Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name VAPA
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr18) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name VAMP associated protein A
Also known as VAMP-A|VAP-33|VAP-A|VAP33|hVAP-33
Coordinate chr18:9914016-9960021
Strand +
Gene summary The protein encoded by this gene is a type IV membrane protein. It is present in the plasma membrane and intracellular vesicles. It may also be associated with the cytoskeleton. This protein may function in vesicle trafficking, membrane fusion, protein complex assembly and cell motility. Alternative splicing occurs at this locus and two transcript variants encoding distinct isoforms have been identified. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from VAPA

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
VAPAP1 chr15:89200499-89201829 - Intragenic
ENSG00000259948 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_194434.3
GAGGCTCGCAAGTGCGCGTGGCCGTGGCGGCTGGTGTGGGGTTGAGTCAGTTGTGGGACCCGGAGCTGCTGACCCAGCGGGTGGCCCACCGAACCGGTGACACAGCGGCAGGCGTTAGGGCTCGGGAGCCGCGAGCCTGGCCTCGTCCTAGAGCTCGGCCGAgccgtcgccgccgtcgtcccccgcccccagtcagcaaaccgccgccgcgggcgcgcccccgcTCTGCGCTGTCTCTCCGATGGCGTCCGCCTCAGGGGCCATGGCGAAGCACGAGCAGATCCTGGTCCTCGATCCGCCCACAGACCTCAAATTCAAAGGCCCCTTCACAGATGTAGTCACTACAAATCTTAAATTGCGAAATCCATCGGATAGAAAAGTGTGTTTCAAAGTGAAGACTACAGCACCTCGCCGGTACTGTGTGAGGCCCAACAGTGGAATTATTGACCCAGGGTCAACTGTGACTGTTTCAGTAATGCTACAGCCCTTTGACTATGATCCGAATGAAAAGAGTAAACACAAGTTTATGGTACAGACAATTTTTGCTCCACCAAACACTTCAGATATGGAAGCTGTGTGGAAAGAGGCAAAACCTGATGAATTAATGGATTCCAAATTGAGATGCGTATTTGAAATGCCCAATGAAAATGATAAATTGAATGATATGGAACCTAGCAAAGCTGTTCCACTGAATGCATCTAAGCAAGATGGACCTATGCCAAAACCACACAGTGTTTCACTTAATGATACCGAAACAAGGAAACTAATGGAAGAGTGTAAAAGACTTCAGGGAGAAATGATGAAGCTATCAGAAGAAAATCGGCACCTGAGAGATGAAGGTTTAAGGCTCAGAAAGGTAGCACATTCGGATAAACCTGGATCAACCTCAACTGCATCCTTCAGAGATAATGTCACCAGTCCTCTTCCTTCACTTCTTGTTGTAATTGCAGCCATTTTCATTGGATTCTTTCTAGGGAAATTCATCTTGTAGAGTGAAGCATGCAGAGTGCTGTTTCTTTTTTTTTTTTTCTCTTGACCAGAAAAAGATTTGTTTACCTACCATTTCATTGGTAGTATGGCCCACGGTGACCATTTTTTTGTGTGTACAGCGTCATATAGGCTTTGCCTTTAATGATCTCTTACGGTTAGAAAACACAATAAAAACAAACTGTTCGGCTACTGGACAGGTTGTATATTACCAGATCATCACTAGCAGATGTCAGTTGCACATTGAGTCCTTTATGAAATTCATAAATAAAGAATTGTTCTTTCTTTGTGGTTTTAATAAGAGTTCAAGAATTGTTCAGAGTCTTGTAAATGTTATTTTAATAATCCCTTTAAATTTTATCTGTTGCTGTTACCTCTTGAAATATGATTTATTTAGATTGCTAATCCCACTCATTCAGGAAATGCCAAGAGGTATTCCTTGGGGAAATGGTGCCTCTTACAGTGTAAATTTTTCCTCCTTTACCTTTGCTAATATCATGGCAGAATTTTTCTTATCCCTTGTGAGGCAGTTGTTGACTGAGTTTTTCATCCTTACAATCCTGTCCCATGGTATTTAACATAAAAAAAAATAAAACTGTTAACAGATTCTTGCTCGATAGCTTGTTTGTGTCTGTCGTGTTATTAGAGGGAACTCCACTATATATGGTCACTTGAAATTATGATGCAAAGGTTTCTCTTGCATTGAAACCCTCTTGGATATTACAGTATTTTTAATTGAAAGTCCTAATTCTGTTAAGGAAAGGAGTTGATTAAATTTTAAGGTACCACTGGTATTTTGGGAGATTATAATCAGTTTGTTTTCAAGATAATAGAAAATAAGGTCCATGAGAATAGAAGTTATGTGATTTCAGTGAGTTGATGTGTACAGCATGGCTGTGCTCCATCTGATTTACCCCATTCTTAAGTTCTGAGAGTATGTTCTCAAGGAAGATTTAACTCTCTTTGGTTTTAAATTACTTTTTAACCAGCCTAATAAATAAGTCTTACTACTTTTCATAATATTTCATAATAGTTAAAAGTAGGTGTTTTTTTCGTGCTCAATTTGGCACTCAAAATAATGTTCATTATGGAAGTTTGGTAATACTGAGCAAGCCTGTGGAATTTTCTTTATGAAAAATGATTTTAGCCTTTGCAAATGTTAACCATGTGAAACACATTTTCAGTATAAGTATGCGTTACAGGGTTTGATACTTTCCTGCACTTAGGTTTGTCCTATTCTTCATTTATTCATACTAGGATAGAAAATTTTGGAATCAGAAAATAGATCCAGTGTTTAGCTACATACAATCTAGTACAAGTGAATTTTTATTCTTAAACATAGGTGTGTTGGCTCTTTTTTTAAAAGATGCGCTCTACCTGAAAAGGAAATTGGATTTTAGAACTGGATGTGGTGCAGTGAAGTATTTTAGGCCCAGGTCTGTGTACACATTTTATAGAAGAATGAAGTACTCTGAAGTATTTTGGTTGCCTTTTCATTTCAACTGTGTTTTGAATTTGTCAGATCACACATATATTGTGTTATTGGGCGCTGTGGTATCTTTTATAAAACCTCTTGCTTGTGTGCAAAAGTTCCTAAAAGGAAACACAAGTAATGCCTATCCATTACTAGCATGCTATGCTGCATGCTTTACTGCCATTGCTGTATGCTTTACTGTCTTTGTAAAAATCCCCCTCTCCCCTTTTCTGGTAACTGGAAAAGCATGCTAAAAATAGTCTTATATTTTCACCCCATAAATGCAGAATCAGTAATTCCTTGGCTTAAAGCTCTTATATAATCAATATTATTGGTGGTAAATACCAAGTTTGGTATCTCATAGCTATCTTTTTTTAAAGAAATTAAGTTCTTGAAAATTTAGCCAAATCCCGTTTTATGggaatgctctttagaattcattttgttcagcccctttgttctatggttgagaaatctgaggccttacgaaggttaagagaactttccccgtgtctcacaggtaggtagaggcagagctggaactagatatctggtctgttgactctagctcagtgtcttctGGTAACTGTTGAAAATTGTCTTAGTTTGAGAGATGGCTGAAATAATGAACATAAAATGCTATTTATAATAACAAGTATATGTGAAATTTCTTATTGTAAGACTACTACCGGCTTACTGTTGAATAGTTTGGTTATAGTGTTTAGGCTAGAAATGCCTCCCACATTGGTAATAAACATTACAAAATACAATGTATTTTTAGGTAGGCATTTTATAAAATGCATTATGCCATGGTTGCTTTTGAGATAGATTGTAGTCTGGGTAGCATCTTTAAAATGTATGTGGGCTTAACTGTTGTTCATATCAGGAGATGCTCTGATTGTATAGGTGAGACTCTGTTTCTGTTATTTTTAATTGCTGTATGAAATGTGATCAGATTATTTTACTACCAACAGTTATAGTTTGAAAGTCCAACTGTATTAATTGACTGATAATATGATAATATAGAGATTAAATTGTTTGTCTTCATTCCTTATATGTTTAGAAGTTTTTGCTTTGTCTGCCTGCTTACTTGTATATGTAAGCATGAGGGAAATACACTGTTGCTAATACTGAAATTACAATCAAGTAACTAAGGCCTTGAGTTCATATGTGACACTGAATGCACTAGCTTCCTTCGTTCTATAACTAATGTACCTTAACTTCCCCCATTCTTATATTTACAAGAAGCTAAGTCATTATGTTCTGAGTGTGTGGTATGTTCCCTTAAAAAAAAATGACACTTGGAAGAAAAATGTATGAAATTCAGAAATTCCGATCAAAGAAAAGTAAttctttctttttttttttgagacagagtcttgctttgttgcccaggctggagggcagtggtgtgatctcacctcactgcagcttccgcctcctgggttcaagtgattctcatggctcagccgcctgagtagctgggattacaggtgtgagccaacaagcccggctaatttttgtatttttagtagagacaaggtttcaccatgttggtcaggctgggctcaaactcctgaatccgcctgcctcggcctcccaaagtgctgggattacaggtgtgagctgccgcacccagccAAGAAAAATAATACTCTTAAATACTTAGATGTTCACCTAAAGTTGATATTATTTGGTATGGGAATTACTTTTGAACTGTAATCTTTCAGATTACACCACTTTGAAAACAAGTTTTAACAGTAGGGTAAAAATATAGTTTTTGAGGGTATTCCCAACTTGTGATCTTCTACCACTTTAGAGACATTCAAGTAATAGTTTTCTTAGAGCTTTGCACATTCCTATTCACTGAGATTTTAAAAATTTCACCTTTATTCGAGGGAAGGATCAATGCTTATTACCATTTGGAAAAACGAAGATCAGAAGGTAAATGATCTTTATTTTCTAGCTTTAAAGGGAAATTAAACCATTCATGAATAAACTTTAAAAATGTGAAGTGTCCTTTTCCTTTTCACAATACAAAAAAAATTTCAACAGATTGTGTGGTTTGTGCATTTATATCCTGTTAAGCATTAATAGCTAATCACTGGGACTTGAATTCTGATGGCAGATAGTCTCTTGCTTAGTGAGATGGAGTTAACTATTTTTTAGTAGGAAGTGAGAACAGCTGATTTTCATGCCACGTTTCATAGCCCCACTTTTGGTAGACTACCACCACGCTTCTTCGCGTAAGCAGTGGCATCTTGGGAATGAATGCCCAGCCGCTCGTGGGTTGGTGCAAAGAAGTATAAACATATATCACTAAGGAAAAAGAAAGTTTGTCTTGCCCTTCTGACACAGTGTGTGCACTTCAGGCAATTTTTGGAAAATATAAAAAATTCCAAATTCTGCCTTTCAGCAGCATCAATTGCTAGGAACATTTCATTCATTTCCCTGTAATATTAATGTTCTTTAAGCATAATCACTAATTATAAGTTGTATCCTATTTTTTTCCAGCTTAATTTCTGTGGTTTATTGAAAA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