Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name CCDC117
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m13_p_5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rousettus aegyptiacus
Full Name N/A
Also known as NULL
Coordinate scaffold_m13_p_5:17624153-17634246
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from CCDC117

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CCDC117P1 scaffold_m13_p_7:57575781-57576569 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>CCDC117_x2
GGCAGTTGCTGTGGCTGCAGCAGCCGGGCCTCGGGACACCGGCGGCCGGGGCCGCCGGCGCAACCTCTTCGTCTCCCCAGCCATGGCCGCGCTCGGCCGTCCCTTCAGCGGCCTCCCTCTGAGCGGTGGCTCGGACTTCCTGCAGCCGCCGTCGCCGCCGGCCTTCCCTGGCCGGGCCTTTCAGCCGGGGGCGGACGGCGCTGAGCTGGCCCCGCGGCCCGGACCCCGCGCTGCCCCGATCAGCCCGGGCGGGAgtgcggcgcgcgaacgTGTTTCAGTTCCCTGTAAAAAGAAACACAAGCTAGAGCAGGAGGATGAAGAGTAAGTTTCAGGTGCCATTTTTTTCACGTTATGGTCTCTTAATTTAACTTAATTTATGTCCTCAGCTACTTGCTGAGACACTAAGTGtctgaaaggaggcacaaggaactggtaacatgggttgccttttagagaaaatgggtggctggcaggtcagagtttggaaactttttaccctataaccaatttaaagtttgcattttgggccatgtgaaCCTTATTACAAAGTAAAAGAATTCCAAGTGTGTAAAGGATATGTATTGAAGCATCTCAAACGGCATGCTCACAATTctccccagaggcaactcctgttacctgtttctcctgtggaagataacttaaaaacttacaagcttataattgtatatacctcttgctttttacatttgtaagaagatactgttcacactgtgcaacacattgatcttttcattttactttctcctagtttgttgcatatagttacatagagttctatgtaatttttcaacagttgaacggaattctattatagggttaggtgtagataatttcccattctgttgatggatttctaagctatttctagtcttttgctattactaacgaatctactgtgaccattgttttgaagttcttttatagatttgcaagtaggtgaatggatttctagatggagaattgctgggttttaaaatgtatgcatttgaaatttcgaACAAGAGTTGTTGCCAGTTTATACTTTTTTAACAGTTGGAACGTTTATTTGTCTATCCTCTCACCAGAACTGTATTTTCAAACTTCTTGACTTAACTTATATGTTAAAAGAAAAAATACATCTCATAGACAGGCAGTCTGTGAAAAAAATGAGAGAAAAAAGTCCCCaaagaggatatgcagttgactaaacaaatgcaaatgtctcacctcatcagtctttggggaagtggacattgaagccacagtgaaatactcctctactaccagatattgattggagtgatcatggagcaccaggaactctcagatactgtgaatgagaatgcaaattggtacaagctctttgggaaacagtttggcattatctaataaattgaaggcacatgcagcctctaccagtttccctcttgagttatgtacatgagcacatcgggagacacaaagttcatagcatcctggctcataaaatctcagaactggaaataattcaaatgtccttcaacagtaaaatgtatatagcttaattccctaaatataaggttcaaaaccaggcaaaactaaacattgtttaggggtgcatatctatatgtgataaacattctttttacaaaggaagtaattaccataaaagAGTCTACTTGTAGGAAAGAGGGACTAGATTACCATTTGGGGATGGTGGCAGCTTATCTTGAAGGTTATTTTTCATTAAATTATATGTATTTTTATGAGCATAGTGTTTTATAGTTAAAAACATTAGATAACAATATAGCTAGACATACTttttatagtttgtatctaatatttagtttgtattttgtaAATTTTAAGCgaacatcttttcatttaagccatgtgtgtttaattttgtgtgaattgttgctatttctgcaaattttttattggcttactggtctttttcttgtttatctgtaagaaatctttGTTAAATCAGCAGTTTATTAAGTGTGTTATAAATGGTTTCCCCAAATTTGTCATTTGTCTTTTGACTTTATGATTTATTTAGTCAGCAGAAACTTTGGATTTTTCTAACCTTGTTGATACATAAACTAATAAGACAGTAGATTTGAAATTTGCCTTAGTTTAAAAACCACTGGTCCAGACATTTGTGTTCTTTACCTTGGGATTGCTGTGGATACACAAGAACCTTTTTGCTTTTATCTTTTGTGAGGGGGTTCCCTATAAGAAAAAAATTTTGAGATTATTGAATAAAGGGTTCCAGTGTTGAAAATAAAAAGTTTGAAGTATAAAAACTATCGACTTAAAAAGTTAACCACATTTAATTTACATATGAAGAGATTGCGGTCTTGAGAATTTGAGGGTCTTGACATTTGCATATCTAATGCCCAGCTGCCACTTCCGTAGCTCTTATCAGTACTGTGAGGTCTTTTCTAGCACATTTTTGGGGGGATTTAATCACCATTGATCTCTATTTATTTGCAAAATAGACCTACAATCATTAAATAATTTAGTACAGATCCTTCTGGTGATCAGAGACCAGAACCCAATTCTCACTCAGTTGCATTTAATAGTTGAATTGTTAGAAGTGCTAGGAAATTACCTATTTTCTCTTTATTTATTCTGCTTTTCTTAGCTAGTTTTTTCTTTGCTTAATTTTTTCTTCTTTTAAAACATCATGTGCTAAAACTATTCAAGTACTACATAAATATGTCCATGATAGCTAGACATTCTTTATACTTTCTTATGAATTAAAACTAATTATAACAAAATACATTTAATCGTTGATTCCAGTCAAAAATCTAGGTTCAGGAGAGCATTATTACTTTTCAGGTTTCATATCACCAAAGACTTTAATGTTAATTTTTGTAGTCTTAACACAGAATGGAAACTTCTTGTAAAATCTGTGCTGCTTCCTTTGACCTTCAGTTTAGAGAATGAAAAGCTGTGGTAGCCATTTATGAgttttgttttgtttttgtcttttttgCAGAGCTGTGTTCTGGTCTTGAGATTACACTTGCTGATGTCAAGGCAATAAAGTACTTTTGGTCTAAATACGTAAATAGAACAGGGCCAGTTGTCTGTTTAACTTGCTTCAGACAGCTTTCAACTAAACTGGGTATATCATACTATTAGCAAATAGTGATTCATGGTTAAGAGTTTGAACAGTTGAACTTTTCTAAAGAGGTTGGAGTTTTTAATGATAGTGGCACAGAAGTAGGATTCAGGAGCTCTGGGGTCTGGTGCCCAACTTCTAGCTCTGTGTTACATAACACTTTGGAGGGGACGCTTTTGATGTTCTTGGTCCTGGTTTCCAAATTTGTAAAACAAAGAAATTGGATTTAATGAACTCTAAGGTCTCTATGAAATATGTTTTTCTAGAAAGTGAGGATCGTTTATGTTGCAGAGTGGGAGAATAGTGCACCCCATTTTTCAGAACTCATAGAGCCAGATAACAGTGTGACATTTTGCAGAGGACCAAGAAATCAGCAACATCGTCAGCACCTGTAGTGCTTGGAACAGACCTTATAAGGCATATATTTTTGCCATAAAGGAATAGAGGATGCCTGCATAACACCATCCCATATGACCAGTTTGTTGGAACACCGCAATATGACAAAATATGGCTAGTGCTTAGTTGCTGCTTTGTAATTTCTGGTTTCCTTATTCCCACTTGAACTATCTAGAGCCAAAAAAATTGGAATGACTTTAAGTTCCGACACTGAACCTTCTAATCTGAAAAGTCCTAGTTTGGCAGAGAACAGTAGAAGAAAACTTCTCAAGGAGGCTGTGAAAATGATAGAAAAGAAAATACATGATTTTTGATCTTGTAATCACATACTGTCCAAAATTGTTATTATTTTTTTAAATAAAAGAATGTGATTAGAGATAGGATGATATTTATATTAGGATTTTCATTAAATTTTTTTTTTTCCAGTTGTCCAGTAAGAAAGAAAAGGCTAACTGAAGCAGGGCTCTGTGCTGATCCTAATGACTGGATTCTTTGTGCACATCAGGATATAGAGGGTCATGGAGTAAATCCATGCACTAGTGGCCTTTCTGCACCTGGCATGTTAGATGTTATTTGTGAAGAAATGGATCAGACAACTGGAGAACTGCAGTGTGAAGTTGCCAGAAGGAGGCTTCAGGAAATTGAGGACAGGATAATTGACGAAGATGAAGAAGTTGAAGCTGACAGAAATATTAACCGTCTCCCCAGTCTTGTCCTTTCTGATACCATGAAAACAGGTTTGAAGAGGGAATTTGATGAAGTCTTTACAAAGAAAATGATTGAGTCCATGAGTCGTCCTTCTATGGAGCTTGTGCTCTGGAAACCTCTTCCTGAACTCCTTTCTGATAAGCCAAAGCCATCATCTAATGCTAAGAACTACCCAGGAGAGAGCCAAACTAAGCATGCCGCTGCTGGCACTACCTTCCCTAGGAGAACTGAACTGTTCTTGGAACCTCGACAAACAGGGGTGCCTATTTATAATAGTTTGGAGATAGCTGCTTGTACAGAAGAAGAGATGGAACTCCAGTAACATGTTTCCATACTGAAGTTGTCAAGTTTTAGAAGGCTCATGTTTTCAGTCATGAGTCTACATATATAGTATAGGGACTTGAAAGTTTTATGAAATGGATGTAATAATATCTCTGCCTGTGATTTGGGGTGGGACTCTCATTTTAGGTAGCCATTTCTTGAATTCAACTTTTTGCCAAGGAAGCTTGTCTCAAGGGAAAATATGttttttttgtttgtttgttttttggtttttttttttttAGAGGGATTAACGTGAGATTACAGTCTGTAAAGGCAAGTATAGAAGCTTTATGTGTAAGGGTGACTTAGGTCATCTGTCACATTGTCTAAACCATGTATTTACTTGGAGCATACTCAGACACTTGAGTTGAAAAAGATACATTAAGAAAGAAAGATACTCCTAGTACAACTGTACCCGGACAGTTGAGTCACAACTTTGTAGATGATGAGCTCTGTTTACAGTGGTGACTTTATAATTGGGGAGAAGGAGGGAAGAAAGCAGTAGCTAAAGCCTATTGCTAAGAAATTTAATAGAGGCTCTGAAACTTATATATTGTCAATTCAATGTAGCTATATTGATTAAATAGCCAGTAGCATTGTGGCCCACCTCCTTGCCTCAGAAAATGTAGTGAAAATACAAACAAAAGCTTTTTCCTTTGAGGCTTTTTTGCCTTGTGCTACTATTGCTCCTTGGATTCCCTTGCATAATTAATAAGCCCAGCTATTCTGTAATGTTTACAAGTTAACTTTGTTAAGTTTAAAAGATTTCGAGGTAACCCGTGTGTAAATTGTCTGTGGGAGAAGCATCCCTTAGGTAATCTCGAGGAAGCGCTGTTTCAGCTAAGCCCAGCATTGATTGTACCTGTGTTAGCAAGTTGAATTTTTAATGTTAACTTAGAAAACAGTGAGTAATTAACTGAGAACATATGGGCAAGCGACACTGAAATTTATTGAAATAGCCAGTTTGCCTGGTGCTTCAACTATTGTGCAGTAGCCTAAACATTAGTAGAGAATAGCTTCCTGCTAACAGGAGATCTTCATCTTGAGGACCTACCTGCCTCAAGGTGTCCTTTGGGAATAACCAGGATTGAAGTTCTTTATTTCTCAGGAAGAACTCTTCTATGGACTCAGTAGTGCAAAGTAAAATGACAATTCCTTTAGGGCTACAGAATATTCACTATAACTTATTAAATGGGTGTAATAGTGTAATACTGGCCCTTTCCTCACGCAACAGGAGACCACCTCAGTTCTTTTTGTTTTTCTGGGTTTCGACAAACAGGGGTGCCTATTTATAATAGTTTCCCCCTTTGTAGGAGAAGTAGATACCTTGTGTAGGGGGAAAAAGTGGTTTATGCCAAGTAGAGGTAACTTTTTAGAAACCAGCTCCCAGGCATTTTTGAAACTCATGCTGAAATCCCTCCCTGTTAGCACATGACGTAGAAGTCACAGGTCTGTTAATTGGACTGTTTCTTTTCTTGCCTTTTGTtcctgctttctctatttctgtctggatagtcaggaaaagatgtaatgtttaatatttaaacaaaatatttaatgtctacacagtaaaattaatcgaacttcaaaccagtattgaaaccagttggaaaccagctaatagtttcttaATCTCAGATTTAGAGATGAATGTAAACTGTATTCTGTTGAAATCTGTAAGTGTTTGATTCATGCCGTTCGAAAAACTCCTGCTTTTAGATAGTTTTTAATGGGACCAACTTGCAAAGTTTGTAGCCTTAAATCTCCATGCTAAAAAATTTGTTCAGTACAACTCGAAAACATGAAGTGACTGCTCAGAATTTGGAGTCAGTCTCCATATTATGGTGGAAAGGGTGGTGACAGCTTTCTCAAGAAGGACCCAAACACACCGATTGTCTTCTATAGAAATTGTTGGACAGGCCTCTGATCAAAGGTCTGTATGATGAAAAGGAGGAAAGAAGAGCCCCCAAACCAAAACCATTGGTAAATATAGGAGAGAATTCAGAATCTGTCATTAAATCCAAATAGAACTTGTTTTAGGAGTCAAGCTATCTGACATAACAATTATTTCTGCAGGAAAAATGGATGTTTAATGCTCCTTTTTAAACTTCTTGCATATGTTTGTACAAAAATTGTCTTCATCCTTGTGGTGCTTATTCATCTGAGCCGACTCCACAGTCCCCTTGCCTCTGCTTTGTTTTGTAATATAAAGCTTTTGCTTTTGCCTTAAGGTTTCCCTAGGGGAATAAGAGGTCTTTTCATTTTGTATAGCTTTTGCAGCATGGATCAAACATTGGCTTTCTATGCTAATGTGTGAAGAGAAAAAAAGTATCTAAAGCAGGTGAGCTTTAATGAACAAATGTATATTTTCTCTGAATTTAAGTAGGGTGTGTGTATTTTTTTTTTTAATTAAAATGAAAGTCCAGTTTTCATAAATATTAGTCAATTTTTTAAAATCTCATTCTTGAAAAGGTGCAAATATAAAATTTAGGAAAATATCTATAACCATGAGAATGTTTACCAGCAAGTTCATTAATTATTTTGGACCTGGAACTTGGTTTTGTTTTTTAATAGTGATGAGAATGGTGCAGTGGTAAGAAAGTTCTGGAAAATGCTGTCAGTTTTACTTTAAAATGAGAATCTGGTGTTTATGTATTGTTTTCAATAAAACTTCGTGTTTTGG