Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Tmem167
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr13) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name transmembrane protein 167
Also known as 0610041E09Rik|5730424F14Rik|Gm10085|Tmem167a
Coordinate chr13:90237786-90263040
Strand +
Gene summary Predicted to be involved in constitutive secretory pathway; intracellular transport; and protein secretion. Predicted to be located in Golgi apparatus. Orthologous to human TMEM167A (transmembrane protein 167A). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Tmem167

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Tmem167P2 chr1:159256528-159257315 + Intergenic
ENSMUSG00000103389 UCSC
Tmem167P6 chr12:67972605-67973093 - Intergenic
ENSMUSG00000113182 UCSC
Tmem167P7 chr14:79058421-79059175 + Intergenic
ENSMUSG00000115305 UCSC
Tmem167P8 chr17:66625686-66626542 - Intergenic
ENSMUSG00000117010 UCSC
Tmem167P3 chr2:152451055-152451439 + Intragenic
ENSMUSG00000089684 UCSC
Tmem167P4 chr4:141083763-141084356 - Intergenic
ENSMUSG00000084238 UCSC
Tmem167P5 chr7:13452931-13453861 - Intergenic
ENSMUSG00000100468 UCSC
Tmem167P1 chr1:10941862-10942067 + Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_025335.3
GCGCCGCGATAGGTCCAACCGGACCGCTGGAGCGAGCGGGAAGCACAGCGGGCCTGCATCCTCTTCCGCCCCGGCCCGGAAGGGTGATGTGGCTGGACCAGCACCGGCCTCACTATGtCTGCCATTTTCAATTTTCAGAGTCTGTTGACTGTAATCTTGCTGCTTATATGTACATGTGCTTATATCCGATCCCTGGCACCCAGCATCCTGGACAGAAATAAAACTGGACTATTGGGAATATTTTGGAAGTGTGCCCGAATTGGGGAACGCAAGAGTCCTTATGTCGCCATATGCTGTATAGTGATGGCCTTCAGCATCCTCTTCATACAGTAGCTTTGGAAACTACCAGCATGTGCTTGCTATCAGACTGTAAACAAGGACTTGCCTCCAGAAAATAATGGGAAGAATGGTTAAGCCATTTGTCTCTGAACATGGAATGAGATAAACTTCAAGATGCTGTTCTCTATTTTTATGCTATTGGACCAATGAGCTGAATGAATAATTAAGATGTAACAGTTCAATACACAGGAATGTGATTGTATCCATCAACCTCAGTTCTCTCACTCCAGTATTACATTCTGCAAATGTCATTCTGTTGTGTCAGGACTGCTTTTCATAAGGTTCTTCGGGCACGAAGTAGAAACCCAGTGGCAAATTCCAAGGCTCCTTTGACTAGGGCTTCAAAATAATGTCTTCACAGAATGGTACCTTCTAGCGACTGGCCTATTTTTATTGAGAAAAAAACttgttctatttttgttgttgttactgttcttATGGATTGCATTCATATTTAAACCCTTTGGATTGCTAACCAGAGTACCTCTATTCTTGGCAAATTCCGCAGTTTATTACAGgtgtttaaagtattttaaacaaAACTCTGAATTTCTTTAGTTAGCCTAAGAGTTGGCTTCTAGTCACAAAGATACAGCTGCCACACTGTGACGAAGAGCACCTTAGAaagaaaagcagcaagtgagcGGTGAGCAAGTAAGCACCGTGCAGTCTTCGTTCTCTGTAGTCTTGTCTTCCAAATAGAACGTCCATCGTAGTTACCCAAAGGTGGTATTTGTGGTGTTCTTAATGCAGTGCTTTAAGTCTAGTGTATGTTCTGTCAGCTTGAACTGGAATCTCTCTTGTAACTTTGTAGGTTATAAACATATCTCATATCTGCTTTAGTCTGGGTACTATGCTCTAAGTACATTTCAGCTTTGACACAGAATGTGAATAGACGAATATCAAAGGATACTTACAAGTTTGTATCCAACATTTCTTCAGGTTCAGCTGAAAATCAGTtactgtttcaaaacaaagagGAATTAAATCCTAGCTGAAAACTATACATagcatttattaattaattactggGTTTAACtgctctttttaaaagtttgaaaaagaaaaaaaaaatttttttcttagaagtgaaGTTTCTATAAAAACAAAGCCCTGAACTTGCAgtcttcactgtgtagcccaaatGGCCACCAGAGCTAGCTAGACCATCAGCTTTGACATCGTGCTTGAAGCTGTGGAGGACAGTGTAGTAGTCTAACATCTAGGAACGCCTACTTGGTTTGTAGAGgttgcttgtttttaaaaagatttttgggATGTCTGCAGCTAGTTAAAACTGGTCTATTTTTATGATAATTATTCTACTCTGAATTTCACCTTAAGCTTTGTATTAGGTCAAggattttcactgtgtcccaaaAGTAGGACTCCCTCGTCACCATATTTGTGCACAGTAAGTAGTCACCTATCACTTTGATTTCTGGGTGGCCATCTGTTCATCATCACTAACAACATTTCCAGAAATGTTGTCAACTTTTTTCCTAAGTTAACATGCATCTCATATCAAAATGGAGAGAATAAGAATCATCTAATATGTTCTCTTTAGTTTGACATTTTAGacaatgtaggtggaaattaGAGGAAGACATAGTTAACTTGAAATATGCATGGTAACATACAACTTTTCGCGGTATGTAGATACTGAGCAGTCTAGACAGGTATTTCTAGCCACTACCGTCCTGATCGTTTAAAGTACAGGCTCTTTAGGGGTGTAGGAAAGCTgcaaagataaaagaatcatataAAGAAAGGCAATTAGCATTTTTGGTGTACAAACACTGACTCCTGTTTTCTGAGCCACGGGGTCGTGTGGGAGGTGTGAAGCCCACAGAATATTTAGCTGTCTTTGTGAGTGGGGTGTGGAGGAGCAGTAAAGCACTTCGGGCAGCTGGCATCTACACAGACTGTAAACACAAAGCTTAGCGGGCGAGGAGCACTAAGACTCAGGTCTGACAATGTCCACATGTTCTCCCTGGCTGCCTTGTTGGCCCTAGAATCTTCAGTCCATGTCCCCACATTTGTTTTATGTTGCTGTTTGGTTTCTGATTAGCTTTATCTGGGCCATTGACAGGGCAGGATATGTCTTGCTTCCAGGTAGTCTTGCAAGATAGTCAAAAGGACACATGTCAAATTGGtcttaatagttttaaaaagttaaaattccaATATGGTGTCCTATTGATACCTTTTCTACTTAGGCTGGAAACTACCATATATGTTTCAATTCAAGGTGTTTCCTGCTGGGGTTAGTAagaatataaatttataataaatttgTTCATCTTCTTAATAAAATTAGTCTTGTACCATAGGGTGACACAGAGTTCCATAAATTAACTCTTCCAAgtttacaaagacaaacaaatcCTTGCCTCCATTTGTGAAAATTATTTAACACttgtaaataatatttttttcaggaaaCATTTACACAATTGGTATGGCATGTGACCATTGAAAATAGATGAGTTGTTTCTCTGTATTCATAATGTACATGAAAGATGAAATTAATGTCTATGAAGTATAATGTGCTAATTCTTGTTATTGACATAATCCCaggattctagaaaaaaaaatgaagagtgaTGATTCATTGAGGGTAGAACTTCTCAGAGATCATGAGTTAAACTGATcttgacagtgtttttttttttttaaaaaaaaaacaaaaaacaattctaTGTTAGGGATTGTATGTCCCTTAGTTTGTGAGGTATGGTGTGGCCATAAAGGTCAACGGATGTTATATTCTGGAAAGTCATGTATTTTACCTACCTCAAAATTGAAGTTGAGATTGTCCCCTCCTGCCTCACAAATCCTTCAGGAAGATAATAAAGTCTCCCTTGGTTTATGAGTGAGCAAAGTTGACTAAGGAATACACTAGTAGATTCTCCTGAGACTTTTGTAAACATTGTAGAGGCAACTGGCCAGTCAAGGCTGTGTTTTCAGAAACTTGTAAAATCTCGTATTCTATCTGCTAAAAGCAGCCCCAGCTGTTAAAACAGGCACCCATCCCAAAAGTGCACAGTTTACATTTCCTGGACATACAGAAAATATTTCTACTTATCAAGAACTTAAGCTCCACAAAAGCCTTTGAGAAGCTACTCTGTCATTACTATCTGAAAACATGAATGGAAAATTCTTAGGGctgctcttctcttcctttgttaCCTTCTAGTAATAATAAATGTTCTCAAACGGTGCTAGCAATCGCCCTTGTTACAGGGGGTCCTGACTAACTTCTGAGAAATAACTTCATATCATTTCCACTTTGCCCTGAACTAATTCCTAAATAATCTGACAGGCCATTTCAGTACCTTTTGTAGAAAGAATTCCTGTTTAAAAGAGGTAGTCGTCCTAgtctctggttagttcatacatCTGCTGTGTAATAAAAAATGAACTGTCAGAAGCCGTCTAGTTTTGATATATCACATTGAAAGAGAGCAGTACATGGAGCTTAGAGGGTGGCCATTATGACTAGAGTAGCTTATCTCCATCTGTGACTTGTCAAGATAAATTTGGAGgggatgtttttattgtttggtgcTTTAAGACTACCCACTCTGTCTCATTGCTGCTTCTTTACAAACCCTAAATATCTAAAGTAATGGTTTCTGTGTTACTGTGACCATGATACAAGACAGTAGCAAAGAGGGGAGGTTTGTGGGGTATTTTCCCTTTAGACATATTGGAGTTTCCCTAAAAACATTTGGCAGGGACTCAAAGTCATGATGGACCAGGGAACTAAAAAGGAGCCAGCCACAAGCTACAGTATAGGCCAACCTCTTAACTTTGAAAGGCCCTCCCCTAGAGACCTACTTCTGAGAAGGTCCCACCTTTAAAATCTCTTCCCCACCAGTAGGAAATAAGTATCCCAAAAGCCAAAATAATGACTTGGCTGGTCTGCTTTGGATCTTATCTTGAATTGTCCCGGAGGTAGTTTAATTCTGATTCTCCATTTAAATAGCAGTCATTGATTactaaaaattataaatttaatctCATGTGAGGGCCTGTAGATATCAATTCCTATCAAACCTAGAAATACAACTCATTTAATTAACACTACTTAAAGAATAAttattgccgcagaccctctgggcccttttgtctgcatggaatgggtctctaggtgcaggtgggcaaagcgttggatgaaagaagggagccaggtgcaAACTAGTCTTgtaaaacccaccaccaggggttctgcacTAGCAGACCTTATCATGAATACTGCAATGCCCCAACACCCTATTTCCTGGGTCTAGAGAAGAATATactaacttgcttctaatatgaagCTCTATACCAAGCTGTAGAGAAGATCTCTGTCTCGgtgggattccctagctctaTTGTTCCCTAGTTTGGGTGAGAATTGCTACTGTCCTTGGTAAATATTTTGTAGACCAGCTCTGACCTACTgtctttgtaatgcttaattattaactgaataggtaacttcctttctGCAGTCCTGCGGGATTTCAAGCTCTTCAAGCTTGcaggcttctgggaccttggaacaatGTGAAGGCTTAAttataacagaatttaatcttaaaaagcatttataataaaatattaaaagagaactcgtagatccatacaccagactaatgcgggaatagagt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