Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Vma21
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chrX) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name VMA21 vacuolar H+-ATPase homolog (S. cerevisiae)
Also known as 2610030H06Rik
Coordinate chrX:70856368-70868312
Strand +
Gene summary Predicted to be involved in vacuolar proton-transporting V-type ATPase complex assembly. Predicted to be located in lysosome. Predicted to be active in endoplasmic reticulum membrane. Human ortholog(s) of this gene implicated in X-linked myopathy with excessive autophagy. Orthologous to human VMA21 (vacuolar ATPase assembly factor VMA21). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Vma21

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Vma21P2 chr4:52494951-52497319 - Intergenic
ENSMUSG00000061619 UCSC
Vma21P3 chrX:100733115-100735532 - Intergenic
ENSMUSG00000082729 UCSC
Vma21P4 chrX:135898719-135899194 + Intergenic
ENSMUSG00000083445 UCSC
Vma21P1 chr1:190732786-190732989 - Intergenic
ENSMUSG00000103723 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001081356.3
TACGCCGCGCCACGCGAGCGTGCTTCGGCAGGGGCACTTCCGGCGCGACCGGCCTAGACTGTCACCCTGTTAGCCGCCGCTGAGCCTCCGCTAACTACCCGGCGCCTGCTGCTGCCCTCCCGGCCACGCCATGGAGCGTCTTGATAAAGCAGCGCTCAATGCGCTGCAGCCTCCAGAGTTCAGAAATGAAAACTCTTTAGCTGCAACCCTGAAGACACTGCTGTTCTTCACAGCTTTAATGATCACGGTTCCTATCGGCTTGTATTTTACAACGAAAGCTTATATATTTGAAGGTGCCCTTGGAATGTCTAATAGAGACAGCTATTTTTATGCCGcaattgttgctgttgttgctgttcatGTGGTTCTGGCCCTGTTTGTCTATGTGGCCTGGAATGAAGGCTCACGACAGTGGCGTGAAGGCAAACAGGATTAAAGTGACATCACCTTTTGATagcatgaaatttatttttgaatatgTTACATAATTCCGGGGTATtgataataaatacatttgtttgAATAAAGTTGAAAGAACATGTTAAAATCAGTCTTAAAGAGTCAGTCACATTTGGCTAAATTTTGACCCACCCAATAATATGGTTACTTTGAACTTTGAATCtccatttgcaaatgaaaatgtGGAAAAGTTGGAGAGGTACAGATGTATATGTTTCATGAGTTATCTCTTATCCTAGGGAGAATTTACATATCTTACAATAACAAAAATGATAGCAATGTGGCTTATActtgcttttcagttttatttatttgggtatATTAAGAAATACTTCATGAAGCAAATCTAAATTCCCTTTTTTACTGAAGGACTTCGCTGGAATTACCAGGCTCTTGGGTTTGAGATTCTACTTTCCTTAAAAGTTACTTACATTGTAGGCATTTTAGTTAATCTGACTTTTAAGTCAGTGAGGAAAGATTGCTCTCACATTCCATTATTTCACAGGGAAAGTCACTGAAACCACACTATTCATGCAAAAGGGTGTAGGGTTACTGAGGACAGCCAACTGGGCTGACTGCCAGCATTGTGAATATCACACTATCATTGTGCCCTCACTTTGCTTTGAAATTAGGTTTCAGTTGCAAAGTTTATCGAAATTCCACTTAATTTGTTGTTCTAGGTTAAAATAGTTTTAGAATACCAAAATGTTCAGCATTTACAAATTGAGAGTCTATACAGGCTTGAAACATCACAATTCTTATGAGGTGTTCATGAAGTTGTTTTGTCTATTAAtcctttttttaaatgacatctcAGCTACATCCTGAGCATAAGCTATGTTCTAAGATAATCCTTAGAGTCTTTTTTTGATTAGAACAACCCTGCGCCTGAAAAAAAGCCCAGTTCCCTTGGTACCTTCAGTCTCTGGTCAGACAGACCTTTTggtactgtgtatgtgtataaaaacGACGACccccaaatatttatttctgattaaaagataatatattctggaaaacactggaaaatacatataaaaattaaaaaagcaaaaaatttcCCATAATGTTAACTACCTGCAGATTATCAGTAGTTTAGTTCACAACCCCTGTACAAGTACACTAAAACCTTGTTTTAAATTTAGATCTTGTCAACTTCACCAAAGAGCTGTTTGCAGTTTTTCAGATGTGTGGTAATTGCCCATTGCCTTACAAAGTATATactatctttattattttaaaattcccatTTCAATGTTTTCAccataaagaaatgtaaaaatttgAGGTGATAACCTAGTTTAAATACTATATAACATGCATATCTCAAAACATTACATGGCACCCATAAGCGTGTATGCTTCTTGTTTTTATGTTAATTAAATTGAATtgtaaaaatgaagaaatttcaAATACCTGTTACTGATAATCCTAATATAATAAATGGCCCCTGCTTAAATATTTGCTATTATTGATTTGATGGTCTACTGTTATTTTCATGCTGTGGAACTAGACTAGAAAAATAGGTGATTGGATATAAAAATATGTGCTTGTGTTATGTTATTGTTATAAACAACAAGattattgtgattttaaaaagattgttCTTAATTCTTAAATTTAACAGTTGTGtgtagtttaaatatattttaaaatgagcatTCTAACCATGAGAGTCTTTATTTTGTAAAGACTGCAGTTTTTAGTATTATGATATTTGAGTCCTAGACATTGTGTGCTAGAGTTCTAGAGGGTTGGTTCCCTTATTAGGTGGCCTATTATATTTAGAATTGTCCACTCAGTTTCTTTTTATGTAATGCCAAGGCTTTTTTCTTATACTTTAGGAATATTGTACTATTTGTAAAATatactgttattttgttttatttcaaacgTTTGCTAACTAATGGTACaggtcttttaaaaagtattttacccaGGGatacatgtaaacacatgtaATTTTCCCTTGGCAATAAAGTACAATGTGTTTGACCATTAAAATATTCACACTGGTATTTAGAATTATTATAAAActtgttttaaagcattttttctAGGATTTTGACTGCTTACTTATGAGTTTGCTGCTGTTAGGTaacatttttttaaggtttttaacTAGTTTCCTCTTTCACAAAGTACATATTTCATGCTGTGTTAGAAGAAAAGCTACAGTTAACCTGTTAAGTGTTTTCCGGCGGAAACTGTTCACTGATGGTCAAAACCTGATTGTAATGGTGATCCCAGTTAGGGAGTATAACTTGAAGTGTCCTTGCAAGCTACTAATTTAACCCCACTTGCTGTAACAGTACTTTTCCCaacttctgatatgccttccGAATAATCCTTTCAGTGCTAAAAAAATGGAAGGCTGCTGTAGGATGCATCTGGTATCACTGACTCTTTAAATGGATGCCATTTCACAGGTTAGAGTAGCATTCTGGTTTTCAATGATAGTAAAGAATTTTAAACCTGCTATTCAAAGTAACTGCGTATTTCATGGGAATCTAATAGTAACTATAACTTGAAGTTTACATGAGAAAAGTCATAGTGAACCGGTTATGGTGTTCCATTATTTTAGGAAGCAGATgtaggaggattaggagtttaaGACCACCCTGGACTTCATGAGACCCTATATcaaaagaacagcagcaacaacaaaagctacAAAAACAATTtgacttaataataataaaaaaaagcaacTAATGGGCTTGTGCTTATTTTCATATAAATCTTTTGTAGACAGGACATTCAAATGGGTAAGTGAAAGTATACAAGGAAGATGTAACCAAGGAAGGCTGATGCTGGAGGTGTGCGAAAGAAAGGCTTGAGATCCGTTTTACATATATCCAGTGTATCTCCAGACAGTTTGTATTTAGTGTGTAAGTATAGTAAATCTGTAGACAAAGTGTTCAGCGATGGTACAGTATTTGTCACTTGTCTTCAGTTAATAGCAGGTTTCTTTACTACGTTATTCACTAGTGAAACACACAGCTATTCAGATTTTGCtcctaaaatttatttttaacagacTTGTGCTATAGTGTAGCTTGACAACATTTTTTATCCCAGGAGAATGGAGTTaccttaaaataaattactttcAGAGATACTGGAAATTTACTCATCAATGCATAACCTGTGAATTTCTTAACTCCATTCCTTTACAGACGTCTAGAATCTTTCCATATCGCTGCCGGCCACACTTTTAAACCTGTGTTAATTGCTATGTGTGCTTGAAGTATCTGTTCTTTTAAAGATGTTCTTTAAGTCATATTGTCAGTTTTACAATCTAGTCTTCCTTCCATGTTTGGTGAAATCTCACTGAACAGGAATAATAGCAATAACTAACAACATCTGCACAGCACCTTACAGTTTGCAGAGAACGTTCACATATTCTTGTCTGAGTTTTGCATAGTGAACATGTCACAGAGATGTCCCTTGATGTCAATGCTAAGTGTTAGAATGTTCAGTCACAGTGTCACTGGCCTTGCTGCGGCACTGATTAGCACACTGacgggtggggggaggggggcgtgcCGATGTGCTGTCTGTAAAGCTGCGTCATCACAACGGGGCCTGGATAGCTTAGCCACTTGCTTCAGACTGACTTGTTAAGTGATGCTTTTCTACTCTACCTGAATGGCTTTTGTAGTCAGTATATTGTAGCCTGTAATTTATATTAATTTACCATTTGTTGTCATTAAAAAAAGTGTCTGTAATGCTA
>NM_001290780.1
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