Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Hnrnpr
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R
Also known as 2610003J05Rik|2610528B01Rik|Hnrpr
Coordinate chr4:136038230-136073292
Strand +
Gene summary Predicted to enable mRNA 3'-UTR binding activity. Predicted to be involved in mRNA destabilization and negative regulation of catalytic activity. Located in nucleus. Is expressed in central nervous system; limb; sensory organ; and thymus. Orthologous to human HNRNPR (heterogeneous nuclear ribonucleoprotein R). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Hnrnpr

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
HnrnprP1 chr1:78760214-78762586 - Intergenic
ENSMUSG00000099377 UCSC
HnrnprP2 chr13:112835953-112837841 + Intragenic
ENSMUSG00000114418 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001277122.1
AGTTCCGGGAAACCCCGCGTGCTGCCGGGATCGCGTCTCGGTCCATgcgagggggggagggggtggcgcGCGCGCCATTTCTTGTCGTTTTCAAAGCGCCTCGCGCTGCTTCTCACGGGCCAGGCCGCCAGCCCCCAGCTCTGCCCTGgATTGGTAGCTTATGTGGATCTTGATGAAAGAGCAATCGATGCTCTCAGGGAGTTTAATGAGGAAGGAGCTCTGTCTGTACTGCAGCAGTTCAAAGAAAGTGACCTGTCTCATGTCCAGGTAAGAACAAAAGTGCATTTTTATGTGGAGTTATGAAGACCTACAGGCAAAGAGAGAAACAAGGCAGCAAGGTACAAGAGTCCACGAAAGGGCCCGATGAAGCAAAAATCAAGGCCTTGCTTGAGAGGACTGGTTATACTTTGGATGTGACCACGGGACAGAGGAAGTATGGCGGTCCCCCACCAGACAGTGTGTACTCGGGTGTGCAGCCTGGGATTGGGACAGAGGTCTTCGTAGGTAAAATCCCAAGAGACTTGTATGAGGATGAATTGGTGCCCCTTTTTGAGAAGGCTGGTCCTATCTGGGATCTACGGCTCATGATGGATCCACTCTCTGGTCAGAACAGAGGCTATGCATTCATCACCTTCTGTGGAAAAGAAGCTGCGCAGGAAGCAGTTAAGCTGTGTGACAGCTATGAGATTCGCCCTGGTAAACACCTGGGAGTGTGCATTTCTGTGGCAAACAACAGACTTTTTGTTGGATCCATTCCAAAGAATAAAACTAAAGAGAACATTCTGGAAGAGTTCAGTAAAGTCACAGAGGGTTTGGTGGACGTTATTCTCTATCATCAACCCGATGACAAAAAGAAGAATCGGGGgttctgcttccttgaatatGAGGATCACAAGTCAGCAGCACAAGCCAGACGCCGGCTGATGAGTGGAAAAGTCAAAGTGTGGGGAAATGTGGTTACAGTAGAGTGGGCTGACCCCGTGGAGGAGCCGGATCCAGAAGTCATGGCAAAGGTAAAAGTTTTATTTGTGAGAAACTTGGCAACTACGGTGACAGAAGAAATATTAGAGAAGTCATTTTCTGAGTTTGGAAAACTGGAGCGAGTGAAGAAGTTGAAGGATTATGCGTTCGTTCATTTTGAGGACAGGGGAGCTGCTGTTAAGGCTATGGATGAAATGAATGGAAAAGAAATAGAAGGGGAAGAAATTGAAATTGTCTTAGCTAAGCCACcagacaagaaaaggaaagagcgCCAAGCTGCTAGACAGGCCTCCAGAAGCACTGCGTATGAAGATTATTATTATCACCCTCCTCCCCGAATGCCACCTCCAATGAGAGGCCGAGGTCGTGGAGGGAGAGGTGGATATGGCTACCCTCCAGATTATTATGGCTATGAAGACTACTATGATGATTACTATGGTTATGATTATCACGACTATCGTGGAGGCTATGAAGATCCCTACTACGGCTATGATGATGGCTATGCagtaagaggaagaggaggaggaaggggggggcgaggtgctccaccaccaccaaggGGGCGGGGAGCACCACCTCCAAGAGGTAGAGCTGGCTATTCACAGAGGGGGGCACCTTTGGGACCACCAAGAGGCTCAAGGGGTGGCAGAGGGGGTCCTGCACAACAGCAGAGAGGCCGTGGTTCTCGTGGAGCTCGGGGCAATCGAGGGGGCAATGTAGGAGGCAAGAGAAAGGCAGATGGGTACAACCAACCTGATTCCAAACGTCGTCAGACCAACAACCAACAGAACTGGGGTTCCCAACCCATCGCTCAGCAGCCGCTTCAGCAAGGTGGTGACTATTCTGGTAACTATGGTTACAATAATGACAACCAAGAATTTTATCAGGATACTTATGGGCAACAGTGGAAATAGACAAGTGAGGGCTTGAAAACGATTCTGTCAAGATCCAATTGGCTCTAGATCTACATTCTTCAAACAAAATTGGCGTAACTGTTTCATCTTTAAGTAGCAGTTTGCTGCCATTTGTATTCAGCTGAAGAAGTCACTATTGTGTATATACTCAAggcttcttatttttcttcttttctaaatgCTCTTGGACATTATTGGGCTTGCAGAGTTCCCTTATTCTGGGGCTACAATGCTTTTATCGTTCCAAGCTTCATCTTAGCTTCAGAACAAACTGTTAAATCATGATTTTGCAGAACCTTTGGTTTGGACAGTTCTGTTCTTTTGGATTTGGAATAGATTACATAGGAGTATGAAGTATGCTGTAAATAAAAGTACAAGCCAGTGCTTTGTCTTAGtagttttaagaaattaaagcAAACAGACTTAAGTTTCCTTGTATTGAAGATAACCTATGACTGTATGTTTTGCATTCCTAGAAGCAGGTtaactgtgtttttaaattgttatAACCACACCTTTTTGAAATCTGCCCTACAAAATTTGTTTGGCTTAAACGTCAAAGCCGTGACAATTTGTTCTTTGATGTGATTGTATTTCCAATTTCTTGTTCATGTAAGATTTCAATAAAACTCAAAAATCTATTCAAAACATCACCTATTTCAAATTCAATTGTGTCTAAAACATTACTTTATTCGTAATCCTTGAAGGAATACTGTTTTCAAAGTAGAACTGCCTATGTGAGTGATCAAATTCATGAAAAATTTCTCGTCTATTCCATCATGTATTGTGGATATTAGATTTGAGGATTATTCTAAATTCACATATTCCAAATACCATTTCATTGATTGGTGTTCTTTCATAAtctcttctaattttgaaattttatccttaaaagaaaacaaacagactccAATGTTTTTGAACAGGTATTGGATCATTTTTATTAAAGCAAAATGGAGCTGGGGAAGCGCACTGCAGTTTGTTTTGACCCACATTCTTTCAAATCAAGGACAATTTGTGACTGAAGACCTTATTTGCTGGATAAAAAATTACACATACAGAGAAAACTTAGTATTGTGATGTCATTTGCACTGTGAACTAAAGTCATTTTTAGTGTTCATGATGAGCACCCCTATTTTACTGGTTTAGGACTGTGATTCCCATCGCTGTGTAAACTTGCTTTGGGAAGCAGCCATGCTTTAGAAGAGACTTAAATATCAAGTGGTTATGTCTCTGGCTTTCTGATAAGACCTTTAATTTTTTTACCATGTCTACTGACTTCAGTTTTGTTCCAATTTATTCTAATGACTTTGCTAAATGAAAAGAGCAGAAGAATGTAaactttcattttgaaattttttccccccgtttggtgctgggaattgaaaccaggACCTGCGCACATGCTACCGTTGAGTTGTATCACTAACCCCTCTAAAATGTTTTACATTATAAAGCATAAGCCACTGGGGGATAATTAAAATGGACTCCCTTGTTTTACGCTCTGTTCCTGTTTGGTGTCTTTTGTGATCACAGTTTCAGGTTTCAGAATCATAAGCCATCCACTTCTTGTCCGCACAGTCAATCACGTTTCCAGTCTCATGACTTCATTTTGAGCTTTAACATTTGCTGATGAAAGCCAAATACCACATTTCTTTTTCAAAGTTTATTCATACAGTATAGTAGTTTAACAggctttattaaattttattctatAGAAGTTGATAAAGGAATCATGTGGCCTGTTGTAGTTATGTTAGCATGGGTGTTAGTAAGGTTTAGATTATAGtctttttaagtttttctaatgcccgtatataaaaataaagagagcaGACAGACACTCTAACTGCTGCTTTTAAACTTATAATAATTTGAGGCCTTGAGTATAAATTAGACTTAAAGAATTAATTTTTTCTTGGAAAGAAAAACATaactaaaagttttattttttttccccctaaatacATGTTTTGGGCTAGCAAGATTTCCCAGCAAGTGCTGCCAAACCTGACTATGATCCCCAGACCCACTCGGTGGAAGGAGTCACAGTTGTGTTGTAGCAcacttgtggaagtcagaggatatgtttcacacatacacaattaatcgattaaaaacattttaattagatgtttgTCATAAAGAAGATTatgaaaggaaatagaaatgatCTGAAAATGCAATTTATTGCACTTCTGCCAATAACCCTAAAATATAAACTAGTAAAACCTCAAGTTCCATTTCAAAATCCTTTCATTGTATAGTCTATTTCAAGTTTTAAGTGGGCACTTCCTATTCTGTTCCTCTCACTAAAGATATATCTGCAGAGATTTCCTTTAATCTTTGCTTTATAAGTTTTTACTTAGTTAAAAGTCAGTGACCCTATATAAAATTTCCCTTTAGAGCTTTCCCTTTTTGATGTCATGTGAGTCATTGCTTGTAGTATCGAGAAAAAGATAACCCCGGTGCTCAGCTTCTCGTAGACAGTGAACGAATGTCAATCAAGGAGAGGCGCACATTCATTCACAGTAGGGAGGGTTTGGTCTTTTAAGTGACTAGGCACAGATTAGGAGTTCTGAGGGGCTTGACTTCCTATCCTACCTTGCCATCTTTTTTTCTCCCCACCCAATTTAGTTGATGAGACTTTATTTATGAGCCTGTCAGATTAAATGAGTGTTGGGAAGTAATACCTATATTGAGGTAGACCTCTCTGTAGGTATCCTCCTGACATTAACAAGTATATTCCTTCCCCATAATGGAATGCAAATTTTTATTTGATCACTCATTTATAGCAGTTGtttaaatgtgtatatttatatgaaggtgttctaattaaaaacaaaaaagttctaATAAGTTGCCAGATTCCTAATTAAATTTGAGTTTTACCTGATCAAAAGATAAGGAAAAATGAGTTTTGGTtttaaaagttcctttaaaaaaaaaaaaagtagagcagaattgtttttcatttttcttagttCCTGGGATTATTCTGCAGAAGAAAGCCCAGTGCTTTCTCCTAGTTAGATGATTTTTCTCATTGACTTTGGTATAGGATGTGAACCCTCTTACATAAATTCTGTACAGAAGAGAAAGGGC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