Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Hnrnph1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr11) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1
Also known as E430005G16Rik|Hnrnph|Hnrph1
Coordinate chr11:50266084-50277355
Strand +
Gene summary Predicted to enable RNA binding activity; enzyme binding activity; and identical protein binding activity. Acts upstream of or within cellular response to interleukin-7. Predicted to be located in cytosol and nucleus. Predicted to be part of catalytic step 2 spliceosome. Predicted to be active in nucleoplasm. Is expressed in brain; gut; liver; metanephros; and respiratory system. Human ortholog(s) of this gene implicated in Sjogren's syndrome. Orthologous to human HNRNPH1 (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Hnrnph1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Hnrnph1P5 chr11:120997105-120997317 - Intergenic
ENSMUSG00000082510 UCSC
Hnrnph1P3 chr4:48344364-48344558 - Intragenic
ENSMUSG00000081953 UCSC
Hnrnph1P4 chr6:117901620-117901814 + Intragenic
N/A UCSC
Hnrnph1P7 chrX:133505680-133507007 + Intergenic
N/A UCSC
Hnrnph1P1 chr2:151638990-151639663 - Intergenic
ENSMUSG00000083088 UCSC
Hnrnph1P2 chr4:17044859-17046054 - Intergenic
ENSMUSG00000082552 UCSC
Hnrnph1P6 chr14:33940029-33940677 + Intergenic
ENSMUSG00000115299 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001362522.1
GACGCAAGTGGGGCGGGGCCGGCAACAGGGTGCGCGTGCGCAGAGCTTGCTGGAAGGGCTTTATTTAGCCTGCGCAGGCGCCCGCTTATCATTTCTCCTCAGCCACGCCGAGGCTTTTTGTGGAGcCCCGCAATCTGTGTGGACGCCAGGACCACCGAAGGGACGATGATGCTGGGAGCAGAAGGCGGAGAGGGCTTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCCTGCTCCGCGGATGAAGTGCAGCGCTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCTtgaaaaaagacagagaaactatGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACAGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTCCCTTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGtatattgaaatatttaagaGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGACCCACCACGAAAACTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGACAGACCTGGGGCTGGCAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGTTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGgcTATGGAGGCTATGATGATTATAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGTGGCTCTACTTTCCAGAGTACAACCGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCATACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATtttttttcaCCACTCAACCCTGTGAGAGTACATATTGAGATTGGACCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTTGAGTTCGCAACCCATGAAGATGCTGTTGCAGCTATGTCAAAAGATAAAGCAAATATGCaaCACAGATATGTAGAGCTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGGTAGCCAAATGCTAGGAGGCATGGGTTTGTCAAACCAGTCCAGTTACGGTGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGCGGATATGGTAGCCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAATGGAAGCCGAGCATCTATGGGCGTGAATGGAATGGGAGGGATGTCTAGCATGTCTAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATTTTGATCACTGACTCTTGGTcaaaaagaaattttttaaaaaacccctCAGTTTAACAGATTTTGCAATCCATCCAGCCTTGTGGTTTTATGCCTGCTCTTAAGTGAACATTGGCGTCGCTCAAAGAAGGCTCAATGTTGAGCATAGCAGTCACCTAGGATGATAGAGCAAAGCTGAGTGAACTGTAACTGTTAAACTTAATTCCTAGCTTTTCTCTAGTTACTGTAGGATGTACGTAAGCAGTAAGTGTATTTAGGTTAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCTCTTATACATACATTGAACACTGTTGATGCATGTTGAAAAACATGCTTTTTTGTAAAACTATAGGAGCTGCGTCTACAATTAAAGTGATACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAAATTTATTTGATAACCTGTAAGGCACGTGAGtttaaagctctttttttttatttttaagttaatggAGAAGTTTTGAGAGACAATACCATTATTTTTTAGGATTTTTGGTCTTAGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAGTCTTTCATTGTATTGTGATTTCTTTTTAGGTGTATTGCGCTAAGTGAACCTTGTCAAATAAATCTTCCTTTTAAAAGCTA
>NM_001362524.1
GACGCAAGTGGGGCGGGGCCGGCAACAGGGTGCGCGTGCGCAGAGCTTGCTGGAAGGGCTTTATTTAGCCTGCGCAGGCGCCCGCTTATCATTTCTCCTCAGCCACGCCGAGGCTTTTTGTGGAGACGCGttcctgacccccacccccaccccgcagcCCCGCAATCTGTGTGGACGCCAGGACCACCGAAGGGACGATGATGCTGGGAGCAGAAGGCGGAGAGGGCTTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCCTGCTCCGCGGATGAAGTGCAGCGCTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCTtgaaaaaagacagagaaactatGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACAGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTCCCTTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGtatattgaaatatttaagaGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGACCCACCACGAAAACTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGACAGACCTGGGGCTGGCAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGTTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGgcTATGGAGGCTATGATGATTATAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGTGGCTCTACTTTCCAGAGTACAACCGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCATACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATtttttttcaCCACTCAACCCTGTGAGAGTACATATTGAGATTGGACCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTTGAGTTCGCAACCCATGAAGATGCTGTTGCAGCTATGTCAAAAGATAAAGCAAATATGCaaCACAGATATGTAGAGCTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGAACACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGCATGGGCTTGTCAAACCAGTCCAGTTACGGTGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGCGGATATGACCAAGTTTTACAGGAAAACTCCAGTGATTTTCAATCAAACATTGCATAGGTAGCCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAATGGAAGCCGAGCATCTATGGGCGTGAATGGAATGGGAGGGATGTCTAGCATGTCTAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATTTTGATCACTGACTCTTGGTcaaaaagaaattttttaaaaaacccctCAGTTTAACAGATTTTGCAATCCATCCAGCCTTGTGGTTTTATGCCTGCTCTTAAGTGAACATTGGCGTCGCTCAAAGAAGGCTCAATGTTGAGCATAGCAGTCACCTAGGATGATAGAGCAAAGCTGAGTGAACTGTAACTGTTAAACTTAATTCCTAGCTTTTCTCTAGTTACTGTAGGATGTACGTAAGCAGTAAGTGTATTTAGGTTAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCTCTTATACATACATTGAACACTGTTGATGCATGTTGAAAAACATGCTTTTTTGTAAAACTATAGGAGCTGCGTCTACAATTAAAGTGATACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAAATTTATTTGATAACCTGTAAGGCACGTGAGtttaaagctctttttttttatttttaagttaatggAGAAGTTTTGAGAGACAATACCATTATTTTTTAGGATTTTTGGTCTTAGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAGTCTTTCATTGTATTGTGATTTCTTTTTAGGTGTATTGCGCTAAGTGAACCTTGTCAAATAAATCTTCCTTTTAAAAGCTA
>NM_001362532.1
GACGCAAGTGGGGCGGGGCCGGCAACAGGGTGCGCGTGCGCAGAGCTTGCTGGAAGGGCTTTATTTAGCCTGCGCAGGCGCCCGCTTATCATTTCTCCTCAGCCACGCCGAGGCTTTTTGTGGAGcCCCGCAATCTGTGTGGACGCCAGGACCACCGAAGGGACGATGATGCTGGGAGCAGAAGGCGGAGAGGGCTTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCCTGCTCCGCGGATGAAGTGCAGCGCTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCTtgaaaaaagacagagaaactatGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACAGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTCCCTTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGtatattgaaatatttaagaGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGACCCACCACGAAAACTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGACAGACCTGGGGCTGGCAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGTTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGgcTATGGAGGCTATGATGATTATAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTATTGTTTTTCAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGTGGCTCTACTTTCCAGAGTACAACCGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCATACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATtttttttcaCCACTCAACCCTGTGAGAGTACATATTGAGATTGGACCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTTGAGTTCGCAACCCATGAAGATGCTGTTGCAGCTATGTCAAAAGATAAAGCAAATATGCaaCACAGATATGTAGAGCTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGGTAGCCAAATGCTAGGAGGCATGGGTTTGTCAAACCAGTCCAGTTACGGTGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGCGGATATGACCAAGTTTTACAGGAAAACTCCAGTGATTTTCAATCAAACATTGCATAGGTAGCCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAATGGAAGCCGAGCATCTATGGGCGTGAATGGAATGGGAGGGATGTCTAGCATGTCTAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATTTTGATCACTGACTCTTGGTcaaaaagaaattttttaaaaaacccctCAGTTTAACAGATTTTGCAATCCATCCAGCCTTGTGGTTTTATGCCTGCTCTTAAGTGAACATTGGCGTCGCTCAAAGAAGGCTCAATGTTGAGCATAGCAGTCACCTAGGATGATAGAGCAAAGCTGAGTGAACTGTAACTGTTAAACTTAATTCCTAGCTTTTCTCTAGTTACTGTAGGATGTACGTAAGCAGTAAGTGTATTTAGGTTAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCTCTTATACATACATTGAACACTGTTGATGCATGTTGAAAAACATGCTTTTTTGTAAAACTATAGGAGCTGCGTCTACAATTAAAGTGATACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAAATTTATTTGATAACCTGTAAGGCACGTGAGtttaaagctctttttttttatttttaagttaatggAGAAGTTTTGAGAGACAATACCATTATTTTTTAGGATTTTTGGTCTTAGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAGTCTTTCATTGTATTGTGATTTCTTTTTAGGTGTATTGCGCTAAGTGAACCTTGTCAAATAAATCTTCCTTTTAAAAGCTA
>NM_001362533.1
cCCCGCAATCTGTGTGGACGCCAGGACCACCGAAGGGACGATGATGCTGGGAGCAGAAGGCGGAGAGGGCTTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCCTGCTCCGCGGATGAAGTGCAGCGCTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCTtgaaaaaagacagagaaactatGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACAGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTCCCTTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGtatattgaaatatttaagaGCAGTCGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGACCCACCACGAAAACTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCCTATGACAGACCTGGGGCTGGCAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGTTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGgcTATGGAGGCTATGATGATTATAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGTTCAGATAGATTTGGAAGAGGAATGTCTGACCACAGATATGGGGACGGTGGCTCTACTTTCCAGAGTACAACCGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCATACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATtttttttcaCCACTCAACCCTGTGAGAGTACATATTGAGATTGGACCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTTGAGTTCGCAACCCATGAAGATGCTGTTGCAGCTATGTCAAAAGATAAAGCAAATATGCaaCACAGATATGTAGAGCTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGGTAGCCAAATGCTAGGAGGCATGGGTTTGTCAAACCAGTCCAGTTACGGTGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGTGGTTATGGAGGTGGTTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGCGGATATGACCAAGTTTTACAGGAAAACTCCAGTGATTTTCAATCAAACATTGCATAGGTAGCCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAATGGAAGCCGAGCATCTATGGGCGTGAATGGAATGGGAGGGATGTCTAGCATGTCTAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATTTTGATCACTGACTCTTGGTcaaaaagaaattttttaaaaaacccctCAGTTTAACAGATTTTGCAATCCATCCAGCCTTGTGGTTTTATGCCTGCTCTTAAGTGAACATTGGCGTCGCTCAAAGAAGGCTCAATGTTGAGCATAGCAGTCACCTAGGATGATAGAGCAAAGCTGAGTGAACTGTAACTGTTAAACTTAATTCCTAGCTTTTCTCTAGTTACTGTAGGATGTACGTAAGCAGTAAGTGTATTTAGGTTAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCTCTTATACATACATTGAACACTGTTGATGCATGTTGAAAAACATGCTTTTTTGTAAAACTATAGGAGCTGCGTCTACAATTAAAGTGATACATTTGGCATGTTTGTTAATTCTAAATTTATTTGATAACCTGTAAGGCACGTGAGtttaaagctctttttttttatttttaagttaatggAGAAGTTTTGAGAGACAATACCATTATTTTTTAGGATTTTTGGTCTTAGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAGTCTTTCATTGTATTGTGATTTCTTTTTAGGTGTATTGCGCTAAGTGAACCTTGTCAAATAAATCTTCCTTTTAAAAGCTA