Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name PCNP
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr13) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Sus scrofa
Full Name PEST proteolytic signal containing nuclear protein
Also known as -
Coordinate chr13:157468427-157491264
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from PCNP

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
PCNPP1 chr2:72163134-72164186 + Intragenic
 N/A UCSC
PCNPP2 chr3:40384915-40385158 - Intragenic
Intragenic
 N/A UCSC
PCNPP3 chr9:67603879-67604457 - Intergenic
 N/A UCSC
PCNPP4 chr14:113531068-113534388 - Intragenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_003132696.4
GCCTCTTCCACGGCTGGCTCCGAAGCTCAATGGTTGCTGGGCAGGGCCGTGACGTCTTTGGCGTGGCTGCAGGGGAGGCCGCGGCGGGGAAAATGGCGGACGGGAAGGCGGGAGAGGAGAAGCCTGAGAAGCCGCAGCGAGCTGGAGCCGCCGGAGGACCTGAAGAAGAAGCAGAAAAACCTGTGAAAACTAAGACTGTTTCTTCCAGTAATGGAGGGGAAAGTTCCAGTCGCAGCGCTGAGAAACGATCAGCTGAAGAAGAAGCTGCAGACCTCCCAACAAAGCCTACAAAGATCTCCAAGTTTGGATTTGCCATAGGTAGTCAGACGACAAAGAAAGCTTCAGCCATATCCATCAAACTTGGCTCAACTAAGCCTAAAGAAACTGTTCCAACTCTTGCTCCAAAAACCCTTTCAGTAGCAGCAGCTTTTAATGAAGATGAAGATAGTGAACCAGAGGAAATGCCTCCAGAAGCAAAGATGAGGATGAAGAATATTGGAAGGGATACACCAACATCAGCAGGACCAAATTCCTTCAATAAAGGAAAACATGGGTTTTCTGATAACCAGAAGCTATGGGAACGAAATATAAAATCTCATCTTGGAAATGTCCATGACCAAGACAATTAAATGATGTGTTTTGAAATTGGGGTGTGGGGTGGGTGTAAAGTTAAAAGGAACAGTTTCCTTTTTTAAAGAATGGTATAAGACTATCTTTGGAGCCGCCtttttttttttttttttttttAAGATTGAATGGTACACTAATAAATGAGAATTTAAAATTAGAGGTAATTTATGTTTTATATGCAGATTTCAAGACATTTACTAATTTTGTAGTTTCATGTGATTAGTTTCCAAAGGTTACAGATAATAAAAAATCAGAAATGGTACCTTTCTAAGAATTGCATATTTTTTTAGACACAACTATTAGCACATTAAGAGGGAAGCAAAAAGTTATTGTCTATTGAAACTATAGTTAATTAGTTTCTAACTTAACTCCCTTATTAGCCTAAACTGTCTGGCTCCCAGGAACAGCCTTATAAAGAAGGGAGTGTTACATTGGGAGGAAAATGTTACTGGACTATTGACTGAGAAAGTAAATTAGTTAAAATTAAAATACGGCTTTTTTTCCTAATGGGCATTTGTTTTGTTTCGAGTCATCATAAACTAGTTATTGCATTGCTATCAGTGGATAACAGATGCTTAGCTCTTTAAAAAGAATATTTTAAAATTTTATGTAAACTGTTGAGTATTTAAGATAGCCCACTTAATTTTAAAGGGTCTTGTCTACCTTCATTAGTTTTCAAAGAACAACCATTTGCTACCAAAGTAAATCAGTATTTTGAATGTGCTTCTCTTGGTTTTGTCATTAGCTAGTTCCTGTAAGCATTTCCATCAGATCTTGAGGCAAATCATAAGGAAGCTGTTTCTTTTAAAATAGCAAACCACCACCAAAAATTTAAATGTACATAGTTAAATATTTGGCTGTTCTTATTTTTTAAAGGGTATAAACACCAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTAAGGTTGTATGAAGATGGAAAATGAGAAAGACGCACTTTCTGTAACTCTATCAAAGCATTTAAGTTACTAACTTGTGAAATCCAATTTGATTCGAACTTATTATAGGAATCCTTCTTTAGCACAATAATATGGTTTATTTTAACTGTATACATATTAACCAGTGGCCTCTCAAAAGCACATTTTAGATACTGAAAATAGAAGGAAAGAAAATGCATCTTTAAACATATTTTATGGAATCTTTGACCACATATACTTTGTTAAGCTATGTGTTGTAGGATTTGTGTTTACTTTGTATTTTTGTATTGTATATGAATTCTTTTTTAATGTGACAGTTAAACACATCTTTAAAAGCATAGTCACACATAAAAGAAACATATAGTATAATGATATCCTTGAAAACTCCTACAGTGTTAAATTTGGAGGCAGCTTCAGACTACTTGATTGGTGGTAATTACTCACTGAGCTCTTTTAATAGGTAATAGCTCTAGAGAAGCAGCCTGTATATATCCCTAATACTTTGTTCACTTGCAGTTGAGTTTAGAGTAAGCCCCAAGTAAAACAATGGAAATGTATATAGAACTATTAGTTCTTACTTACATGATTTAACTATATCAAGATAAATGAATTTAACTTGCTTTAATGTAGGCAAACTTGCCGTTTTTGTTCATTTTAATGTTTATGTTCAAATAACATCCCTCTCCTACATTTTCTTTTCTTGACTCAAATATTAACCTAAGGTCAAGATAGGAGAGAGAAACGACTGAGATGAATGTCTTTACTAAAATACCAATAAATTTGTCAAACTCAATTAGTGTTCTTATTTTCTATTCCATGTAATTGTTGCCGGTTTATTTGTTTTAAACAAAGAAGAGACGTTATTGTTGCTCTTGCCCAGATTGTTGGCCAAAGATGGGAAATTTAggtgttccctggcggcctagtggttaaaggatctggcatggttactgctgtgtctctgacccaggaatttacacatgccatgggtgcacaaaaaaaaataaaaaataaagataaaaataaaataaaataaaaaaaGCGGAGATTTTAAATTATTTGAggagttcctgttgtggtgcagcagaaacgaatctgaccaggaaccataaggttgcaagtttgatccctggccttgctcagtgggttaaggatccagagttgctgtgaggtgtactgtaggtcgcagacaaagctcagatctggcattgctgaggtgtaggcagctatagctccaattacacccctagcctggaagcctccatatgccacaggtgcagccctaaaaagcaaaaaagaaaaaaaaaaTTGGGTTTACCTAACTTAGCATATACTTCTAGAACATTACATTATCTCAGGTTGGAAAAGACCTAATCCGAATCCCCTTTCTCTACTGCCTAAGTGGTTGGCAATTGCATGCTATAAAATATCCTGCCAAGGCATATCTTTGAGTATCTCTAAATGTTAGAAGGTATTCTCTTACTAGTGTCTGCCATCTCCCCTCACCctctttgtggccacacccacatcatatggaagttcctgggctagggataaaatccaagctgcagccacgaccaatgccacagccacagcaaggcaggatccaagccataatgtggcccatgctgcgacttgaagcaacagcagattcttaacccactaagggaggacagggatagaactcacgtcctcactgagacagtgttgggtccttaacctgctgagccacaatgggaattcTTCTAAATATTTTCTTAATGTTTATAATGCTGCTGTCAAATAGTTCAAGTCTTATTAAATGCAAAGATTGAAATAAATTTTAGAATTAAGATTCACTTCTAGTTTGACTTAATCACAAGTGAAGGCTATGAATTTCATTTTTTTTTAATTCTAATCAAAGTTAGCTTGATATACTGTGGAGGAACTGTTCAAGTTACTCTCCTGCTGAGATGATGATACTCCTGTAtttaacttttcattttgaaaaatttcagacttaacaaaacattgcaaaaatattacaaagtttccatgttctccaaatgataacatcttatataaccacaggacagttcatcagaaccagggaattaacattattaaaatttttatatcattgtatactactgttctacagaccttattcagatttcttcaccattcactccattaatgtctccctatttgaagattcacttcattttcacacatttatttgtcatctctcctcaagctcctttaacctgtgactccagtgtttgtcttttatgacttgagacattttgaaaagtataggccagtcatttgttaaagatctctaaatttgtgatttccctaatgtttcctcatgattaaattcaatgtatatattcttggcaagaagggacagaactgacgtgtcctcagtgcactagcaaacgcatgatgtcaatttgacctcttactggtaatgttaattttgaccgtttggttagagtgatacctgccagaattcctttgtgattatcaagtatcttatggggaaattcttctaagtatcctatttatcatacttttgcccactaattggcaagctttcatgttttttgctctttgggtttttttcccccatgattcttttcctgaaacaattagtgtaggatttaccaaatggtgattttctattttctgttttcatcactctatttttagtaattgaaattctgtgaagatttctttgccattcttttttttttttttggctgcacctgcagcgtgcagaagttccagagccagggatcaaacctgtgctacaactgcgccaccagggaactccattctttaaccaattattttatccacaacaggccctagtattctatatgtgataatgcattactaccaatattttgttactcaaaatgtcccagatttgccccctgcaaaccccttcccattgacctttgtttctttttaacatgtccccattcttttttttaatacttcctaaatttctggcaccagaagatattctggatttaccttgtattttctcttctctaaccttggaatttgatctgtaagcatccatgattccttttagaacctatttagaaaccaaaatctgcacgaagtgtactcattggtaactgaagtgtcattgcttctagcctggttaacagctagaaagtatatgtatgtgtgtatatatgtactaatttctatatctatatgtgtatatgtatgtgtattatttatatatatatttccatgagttcatatagatatttctaataccagaccaacattctggtcttcctcctttattagtcttaccaacagtaagaaatctgactttgactaactataatctgttgatttatttgattaatttctagaatacacataaagtagtttgagaattatgaatttatatatttccctatgaaaaactactaacattt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