Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SCOC
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Choloepus didactylus
Full Name N/A
Also known as SCOC
Coordinate chr3:153318974-153358656
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from SCOC

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SCOCP2 chr2:64656565-64658389 + Intragenic
N/A UCSC
SCOCP3 chr3:148095781-148097519 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP4 chr4:62728000-62729835 - Intragenic
N/A UCSC
SCOCP5 chr5:119825300-119827137 - Intragenic
N/A UCSC
SCOCP6 chr6:27351323-27353138 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP8 chr7:67043227-67045093 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP9 chr8:130087668-130089697 + Intragenic
N/A UCSC
SCOCP10 chr9:111297794-111298300 - Intragenic
N/A UCSC
SCOCP11 chr10:17474969-17475876 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP12 chr11:26345789-26347682 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP13 chr11:37055184-37057019 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP16 chr14:73054641-73056445 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP17 chr18:33473068-33474862 - Intragenic
N/A UCSC
SCOCP18 chr19:29447437-29449216 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP19 chr19:60594330-60596167 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP20 chr20:15915054-15917624 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP21 chr21:45403476-45405354 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP22 chr21:5033044-5034920 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP23 chr21:7587173-7589015 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP24 chrY:12680185-12682056 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP1 chr2:190026659-190028658 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP7 chr7:55560004-55561791 + Intergenic
N/A UCSC
SCOCP15 chr12:12979872-12981912 - Intergenic
N/A UCSC
SCOCP14 chr11:87933515-87935295 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_037830701.1
tgggagggaggaggtgCGACTCTCCCTCGGCGCAGACTCTGTGGGCTGAGAAGGCAGCGTTGCCGGTGTATTCTGGTGCAAGTGCCGGGCCTGAGGCGTCTTATTCCgaatcccctcccctctcccggCTCCTCAAGCACCAGACCTTTCATCAGGGGTTTTGTATCTGAGGCCCAAAAGTTTTTTACGCAAGATGATGAATGCTGACATGGATGCTGTTGATGCTGAAAATCAggtggaactggaggaaaaaacacGACTTATTAATCAAGTGTTGGAACTCCAACACACACTTGAAGATCTCTCGGCAAGAGTAGATGCAGTTAAGGAAGAAAATCTGAAGCTAAAATCAGAAAACCAAGTTCTTGGACAATATATAGAAAACCTCATGTCAGCTTCTAGTGTTTTTCAAACAACTgacacaaaaagcaaaagaaagtaaGGCTGATATCCATTCTGTTTTATGGAATTGctgctggtttttttttctttaaaatttgagtAGATTCCAAAAGTTACAGTACCTTTGTTTGTGGCTTCATTGAATATTTATGAAGATAATGGCAGATCTAGGTAAAAATTAAGAGCTCTAAAAGTATAACTGGAGACTTCTATGAGTTTGTATATTAACTTAGTCTATGAAAACATGTAACTATATTGATAGTAGAGACTTTATAATTAGAAttgcatatatttattaaaacttgAAAATGAGTGTTTTATcaaatttgctttgatttataaGTTTAGCACTGTCTTTTATTATAGGCTTCGTAAAAGatgatagaagaaaataactaCCATGTTGTAAAAAAGTAACCAAAATCATGTACTGAATGCACAGCTTTATGTACCCTGCCCACCGTCTTGTGCCTCTTTTCCATTTGCCTCTTCCTTCCCATTTCCCTTCTAAGGATAAACAGTTGGTTCCACATttgtaaaagtaattttaataattaatcatTTATGAAAATAACCTGAACTCATTGTTGAATTTAACCAAAATAAGATAGTTTCTCAGCTAGGACCTGTCATTTGTTATATTTAGTAACAAGATAGGACTGTTAGTTCCTTTTTGATAAATTGAAAACAGGCTATAAAAATGATTGTTCTTTGAAACTGTGAATTTTCAAATTCGGAAGATTTGTTGTTCAAAACTTCCTTCTGCACTTGGTATCTAAAAAGATGAGCTctggttgtatgtgtgtgtgtttaaaatagaaaatcttgGGAAACTTAGAATGGAAAAAGTACCTGATAAACAGTAACTAACTCCAAATATTTTCACTCCAGATTTGTGTCATCCTGACATAGATTAGGTCTTTTGGGGAATATATATGAAAGTGGATTAAGTCTGACTAACTTTATGTAATCCACATTTGGAAGAGAACAGTTATAAAGTGTTTGGTCTCTTAAGGTTTATTTATGGTGCCCAGAAGATCAAGTTTGCAAAAACCCTTAAAAGTATGTTAGTAtcagaataatgaataaaatgggaGGGTTTTACATATGTACTACTTGAtaatttttctcagtattttatcTTAGTAGTTcttgaattttctgtaaatcaaCTACTTGATTTGTAGAATTTTGGGCATCCTTTTACTAGAGTTTTTTGGTAAGGGAATTTTgcagaaataatgttaaaatgctaGTTATAATAGGAAGACAGATCCACTGATAATAGCTTGTGGTTTTAGATTTGGGCCACTTTTAATCATGGAATAATAATCTTAATGTTTGTATTGGTGCAagtaaaattcaataaatgactTCAGCTGTATGAATATATAATAGTTGTACTGCAAACATTTGCATCCCTTTTGTGACCTGATTTACAAACGTTTGAAAATTGTGTTGCGATTCTGCTTTGCTGTTTAATAAAAAGCCATTTCAGAGa
>XM_037830702.1
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>XM_037830703.1
GGCAGCGTTGCCGGTGTATTCTGGTGCAAGTGCCGGGCCTGAGGCGTCTTATTCCgaatcccctcccctctcccggCTCCTCAAGCACCAGGCGCTGAAAGCAGCACCCGGGTTTGTTTCTCCATCGGATTCTCTTAATGGTTCTGCGGAACAAGTTTGAGTGGACCTTTCATCAGGGGTTTTGTATCTGAGGCCCAAAAGTTTTTTACGCAAGATGATGAATGCTGACATGGATGCTGTTGATGCTGAAAATCAggtggaactggaggaaaaaacacGACTTATTAATCAAGTGTTGGAACTCCAACACACACTTGAAGATCTCTCGGCAAGAGTAGATGCAGTTAAGGAAGAAAATCTGAAGCTAAAATCAGAAAACCAAGTTCTTGGACAATATATAGAAAACCTCATGTCAGCTTCTAGTGTTTTTCAAACAACTgacacaaaaagcaaaagaaagtaaGGCTGATATCCATTCTGTTTTATGGAATTGctgctggtttttttttctttaaaatttgagtAGATTCCAAAAGTTACAGTACCTTTGTTTGTGGCTTCATTGAATATTTATGAAGATAATGGCAGATCTAGGTAAAAATTAAGAGCTCTAAAAGTATAACTGGAGACTTCTATGAGTTTGTATATTAACTTAGTCTATGAAAACATGTAACTATATTGATAGTAGAGACTTTATAATTAGAAttgcatatatttattaaaacttgAAAATGAGTGTTTTATcaaatttgctttgatttataaGTTTAGCACTGTCTTTTATTATAGGCTTCGTAAAAGatgatagaagaaaataactaCCATGTTGTAAAAAAGTAACCAAAATCATGTACTGAATGCACAGCTTTATGTACCCTGCCCACCGTCTTGTGCCTCTTTTCCATTTGCCTCTTCCTTCCCATTTCCCTTCTAAGGATAAACAGTTGGTTCCACATttgtaaaagtaattttaataattaatcatTTATGAAAATAACCTGAACTCATTGTTGAATTTAACCAAAATAAGATAGTTTCTCAGCTAGGACCTGTCATTTGTTATATTTAGTAACAAGATAGGACTGTTAGTTCCTTTTTGATAAATTGAAAACAGGCTATAAAAATGATTGTTCTTTGAAACTGTGAATTTTCAAATTCGGAAGATTTGTTGTTCAAAACTTCCTTCTGCACTTGGTATCTAAAAAGATGAGCTctggttgtatgtgtgtgtgtttaaaatagaaaatcttgGGAAACTTAGAATGGAAAAAGTACCTGATAAACAGTAACTAACTCCAAATATTTTCACTCCAGATTTGTGTCATCCTGACATAGATTAGGTCTTTTGGGGAATATATATGAAAGTGGATTAAGTCTGACTAACTTTATGTAATCCACATTTGGAAGAGAACAGTTATAAAGTGTTTGGTCTCTTAAGGTTTATTTATGGTGCCCAGAAGATCAAGTTTGCAAAAACCCTTAAAAGTATGTTAGTAtcagaataatgaataaaatgggaGGGTTTTACATATGTACTACTTGAtaatttttctcagtattttatcTTAGTAGTTcttgaattttctgtaaatcaaCTACTTGATTTGTAGAATTTTGGGCATCCTTTTACTAGAGTTTTTTGGTAAGGGAATTTTgcagaaataatgttaaaatgctaGTTATAATAGGAAGACAGATCCACTGATAATAGCTTGTGGTTTTAGATTTGGGCCACTTTTAATCATGGAATAATAATCTTAATGTTTGTATTGGTGCAagtaaaattcaataaatgactTCAGCTGTATGAATATATAATAGTTGTACTGCAAACATTTGCATCCCTTTTGTGACCTGATTTACAAACGTTTGAAAATTGTGTTGCGATTCTGCTTTGCTGTTTAATAAAAAGCCATTTCAGAGa