Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Eloc
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name elongin C
Also known as Tceb1
Coordinate chr5:2042991-2059357
Strand +
Gene summary Predicted to contribute to ubiquitin-protein transferase activity. Involved in positive regulation of transcription elongation from RNA polymerase II promoter. Part of VCB complex. Orthologous to human ELOC (elongin C). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Eloc

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Tceb1P3 chr6:60818399-60818724 + Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P1 chr4:162005874-162006851 - Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P2 chr5:129004050-129004488 + Intragenic
N/A UCSC
Tceb1P4 chr6:78586006-78586657 - Intragenic
N/A UCSC
Tceb1P6 chr12:19254161-19254624 - Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P7 chr16:21767701-21768366 - Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P9 chrX:71321375-71321799 + Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P5 chr8:72720705-72721050 - Intergenic
N/A UCSC
Tceb1P8 chr20:27352180-27352669 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001270561.1
TTTGTTTTACTGTTGAAATCAGTCTCTAGTCCCAGGAGAGAGCCCTCGCCCGTTTAAGCTCTAGGACCGCGAAAAGAGTTTACGTTCCGCACAACTTGGGTAATCTCTGCCTGGCTGGGTACATTGGCTCATGATGCATATTTCTACCTATTACTTTTTTGCATGAAAGGAGGTATCTAGTGCCAGGAAACTAGTAACTTCCTCTGGGATCAAATAGAATTTTATAAGAACACAATGGATGGAGAGGAGAAAACCTATGGTGGCTGTGAAGGCCCTGATGCCATGTATGTGAAATTAATATCTTCTGATGGTCATGAATTTATTGTAAAAAGAGAACATGCATTAACATCAGGAACAATAAAGGCCATGTTGAGTGGTCCAGGTCAGTTTGCGGAGAATGAAACCAATGAGGTCAACTTTAGAGAGATCCCTTCACATGTGCTATCGAAAGTGTGCATGTATTTTACCTACAAGGTCCGCTATACTAACAGCTCCACTGAAATTCCTGAATTCCCAATTGCACCTGAAATTGCACTGGAACTGCTGATGGCCGCGAACTTCCTAGATTGTTAAATAAAATAAATTATAATAAACTGTTAATTTTTTTCAGTATTTAATACCTGTAGTTCAGTTAGTAATTTTTCACATGTAGCATGTTGCCTGTATGAAGCTGAACTCTAAAGTGAATCGCTGAGCAGATTTCTTCTGTCATTTGCATAGCAGAGTTGAAATTTGTTTGCTACATCAACAAATTAAGGAAGTTTCACAAGCCAAAAAATAAATAAATAATGCCAGTTTATAGGTGGTTTGCTTTCTCCTTTGGATGTGACCTTTAAAGTTATACCTGATATAGCAAATCCTGGAATGTAAGCGTAAATGAATATATTCTACAGGTAAATACAGGGGCTAAGGATTTTTATGTTTTTAGTGTTTTTTTAAGAACCAGTTCTGATCTTAAGCCACTGAGCATTATTAGAATTATGCAAATAATTACATGAAAAACATGTTTATAACTTAGCCGAACCTTGATTTTTGTAACTCAAAGAATAAGAGTTGAAATTTCTTATGTGTTTTTTGATAAACTGCAGTATTGTTTAAGTGCATCTTGTGTTTTGTTTATTGCCACAATTCAAGTACTTTATTTAAAAGCAATTTTGGAAGCTAACCAGGTATATTTTTTAGAATAGTAACTGAACTGTAGCTGTCTAGTCAAGTAAATGATGACTTAAGAGTTCTGTGCACTGTGTTTGAACATTCTGAAGCATGACTTCTATCATCAGGGTGTCTCAAGTTTCCATTCTTCATGGTTTCTTGGAGTAACACTTCATGGTGTTGAGATGTGTCCTAAACACTTCATGAGCTTGATCCAAACTTAGAGTCTAGGTGTGCCAAGCTCTTCTAGTCTTCCTGCATCACTGGAATGCTATGAAAATAGTAATGGAGGGCTGTGGCACGAGCCCTGTGCTCTTAGATGTACCACCAGATAGGTACCCTCCTAGCGTATCTTCCAGCCAACCATACATACTAAAAGCCATGGGTCTGCTGAAGTCACATTCATGAGTCACATTCAGCCTTTAAATGAGCAGACAAAATCTCTGAATGTGTTGGCTAGATCTCTGCCTTGGCATGGTGGAGCGCTGAAGTGAATAGGATGGTGGGATGTGGTTGCCTCCAGTGGCTGTCACAGGTCTGTCTGCAAGCCTTCTACATTCTTCCCAGGACCGGAAGCTGCAGAAACCGTAACTTCTCAGCATGGAAGTGGTTCCATGTAAGTTGGTTTATTTTTAGTAATGTTTCAAGGCATGCTGGCACACAGCTTAGTACAGTGTTCTGGAAGTACAGGAATTGTGTTTCGGGCTACAAGTATTGGAGACTCAGTGGTAGTGCCACTGTGACAAAGCCCTCTGCTTGCTCAGTCTCTAGCTAACGTACTTGCCCTTTCTGTCAGCGCTAATTCAAAGCCCAAAAGACAGTAGCTAGAAAGAAGAGTTAGCTTGAGCCAGTTTTTGCAGGCTACTCTGTGTTCGGTCCAGAGGTAGCCTTAACTTCAGAACATTAAAATTACAACACTCTAGGCAAATTGTATATGGTACAGCAAATGGTACATTGTGTTAATAAACGCTGTATTGGCTGAAAAGG
>NM_022593.4
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>XM_006237724.3
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