Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name LLPH
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name LLP homolog, long-term synaptic facilitation factor
Also known as C12orf31|hLLP
Coordinate chr12:66116555-66130750
Strand -
Gene summary Enables RNA binding activity. Predicted to be involved in dendrite extension and positive regulation of dendritic spine development. Located in chromosome and nucleolus. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from LLPH

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
LLPHP4 chr12:12845890-12846169 - Intergenic
N/A UCSC
LLPHP1 chr20:20721170-20722391 + Intergenic
ENSG00000270793 UCSC
LLPHP2 chr21:25762574-25763355 - Intragenic
ENSG00000235514 UCSC
LLPHP3 chr2:221944174-221944811 + Intergenic
ENSG00000233868 UCSC
LLPHP5 chr22:41676542-41677157 - Intragenic
ENSG00000285531 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_032338.4
GACTTCCGGTCGGCGTGAGCGTGAGGTGTGGGTGTTCGTTTCTCAGGTAAAACATGGCTAAAAGCTTACGGAGTAAGTGGAAAAGAAAGATGCGTGCTGAAAAGAGAAAAAAGAATGCCCCAAAGGAGGCCAGCAGGCTTAAAAGTATTCTCAAACTAGACGGTGATGTTTTAATGAAAGATGTTCAAGAGATAGCAACTGTGGTGGTACCCAAACCCAAACATTGCCAAGAGAAAATGCAATGTGAGGTAAAAGATGAAAAAGATGACATGAAAATGGAGACTGATATTAAGAGAAACAAAAAGACTCTTCTAGACCAGCATGGACAGTACCCAATATGGATGaaccaaaggcaaagaaaaaggctgaaggcaaagcgagagaaaagaaaggggaaaagcaaagcaaaagcaGTGAAAGTGGCAAAGGGTTTGGCCTGGTAGACTCTTAAAACCTTGGAAAATGCCACATGGGATAGATGACGGATTAGAATGTATACACATGTATACTTTGATTTCAACTGCCACCAAATGAAAACCATTTGTTTTCCTATTTTAACTTGGCCTTTTTTCTTCAATTCAAACCCAGCATAACTCCTCAAGTTTGTTTTGGGAACTTGAATAAAATATTTTCTTTGATACATCCAAGCTCTACTGATACTTTAACTGGATGCTACCCAATATCCAGTTATAATCAGGCCTCAACGTTCTGTCAGGTATTAATATGGTTAGAATTGTTCTTACAACTGGTAATTATAGTCAATAGAGATAAAACAGATGATGTACTGACAAATTTTTGTGAACTTAGATTTTAAAGAAAGTTGTTGTATAATCATATCATTTAAAAATACTACATTAGggctgggcatggtggctcacacctgtaatcccagcactttgggaggccgaggcaggtggatcacgaggtcagttcgagactagcctggctaatacagtgaaaccccatctctactaaaaatacaaaattagccgggcatgggggcgcgcacctgtagttccagctactcgggaggctgaggcaggataattgcttgaacccaggagatggaggttgcagtgagccaagattgccccactgcactccaccctgggcaatggagtaggactctgtctcaaaaaaaaaaaaaaTAATGGATCTTATAAAGTACTTGTGTGGAGCTTTGATTCCACAGAATAAAAGATATTTTGTGTGTAGATCTTCAAGTCTGATTTTTTTTTCTTTCATGTATGCTTAAGGTTTTTTAGTCCTAGAGAAGACCAGATTTCAATTAAATGTTTTCTTATCTTAATTTTAGGTAGAATATTAACATATACAAATCAGTATGCTTTTTAGGAAATTAGAACATTTCAGGTTTTTCATGGAAACTGATTTAATGTTCTTTAGTGTTAATATTGTGTGGCCTAATATAGTATCATGcagcattccccggagtgtgttcttcagtatcagtttcctctggatgcttggttaaaaaaaataaattgtgttcacatcgatttgggaaatgctacatacttgaagatttacaaaagattttagtttaggattagaatagtcctacagggttccagcagcaaagaaacctgtttagcGTCTACTCTTTGAAACTAGTTTTCTGAGAAATGATTTTTAGTTAAATCTGTCTTACTACAGTTTGCTAAATTCATTTTTATTTTACTTTTAGTTAAGCAATCTAAACTTAGCATTCCCTCTGAATTTCACTATAATCAGATTAACCATCTCATATGTTAACTGGAACAACcaaatacttactgagtgcctagtatgtgggccagggactttccagatgcttgggacagattgaataagataagatttctgctctcatagggctGAGAGCTGTGTATCTGTTTAGAAGAAGATGTTAACTTCCCAGGAGAACTCAAGTAAAATGTGAAATAGAATAAGGCCACTTGGTCATGAGGTCACAAACTTTGTGCCAGGCACACTGCTAAATTGGGGCACAATACATGGACATGTATTGTAATAAAGAGGACATGACCCAAATGTTTCAGAAAATTTAAGCTTATAAAATTTGATGCCAGTAAACTCTTGGAATTGTTTAAATATAGTAGACTTTTCTTATTTTTCTCAATAGTTTATTGAAAAGTTGGTAGATAACTTTAAATGCTTAAAATTTCTTAACAGCTAAGAAAGATATGAATTGAAAGATGTCATTCATGATCTTTGTTGCCTTTGGTGTAGGTATGAATAACACTAGCATTTGTGAGGGAAAAGTGAATATGTACATTTTTATTCATAAAATAAAAAAAATTGCAAACAACCAGTTAAGCCACTGACAATATCAGCCTAAATACAGTAGCTGAATTATTTATGttttttttttttttttttttgagatggggtctcactctgtcacccaggctggagtgattggcacaagtgtggctccgctgcaacctccacctcccaggctgaagcgattctcccacctcagcctccccagtagctgggactacaggtgggtgccaccacgcccagctaatttttgtatttttgtagagacagggtttcgccatgttgcccaggctggtctcaaactcctggactcaagtaatccacctgccccagcctcccaaagtggtgggattacatgcgtgagccaccacacccggccTAATGTAGACATTTTTTATGATTTTTGGAAAAGGGGGCCAGGCACCAaattctaacaatttgggaggctgaggcagatggatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaacatggtgaaaccctgtctctactaaaaatacaaagttagctgggcatggtggcaggtgcctgtaatcccagctacttgggaggctgaggaaggagaatcgcttgaacctgggaggcagaggttgcagtgagtcaagaccacaccattgcactccagcctgagcaagaagagcgaaactccatctcaaaaaaaaaaaaaaaaaaaGTCTACATTCGTGATATTACACAGTTGGCACTTATTTACATTTTGGCAGCATTGTCAGGTAGAGACCAATGCCAGGGTTATGTTCATGTTTTCTGTGGCTGATAACCTCTAATTTGATTCTGTTGATAGTAGCTTTGAGCTTTCATCCAGAGCCTCTCTGATGTTAGGATTTTCACTTCATTGTGTCCAGTCATGAAGTTTGTCCATTCAGGATTTAACTTGAAAGTTAACAAAATCAAAAATCAAAGCACCATTACCAGAAAACATATTTGGGAATCATGTTCTCAAGTGTCACATGGCCTCTGGAAAGGCGACTGCTGAAGAGAAGTTTACTGACACAGTGTTGTCAGTACCCTCTAAGGCACTGAGTTCCTGAACACTACCAGCAAGATTCTCCCCACCTCCAAATATTGGCAGGAAATTTAGACTAGCATTTCAAAATTAGTGCAGGGGTATGGTCACATCTTTGGCACTTTATTTTTAAAGATTACAAATCGAGAAGTATAGCATAGTCCTTTTATCTTTTAAATAATTAGCTTATTTTTTTGAAATTTGTCATCTTTTTGACTGACATTTTCCAGAGAATTGCTGTAAAGCCACAAGATGGAGCTCAAGCTAAGCACCAAATCATTTTGGAATTAGATTGAGTGAGCTAAATCACATTAGGAATTGAATGTAACACTTTTTGTGTTTTAAGAAATTAAGTCTGAAATCAAAATATAATTTAAAGAtgatcaaaactgcttcaagtattaactcatttaatctgcccagcaatctcatgagtttggtactaatgttatctgagtttggtactaatgtaatctctgtttacacatggggaaactgaggcacacaggccatacaactaaaactgaaatctgggattcaaatttaggcagtgtggctctagagcctatactcttacaatgccattctgCCTCTCAAGGATGTGCAAACTCTTGCTAAGAGAGAAAGGTGATTTTAGGATAGAATACCTATTTTTGGGTCAACCTGTGATAGATTGGGTTCATGTGGGCTCAGGATCAGATAAAGAGCAGGTTTAAGTAGAATAATGATGTACAGAACCCTCCTCAAATCTCTAGGCCTAAGGCAGACTGGATTTCCTCAGGTGACACTTCATTAGGAATGGGCTGACCAATCCAAAAGGGGAAGGTGTAGGCCATGATCAGTAGTTGCCCAAGGTACTAATCAGAGAAGAAATGCAAACTGCAGTTGAAGCTCTAAGGTAGAATCAAGTAGTGGTTTTGACCACATCCTATTTTCTACTGTCACATTAGTGTAGATATCTCTTCCCACTATGTAATTCACATGCTACATCAAATAAGGATGCAGCAGTATATATTTGCTTATTAGGAAATTCAGATATTTTCAAAATTTGGATCCGTGTTTCTGGAATATGGCTTAAGAGTTGGAGAAGAAAAATAGCTATAAATGACTTGAATCAAATATCTGAAATGGACTGGTGGTGATGGTGAGGGGCAGCAATGTGTAATTTAGGGAAGTGCTGACCACAACATAAAATTGGGAGGAATCTAAGGCATTGCCAAATTTATAAATACTACAATAgaaatgcagatgctaagctgttggctaatcttactagttaagtgactaacttctgatgccatctggcagagtgattcaaatttgtgcTAAACACAAAATATATGTCTTTTTCCCTCTATTTGCCTGCATGTATTAATAAAAACACTGTTGCAGTAGACACATACCAATTTTACAAGGAAATGTTTAGGGGTGAGGTGGGACTGTTAAATACTTACATCAGGTCAAAGGTCACTCTGCTGTTTCCAGAGGACTGTCAGGTAGCCAGGAGGCCCAGGGCCACTTTTGGGCCTGCTTACAAAACCCTAAATTTTCCGCAGTTGAATGCCAAGAGTCTTTTGCAGTTATTTTAGAGCAGGGGAGAAAATACAATGTGTTGCCAAATAAGCTTAATTTGGTAGGCAAGCAGTA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