Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SCOC
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name short coiled-coil protein
Also known as HRIHFB2072|SCOCO|UNC-69
Coordinate chr4:140257308-140385728
Strand +
Gene summary This gene encodes a short coiled-coiled domain-containing protein that localizes to the Golgi apparatus. The encoded protein interacts with ADP-ribosylation factor-like proteins. Pseudogenes of this gene are found on chromosomes 1 and 14. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Apr 2009]

Retrocopy(s) from SCOC

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SCOCP1 chr14:60159031-60161302 + Intragenic
ENSG00000258896 UCSC
SCOCP2 chr1:150780277-150784473 + Intergenic
ENSG00000236713 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001153446.1
ACTTCCGGTTAAGAATGCAACACTCAGGTCTGAAAATTGAACAAGATGGACGGGTCCAGGAAAGAGGAGGAGGAAGACAGCACATTCACCAACATTTCTCTTGCAGATGACATAGACCATTCCTCAAGAATTTTGTATCCAAGGCCCAAAAGTTTGTTACCCAAGATGATGAATGCTGACATGGATGCAGTTGATGCTGAAAATCAAGTGGAACTGGAGGAAAAAACAAGACTTATTAATCAAGTGTTGGAACTCCAACACACACTTGAAGATCTCTCTGCAAGAGTAGATGCAGTTAAGGAAGAAAATCTGAAGCTAAAATCAGAAAACCAAGTTCTTGGACAATATATAGAAAATCTCATGTCAGCTTCTAGTGTTTTTCAAACAACTGACACAAAAAGCAAAAGAAAGTAAGGGATTGACACCCTTCTGTTTTATGGAATTGCTGCTGATCATTTTTTCTTTAAAACTTGGATAGATTCCAAAAGTTACAGTACCTTTGTGGCTTCATTGAATATTTATGAAGATAATGTCAGATGTAGACAAAAATAACACAATAACAGGAGACTTCCATAAGTTTGTGTATTATGTTAGTCTATGAAAACGTGCAAATGTATTGTAGAGACTTTATGATTAGAATTGCATATATTTATGAAACTTAAAGATGAATGTTTTATTGAATTTGTAGGTTTAGCACTGTCTTTTATTATAGGATTAGTAAGATATACAAGAAAATAACCACCGTGTTGTGAAAAAGTGACCAAAATCATGTACTAAATGCACAGCTTTATGTACCCTGTCCACCATCTTGTGCCTCTTCTCCATTTGCCTCTTCCTTCCTATTTCCCTTCCGCTAAGGAAAAAAATTGGTGTCACATTTGTAAAAGTAATTTTAATAGTTAATCATCTCTGAGAGTAACCTGTATTTTAATTGTTGAAACTTAACCAAAATAAGATACTGTCTCAGCTAGGGCTTGTCATTTGTGTATTTAGTGTTAAGATAGGAATGCTAGTGTCTCTTTAATTAATTGGAAATAGATGGAGGCTAAAAATGAAGGTTTTTCTTTGAAACTGAATTAACTTGGGAATATTTGTTGTTAAAAACTTCTTTTTGCCCAAAATAACTCATTTTGTATTATCTGAAAATATATAATTTCTGGTCATGTGTATGTTAAAATAGAAAATTTTGAGGAAAAATGGAAATAGGGTGGAAAAGTACTCGGTAAACAGTAGTAACCAAATATTTTCACTCCAGATTTGTGTTTTCTCTGGCACAGAGTAGATCTTTTGGGAAATATATATGAAAGTGGATTAAGTTTGACTACCCTTATGTTAGCCACATCTGGATGAGAACAGTTACAAAGAGTTTGGTCTCTAAGTTGATTTGTACCCAGTGGGTCAACTTCTGCAAAATTCCGTAATGGTGTATTAGTATTAGAATAGTGAATAAAATGGGAAAGTTATACATGTATACTTATTATCTTGCTCAGTATTTTATCTCACTTGTTCTAGAATTTTCTGTAAACCCTGCTACTGGGTTTGAAGAGTTTTAGTCATCCTTTAACAATTTTTAAAAATTTAGCTTCTAGATTCCATTTGGTAAGGAAATCAATATTGGAAGTATTGCTAAAATCTTATAATATGAAAAGAGATCCACTAATGTAGCTTAAGGTTATTAGATTTGGGCTTTTAATCATGGAATAATCTTATGTATTGGTGTAAGAGTTGATGAATGACTTTAGCTGTGTGAATATATAATAGTCAAACTGCAAACATTTTGCATCCCTTTTGTGACCTAATTTACAGACATTTAAATTGTGTTGCAGTTCTGCTTTGCCGTTTAATAAAAAGCTATTTCAGAGGTTG
>NM_001153484.2
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