RCPedia: Genes

Summary

Gene Name	FUNDC2	Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chrX) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie	Homo sapiens
Full Name	FUN14 domain containing 2
Also known as	DC44\|HCBP6\|HCC3\|PD03104
Coordinate	chrX:155026844-155060304
Strand	+
Gene summary	Predicted to be involved in autophagy of mitochondrion. Located in mitochondrion. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from FUNDC2

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
FUNDC2P4	chr22:39155506-39156857	+	Intergenic	ENSG00000227009	UCSC
FUNDC2P2	chr2:84290635-84291759	+	Intergenic	ENSG00000182814	UCSC
FUNDC2P1	chr5:73508676-73509715	+	Intergenic	ENSG00000255883	UCSC
FUNDC2P3	chr6:146171380-146172049	+	Intragenic	ENSG00000187103	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_023934.4
GACACCGCACGCTGAGCTCTGTGATGTAGCCGCTTGCGGAGACTGCAAGCAGCCGCGGCGCGCCCGGCCCTCCCTCTTCCGCTGCCGCCGTGGGAATGGAAACATCTGCCCCACGTGCCGGAAGCCAAGTGGTGGCGACAACTGCGCGCCACTCCGCGGCCTACCGCGCAGATCCTCTACGTGTGTCCTCGCGAGACAAGCTCACCGAAATGGCCGCGTCCAGTCAAGGAAACTTTGAGGGAAATTTTGAGTCACTGGACCTTGCGGAATTTGCTAAGAAGCAGCCATGGTGGCGTAAGCTGTTCGGGCAGGAATCTGGACCTTCAGCAGAAAAGTATAGCGTGGCAACCCAGCTGTTCATTGGAGGTGTCACTGGATGGTGCACAGGTTTCATATTCCAGAAGGTTGGAAAGTTGGCTGCAACAGCTGTGGGAGGTGGATTTTTTCTCCTTCAGCTTGCAAACCATACTGGGTACATCAAAGTTGACTGGCAACGAGTGGAGAAGGACATGAAGAAAGCCAAAGAGCAGCTGAAGATCCGTAAGAGCAATCAGATACCTACTGAGGTCAGGAGCAAAGCTGAGGAGGTGGTGTCATTTGTGAAGAAGAATGTTCTAGTAACTGGGGGATTTTTCGGAGGCTTTCTGCTTGGCATGGCATCCTAAGGAAGATGACCTCATGTTCATTGTTCCTGGTTTTTTCCAGCCAGCAGCCTCTACACTCCATCATAGGACATCGAGTCCCTCCTCCTCTTCTCCCATGCCTTCTTCCCTGCCATGGCAAATCTGAGTGGCTTCTCTAAGCATCTGCTGGTACAAGTCAATGTGGCACCATGAGCTTCATGGTGGCAGAAGAGACAATAGTCCTTAGCTCTCCTCCCAGTACACCCCCTACTTGGCCAGTCTGTAGGCCAACAAGAAGGTTCCTTTACCCCCATGCAAGACACTTATGAGAACACATTACAAGATGGCTGACCGTGGAGGATGAGTGGATCCTGAAAGGTTGTCCCAAACTGTTGATTTGGAAAAGAAATAAGCACATAGATAACCTTATTGTGTGCTGCATGGAAAGGAACTGAATACATTTGCCTTTAAGCATGAAAGATTTTGGTATCTTGGTGTCTACTTTCTTTTTTAGTTGGTTTTACATTACAGAAAGCTATTTAAATGTGTTATAATTATGCCGACAAAATTGGCAGCATAATTACTGTAATTGAAAAATCTGATATTGTCCAGGAATGCTTTCTACCGTACAGGATAATGTATCTCATGGCTGTTTCCAAAGGGTTTATTTATTGTAAAACAAGTGATTTAGGTGGGAAAGGGAAGATTTTGGATTTTTATTTTGTAGAAAAGGTTTTAAGCTTTGAAATGTGAATGAAATATCCTTATCAAAACATTAGGGGTGGCCATAACTCCTCTGTGCCACTTCTACTATTTTTTTTTTTAATCTAGTTAGTATGAAATACAACATTTAAACCGGAATTTTAAAGAAGTAGCTTTCCAGGGATTCAGAATTAAGAAAGATAGTGATAGGACATGAGAAATAAATTTCCATCAAGTGTAATCTACCGTCTCATGATGACCACAACCCTGAGAATTATTCTTTAAAAGCTTacacacacacacacacacgggcacacacgcacacacaGAatcttaccacattttgctgtagtggcatgttaccatgtctacagtccctactagaatatcagtcagctttcagagggcaagacttctgtcttcaccattatactcacagggcctagcacttaataggtgctgagtaTTTGAATAATGACTTTATAGAAAGAAAACTCACTATTAAAGGTTAGTTTTACTCAGAATTGTTAATCTTGGAGATGATCTCTTGTGAAATATGAGTGTGTTTCTAAGGCCATACATTTAAAAATGTTTGCATTTTAACCCGTCTTGAGAATGATGTATTGAATTTGAAAATCAAAACTACCAGTGGATGTGTGGAACTTTACAGAAACCACCTATTTGCGTTTTTCTCCTTACATTTAAGGAAACATAAGCCATTTTGCTTGCAATATGTATGAATCATCTCAAAACCATAATGGTATGAGCCTCTTTGCTGCATATTTTGCTATAAGAACTTAttttttttcactttttattatggacgctttcaggaatatataaaagtagagaatatagtacaataatccccctgtgtatctatcactcactcacaacaatcatcaaattatagctctgctggtttttaccagttattgtgaaacaaatatcaaaatgtcattttatcatatttcagtatgtatctctaaaaggtaagaattatttctaaaaatcataaatacctcatcatatcagacattaacagtaattacataatatccaaaatctgatcagtgttcaaaatttcctcaagtgttttatatttagtttgtttgaatcaaaattcatgcaaggttcacatcgtatttgcatgatttggataagtctcttaaccttatagatcctcctctatttttttttttttgcTTGCtatatatttatatctctatatatattgatatagacatatgtaGTGACACTGAGTCATCTGTTTCCTGCTTCCCCACACTCtgcctctcctgacatctgggtctctgggttatgccatatatggtgatagtggctgcagccactttacctgtgtgacttacccacagcaatgggatggtaacagcaaagctaaccaaagtgctctgtgcccctttgggttgcatgtggggagactggccacccaatgcctctccagtggggtaggggttgtcttttggtgcatctgtttttcctgtgattattggtgagggcagcaaagattagcaggtggttgtaaactaccttgagtaggttgtaataaatagtctggcctcagactgtattctgattgtctgaattaagatctgtaggtaggtccctcctgaagttttttcccagctggctgcctctacgactgtgagggtcatggttgaggtcagtattgcaggttggcctcatcctgctAGtatgagaacggctgtgagttctgcccacggtgtgaggccactgtgaccacttgggattgtgcagagctggcatggaggttgaacacgcacagctgcacaccttgttttcagtttagctgaaccatcggtgaaggaggctcaggcatttggggttacctgtgaatcaaggccctattgtgccagcagttttgtttcaggtggtgaagtgggagttaaggtttcccccaaaagaacagctgccactcctccatgcaaaaccgagatgattcaaggaccaggcagctccacctttcagtgcactactttcatttgactggagaggcctgcttagcTAGGCACGTATTTTCTCCAGTAGCAGAGTCCAATGACGCTCTGGACTTCCTAATTAGTGGTGGTGGGGCGGAAGTTTTTCCTTGGGAAGAGCGTTGTCGCTGTATATGGTCCGCAGAAACTTGACTTGGAATGTGTTCGGGGTTTCATCGCCCCCTTGTGGCGGCGACGTGGTAACACCGCACTCAAGGCTTCCAACTTGTCAACCAATAGGATGGCATCTACGTAGTGAAGGCTTCCCTTCCCTTGTCCTGCAGCGTGCTGGACAGTGTCCCGGCTCAGGGACCCCTTCTGTCCCCTTCCTGGCTACTATGGGTCGGCCCTGCGTCCTCACCACTTTGAGCCACCCTTTGACCCAGCGTCTCTCCCGCAATGGGACCTGGTGGGATGGGGACTTGGAGCATGCTACAGGAGAGGTAGAACTTTTGAGTCTCTTCTTCCCAAGGTTCTCCCCAGAGTCGGAGAGCAGAGACGGATCCAGGGGCACTTTCTGGCCGCTGCCTGCTCGGGCTCAACAGATGGAGTCCAATGTTTCAGTCTCCCCCAAGAATGTGTATCCTCATTGCTGACACGGGAGCTGGGTGCGGGGAGAGATGTGGTGGTGGGGACCCTTGCCTGAGCAGCCCATTGTCATGAGTGTTATTGCCATTGTGATAATATGTTAGCATGACTCTCCTCCCAAATGGCCGCTTGTTTGTTGCAATCTCCCGCCACTCAGCCTCCAGACATTCATTAACAGGACAGTGGGGTTCTTGACTCCCCTACCACTGGGGTGACAGTCCTTGCTACTGGATCTGGGCAGTTACTGTCTCATGGATGCTGGCAGAAGACGATTCAAGTTGGCGGACTAGATTCTACAAGGAATGATCTCTTGCATAATTCTAGCCAACATGCTCTTGGGGTGGGTGCTTCTGGTTTTGGAAAGCAAAGTTACTGTGTAGTTAACAACTATTGTGGTAAGAATAGTCTCTCCATCATTCTTTTGTTTCACGGTTGTCAGAAAGATGGGCATAACTAATGGTTGGGCTCTTATTTGGAACCTCTACTTTTGTACAGTTTGGGAATCTCTGCTTGAAAAGATGGTATACTGATGGATTTGAAATTTCTGAGTATCATCAATGTTTCATGATGATCTCAATTTCTTCTCAGAGGGAAGCTCACAGCCAGTTTTGGACCCCAGAGAAAAATGTGGCTGCTGCCCTCTACTCCCTCTACCAAATTATCAGCTTCATTTCTTTGTCATGAAATCTAGTATGATTTCTCAGAAATCAGGCCCAGAACTAAAATACATTTTCTGCCCAATTTTCTAAGAGGTCACACTAACATCTGAGTAATTGGGCAGAAAACCTATTTTAGTTCTGAGCCTGATTTTTCTAGAAGTCATATGGTATAGCTTATATTTCCGATGCTTGCATTCTTTTTAAGGGGTCATGAATCTTAATACTTTTTTTTTTAAAAGAAAAGTGTCGCACTTTTTCACATTTTTATAAAGCTTTAAAGTCAGTTTACTGACTTTTCAAAAGTGTCTACCTTTTTAAATTTTAAAATGGTAAGAAATGACATTCCTGAGAGcagtggctttcatccttgcttgcacttgggaatcacctgtgaaattttaaaaactact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