Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Ube2v2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr16) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name ubiquitin-conjugating enzyme E2 variant 2
Also known as 1110021H13Rik|4632410D19Rik|5730524P06Rik|6820402M05|MMS2
Coordinate chr16:15368850-15412382
Strand -
Gene summary Acts upstream of or within error-free postreplication DNA repair. Predicted to be located in nucleoplasm. Predicted to be part of UBC13-MMS2 complex. Predicted to be active in nucleus. Is expressed in embryo. Orthologous to human UBE2V2 (ubiquitin conjugating enzyme E2 V2). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Ube2v2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Ube2v2P4 chr9:17435282-17437948 + Intragenic
ENSMUSG00000111534 UCSC
Ube2v2P5 chr15:31445802-31446977 - Intragenic
ENSMUSG00000068964 UCSC
Ube2v2P6 chr16:18846955-18848332 + Intergenic
ENSMUSG00000060811 UCSC
Ube2v2P1 chr2:77085915-77086774 - Intragenic
ENSMUSG00000084087 UCSC
Ube2v2P2 chr4:12130826-12131993 - Intergenic
ENSMUSG00000082676 UCSC
Ube2v2P3 chr6:100581606-100583267 + Intragenic
ENSMUSG00000079224 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001159351.1
GTTGACGCCCTGCGTGCGGTGGTGCGTCTGGTAGCAGGAGAAGATGGCGGTCTCCACAGGAGTTAAAGTTCCTCGTAATTTTCGCTTGTTGGAAGAACTTGAAGAAGGACAAAAAGGAGTAGGTGATGGTACTGTTAGCTGGGGCCTTGAAGATGATGAAGACATGACACTTACAAGGTGGACAGGCATGATTATTGGGCCACCAAGGgtGGATGCACGGAGCATACCAGTATTAGCAAAATGGCAAAATTCCTATAGCATTAAAGTCATACTTCAAGAGCTAAGACGTCTTATGATGTCCAAAGAAAATATGAAGCTTCCACAGCCTCCAGAAGGACAGACGTACAACAACTAACTTTAGTGGATCTCAAACTTGTCTTAAATCAGCAACCTTCTACTCATGTTAATGTCTTGATTAAATATCACCATGCACAATACCCACACAATAAGTAAAAGAATTGCAGCTGGTAAACATGACCTGGACAGTTGtaagaatatatttaatatatgtacaCCTATTATGTTTTCAGGTAACAAGAGACGTGCAGcacaatttttctttctattaaagCACTGTCATTTAAACATGAACCTGAAGTACTCAAAATGGAGTTCAGGCTTTCAAGACAAAAGCATGACAAAAGAGTGTCATGTGGCCATggaaacatttgtttttctggaaagtaaagtctcaagaaggaagaacagaaatGGCATGCTTTATCATATTTAGAGCTGCAGTTGGAATTGTTTAAAGTAGCAGATACAATGACTAGTCAACAATTGTGTTAATTCTTGAAGCGGTGTGGGTGCTGACTACTATTAGTACAAACATaggttcaggattgttttgatacCTGTATTTATAATAAAAGGTGTTGGGGTTTTGAATTTCTGTTAAAAGCTGTTCCCGTTTGTTACATGTAACAGACATAATAATTTGTTTACAGTCTTTGTTTAGTAAAACATGCTTAGATGTTTTAAGTGAAGTCAACAAAAAGGAAATAGGTGTATGGATATGTGATTTTGAGATGAAAGTTagtcttaaaatgtaaataaaatatggaatgtgtCTTAAGAGACTGTGCTATTTCTGTTACATTGATATATGCTATGGTAGCCATATCATGGTAGCAAAATTGGGAGTTATTAAGCTAGGCATGGtaatggcagaggcaggcgattacaagttcctggccagcctgggctagtaCATAAGACtgcaattaaaacaaaataagaaatactgTGAGACTATCAAAGACTTTCATTGAAATTCTATTCTATATGCCTATGTTTGGAACTTACAGAGCACTTGTTGTGACACCGTACATGCTCAGTTTAATTTCTTCGCACAAAGAGGTATCTCAGTtactatatttcaaattttatttcatcATAGGCAATATTAAAAAAGATCTTTGCATTTTAGCAGTTTTTGTAGCTACAAACTGCAAATTATTCAGTactcatttaattttttcttgtgacattttaatttttctgtaaagCTTTGGTTCATTACAATTGACTGAATTGAAGACTTTCCTCccctatctttaattttttttttgttatttagtgtgtgtgtgcgcagtgtgtgtggtggggggatgtgtgcgcgcgcatacgtgtgtgtacttgtgtgaagATCAGAGGTTACCTTTGGAGTGTTGGTTCTTGCCTTCACTTTCCTGTGTGTTACTGATGTCGAACTCTGATCACCATGTACCATGCGTGTCAACAAGGGCCctcactgcagagccatctcattGGTTCCTCTTCTAAGAACAACGGAAGTTAATTTTATCATTCCACTCTGTTTACTTTAACAAATATGTGTCTGaagttgaaagtttatttttattcttttatcaaATTGACAGTTTAattgtcaaaataaaaaaatgagatgTTCAAACTTTGCATATAAAGAAAGTAAAGGGAACAGCATGACTAGTATACTGATTACTTTTGGTTACTTTTATAGCAAGGATAGGTTTCTTGACATATACTTGGTGTGTTTTGATTAAGCTGTTTAAAAGTTAATGTTTTTTTAGTCATTAAACTAGTTTGTCTAGACATTATCATCACTGTTGTAGTTTGAAAGAGGGTACCACTGTATAACCTATGATGGCTTCAAACTTGCACAAttatttctgtctcagcctcccaagtactagttCAGGTGTACACCATGTCCAGCATAAGTGGACTCATTTTAAATGAGCTAGTCTAATTATCAACAAACTTCCTTTATtcgtgttttgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgttgggtgcatGCAGAGGCCTTAGGTGGTATCTGGAGTCTCTCTTAATTGTTCTTTCACTTTATAGTGTCAGACAGTGTTTTTAAATGaagcccagagctcactgatgcaGCTAGACTTGCTAATCAGCTTGCTATAGAAatagatccccctgcctctgctttccaaggctGGAATTATAGCCTTACCTGttattttatgtgggttctgggaatcggaTCTCCAACAAGCATTttcaaccattgagccatctcagccCCTCAAAGATGTTCTAAATATTTAACCACATAGAACATACACATAACATTTTCCATGTGTAATTGATTAAAGTAGACTTAAATGAAATATACTAATATTTAATGATTAAAGATTACATTCAATTGCATTGACAGTATAGAGTCATTACCAGTTCTTTTCTGCCTTGAAAATGTGTCTTGTGATACTTGGAGCTAGTAAGTGTTGGGATGCTTTTGATAGCCTTTGGTAGAATCTGGTACTTTGGTCTCATGTTGTCTTTGTATATGCCACTGTGAGAGTTCTCTCCTCCACCCAAGGCTGTTTGTCAGAGCCCagcctatttaaaaaaaaccccTTTCTTGTTTAAGGGATTGTGGATCTTAGCATAAATCTATGAGTCAGTTAACAGATTTCCAAAGCAAAATCCATTTTGCATGTAACAGTTATATATGATTATCTAAGATTGATGAAATTTTAGAGTTAATAGAGCctcttttaaataaaagcaaatcttCTTTTGTAAAGTGACTAGGATTGCAGGAATGTGGTATAAATAGACTAGAAATTTGCCTTAGAAACTTGTTTCAAGAGATTTTAAAGTATGACCCTTGATGACTATAtgttaataaaagttaaaaagtaaaattcttgtTCCAGTAGGTCCCTGTTATACTTTAATGGCTTTAACTATTTGTTATTTTCAGAATtggtaattttttattatttgttaatttaaaataaagttattgCACTTGTTTAGGGATCTGTATATACTTTTCTAGAATTTTTGTAACAAACATTGGGTCTGTCACAGGCAGTCTTTTGGGTGTGAAAACAAAACCTGTAATTTTACATTGACCTTTATAAAAACTATTTTACTCAACATTTGGGTATGTGAATAAATAGGGACTTTAGTTTGATTTATCAGGACAAGTACTTCACCAAGACTGACTTCCATCATCGAAGTGTTCTTCAACATTAGAATGCATGTGAAGTTGATATTTGAAAATTTAGAGCATTGTTGAAAACCACTCTTAATAGGTTTGATGTTTATGGCTTTAGGCCATTCTCATAAGTTCAGTCAAAATCATGTCAGCTTCCTAAATGAGTTTAAAACCATATATTCTTGCATGCTTACAAGGATTTTGGAAACTACTTAAGGAATCTTacagtttttttcctttataagaatagTTTTTAGGTATTTGTATACAGAGCTACAATATTATTGATTATTGGGAAGGATAGCAGACACAGATCTTACTTTTCTGATAAGTAGCAATACACTTTCATTGCTTCAGTTTGACCAGTTTTTGTTCAGTTGTAATGCCTCAAGATTTTGGAAAGATGTACATGTTTTCTGAACTAGAAACACCATGAAAAGGAATAAACACAAGTGGTAGGAACACAAGTGATTAACTTACATTCAGTACCGAGCTTACTAAAAAGCAGGGAGTCCACAGGAATAGAATTTCTAAAGTTAATGTTCTTTGGAGAAGTTACCAAAGACTGAATAAACTTTTTCTCTAAAACTAtattttgtgtgtgcctgtgactgtgcatttgcatgcctgtgtgcattcatttatgagtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtggccaaAGAACAACTTAGGAATTTGTTCGCACCTTGCACTGTGtgaggggttgaactcaggtcatctggcttaGATGCAagtatctttacccactgaaccatcttgcttgTCCCAGGGGAATCTGATACTGAACAtattggatgtttaggaagttttctggAATTTTGAAAAGATACACTGTAAgtattttctgaaaagaaaactaATAAAGGTATTTGTTGatacaggaaataaaaatgaagaccaTTTTGTAAAATCAAGGAGTTTGAAaaactcatagaatgagttacaTGATTTAAAAAGCCATTAGCAGGCTGGAGGAGTGAGCCTGATGTCTTGTTTGGATATGCAGACGCCATGTAGAAAGCGGGACAGTGTAGTATGTGAGTAATCCCAACATGTCTCTACCAGCAGGTGTGGGGAGACAGAACTTTTAAAAGCAACCGCTGGTTGCTGTGGTGTTTATATCTTCAATAAAAGGTGTGCAGCTAAGAAATAAGGGTTTTGCCCCATCTCATTTttccatataatttaaaaatactgcGGTaggttcccccttctaagtttATGAGATCAATGATAAAAgctgaatcaatctctctctctctctctgtctgtctgtctcaagagatttatttatttcatgtatgtgagtacactgtcattgtctttagacacaccaggagaggacatcggatccccattacagatggctgtgagccaccatgtagttgctgggaattgaactcaggacctctaggaagagcagtcagtgtgggAATCACTTGTCTACCTACTTCCCACGGACAGAATCAAC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>NM_023585.4
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