATGACAACGAAAGAAGTGGAGAGAGGAAAGAGTAAATGTGTCAAATACTGGCCTGATGAGTATGCTCTAAAAGAATATGGCGTCATGCGTGTTAGGAACGTCAAAGAAAGCGCCGCTCATGACTATACGCTAAGAGAACTTAAACTTTCAAAGGTTGGACAAGCTCTACTCCAGGGGAATACGGAGAGAACGGTCTGGCAATACCACTTTCGGACCTGGCCGGACCACGGCGTGCCCAGCGACCCTGGGGGCGTGCTGGACTTCCTGGAGGAGGTGCACCATAAGCAGGAGAGCATCATGGATGCAGGGCCGGTCGTGGTGCACTGCAGTGCTGGAATTGGCCGGACAGGGACGTTCATTGTGATTGATATTCTTATTGACATCATCAGAGAGAAAGGTGTTGACTGCGATATTGACGTTCCCAAAACCATCCAGATGGTGCGGTCTCAGAGGTCAGGGATGGTCCAGACAGAAGCACAGTACCGATTTATCTATATGGCGGTCCAGCATTATATTGAAACACTACAGCGCAGGATTGAAGAAGAGCAGAAAAGCAAGAGGAAAGGGCACGAATATACAAATATTAAGTATTCTCTAGCGGACCAGACGAGTGGAGATCAGAGCCCTCTCCCGCCTTGTACTCCAACGCCACCCTGTGCAGAAATGAGAGAAGACAGTGCTAGAGTCTATGAAAACGTGGGCCTGATGCAACAGCAGAAAAGTTTCAGATGAGAAAACCTGCCAAAACTTCAGCACAGAAATAGATGTGGACTTTCACCCTCTCCCTAAAAAGATCAAGAACAGACGCAAGAAAGTTTATGTGAAGACAGAATTTGGATTTGGAAGGCTTGCAATGTGGTTGACTACCTTTTGATAAGCAAAATTTGAAACCATTTAAAGACCACTGTATTTTAACTCAACAATACCTGCTTCCCAATTACTCATTTCCTCAGATAAGAAGAAATCATCTCTACAATGTAGACAACATTATATTTTATAGAATTTGTTTGAAATTGAGGAAGCAGTTAAATTGTGCGCTGTATTTTGCAGATTATGGGGATTCAAATTCTAGTAATAGGCTTTTTTATTTTTATTTTTATACCCTTAACCAGTTTAATTTTTTTTTTCCTCATTGTTGGGGATGATGAGAAGAAATGATTTGGGAAAATTAAGTAACAACGACCTAGAAAAGTGAGAACAATCTCATTTACCATCATGTATCCAGTAGTGGATAATTCATTTTGATGGCTTCTATTTTTGGCCAAATGAGAATTAAGCCAGTGCCTGAGACTGTCAGAAGTTGACCTTTGCACTGGCATTAAAGAGTCATAGAAAAAGAATCATGGATATTTATGAATTAAGGTAAGAGGTGTGGCttttttttttttcttttttCCAGCCGTTGACCAATTATAGTTCGGCTGTTGACTGAGAAGTTTGTGGTGGGAAAACGTTTGCCATATTTTCTTTGCATTTGAATAATTGTCTTGTACTTAGAAAAAAGGCGTCTATGAATGACCAGTGTTTTTGGTCGCCAAAtgttgctgacaaacttatcccaaaactttagtggcttaaaaaaacctgcccccaactgttagtcaatctgagctgggctcagctgggctgttcttctgccagcctgcaggtggccactcatgtggtcagcaggtcggcggagagactgggatggctgggcttctctctctgcctgcagtcctgagtctctccttcttcgtgtagtctctttcagtggcctggctggcagggtagctagacctctcacatgcagctcagagctcccaagagctcaaaagcagaaatggccaggccttctgaaaacttaagtccagaattgtcacagtgtcccttctacttccctctattgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgatgGTTTTTTCTAATCAGAAGAAAGCTGGGGTATGCCCtctacttactaaacaagtcacaagcccagctcagattcaagaaaagggtgtgaagtagaGGTGCAGTTAAGTGGGGGGCCACTAGTCTAACAGACGGTCACAACCAGTGCCATGGAAAACCAAGGATATTAGCAAAAGCAGAAGTTGCTAGTGACCTTGGGAAGCCGAAGCTGCTTACAGTAGCTGGGACAAGCTGAAAGTCAGACTAAGAAATAAAGAGAGGGCCTTCAAGAAGCTTCCTGAATGATTTCTGCTAGCCCTGAGCCTATTTTTGGAACCAGCACTTGGGGAAACTGATCTTGTGAGGATGGATGTGTTTAGGGACACAGGGCTTTTGAGAGCAGCACCACCCCACTGGGGCATCCCCAGACTTGGGAAACGTGACTCTTTCTTAATGCCACTGGGTTTTAGTCAGGCCACAGTGAGAAGGAACAGCCCTAACAGGCCTCCAGCCAGGTTGAATGAGCTCATTTTTGTTGTAGCCAACCAGTAAGATTTGCTAATGTTCTACATTAAGTGCCTTCTCCAAAGACATCCCTCTTTGCCTCATATGTTGAATCATCCAGTGCGGATATTTCAATGAAAATATCATTGGTTGACTTTTGTGATGGTAATAATGCTATGGCATCTTTGCCATGAAGTTGTGGCCTCCTTGGATTCTTCTGACTTTGGCTTCTGAAAGGAAGGCCTAGATCCAGCCCTGGTGGTAGTTCCTTTCTGAGGTCTCTCAGTCCCTTGAGACTTTGGGGTAGTTTGGCTGCCATTCTCACTGACAAAATGTATATCAGCCCCCACCTCCACCCCCCAATATTCCTTGAACTTTGAATTGCTTCAGAACACAGGTGTGGCCTGAAGGTATTCCCTTATTAGGGAAGTGTCACTGCTGTCTTCTAGTCAAACTTGTAAAGAAAAAGATTCCAGTTCAGTATTTGCAGCAAGAAGCTTGAATGCTGTTCTTTTTATCGCATTGTTACATCGACTCATTCTCCATTTTGCTTTGGTTTTGTCTTGACTTGACTTGACTTTGGGGGTAAAGTCTTTCACCAGCACACAAGAGTTTGATTGTACAAATATATCTTCTGCATTAACATCTCTGCCTGTTGCTTAAGATCAGTTGCTTTTATACTCAGAATGGAAATACCTGATCTTGGCTAGTTTTGTTATAAGATATTGATTTCATTTAGATTTCCCTCCACGAGGTCAGCAAACTATCATGTTCTTATGTAAACTTAGGCCAAGGCCAGAGTTATCATAGTCCCTAGGTTGCTACGGCTTATCATGTGCTTGGTAAAAGGTGATCGCAGGTTCTCAGACGAGTTTACTTTACATGAGATGGAATCAGGCAGAGAGGCTGGGATGATGGAGAAAGCTCGAGGTGAAGTTTTAAAAAAAAAGTTGTGGAAAGGAAAGTTCCAAAGAGGTGGTTTCTGAGGAAGTCAGAGCGCCCAGGGCCAGAGCAGTCAGTAATGGGTGAATGAGGTTGTTTGGAAAGTCGGTGTGACAGACACATGGATGCCATCTACTTCTAGGTTGCTGGTGGGTATTAAATATGCACAATATTCCATAGCTCACTGAGGATTTTAAAATTATAAGCATAGGATTTTATATTTTGGGGTGAAAGAATTATCTGGCACATTAGGTATTGGAGTTTAAAAAAAAAGCCAAATTTCACAGTCTTAATAACTTTTTTTAAAAAAAACTAAAAGGCGCTTCATGTCCAGTGTGTGGCCCTTCTGAAACTTATGGTCATCTCTCCCACTGAAACCAAGGTCTTTTCAAATGTGGCTAAATGGGGATGAGGAGAC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>NM_001374625.1
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