Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name CRIPT
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name CXXC repeat containing interactor of PDZ3 domain
Also known as HSPC139|SSMDF
Coordinate chr2:46617215-46630176
Strand +
Gene summary This gene encodes a protein that binds to the PDZ3 peptide recognition domain. The encoded protein may modulates protein interactions with the cytoskeleton. A mutation in this gene resulted in short stature with microcephaly and distinctive facies. [provided by RefSeq, Jun 2014]

Retrocopy(s) from CRIPT

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CRIPTP1 chr12:74656569-74656797 + Intergenic
ENSG00000257323 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_014171.6
GTAGTGTTGTTGTTTTCAGCctgctgctgctgctgctgttgcggctAGGGGAACCGTCGTGGGGAAGGATGGTGTGCGAAAAATGTGAAAAGAAACTTGGTACTGTTATCACTCCAGATACATGGAAAGATGGTGCTAGGAATACCACAGAAAGTGGTGGAAGAAAGCTGAATGAAAATAAAGCTTTGACTTCAAAAAAAGCAAGATTTGATCCATATGGAAAGAATAAGTTCTCCACTTGTAGAATTTGTAAAAGTTCTGTGCACCAACCAGGTTCTCATTACTGCCAGGGCTGTGCCTACAAAAAAGGCATCTGTGCGATGTGTGGAAAAAAGGTTTTGGATACCAAAAACTACAAGCAAACATCTGTCTAGATGTATTGATGGAATTTCTGGCTTTCTAAATGATTTTACTTTCTGCCTTGAATTTTCAAGGCATAGATGTCAACTTACAGAATAACATGTTTTAAGATAATTAAGTTTAAACCAGAGAATTTGATTGTTACTCATTTTGCTCTCATGTTCTAAACAGCAACAGTGTAACTAGTCTTTTGTTGTAAATGGTTATTTTCCTTATAAGAATTTTAAGAACTAAGTGGCAAATTCCATGAAAATATTTCTCAGTTCTGTATGCACTTTTATTTAACATTATTCATATAATTCTCCCCCCACCACTTTATTTATAGATACTGCAAAAGTGAGAAGGAGATAATAGATACTTTGCTCTGAATTTGGCATCCAGAGTTAACATTTCTCCCCTCACTCCCTTGCTGGTGTCATAGTTATTAGAATCAGCAGCCTCTTAACTAATTGCGGTTTCATAGGATATATAAATGTTTCAAGCCATTATTGCTGAATGGTTCTTTAGTTATTAACCTAGACCCAAATCAAAGACCAGTTGGATTTATGATATTTTTTATTTGTTCTTGCAGCCAAAGTGCCAGTTTCTTTAATATGTGACCAAGAACACAAGGAGCATCCATATGGCCAAATAAATACACTGAATTTTAGAAAAACATATTACTTTGAATTCAAATTGTCATGAAAACCAGAACAGTGTTTGTCCATGTTGCATGTAATGAAAATAAATCCCTGCTCTGAGAAAAGCTCTTTGAAGCAAAAACCAAACttttttttttttttttttACCTCCTGTCTTGCCCCCTAAAAGAAATAAATAGAGCAAACATCTTGACTCTCCCTTTTTAAAAtttgtttgttttttttttttttttttggatacaagagctcactctgttgcccagggtggagtgcagaggtatcatcaggctctctgcagcctccatctgctgggctcaagcaattcttccccctcagcctcctaagtagctggggactacaggcgtgtgccactgtgctcagctagtttttatttttagtagagatgaggactcactatgttgcccaagctgttctcgaacttctgatctcaagcaatcctctggcctcagccttccgaagtgctgggatacaggtgtgagccacagaacttggccTCTCTCttttttttttttttttttttttttttttAACACTACAGGTTTCAAATGAATACTTTTCTTATGTTGCCTTCAGAGGTTCAGGACTTCTGCTTTTAAAACCTGCAGCCTACCGTGGGAAACCAAAAAAGCATTCCCTATTTCCAACTGCAGTATGTATAAATACATATCACTACAAAATGTATAGAAAGTGTGATGAGATACATGAATGGCATTTTTATTGGTCATAACATTTTGATGAAAAGCATTTAAAGTTTTAACTTTATAAGGCTTTTCAAAATGTGTTTTTCTGAGATACATTGTTATTTATTCATATCCAGAAAAATTACAAGGATAATACAGAATATAATAAATAATTTATCTGAGAGCAGGAAGTATCCTCTCATGCTTAATCAGTTTGGGGTTTTTAATTATAACACAGGAAACTCATAACAGGACCTGGTCAGAGAGCATCCCAGATCCATTAAAGATTGGATTCATTGACTTGGAGAAAAGTACATTTCTCAGGGATCAGCTAGAATCTGGACTTGCCTAACTCACATTTCATTTTTTTTGTTGTTGTTGTTGtttttataatttcaacttttattttagatgtaggggtacatgtgcaggtgagttatatgggtatattttgtgatgctgaggtttggggtacaaatgatcctgtcacccaggtagtgagcatagagtccaacaggtggtttttcaccccttccctcccctcttccctccagtagtcccctatgtctgttctcatttttatgtccatgtgtacccattgcttagttcccactgataagtgagaacatgcggtctttggttttctgttcctgtgtatattcactataatgacctccagctgcatccatgttgctgcaaaagacatgattttcattcttttttatggctgcatagtattctgtggtgtatatgtaccaattttctttatccagtccactattaatgagcatctaggttgattctgtgtctttgctgttgtgaatagtgctgtgatgaatatgtgagtgtatgtgtctttttggtagaacaatttattttcatttggatttatatccagtcatgggattgctggttcaaatggtagttctgttttaacttctttgagaaatctccaaactgctttcacagtggctgaactaatttgcatttccatcagtgtaggcgcattctacactgcactggcttctacagtgttgaagcattccgtttttcccacagcctcaccagcatctgttatttttttgactttttgataatagccattctgactggtgtgagattgtaactcattgtggttttgatttgcatttatctgattagtaatgttgagcattttttcatgtttgttaaccgcttgtatgttgtcttttgagaagtgtctgttcaagtcttttggcatttttttaatgggtttttgtttgtgtgtgtgtatttttgtttttgtttttgttttgagatggagtttcactgttgtcacccaggctagagtgcaatggcaccatctcagctcactgcaacctccacctcccgggttcaagcgattctcctgccccagcctcctgagttgctgggattacaggtgcctgccaccaagcgtggctaattttggtacttttagtagagacagggtttcaccatgttggccagcctggtctcgaattcctgacctcaggtgatccacccatctcagcctcccaaagtgctgggattacaggagtgagccaccacacctggccacgagttacttggttttcgttttctgaattgttttagttccttatagattttggacattagacctttttcagatgcacagtttgtgaatattctctcccattctgtaggttgtctgtttactgtattgatagttccttttgcggtgcagaagctctttagtttgattaggttccacttgtcaatttttgtttttgttgcaattgcttttgaggacttagccgtaagttctttcccatagctgatgtccagatgttatttcgtaggttttcttctaggactcttatagcttgaagtcttacatttaaatctttttttttttttttccccaaagacagagtctccttctgttgcccaggctggagtacagtggtacaatcttggctcaccacaacctccacctcccaggctcaagcgattctcatgcctcagcctcccaacctaactgggattacaggcacatgccaccacgcctggctaatttttctatttttagtaggaatggggttttaccatgttggccaggctggtcttgaattccgagcctcaagtgatccacccacctcagtctcccaaagtgctgggattacaggcatgagccactgcacccggccccttatatttaaatctttaatctatcttgaggtaattttatatatatggtgaaaggggtccagtttgagtcttctgcatatggctagacagctgttccagcaccatttattgaattagggaatcctttctctgttgcttatttttgttaactttgtcaaaggtcagatggctgtaggtgtgtagctttatttctgtctgttccattccattggtctatgggtctgtttttatatctgtaccatgctgttttggttactgtagcttccttatagtatagtttaactcaggtaatgtgatacctcagctttgttttatttgcttaggattgattttttggttccatatgaattttagaatggattttttctttttttttttttttgagacggagtcttgctgtgtctcccaggctctgagtgcagctgtgcaatctcagctcactgcaacctctgcctcctgagttcaagcaattctcctgcctcagcctcccaaatagctgggattacaggagcccgccaaccatgcccagctaatttatgtaattttagtagagatggggtttcatcatcttagccaggctggtcttgaactcctgacgttgtgatccacccgcctcagcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccactggacccggcaggatttttctaattctgtgaaaaatgatgtttgtagtttgataggaatagcattgaatctgtggattgctttgggcagtatggccattttaatgatattgattcttctagctcatgagcttggaatgtttttccatttgtttgtgtcatctctgatttctttcagcgtgttttgtagttctTGTCCAGCTCACATTTTATCTTCATACTTTGAGTAGCCTCCTTCCATGAATGGATCATCCAGTGGCCGCACTTAGGTTCTCCTATGAAGATTTTTGTTGTATTGTACCTCAGAACCATCTCCATATTCTCTAAATAATAATAATGATGGTCATAAATTGAATAGAAGTATTTACTAGATGAGGAGGAAAACCCTAAAACAAAACATGAACATAAAATATTTTTAAAAGGAAGACATACAAACAGACACTATAACCAAATAAGA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