RCPedia: Genes

Summary

Gene Name	PAPOLA	Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in scaffold_m13_p_3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie	Rousettus aegyptiacus
Full Name	N/A
Also known as	NULL
Coordinate	scaffold_m13_p_3:168089172-168151866
Strand	+
Gene summary	N/A

Retrocopy(s) from PAPOLA

Retroname	Coord	Strand	Genomic Region	ENSG
PAPOLAP2	scaffold_m13_p_9:19798016-19798524	-	Intergenic	N/A	UCSC
PAPOLAP1	scaffold_m13_p_7:71588886-71589723	-	Intergenic	N/A	UCSC

Expression

Transcript Sequences

>PAPOLA_x2
CTGCGCAGGCGTGCGCACGGCGTGCGTGCCGGCGTCAGCGGTTCTAGAACGTTGCTGTGGTAGCGCTCGGGCGCCATGTTAGGACGAAGGGGAAGGAGGAGAAGCGCTTAAAGCGGCGGGAGCGGGTGCGGGAGTGGGGTTGGACCCAGGGCTGAGGCAGGCCCCCCTCCCTCCCGCCTCAGTGGATCATGCCCAGGGCGGCAGCGGCCGCGGTTGCGGGGGGGAAGTGACTGGGCGGTGCCGGCGCAGGAGACGATGCCGTTTCCAGTTACAACGCAGGGATCACAGCAAACACAGCCGCCACAGAAGCACTATGGCATTACCTCTCCTATCAGCTTAGCAGCCCCCAAGGAGACTGATTGCCTGCTCACACAGAAGCTAATTGAGACTCTGAAGCCCTTTGGGGTTTTTGAAGAAGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAATTTTGGGAAAATTAAATAACCTTGTAAAAGAGTGGATACGAGAAATCAGTGAAAGCAAGAATCTTCCACAGTCTGTAATTGAAAATGTTGGAGGAAAAATTTTTACATTTGGATCTTACAGATTAGGAGTACACACTAAAGGTGCCGATATTGATGCGTTGTGTGTTGCACCAAGACATGTTGATCGAAGTGACTTTTTCACCTCATTCTATGATAAGTTGAAATTACAGGAAGAAGTAAAAGATTTAAGAGCTGTCGAAGAGGCGTTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGATATTTTATTTGCAAGATTAGCACTGCAGACTATTCCAGAAGACTTGGACTTACGAGATGACAGTCTGCTTAAAAATTTAGATATAAGATGCATACGAAGTCTTAACGGTTGCAGGGTAACCGATGAAATTTTACACCTAGTACCAAACATTGACAACTTCAGGTTAACTCTGAGAGCTATCAAACTGTGGGCCAAACGCCACAACATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGTGGTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTATCCAAATGCAATAGCATCAACTCTTGTACATAAATTTTTCTTGGTATTTTCTAAATGGGAATGGCCAAATCCAGTGCTATTGAAACAACCTGAAGAATGCAATCTTAATTTGCCTGTATGGGACCCAAGGGTAAACCCCAGTGATAGGTACCATCTTATGCCTATAATTACACCAGCATACCCACAACAGAACTCCACGTACAATGTGTCCGTTTCAACACGGATGGTCATGGTTGAGGAGTTTAAACAAGGTCTTGCTATCACAGATGAAATTTTGCTGAGTAAGGGAGAGTGGTCCAAACTTTTTGAAGCTCCAAACTTCTTTCAAAAGTACAAGCATTATATTGTACTTCTAGCAAGTGCACCAACAGAAAAACAACGCCTAGAATGGGTGGGCTTGGTGGAATCCAAAATCCGAATCCTGGTTGGAAGTTTGGAGAAGAATGAATTTATTACACTGGCTCATGTGAATCCCCAGTCATTTCCAGCACCCAAAGAAAATCCTGACAAGGAAGAATTTCGCACGATGTGGGTGATTGGGTTAGTGTTTAAAAAAACAGAAAACTCTGAAAATCTCAGTGTTGATCTCACCTATGATATTCAGTCTTTCACAGATACAGTTTATAGGCAAGCAATAAACAGCAAGATGTTTGAGGTGGACATGAAAATTGCTGCAATGCATGTGAAAAGAAAGCAACTCCATGAGCTACTACCTAATCATGTGCTTCAGAAAAAGAAAAAGCATTCAACAGAAGGTGTCAGATTGACACCTCTGAACGATAGCAGCCTCGACTTGTCTATGGACAGTGATAACAGCATGTCTGTGCCTTCACCTACTAGTGCTATGAAGACCAGTCCATTGAACAGTTCTGGCAGCTCTCAGGGCAGAAACAGTCCTGCTCCAGCTGTAACAGCAGCATCTGTGACCAACATACAGGCTACTGAAGTTTCTGTGCCACAAGTAAATTCCAGTGAAAGCTCAGGGGGTACATCGAGTGAAAGCATTCCTCAAACTGCCACACAGCCAGCCATTTCATCACCACCAAAGCCTACAGTCTCCAGAGTCGTTTCTTCAACACGTCTGGTAAACCCACCACCTAGACCTTCAGGAAATACAACAACAAAAATACCTAATCCTGTAGCAGGAGTCAAGAGGAGATCCTCACCTCACAAGGAAGAGAGTCCCAAGAAAACCAAAACAGAAGAGGAACAACCTGATACAGAAACAAGTACAACTCAATCAGAAACTGTTCAGACAGCAGCTTCTCTGTTGGCCTCTCAGAAAACATCCAGTACAGACCTTTCCGATATCCCTGCTCTCCCTGCAAATCCTATTCCTGTTATCAAGAATTCAATAAAGCTGAGATTGAATCGGTAAAACCACCTCAGGGGTCCATAAACAATATCTGCCAACTCAACCTATTGTCTTCAAATGCTAAAAAGGAGAATGGAGGGTACAAGACTAGACATGACTGAAAATGGATTTAGGTTTTTTCTGCGACCTCCCGTTCTGGCTCATCAGCACCCGATCGGAAGCCCAGGTTAGTCCGTGGAGCCAGGAGTGCTGTTCCTATTGTGTTAGCAGCAGTTGCATCAACTATTTCAAAAATTTACTGCCTTTAAAAAAACCTCAAGCTATATTTGTATTCATAATTGACATCTGGATTGGGTTTATTGTTTGATGCATTGTTTGGAAAATTTGCGATATAAACTGGCATAAGAATTCCTTATTCTGATGATGCACTTTTATGTATTTTTTTTATTAGAAAGTAGAACTAATTTTAGATTTTCAGCTTGATGGATTTTCATTTTTTCCTGAAGAGTTTTTTTTACCATTAGTCTTCAAATTGGATACCATTGTGCAGTGGGGTACCGTTGTACCTCAGAGAACGGATAAGAGTATATCTGGTTCAGTCCCTGTGAGGTAACTGTAACCCCTAAAATGAAATGTCAGATATAGGGTATATATTTGACCTTGAAAGGATAATTAGGAAATACTTGGTTTTGATGGAGTCATGATTAAGAAATGATATATTAGTTTTATTTATAGAATTCTTTAGAGTGCATACAAATCAGCGATCAGCCAGCAGATATTTTTCTTTGAGCTTGTTAAAGCTCCATATTCTTTTGCCTTCAATCTGTTGTCTTTGAAACAAACAAAGCTTTTTGCTCCCTCCCCCTTTTTCTTTTTTTCTTTTTGCTTGTATGCATAAGGTAGGATTTATTTCATACAAAACAAAAATGCCAGTATTTTCTCAAGCCATGATGTGAAACCAGTGACCCTGTGGCCACATGGCACAGAACACTAAATTTTGGTCCCATGGCTGAAACTTTAGGGTGAGTAAAAGTAATGCCTGTGAACATGATACCTAACTTGGATGGCCATTTGATCTCTAAGAGGAATTTTGTACACTCCACAGAACTCCTGTCTATAGTAAAGTTGTTTTCCATTTTAAACATGTGGGCAAAAAGGCATTTTCTCCAAGAATTTTAAACTAATTTTTACTTTTAAATGGTTGACCAAAATTTGTCAGTAAATTTTACATGTAGGAACATTTTAAAAATCATTTCTAGCAAGCACTTGACATCTCGTCAGCTCTTTACTCCTTTTTCATTTTGTTTTATCCTATCATTAGATTAGGAACCCTTTTCTTTGAAGAAAATTCTTTCTCGCAATTAAGCAGCAGCACACCCATCTTTACGAAGTGTGAGGGATGCCAGATGTCGATAGATGCACTCTTTCTGAATCTGGACGAAGCAAACCTAACAGATTTTTCTGATGAGCATGTTTTACGAATCCTCCATTGTGCTCCGTTCTATCACATGTGCATTTTTCATGTTAAACTGCAGTTACTTAAACTCTTCCCCTGCCCTTCTAAATTAATTTTCCAAAGTTGGAGTGTAGTCTTTTCCCCTTTAGGCTATGCATTAATTGAGGCTTTCTTTTCACCATACTTTATGATGTCTAGTATCCACTGTTTCCAGTTCCCACGTCTTTGCACAGTCACCTTGCCCATTCTCCCACCACCTAAGAAAAAAAGATGGTCATACTAACAGGTGAAGTGTACAAGGTGTCTGTGTGTTTTGTGTAGCTTCAGAGTTAGATTGAAATTGCCAGGCACAGATTTAGTCTTGTCATTTTGTTTACACATTGGGGAAAAAAAAATTCAGTTTATTAAACGTTTCATGTAACTGCACCCAAGTTTTGCCAAGCTGGAAACTTGGACCTTTTCTGTGTAGTGACTTTTTAATTCTAGTTTTCATAACCTGGAGGTCGGACTGTTGCTTTCGCATGATGTACGTAGTGTCTCATGACTGGAGTTTGCTTTGTTTTATAGTATCTGTACTCCTTGTATTTTTCAAGAGCTATTTTGTAAACAGATGATGTATTTCTCCATTGAAAACACAATAAAAAAAAACAGCACAATCCCACAGTTGGCTGGTTTCTTTTGACTGACCGTGTTCTTCTGTTCTCTTCGGTGATCTAATAGGTTCTACCTGTAAGTTTATATAGTATGGCTCTAAGTGAAGATTTGCAAAAGAATTTACTGTGGTTACATATGGAAAAGATTTGTTTCTGGTTAATTTATGCCATTAGCAGCAGCCTGTTATTGATTGATAGCTCACGTAATTAGGTATTTGTTTTTCATATAATTGATTATTCGGGAACAAAACATGAATATAGTTACTATTAATTCACTGTTTCAGCTGTCCCATCCTCTAAAATATGTATTCTATGCGTGTAGACACTATACCTTTTCTGTGTATTTATTTCATGCCTGTAGACAGTGTACCACCGACATGCTTTTCAAAGCTGTTAGTTTTCAAAGCAGTTGGTATTCCAGTTCTGATGTCAGCAGGTGGCACTGTTGATTTTCAATGAATTTAGAATTACGGACTGTAACCAGCCAGGATCCAATGTTTCTCATTTTACTAAACCCAAATCAGATGCTGCTTTTCTTAAAC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>PAPOLA_x4
ATGCCGTTTCCAGTTACAACGCAGGGATCACAGCAAACACAGCCGCCACAGAAGCACTATGGCATTACCTCTCCTATCAGCTTAGCAGCCCCCAAGGAGACTGATTGCCTGCTCACACAGAAGCTAATTGAGACTCTGAAGCCCTTTGGGGTTTTTGAAGAAGAAGAGGAACTGCAGCGCAGGATTTTAATTTTGGGAAAATTAAATAACCTTGTAAAAGAGTGGATACGAGAAATCAGTGAAAGCAAGAATCTTCCACAGTCTGTAATTGAAAATGTTGGAGGAAAAATTTTTACATTTGGATCTTACAGATTAGGAGTACACACTAAAGGTGCCGATATTGATGCGTTGTGTGTTGCACCAAGACATGTTGATCGAAGTGACTTTTTCACCTCATTCTATGATAAGTTGAAATTACAGGAAGAAGTAAAAGATTTAAGAGCTGTCGAAGAGGCGTTTGTGCCAGTTATCAAACTGTGTTTTGATGGGATAGAGATTGATATTTTATTTGCAAGATTAGCACTGCAGACTATTCCAGAAGACTTGGACTTACGAGATGACAGTCTGCTTAAAAATTTAGATATAAGATGCATACGAAGTCTTAACGGTTGCAGGGTAACCGATGAAATTTTACACCTAGTACCAAACATTGACAACTTCAGGTTAACTCTGAGAGCTATCAAACTGTGGGCCAAACGCCACAACATCTATTCCAATATATTAGGTTTCCTCGGTGGTGTTTCCTGGGCTATGCTAGTAGCAAGAACTTGCCAGCTTTATCCAAATGCAATAGCATCAACTCTTGTACATAAATTTTTCTTGGTATTTTCTAAATGGTATGTGTTTAGATTATATTAA