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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name RAP1B
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name RAP1B, member of RAS oncogene family
Also known as K-REV|RAL1B
Coordinate chr12:68610899-68671901
Strand +
Gene summary This gene encodes a member of the RAS-like small GTP-binding protein superfamily. Members of this family regulate multiple cellular processes including cell adhesion and growth and differentiation. This protein localizes to cellular membranes and has been shown to regulate integrin-mediated cell signaling. This protein also plays a role in regulating outside-in signaling in platelets. Alternate splicing results in multiple transcript variants. Pseudogenes of this gene are found on chromosomes 3, 5, 6 and 9. [provided by RefSeq, Oct 2011]

Retrocopy(s) from RAP1B

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RAP1BP2 chr3:104062958-104065069 + Intergenic
 ENSG00000214405 UCSC
RAP1BP3 chr6:117431536-117433224 + Intergenic
 ENSG00000219703 UCSC
RAP1BL chr5:76170084-76174354 - Intragenic
 ENSG00000254893 UCSC
RAP1BP1 chr9:18717297-18718686 - Intragenic
 ENSG00000236857 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001010942.3
GACATCGCCAAACCTCGCCCAGATTCAGGCGTGTAAACCAGCCGGAGCGGCGCGGCAGCGGCAGGACCGCCGTGGCGCCTAGAGTAGCGACCCGGGGGGAGCGCGGGGCGACGCTGGCTGCAGGGACCCGGTGACAGCGTGAGAGGTACTAGGTTTTGACAAGCTTGCATCATGCGTGAGTATAAGCTAGTCGTTCTTGGCTCAGGAGGCGTTGGAAAGTCTGCTTTGACTGTACAATTTGTTCAAGGAATTTTTGTAGAAAAATACGATCCTACGATAGAAGATTCTTATAGAAAGCAAGTTGAAGTAGATGCACAACAGTGTATGCTTGAAATCTTGGATACTGCAGGAACGGAGCAATTTACAGCAATGAGGGATTTATACATGAAAAATGGACAAGGATTTGCATTAGTTTATTCCATCACAGCACAGTCCACATTTAACGATTTACAAGACCTGAGAGAACAGATTCTTCGAGTTAAAGACACTGATGATGTTCCAATGATTCTTGTTGGTAATAAGTGTGACTTGGAAGATGAAAGAGTTGTAGGGAAGGAACAAGGTCAAAATCTAGCAAGACAATGGAACAACTGTGCATTCTTAGAATCTTCTGCAAAATCAAAAATAAATGTTAATGAGATCTTTTATGACCTAGTGCGGCAAATTAACAGAAAAACTCCAGTGCCTGGGAAGGCTCGCAAAAAGTCATCATGTCAGCTGCTTTAATATACTAAATGCATTGTAGCTCTGAGCCAGGTCTGAAGAACTGTTGCCCAATTCAACAGTGCCAGCATTCCAACTTTGTTAAACCTACCAACATCTTAAATGGACTTTCCTGTGGTGGTACCCTTTAAGAGGCGGATGAAAGCTACTATATCAGTTTGCACATTCTAATCACTTTCCAGTATCACAAGAGAGATTTTTACTTATATAATAGTCCTAGAGTTTGCAGCTGGTAAAACCAGAGGCTACATCCAGTATTACTGCTAAGAGACATTCTTCATCCACCAATGTTGTACATGTATGAAAATGGTGTACTGTATACTTTAACATGCCCCATACTTTGTATTGGAGAGTACAATAATGTAAATCCTAAAAGCACCACTATTTTAGCATAATAAAAGAAAGTCCAAAGAGCTCCTATATAGACTACTCCAGATAACTTCGCTTCTTTGATACTTGTAGCTTATTGTAATTTTTTTTAAGAAATTCAAGGTCATTATTATTGTACAAAATAAGCGCTTTGATTAACACAGCTATATAGTTTTTTTAATTTTTAAAAAACCTGTGGAGACGGTGATCTTGTCTTTAAAACATGATAGTCCTTTCAGTATAATGTCTTAGATTAAAGACGTTGCCTTTAATATCTGTTGGGAAGGAAATGTCCAGACTTTTCAAATCTCTTATTATATGTTTCCTTTTTTTGTTTACATAGGGAACAATGTTTATAGTCGTGTGTACAGTGGGGGTCTACAACAAGAAGTGTATATTTTCAAACAATTTTTTAATGATTTAACAATTTTTGTAAATCATTTTCAGGCTTCTGCAGCTGTAGATTCTCACTGTGAATCCCTTGCTTGCTCATGCATAAGTGTATTTGCAATACCAAATATACAGGTTTAGTATTTTTGCCTGTTAGTGATTGTTTCACATGTGTAACGTTTTGGTTGAGATGTTAAATGGTGGACGAGTACTGTGGATGTGAATGTGGGAAGTAATTTTAATCATATGTAATTGGTCACAAGGCCTAATTTGCAGTAACTATTGCTGTTTTATTTAACAATGCCTTGTTGCTTTGTATGCATTAATGTTTGGATGTAAAGATTGTGTGTCTATCCAACAGGGAGCCACAGTATTTAAATTGACCAACCTAATGTTACAACTACTTTGAGGTGGCCAAATGTAAACTAAAAGCCTTAATTAAAGTGGTGCAATTTTGTATAACTTAGCATCAGTAGTTCAATAAATTTGGATTGCCATGCAAGGGCTTGCATTATAATTACTTGCCACTTGAATGTGTTTTGTGTAATGTTTTAACAGTGCTAGTAAATAAATACGGGTTTACCCTGGTTTTAATTGTAATAGGTGCATTTTACACAGCATGGTTTCATAATTTAACATCTGGGCAAGCCAGACTCATTAATTACAGGAATAAGGAAGTAGCGAGTTTTCTGGTATTGTTTGAATATCCACATAACCACCTTTTGAACTTTTCCTTGAGAAATAATTTTGTAAATCAAGCAGTATTACTTACGAATAAATGCCTTTGGGTAATGTTCAGTAGCTATTTGATGAGGTAGGTAAAAGAGGAACGATTTAACATACTTTCATGGATGTTACACTATGGATTTTTTAAAATACAGGATTGAAGTTAGAATATTGTGGTTATAAAAATCTTTGAGTGATGTGGATTAAGCACTTAGAGAATCGATATTTTTCTTAAATATGCTATAATTGAATTCTGTAAGAACTGAATTCTTATAGAATTATTTTAAAACTTTTTAAAAATTGTAAAGCTCTTAAAAAACTTTTTGAAAGTATTTGCCAGCTACTGGAGCAATTAATCAGTGATAATATCTAATAGAGGGGTATCTGCTAATCCCCTAAATACACGCTGTTTGAATGATACATTTTTAAAGGCTTTCATGTTAAGAAAAAGTCTGATTCTTTACAAAAGGGACTTGTTTTGGCAGAACTGGTTTTATTTATAATCATTTGGGAAAAAAATTAAGCCCAAAAAACTGGGACTGTGAAACACTAAAATTACTTCAATTTACTATGTCCTGTTACATCCATTGATACCGCCATTATTCAATAATTACTtttaataaatgtttgctgcctaccagctatgtaccaggcccagttctaggcTCAAACAGCTAAATattcattcattggacaaattaagtacttaagtataaaaattgttctaggcctaaggatgtagcagcaaccaagatcaactataaaatgctgccctcctagaatttatattctattgAagagtttctcagcctcagcactattgatgttttatgtttgataatgtattctggcgactctcctgtgcattataggaattttaatatctgcccactagatgccagtcacaccaccccagcccccaagttgtggcaaccaaaaatgtttccagacattgccagatgttcccCAGTTGGATTGTTGGGGGACAAGGGAGGTGAACTTGGAGGGCAAAATCACCCTGGTGAAGAACTACTGCTCTGGTGGGAAACAACACATTAGTTACAGATGAGTGTTAGGGTTACAAGATGGATGGTTTACTATatagtgaataagaatataaagtttggagccagacttcctgggtttttaatcccagctcttccagttcctactatatgcctttggttgggtgccttggtttcctcatctgtaaaatgagaatgataatacctacttcataggAGAGTGAAATGAATGCCAGTGCTATCCTCTAGGTCtatatatatatatatatatatatattatatatagtacatatatagagagagtatatatatatatGTAGTACAGTGGAGGTCTATATAATACTATATATATAATTTATTTTTTTCAATGCTGATAGGAATAAGGCTGTGGTTTGGCAAAAAGCACCATTTTCTCCTATACAAAATAGTAACTGCAGTTTGGGAGCACAACTCATGTAGATTGACTTTTCTGGTGCTTAATGGGAAAATACTAAAATAATTGAGTCAGAAAAGGCATGAATTCCTTTTCACGTCCCCAAGGATACTTGAAGAAACTTGAGTTTTAGGAGAAAATCAGAGTGGTCTTTCACTTACATTTTTCTAAAAAGTGTAAAAACCCTGTATTGACTTTCTTGTTGATTCAGTTGTTTCTTAAACGTAAATAGCTCATCTTTACCATATGTGGGCATTACAAATAGAAATTTTTAAAATTCCATTTATAAAATGAAGTTTTGCCGTTTTTTTTTTTAAATCATTCCGTCTTTAGTTGTGGGACAGCAAACTTAGAATCGAAACTCATCACTACAACTTTTCTTTGAGTTAAACTCTTATCTGTGTTTTCATTGAATTTAATCTCCATCTATTCTATCTCTTCTTAAATCTTGGAAATGTAAAAGGGAGTTATAGTGTTTTACAATTAATACTCTTACTATTACCTTAGAAGCCTTAAAAGTGCTTGCAGGCTTGTCTCATAATCTGTCAGTGAGCCTTAACATTGTGATTTGTAAGACTAAAATTTTTTTTTCAAACAAAACAAATCTGAcagcctgggcaacatagaccccatctctacaaaaaaaaatttttttttaattagctgggcatggtggtgcacgtctgtacctgtagtcccagctattcagaaggattgcttgatcccaggagatcaaggatacagtgaactgtgttcgcgccactgcacccccacgatggcaatagagtgagaccctgtcttagaaaaaaaagataaaTAAGTCTGTTCTATTTGTTACAGTGCATCAACACATTTGAATTTTCtttttttttctttttcttttttttttttgagactgagtttcgctcttgttgcccaggctggcgtacagtggtgcgatcttggctcaccccaacctctgcctcccaggttcaagcaattcttctgcctcagcctcctgaatagctgggattacaagcatgcaccaccacgcctggctaattttgtattttttggtagagatgaggtttctccatgttggttaggctggtttcgaactcccgacccaggtgatccgcctgcgtcagcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagccaccgcacccagccTAATCAATACATTTGATATTTCAAGAATACATGAGAGAAGAGAGGTAGATTGAGAACAGAACTAAACTTTATATATGTTTCCTTAACTATTGGGAGGAAAATGGATGAGTCTGTGTTGGGATACCTGTTGAAACAAGACTACTAAACAGATTAATCAACTA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