Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name GNPNAT1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr14) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name glucosamine-phosphate N-acetyltransferase 1
Also known as GNA1|GNPNAT|Gpnat1|RHZDAN
Coordinate chr14:52775193-52791607
Strand -
Gene summary Enables identical protein binding activity. Predicted to be involved in UDP-N-acetylglucosamine biosynthetic process. Predicted to act upstream of or within cellular response to leukemia inhibitory factor. Predicted to be located in late endosome. Predicted to be active in Golgi apparatus; endoplasmic reticulum; and endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from GNPNAT1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
GNPNAT1P1 chr2:189822133-189824484 + Intragenic
N/A UCSC
GNPNAT1P2 chr8:84828089-84829491 - Intragenic
ENSG00000248978 UCSC
GNPNAT1P3 chr8:121112535-121113937 - Intergenic
ENSG00000271219 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_198066.4
AGAGGCGAGGTGGAGGCGTTGGCGCTGCCACGTCTGGGCCGCGGTTCCCAACTgtggcgcgggcggtggaggaggaggtggggctggcgctgAAGCCGGATCCGGATCCGGTGCTGTGCACACTGGTGGGGGAGAGTCCGACGCGCCTGGCTAGGAGCGCCGACCGCAGGGCCTCTACGGACCTTACTAGAAAAATGAAACCTGATGAAACTCCTATGTTTGACCCAAGTCTACTCAAAGAAGTGGACTGGAGTCAGAATACAGCTACATTTTCTCCAGCCATTTCCCCAACACATCCTGGAGAAGGCTTGGTTTTGAGGCCTCTTTGTACTGCTGACTTAAATAGAGGTTTTTTTAAGGTATTGGGTCAGCTAACAGAGACTGGAGTTGTCAGCCCTGAACAATTTATGAAATCTTTTGAGCATATGAAGAAATCTGGGGATTATTATGTTACAGTTGTAGAAGATGTGACTCTAGGACAGATTGTTGCTACGGCAACTCTGATTATAGAACATAAATTCATCCATTCCTGTGCTAAGAGAGGAAGAGTAGAAGATGTTGTTGTTAGTGATGAATGCAGAGGAAAGCAGCTTGGCAAATTGTTATTATCAACCCTTACTTTGCTAAGCAAGAAACTGAACTGTTACAAGATTACCCTTGAATGTCTACCACAAAATGTTGGTTTCTATAAAAAGTTTGGATATACTGTATCTGAAGAAAACTACATGTGTCGGAGGTTTCTAAAGTAAAAATCTTGTAAGAAAATTGTCAAAGGGGCTAATGCTACAAGGCTACACTCTTCCTAGAGTTGAAATATTTTGTTGCTGCAGCCGAGTGACCTCCATAAATACTGGACTGAAAAAACATTGTAATACTACAAGTATAATGACATTTAGAAGATTACTTTGGGCTGGTGGGACATGCTGTGAATTTAGATTACAAATGAATATTATAAAGGGGATGATTTTTAACCAAAGGAATATATTTTTAACTTGAATCTTTTCTTGCATTGTATTTTTCTAAAAGTTTGGCTTCCTTTCTTGGTAGTCAAGAGTATGGGTAATAAGGAGTTATATGTCTGCTATCTGTGTTGCTCATTTAAAAAAAGTATACATTGAATAAGGCTGTTTATCACATGCATAAAATTAAATATTTTTGTTTCAAAGAAACATCTCAATACACTTAGGGGTGTATTGTTTCCCACATATTAAGTCAGGGTGGATAAATTAGTTATTATAACTAAACATAGTATAGTCCAACATTCGTTGATCCCAATACAGGCAAACAACCTGGTCAACCTTTTGAAGTAGAAGAAATGAAAATTACTTGACAAGATTAAAAGTAAAACAATTTAAATGTTTTACTGAAAGTTTATATAGTATAGTCTATGTAGATAAAAAGTACCACTTGTCTTTTCTGTGAATTATGACTATTCATTTGTTAAAAATACCTAAGAGCAATTATAGTGGGACATCTAAGGTCCTCTGTAAACAGTGAATTAGCAAACCTCAGCCTATGTGTTTCTACCCTGATTTTTTTCTTTTCATGGGTATCTGAAGCCTCTAAGTTTTTTCAAAAATGGAGTATCACAAAATTGAGTGAAACACAATACTTAATGTATTGTACTAGATTGCCAAATTCATAAAATGTTAATGGAAGCTTTTTGATGTGATTATAATGGCACTATTCTGGTCAttatcctattttgattttatttaattttTTAAAGTTGAAGAATTAAATATTTTAATGGTTCTAATCTTTTGCATTCCATGTTGCATTAAACCTGTTTATATGAGTAGTCTTCTGTTAGAATCACATCTGTGCTTTTCTTGAGTCTGCTGTTGAACTATTAGATTAAGTCATAATTCATAAAATTTTAGTTTAATGTGCTCTTTGTAAAATGAAATTGTAAAGAAAATACCAGTGTTTCTCATCCCATTGACTCACACCACGTCATCTGGATTTTGGATTTCCCTCCATGCAGCCAGCTATAGTTGGCTTTCCAAAACAACAGAAATCCTTCACCAATAGAGTGCACTACTTACCTGCTTATAGCCTATACAGACGAACTGATCTGTCCTTCGTGAAACGCAACAAAGCTAGTTCTGTCTTTTCAGAAGTCCTACAACCTTGACAAAGAGTAGTTTTATCAGGTAAATCCTGGTAATTAAAAACGCATGTTTTTAAAAATTAGCCTGGTAAggccgggtgcagtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcagatcacaaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaaaatggtgaaaccctgtctctactaaaaaaaagaaaaattagccagacgtggtggcatgcgcctgtaatcccagctactcaggaagctgaggcgagagaatcgcttgaacccgggaggcaaaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcactccagcctggcgacagagagagactccatctcaaaacaaaacaaaaaaaaTTAGCCTACTTAAAGGCACAACTAAATGCTTTATTACCTTTCTTACCACTGAACAATTTGAGGTAAAATCATTCACAAGGTTGGCACTTCAGTAAATCCCTTTAAATAGTGTTCCTAAGATATCTCTTAAATCCTCCCATAGGAAATAGAATTACAGGTAAGGTACACCATACAAAAATTGTGTCATTGAGGACAATGGTGATCTGTAATTTTAGTTGAGTATGTTTATGATTTTTGAAGCCATATGGTGAGTAAATGTAAATATGAAAAAAGTGCTACATAAAACACTTCTTAAACTTTTTTTTTTTAAAAactgctccttgtggagcaggactaccccataggcagtgtacccacaatagATAGCCttttgttgttgttgttgttgagacaaggtctcgctgttgcccaggctagagcgcaggggcacaatcaccacacactgccgcttcaatctcctgggctcaaatgatccttccacctcagcctcccatgtggctgggactataggtgcatgccaccacacccagctaattaaaaaaattttttgtgtggagtctatgttgcccaggctggtctcttaactcctaggctcaagtgatcctcccacctcagcctcccaaagtgcttggatgacaggtgcgagccactgcacctggccCACATTTTTTAAAgagacactgtcccactccatcacccaggctggagtccagtggtgtgatcatagctcactgcatcctccagttcctgggttcaagccatccctcctgcctcagcctccccagtagctggaactacaggtgtgtgccatcacacctggctttacatttttctgtggggtcttactatattgcccaagccggtctcaaactcctgagctcaagtgatcctctgcctcagcctccagagtatctgggattacatatgtcggctaccgtgtctggccGTTCACATCTTTGGCCACTATTTGCTTGTGAAAAGGTATAATGAGGTGGTACTTATCATTTTTACTGTGTCTCATGTTTTGTATATTTTTGTTTCATCAACTAAGATGcactgtaacatctctgaaatctggatatattatcaatggtttatcatagttttgttagcaatacactgtcttttagtggtgcctaaaataatggtatagttgtgaggtgatcttagatttgatgaagcacagTATGCAGGTAGGCCTAATGGGGGAAGATGGTAATATAAAAGCAAGAAGTATTTTTTTTTTGTAATGACTGAAAGCTGTTCTGTGGATGACCTACCCTTTCCTTTAAACACGATTCTCTCACTTCCAACTCCAAACTTGCTCAACTAATCCTTAAAAATAAACTTGAGCTGGAATTTGA
>XM_005268012.3
TGGCTAGGAGCGCCGACCGCAGGGCCTCTACGGTTCCTGTAACCAGCACAGTGCCTGATTCATGAATTAAAGACCTTACTAGAAAAATGAAACCTGATGAAACTCCTATGTTTGACCCAAGTCTACTCAAAGAAGTGGACTGGAGTCAGAATACAGCTACATTTTCTCCAGCCATTTCCCCAACACATCCTGGAGAAGGCTTGGTTTTGAGGCCTCTTTGTACTGCTGACTTAAATAGAGGTTTTTTTAAGGTATTGGGTCAGCTAACAGAGACTGGAGTTGTCAGCCCTGAACAATTTATGAAATCTTTTGAGCATATGAAGAAATCTGGGGATTATTATGTTACAGTTGTAGAAGATGTGACTCTAGGACAGATTGTTGCTACGGCAACTCTGATTATAGAACATAAATTCATCCATTCCTGTGCTAAGAGAGGAAGAGTAGAAGATGTTGTTGTTAGTGATGAATGCAGAGGAAAGCAGCTTGGCAAATTGTTATTATCAACCCTTACTTTGCTAAGCAAGAAACTGAACTGTTACAAGATTACCCTTGAATGTCTACCACAAAATGTTGGTTTCTATAAAAAGTTTGGATATACTGTATCTGAAGAAAACTACATGTGTCGGAGGTTTCTAAAGTAAAAATCTTGTAAGAAAATTGTCAAAGGGGCTAATGCTACAAGGCTACACTCTTCCTAGAGTTGAAATATTTTGTTGCTGCAGCCGAGTGACCTCCATAAATACTGGACTGAAAAAACATTGTAATACTACAAGTATAATGACATTTAGAAGATTACTTTGGGCTGGTGGGACATGCTGTGAATTTAGATTACAAATGAATATTATAAAGGGGATGATTTTTAACCAAAGGAATATATTTTTAACTTGAATCTTTTCTTGCATTGTATTTTTCTAAAAGTTTGGCTTCCTTTCTTGGTAGTCAAGAGTATGGGTAATAAGGAGTTATATGTCTGCTATCTGTGTTGCTCATTTAAAAAAAGTATACATTGAATAAGGCTGTTTATCACATGCATAAAATTAAATATTTTTGTTTCAAAGAAACATCTCAATACACTTAGGGGTGTATTGTTTCCCACATATTAAGTCAGGGTGGATAAATTAGTTATTATAACTAAACATAGTATAGTCCAACATTCGTTGATCCCAATACAGGCAAACAACCTGGTCAACCTTTTGAAGTAGAAGAAATGAAAATTACTTGACAAGATTAAAAGTAAAACAATTTAAATGTTTTACTGAAAGTTTATATAGTATAGTCTATGTAGATAAAAAGTACCACTTGTCTTTTCTGTGAATTATGACTATTCATTTGTTAAAAATACCTAAGAGCAATTATAGTGGGACATCTAAGGTCCTCTGTAAACAGTGAATTAGCAAACCTCAGCCTATGTGTTTCTACCCTGATTTTTTTCTTTTCATGGGTATCTGAAGCCTCTAAGTTTTTTCAAAAATGGAGTATCACAAAATTGAGTGAAACACAATACTTAATGTATTGTACTAGATTGCCAAATTCATAAAATGTTAATGGAAGCTTTTTGATGTGATTATAATGGCACTATTCTGGTCAttatcctattttgattttatttaattttTTAAAGTTGAAGAATTAAATATTTTAATGGTTCTAATCTTTTGCATTCCATGTTGCATTAAACCTGTTTATATGAGTAGTCTTCTGTTAGAATCACATCTGTGCTTTTCTTGAGTCTGCTGTTGAACTATTAGATTAAGTCATAATTCATAAAATTTTAGTTTAATGTGCTCTTTGTAAAATGAAATTGTAAAGAAAATACCAGTGTTTCTCATCCCATTGACTCACACCACGTCATCTGGATTTTGGATTTCCCTCCATGCAGCCAGCTATAGTTGGCTTTCCAAAACAACAGAAATCCTTCACCAATAGAGTGCACTACTTACCTGCTTATAGCCTATACAGACGAACTGATCTGTCCTTCGTGAAACGCAACAAAGCTAGTTCTGTCTTTTCAGAAGTCCTACAACCTTGACAAAGAGTAGTTTTATCAGGTAAATCCTGGTAATTAAAAACGCATGTTTTTAAAAATTAGCCTGGTAAggccgggtgcagtggctcacgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggtgggcagatcacaaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaaaatggtgaaaccctgtctctactaaaaaaaagaaaaattagccagacgtggtggcatgcgcctgtaatcccagctactcaggaagctgaggcgagagaatcgcttgaacccgggaggcaaaggttgcagtgagctgagatcacaccactgcactccagcctggcgacagagagagactccatctcaaaacaaaacaaaaaaaaTTAGCCTACTTAAAGGCACAACTAAATGCTTTATTACCTTTCTTACCACTGAACAATTTGAGGTAAAATCATTCACAAGGTTGGCACTTCAGTAAATCCCTTTAAATAGTGTTCCTAAGATATCTCTTAAATCCTCCCATAGGAAATAGAATTACAGGTAAGGTACACCATACAAAAATTGTGTCATTGAGGACAATGGTGATCTGTAATTTTAGTTGAGTATGTTTATGATTTTTGAAGCCATATGGTGAGTAAATGTAAATATGAAAAAAGTGCTACATAAAACACTTCTTAAACTTTTTTTTTTTAAAAactgctccttgtggagcaggactaccccataggcagtgtacccacaatagATAGCCttttgttgttgttgttgttgagacaaggtctcgctgttgcccaggctagagcgcaggggcacaatcaccacacactgccgcttcaatctcctgggctcaaatgatccttccacctcagcctcccatgtggctgggactataggtgcatgccaccacacccagctaattaaaaaaattttttgtgtggagtctatgttgcccaggctggtctcttaactcctaggctcaagtgatcctcccacctcagcctcccaaagtgcttggatgacaggtgcgagccactgcacctggccCACATTTTTTAAAgagacactgtcccactccatcacccaggctggagtccagtggtgtgatcatagctcactgcatcctccagttcctgggttcaagccatccctcctgcctcagcctccccagtagctggaactacaggtgtgtgccatcacacctggctttacatttttctgtggggtcttactatattgcccaagccggtctcaaactcctgagctcaagtgatcctctgcctcagcctccagagtatctgggattacatatgtcggctaccgtgtctggccGTTCACATCTTTGGCCACTATTTGCTTGTGAAAAGGTATAATGAGGTGGTACTTATCATTTTTACTGTGTCTCATGTTTTGTATATTTTTGTTTCATCAACTAAGATGcactgtaacatctctgaaatctggatatattatcaatggtttatcatagttttgttagcaatacactgtcttttagtggtgcctaaaataatggtatagttgtgaggtgatcttagatttgatgaagcacagTATGCAGGTAGGCCTAATGGGGGAAGATGGTAATATAAAAGCAAGAAGTATTTTTTTTTTGTAATGACTGAAAGCTGTTCTGTGGATGACCTACCCTTTCCTTTAAACACGATTCTCTCACTTCCAACTCCAAACTTGCTCAACTAATCCTTAAAAATAAACTTGAGCTGGAATTTGA