Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SDR42E1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr16) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name short chain dehydrogenase/reductase family 42E, member 1
Also known as HSPC105
Coordinate chr16:81988855-82011526
Strand -
Gene summary Predicted to enable oxidoreductase activity, acting on the CH-OH group of donors, NAD or NADP as acceptor. Predicted to be involved in steroid biosynthetic process. Predicted to be integral component of membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from SDR42E1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SDR42E1P5 chr2:102411197-102412108 + Intergenic
ENSG00000236785 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_145168.3
GCCCCAGCTGTGGTGATGGGTAGCTAGGAGGCCTGGGCCTCTCTGCCTGCTGTAGCCGTCTGCCGCGCCCTTGTTCCTGCAGCTGTCCAGTTATCTTTTGACTGCCACATATGGACCCCAAAAGATCTCAAAAGGAAAGTGTCCTCATTACAGGAGGAAGTGGCTATTTTGGTTTTCGCCTGGGCTGTGCCCTGAACCAAAATGGAGTCCATGTGATTCTGTTTGACATCAGCAGCCCTGCTCAAACCATTCCAGAAGGAATCAAGTTTATACAAGGAGACATCCGCCACCTGTCTGACGTAGAGAAAGCCTTCCAGGATGCAGACGTCACTTGTGTGTTCCATATTGCCTCTTATGGTATGTCAGGGCGGGAGCAACTCAATCGAAACCTGATCAAAGAAGTCAACGTCAGGGGCACAGACAACATCCTCCAGGTTTGCCAAAGGAGAAGGGTGCCCAGGTTAGTTTACACCAGCACTTTCAATGTCATCTTTGGAGGTCAAGTTATCAGAAATGGGGATGAATCTCTGCCCTACCTGCCTCTTCACCTCCACCCTGATCACTACTCTCGGACAAAGTCAATTGCAGAGCAGAAGGTGCTGGAGGCGAATGCTACACCCCTGGACAGAGGCGACGGTGTCTTAAGAACCTGCGCTCTGAGGCCAGCTGGCATCTATGGGCCTGGAGAACAAAGACACCTTCCCAGGATAGTCAGCTACATCGAGAAGGGTCTGTTCAAGTTTGTCTACGGGGACCCCAGGAGCCTGGTTGAGTTTGTCCACGTGGATAACTTGGTGCAGGCTCACATTCTGGCCTCAGAAGCCCTGAGAGCTGACAAGGGCCATATTGCCTCTGGGCAGCCCTACTTCATCTCAGATGGCAGACCCGTGAACAACTTTGAGTTCTTCCGGCCTCTGGTTGAGGGCCTGGGCTACACATTCCCGTCTACCCGCCTGCCATTGACCTTGGTCTACTGCTTTGCTTTTCTAACAGAGATGGTTCACTTCATTTTGGGTCGACTCTACAACTTCCAGCCCTTCCTCACTCGCACTGAAGTTTACAAAACTGGTGTCACACATTATTTTAGCTTAGAGAAAGCCAAGAAAGAGCTAGGTTATAAGGCTCAGCCATTTGACCTCCAGGAAGCAGTGGAATGGTTTAAAGCCCATGGTCATGGCAGAAGTTCTGGAAGTCGTGACTCGGAGTGTTTTGTTTGGGATGGGCTATTGGTCTTCCTCCTGATTATAGCAGTTCTCATGTGGCTGCCTTCTTCTGTGATTCTGTCACTGTGAAGGAGGGGCCAGAAATAAGGTGATCACAGTTGGCTGAGATGGTTCTCAAGAAACATGGGTTTTAAAATGTGTACAGTGATATCTGGTGCCAAACATTGGCTCTTCAAATTGCTACTTAAGAATAGGTTCTTGGATTGAATCTTTATGTCTTATTTCCTTGCACTAATCCAGATGGGAATGAAAAAGCAGAAGCAGAGATTAGTTTGAAATTTGATTTGTTATGTGCTTCTGTTTTAGGTGGGTACAATAGAAGTCAGTTTGGAGCCATAGAAGTAGGCTTAGTTGAGTTGGAGATGCCCATCTTGAATTTCTGAGAGGGCAAGATATACTTATTTCCATTTTATGCAGTCTGCATCTACCTAAAACCTCTGACTGATGTGGGAATGGCGAAACACTATCAGGCTTGAATGCGTGTGAAAAACACCAAATTGGCCCAGATCCCTAACAGAGCAATCCTCGAGGGGATGGTGGCTATTGCTGGAGAGGCATTAGCTATTCACAGGGTACGTTTTAGGTGTTAACTTTTGCCCTTTATGATATCAGGGCATTATGCCTATGTGAACACATGGTAATGTTTGATGTTTAGGCCTTTATTctacctcataggattcttttgaggattaaattcaagcatacaaagcgctCCTCAACACACATAGCCATTCTTTTTATCAGAATTGTCATGGTACATTCCTTATGAGGGCTTTCTTCCTCAGTGTTCTCTTTAGAGGgctattgctactggactttctgcaatgtctttgggtgtgccctcagagcctgcaacaagtgtatttggatatactctatttgtaaagtttaggcctctaagaaggccacaatgaagcaactaaaaatctgatgattaagggagtcaatcaagctgatgccatttttagtttaaaaatgaagcagagctctaaactcatagatgggttttcttactgggaagaagattggctctctgaagacagcttccaatgaggaatgtattgaacaatggcagcactgtCTGGCCACCCACAAACTGTTACAGATGATCCAGTTACACTGTTGCATAGGAACCCAAGTGGAAAGAAGACAGAGTCCATGTCTGTCCATGGCTCCAGCTACAGAAAGGATAGTATGGGAACATTACAAGGGGGATACATTACTGTGGAAAGTTCTGCTAGAGTTAGTCTTGAGAGTATCTGTAAAATACAAATAGATGAGCAATCCCTGTGGAATGCTGCCTGGATATTTtcagaaaagctctgaacttgatgtcataataccaacaccgtgaatatcgtgtgtggccttaaccaaggaacagaagccctttagaacttagcttcctcacttgggagctgggactgactgcatttgccctttgtataaacccacccaccccatagggttcactgggagcataaagcaagatgtggtgaaagtacttctaatataaattgcaacatcagtatgaggTGATGGTAGTGATTGTTTTTAGGAAAACGTGTTTGGAGTCTTTTCTGTCATAAAGAAGCTTTTGCATTAGCCTGGGGTTAACGCATATGAGCACCTGCCATGTATTGTTCTagaactgcttgaatatcctcatccccagagcaggtcatccaagacagcagggtggaagctgcattgtcctttatgacttggcctcaaatgtcacagtgtcattccacagtatattggttatgcaggtcaatcctattcagtaggggaaggaaatacacaaaggtatttccgtattataccagaagagggagatggtcaaaggcgatcttggaggctgagctcttggcccgatgtgagtcatccttccttttccatgaaacgttgcccacatttccagctacaaagctttttctgcctgcttcttgccagaaggattttaggggcccaacggctgtgttaacattttgcactatatccctttccattcaagctggcagtggtactgggaacattattttgaatgcgtcacctgagtcttattgcagttcactcacaaaagccacacccacaaatctctgaggtaagttctccactgtgagcttctgctcagactgccaagggacaatacgctgtgcttcttagaagccttactgtctgaacagctctctggggtgccacatcaggcctttctgagatcttaaaaagattttatactcacagccACagccatgcactgtcgtttccacagtctcgggtgtttacacaggttagccgtattcagtgtgggaggagactacacaaggatatgaataccaggaggtggtgtcattggaggccaacgtggaacctggctaccacaTTCCTGCTTCCATATctccccaattctgttactgtctcccactccagcttgaaatggtagattttctcagtgctcattccttggccctgttctaataccatactttctccctaggtgagctcacctaagcccatggcctccattttcatctcccagcccaaatatgtactactagatgtacagttccagaccactcctgggctccagactcatatctaagtacttctgcaactccacatggatgtcccacatgcacctgtcagccagtgtagccaaagtggaattcataatcctctcccaccccaaattcttacagggctcccttccttagtaaatatctccactacctgctgaatttcccatcccagagatctgggataatccctgacccctgccctctcccagacttgacacacctaacccatgtttaagccagttgatttttacttgtaatcatgccttaaaactgcccaaggtataggtgtaccttctctcccatagattccactagtagcccatttgctcttccacccatatccacaccctccttccttcagtccattctccacatgcctagccaagagactctataaaggtgcaaatcttttgtcacttctctgctgaaaactttccttaggttgagaatctttaacgtgatcaagaggctttgtctgaactggccccttgcctgtctctctaacttcatctcacattattctgccttctctgccccaattacactgaccttttttaggttcctgggctccaagcttctcaggctccctgctcctccttttggcctgaataatgtttatttcgtgtctcttgttaagtctctttctagaggccttcactgatcccagcaatttaagattggtgctcctgctacaaatgatgctacaggcctgtcatagcttcctgcctttcttttatagcattgctcataactgtaaacatttgtacggttatttgtttaatgcctgttagctctatgagggtgggaactttgtcttgcttacagctgtactcctaatgcccggcacagtgcaggagttcaataagtatttgtccaatgaatgCTGTTTTCCCATCTGCTATGGATGAACACTCTTTTCTAGCACACAGAtaactcactgtttctaatcttttggagactggggaaaatagccaacctacactagaactgtcgtaactaagtcaagattagatgaggtctagtgagtaagggAAGTCATTGTCTATATGATCTGGTGGAGTATTAATGCTATAAGGAGGTCAGGGAATGGGGAAGGAATGTGGGCCAAGTGATTTGTGCTCCCTCCACATCTCAGCTGAAAACTCACCACTTTAAAAGACTTAGTCTATTTCCTGAAAGGGAGCTCCCCTTCCTT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