Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name FXR1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name FMR1 autosomal homolog 1
Also known as FXR1P|MYOPMIL|MYORIBF
Coordinate chr3:180912670-180982753
Strand +
Gene summary The protein encoded by this gene is an RNA binding protein that interacts with the functionally-similar proteins FMR1 and FXR2. These proteins shuttle between the nucleus and cytoplasm and associate with polyribosomes, predominantly with the 60S ribosomal subunit. Three transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from FXR1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
FXR1P1 chr12:42430818-42433356 - Intragenic
ENSG00000257376 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001363882.1
CTTTGCGGTTCCAACATGGCGGAGCTGACGGTGGAGGTTCGCGGCTCTAACGGGGCTTTCTACAAGTCAATTCACAATGAATCAAATGTCCCCATTTTGGAACTCTGAAGTATTTATAATTGATCTCTATACATATCTACAATCTACTGCTTGTTTCTACTTAGACTTTGACTCCATTACTCATTTTGCCTCACAAAGTGAGTTGGTACTTTGACAAAGGTTGGAAAGGACACTAGCCACCTGTGTGTGCACTGAAATCATGTACGCTTGAACATTTGGAATTTTATGTCCAGCCATAATCCACTTGCATATGCACTTTGTGGAAACTGTGGTCTTCAGAACTCTGGAAGAATGagaatggcggagtggaaaagagtcctggatttgaagtaaacagatgagaattctagGGATTTATCAAAGATGTTCATGAAGACTCCCTTACAGTTGTTTTTGAAAATAATTGGCAACCAGAACGCCAGGTTCCATTTAATGAAGTTAGATTACCACCACCACCTGATATAAAAAAAGAAATTAGTGAAGGAGATGAAGTAGAGGTATATTCAAGAGCAAATGACCAAGAGCCATGTGGGTGGTGGTTGGCTAAAGTTCGGATGATGAAAGGAGAATTTTATGTCATTGAATATGCTGCTTGTGACGCTACTTACAATGAAATAGTCACATTTGAACGACTTCGGCCTGTCAATCAAAATAAAACTGTCAAAAAAAATACCTTCTTTAAATGCACAGTGGATGTTCCTGAGGATTTGAGAGAGGCGTGTGCTAATGAAAATGCACATAAAGATTTTAAGAAAGCAGTAGGAGCATGCAGAATTTTTTACCATCCAGAAACAACACAGCTAATGATACTGTCTGCCAGTGAAGCAACTGTGAAGAGAGTAAACATCTTAAGTGACATGCATTTGCGAAGTATTCGTACGAAGTTGATGCTTATGTCCAGAAATGAAGAGGCCACTAAGCATTTAGAATGCACAAAACAACTTGCAGCAGCTTTTCATGAGGAATTTGTTGTGAGAGAAGATTTAATGGGCCTGGCAATAGGAACACATGGTAGTAACATCCAGCAAGCTAGGAAGGTTCCTGGAGTTACCGCCATTGAGCTAGATGAAGATACTGGAACATTCAGAATCTACGGAGAGAGTGCTGATGCTGTAAAAAAGGCTAGAGGTTTCTTGGAATTTGTGGAGGATTTTATTCAGGTTCCTAGGAATCTCGTTGGAAAAGTAATTGGAAAAAATGGCAAAGTTATTCAAGAAATAGTGGACAAATCTGGTGTGGTTCGAGTGAGAATTGAAGGGGACAATGAAAATAAATTACCCAGAGAAGACGGTATGGTTCCATTTGTATTTGTTGGCACTAAAGAAAGCATTGGAAATGTGCAGGTTCTTCTAGAGTATCATATTGCCTATCTAAAGGAAGTAGAACAGCTAAGAATGGAACGCCTACAGATTGATGAACAGCTGCGACAGATTGGTTCTAGGTCTTATAGCGGAAGAGGCAGAGGTCGTCGGGGACCTAATTACACCTCCGGTTATGGTACAAATTCTGAGCTGTCTAACCCCTCTGAAACGGAATCTGAGCGTAAAGACGAGCTGAGTGATTGGTCATTGGCAGGAGAAGATGATCGAGACAGCCGACATCAGCGTGACAGCAGGAGACGCCCAGGAGGAAGAGGCAGAAGTGTTTCAGGGGGTCGAGGTCGTGGTGGACCACGTGGTGGCAAATCCTCCATCAGTTCTGTGCTCAAAGATCCAGACAGCAATCCATACAGCTTACTTGATAATACAGAATCAGATCAGACTGCAGACACTGATGCCAGCGAATCTCATCACAGTACTAACCGTCGTAGGCGGTCTCGTAGACGAAGGACTGATGAAGATGCTGTTCTGATGGATGGAATGACTGAATCTGATACAGCTTCAGTTAATGAAAATGGGCTAGGCAAAAGATGTGATTGAAGAGCATGGTCCTTCAGAAAAGGCAATAAACGGCCCAACTAGTGCTTCTGGCGATGACATTTCTAAGCTACAGCGTACTCCAGGAGAAGAAAAGATTAATACCTTAAAAGAAGAAAACACTCAAGAAGCAGCAGTCCTGAATGGTGTTTCATAAACTGAAGAAGTTCCTAGTTTACAGTTCTTTTACATTACATTTACAATAGTGCTTGTACAAGCTTGCCAAAGATAGAATATGGATCGCCAGTCTTTACATCGCACTTTCAGTTCCTCCATTTGGAATTCAAAAAGGGGAGGGATCCTGAAGAAATCATATGTTAAACATACTTTGACACCTACTGTGTTATAAAATATATCATCAGATGTGCCTTGAGAATAGTATATGTAACATTAAAAAAAAGTTGCTGGCTATAGGAAATGTTATTTTGTTTTCAAAATATGGCAGAGATGGGGGGTGGTGGGTGGGGTGGGATCCCTAACGTAATATTCTTTATGAAAGCATTAGCTGCTTTTGTTACATTTTTAATATGCAACCACTTCTTCACCTGAGGAAAACTAGAATGAAATGCAGTCTAAAATATTTTGCACTGAATTGTAATTTCTTCATTAGTTTAGTCTGGAAACTGGTCTGTTTTAATGTGTTTTTTAAATGCTGTATGTAGAGGAAAATCTGCAGACCACTGGAATACATTTGTTAAACTCTCATCTGCAGGGACACTGGGCGATACTTGGCAGTGACTGTTCTACCTTGAGGCTTTGTTTGGTTTATTTATTAAAGTGTACAGTATTTAAAAATCAAACATAGCTTTAGTTAAAACACTAAGCTGAATTAGTCATGTCCATTCAGACATAACCTGAACTACTGAAAAGATCAATTTCCAGAAGGTTTATTCTGTATAAACTACATGTTAGTCTTCAGTAGAGTATCttttttttttccttttttttttttttatttCGGTTGTTTGATGTGCAATATGTTTTTGTATGCAGGTAGTAAATAAACTTTGATCTTCCATTTGCTGAATTTTTTTAACTTTCTACTTTTTACACCAATTGTTGCAAAATAGTTGGAGCTATTAATAGGCTTAGGATAGTATACTTTGCTTTTTAAAAAGCATTTATACTTGCTCATAAATAGCATTAAAATGTCAGTTGGCCATTTAATCATTTTGTAATGAATCATCTGAAATCTTTACACAAGTTTAGGCTGTTAGATGCATAGGTAATTAATAATACATGTGATAATTAGCAAAAAAACCTAACAAAATTCTAATCAAAGGCAACTTTGGAAGACAATGGGGGATAGAAGGGATGACAAGCAATTTTTAAATAATAGGCCAATGATTTGCTTTATTCATTCTCAACTTATTTTGAAGGCTCTCATATCAGTGACCAAAAATCAGTTATTAAACTTTATGTATATATTTTAGCCAGAGCTTAATTTTTATGAAGATAAAGACATGAAGTTTAACAATGGACAACAGTTAGTACAGCTAATTGTGAGGTCAAGTAATTGTTAGACATAGGGGAAGGCTTTGTTCCACAATATTATATGGACCACTGAACAAGAATGACAGCCCTTTGTTATCACTTGGCATATGAAAAGTGTTGTGTGCATAGTTTGTGTTAATTTTTTATGTGCATAAAAATGTGATTTTAATTTATATGCTCTGAAGGATAATTCAGGGTATAGTTAAAAATGTACAATGTGCCAGTTCAGTATATATAACCCTAGCCCTCAAATTATTCTGATTAAGGTTAAAATGTGCTGGTATTACGTGCTTTTTCCTGAGGCCTTCTGATTGGTTCTTGGTAACAGAATTTTAAAGTAAGGTGTGAGTAGTGCAACTCCTGTCCTTTATATATAAAGATATCAAGTAATTTCATGTCCTGATATTTAAAAAAATTACCCACAAATGTGTTTTTTTAAATCGATCAAAGCTAGCAACAGGTTAAATTGTCTCAGTTCTCTTACATAATTGGGTTAAAAATTATAAGGTATTAGAAGAATTTTAATTAATGCCAAATTGGTAAATATGGTGTAAAAAAAAAAAAAAAGACTTTTCATTTTCTCCCACATAGAATAGTCAGATATATTAAACATCCCTTTTCCATAAAGATGGTTTCAATGGGAATGGAAGAAACAAAATCTTAAAAGAGTGAGTATAGCTGAACCAATTCTTCATTCTAGCAATAACCACACTAAGTTCATTACTTTACAAATGACTAAACCCAATGTCTTGTCCTTTAAAAAATATAGGTAGTGCAGAATTGTGATAAATACGCATTTGTTTTTTTAGAGAGCCCCACTCCCCAAAGGGTAGCCATTAATTCAGGTAGCCTTTTAAATGTATTTGAGAGGGTTCCGTCTTTTTGGCTGCTATCCTAGTTAGGTGAGATGTTGCTATGGGAAGAACTTGCCACTATACACTAAACAGACACTTAAGCAAAAGATGTATTCTGGAgcctggcacagtagcttatgtctttggttctagctactcaggagcctgaggtgggagcatcatttgaactcagttctgggcCACTGAGACCCTCTTTAAAGAGAAGGAAAAAAAGGTATTCTGGAAGATCTTGTGCAGTTGCAACAATGTTTCAGCATATATATGTGAATTCATATATGACACCTGAACGGAATCATGAAGTAACAGCTGAGATTATATGGTGGCAAAAATGACCTGCTTTTCCTGAAGCTTTGGGAGGCCTAGGATTCTTGCTTTAGGCATCACCTTTGTTAAGCCTTAAAGGGGGCTACAACTTGTGCAAAATGGTGTCTCTGGTAACACTTCAGAAATAATTGGCAAAAGTGTAATAGGAATACACAAAtctttattttgaaataatcttgtattttaatgtggaattagaagcagcacatcaaactggtgagttcacagaaacttacctgagatgatgctGGGTTCCATTGCTGTTGTGCTAAGTCACGTATTTTTGTAGCTGCTGTTAGCTGTGTCTAGCGTTTTGTAACCTAAGGAGGGT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