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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name CCDC171
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chrZ) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Taeniopygia guttata
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chrZ:71344206-71513097
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from CCDC171

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
CCDC171P1 chrZ:20869962-20870227 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_032744515.1
ATTGaagcagaaatgcatttttttctttcccatatcACTCATCCAGCAACTGGAATGAATAAAGCCagtttatattaatatattacaCCTACTGCTGCCACTGGACACCACAATATTAAATATACATTGAAGTATTGGAGAGTACTGAAAGGAGGTATGCAAGGTTGGTGAAAATGTTATGAGGGATGcctgaggtcacttggtctgttcagtcTGCAGGACGCTGAGGAGAGATGTCATcgcagttacaacttcctctCAAGGGGAAGTGAAGGGACAGGCACTGATCCTTAATCTCTAGTGACCGGACGGAGGGAATGACCTGAAAATTGTAATGTTTTTATGATATGGAAGAATCATCTTGGAAGCTTGTCAAGTAAATGTATATACAGTTGATTCATTCTCCAGAGTTTATAGTTTTTGCAGCTTGACAAGCTGTCTATTGGCCATCATGAGTTCATCCTCTCCTGTCAACTATTCTGTCACAGAAGCTAGAAGcCTACATAATGAGGAATGTGAGTTACTACAGAAGAGCAATGAATTAGATTTGGATGCTGTTTTAGGTGTGAAATGGAAACTTCTTCaagctaaaaaagaaaacttggaCTTAACTATTCGACACAATCAAGAAgtGTCCAACTATGAGAAACAGATAATCAAATTACGGTCGGAATTTGAGAAAGGAGAGGCCATTCGACAAGGTCTGGAGTATGAATTGGCAGTTGCCAGAAAAAGTGCCCATCTGAAAATGTGTACTGCAGAAGAAGAATTGTGTGATGCAAAAAACAAACTTAAGGAACTGCAAGTACTCAATGAAAACCTTCAACAGAAAGTGACAGAGACTGAGAAAATGTTTCATAATGCTGAACAGAAGTGGAAAGAAGAACAGCAAAGACTCTCAAAGGAGCTGAATAATGACCTGCAAAATATACGCAAGAAATTGAGAGATGTGGAAGTGGAGCACAGTGGCTGCAATGAGGTGCTAAGATGCCAGGCCAATGAACTTAAATGCAGCACTGAGCGAGAGAAGAGACTTTTAAAGGAACTTGAATCAGCTGCAGTGAGAAAAAAGAAGCTGGAAGAAAACATTGAAGCAGAGAGAGCAGCGCATTTAGCATCCAATTTCGCTTCAGAGATCATCCAGTTAAGAATTCAAGAACTTGAAGAAGCTGTGCGTGTGGAAAAGGACAGACGAGAAGAAGCTCTTTCAGATTTAGACATGATCAAGAAAGAGTTCAAAGGGTTGGAATATGCGtatgagagagaaaaacacaatGCCCAAGAGAACTTGGAGAAACTCAGTGTATTAGAAAAAGAGTGTTACTCCTCCAACAATCAAATTAAAGAACTGattgaggaaaagaagaaggtAATTATGGACCTCTCTGCAAGACTAGGGAATGCTGAAAAAAGCTGCAGTGAATTGCAGAGTGAACTTGCAATGGCCAAGAAACACCAGGTCTTTCTAACAGAGACGTATGAAAACAACATGAGAGAGCTGGAGTTACTCTTGGACAGCTTTGCTATGTCAGACCAGCGGACAGCAGgCACTTGTGAGGACAAAGATAAacctctgagctgctctgtcGTTGAGACTTTGAGGTGTACCTTGACAGCTTACCAGAACAAGCTGGAAGATACGTCTAATGAGCTTGAGAAAACGAAGACTTTGTGTAAAAAGATGACAAAAGAATTTGAGGTATCTGAGGAGAAAATGTGTGCTTTAAGACAAGACCTTAAGGAAGCTCAGGATACCATGGCTGATGCCAATAAAGAGTTAAACTATCTGCAATCTAAGTGTGCAGACAGAGAGACTTTAatagaaactttaaaaatggaACTACAGGATGTACAGCAATGCTGGGAGAAAGAGCAAGTACGTGccacagaatctgaaaatgaaatccAGAAGCTTACCAGGGCTTACCAGAAGGATATGGAGGAGAAACTAGCCTTCCTTCATAGCTTATACCAGCATTTGATAGCAGGCTGTGTACTTATAAAACAACCAGAAGGCATCCTAGATAGCTTCTCTTGGCCTGAGCTTTGTGTAGTCTTGCAGGAGAATGTTGATGCCCTGATCTCAGACCTCAACAGGGCTAATGAGAAGATATCTCACCTGGAATATGTTTGCAAAAACAAGTCCAATACTATGAAGGAGCTTCAGCAGAGCCAGGAAGATGCTTTTAACAAAATGGCTGCACAAATGAAAGCACAGGCAAGCTGTtggcagaatgaaaaaaagtatCTGGAACAGCAGTACTCAGGCCTCCTTGGGGAAGTTCATGCAAGGGCACAGGAATACCAAGTAGCAGCAGAGAAAAGTAAGGCAAAAATTTATGTACTTGAAAAAAGTCAAGAGAAATTGGCTCTTGAAAACACTTCTGTGAAAAAGATGTTAACACAGTTTCAGAAGGAGCATTCCTCACTCCTGGCAGCCTGTGCACTATTAGCAGGTGCCCTGTATCCTCTGTATGGCCAATTGTGTGCTATGTCTTCCCAAAGAGACCTTCTCCAGGATCAAGTGAACACATATGAATTAGTGAACCAGAAGATTAGGACCCTAGTTCATGCTCTCTCTGATGATAAGGGAAACACTGAAGATGAAGTaaaactaaagaaaagaaaatcccaggGCCTGATTTATGTATTCCGAAGAGCTGTGATTGCAGTTTTGGCAGCCAACAGACTTAAGGTTTTAGCACAGTCTTCTAGTTCCCTCTTCACCTGGACAAATGGCTTAAAAGAAGGCATTGGAATTCCAGTTTGTGTAGGAGAATCCAAAGGCAAGCGTAATCTGTCAAGTTGTGACGAGGAAGCGCTTGACTGTGTGGAAGCACTCAGCTGGTTTGCTAGTTCCAACCTCCTTGCTGCAATAATCAGTTCTGTCACTGAATTGCAGGATGTTGTTAACAAACCAGggtgttttttgtttgactgtttgggggttttgtttgtctttgttttttggtttttttttaaaggtacaAAGTCCTGGGTTTCTGGAAAGTTACTTGTAAATGCAGCCAGGAATTCGTTTTCAAAACTTATGGACAAGCTGAATGTTATAATGGAGACGGTTCCATTAGACCACAGCAAGTACATTACTTATCTGGAGAAAGACTCCTTGGTACAGAGCCTGGCTCATGgacttaataaaataaatacccaGGCCATGGAAGCTGGATTGTGTGACAGAGTATCCAGTATGAAAAACTTTGAATCCTTGCAAAAGCGAATATTTGAATTTACACAAAGACTTCATACAGCAGAAGTAGAACGTCGCTCACTGCGCCTACGACTTGCAGAATTCAAAttgaatttcagtgaaatgaaaaaagaagcagaCAAAGCAGAGAGGCTGCAAGAACAATTAAATATGCTTAAGCAAAAATTAATCACCAATGAGAGGTTTGAAAGTGTATGTGAAGAATTAAGTAATGCATTACATCGGGAGCATCAGGCACAATTGCTTTTGAATGAACAAGCACAACAGCTACAGGAGTTAAATAATAAACTAGAATGGCAATCCAGTGAAGAAGCAGATAAAACCCAAGTCTTAAGTGAATCTGTAAAGTATTCTTCTGTGAATTGACAACTGAGCAAAGGGACTGCTTCACCAGCATTTTGACAAATAGAAGCACTTATAAGTCTGAGAGAAGAAGTGTCAAGCAGGAGGAGAACCAAAATGATTCCAGCTGCAAAAGTATTagaaatttcataaatattgaaaatattactATGAAAGTAGATGTCAAAGAGGATGAGTTGCAGCAAAGTAGATGTGATGTATAGTGGAGGATGCTGAATGATGTTGTGAAATTTATTGAGGAGGCTTTTCACTGTTGGTATTATTTACTAAAAATGCCTTACCTCACTAAAGGTAAAAGACAGTGACATTTCCAATTTACCTGTTaggttttgtgtggtttttttttctccctcacaGTTCCCTAGTTTTGGGTGTTAATTGAAATGGAAGAATAAATGTCCTACTGTTTTTCAGTCAGGTTGCTTGTTAATActattgtattttctttcagctaTAACTGCAGTGTATATATAAGCTGTTATTCTTGTGTTTGATTTCTTTGAGAAATGCTTgatttgagatttttaaatggCTATTAGGAATATAAAGAAGGGAAGGACTAGAAGACAAATCCTAttttaaatcttaatttttgtCTACTTTTTGTACATTAATACATGTTTTTTCACcatgttttactttttctaaAACACGCCTTTTCATTTGTTCAGAGACTGTGAAGAGAAAGGTCAATTGTAGGCAATTAAAATATAGGAGAAACTATTAAACAGATCTCTTACATAGATTATTGGATACTGAATTATATTTCACAGCTTCTGGTTTTTGTTAATTGAAGGCTATATACAAGTTTTTTTGAGACAGTCATGATCCTAAAATGCATCCTAATTTTGCAGTTCTTTAACAGTTGTTTGCTACTGGAACGTTTTCCTTTAATGTAAAATGCTTGGTTATTGCTGAAATCTTTCAAGGTATCATGCAATGTAATAGGTGATAGGTGATAAAATAGGTGATAGGGTGGAGACAAAGAACATTGACAAAATAAACCTTAAGATCTGAAGTTTACTACTTACAGGTACACTGATTTGGTTTATTACTTTGTAAGTCACAATCCTTCCCATTGAGGAGTTTTAAACCAATTTTAAGTTGTAGGCTTGTTGCTGTGTACTGTCCCTCAACTTAGGTTAATTGGTAtctcattatttctttattatatttaCTACAAAAGATAGtacaaaattgcattttggTTGTAACAGCATGTATCTGTGACAGTATCAAAAAAGGAGACAAGAACAATTGTGGTAACATCAAAACGTGTTAATGATCTTGTGGTcctcgatttttttttttagtcatgcAGATACAATTTTGCAATGTATCCATCCTAAGTCATCATTTTACCTTCACTTTTTATCATTGTTTTTACAATTCCAAACGTGTGTTGTAT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