Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name RPE
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr8) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Microcebus murinus
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr8:27281341-27300069
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from RPE

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RPEP1 chr6:10053877-10055505 + Intergenic
N/A UCSC
RPEP3 chr8:83292302-83292847 - Intragenic
N/A UCSC
RPEP4 chr12:8532041-8533590 - Intergenic
N/A UCSC
RPEP5 chr31:13017905-13018545 - Intragenic
N/A UCSC
RPEP2 chr8:135896149-135897033 + Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_012751458.2
AGGGGCGGGGCCAAAGCTGCGCGCCCAATCGGGGCGACGCCTTCGTCTTGCGGTGGGACTCGTGAGGTAACCTGCTCTTAGGAACCAGCAGTATGGCGTCGGGCTGCAAGATTGGCCCGTCTATCCTCAACAGCGACCTGGCCAATTTAGGGGCCGAGTGCCTCCGGATGCTAGACTCTGGGGCGGATTATCTGCACCTGGATGTAATGGACGGGCATTTTGTTCCCAACATCACCTTTGGTCACCCTGTGGTAGAAAGCCTCCGAAAGCAGCTAGGCCAGGACCCTTTCTTTGACATGCACATGATGGTGGCCAGGCCGGAACAGTGGGTAAAGCCAATGGCTGTAGCAGGAGCCAATCAGTACACCTTTCATCTTGAGGCGACTGAGAACCCAGGGGCTTTAATTAAAGACATTCGGGAGAATGGAATGAAAGTTGGCCTTGCCATCAAACCAGGAACTACGGTTGAGTATTTGGCACCATGGGCTAATCAAATAGATATGGCCTTGGTTATGACAGTGGAACCTGGGTTTGGAGGGCAGAAATTCATGGAAGATATGATGCCAAAGGTTCACTGGTTGAGGACCCAGTTCCCATCTTTGGATATAGAGGTCGATGGTGGAGTAGGTCCTGACACTGTCCATAAGTGTGCAGAGGCAGGAGCTAACATGATTGTGTCTGGCAGTGCCATTATGAGGAGTGAAGACCCCAGATCCGTGATCAACCTGTTAAGAAATGTTTGCTCAGAAGCTGCTCAGAAACGTTCTCTTGATCGATGAAACCATAAGGAGCCCAGTGTTTCTGCTCATGAATTCTCTAttgtaaaacaggaatattgactaCCAAATCATATTGCAGTTGAGGCAGTACTGTTTTTCAAAGCAATTATTCATTCCAGTGATTAAAATCTATTGTGCAGAATGTTCTAAGAGGTTAGCAATTGGTGTGTATAACTGCATTTTTAGTCATGCAATTTAAAGATTAATGTAGTGAAATACTCAGTTTTTACTGGGAGACTTGATTTTTATGAAGAGTAAAAATAGTCTGTATTAAGGTTACAAATAGAAATGTGTCTTAATGCCTAAGGGAGGGCATATTagctatatgaaaaaaatttttttgtatttctaagaaaaattttctgtttctcagctGTTTTCCAAATGCAAAGGAAATCcttatgtttttcctatttcatgTCATTTGTGATTTGTTTATATGCTTGATAATATGAGaagaatggaatttaaaaatataagcttgGGTGGGATGGCATACCATATTATTGcatctaaaacatttatttttaccttatacTTGActcataaaaagtataaaaacaaatatatgaagcCCAGGGGTTCTAAAATACAAGCATAGATTTTATCAGGGTGTTTTCTTTGTCAAAAGCAGGTTATTCGGTGATTCCTCACCCCTGGTTTTCTCTAATCTCACCCACCATTCTTAAGAACATTGAATAACGCTGTTGTGTTAGCTCTACgtagaaaggagaaaagtaaagcCTCTATCTGGAAATAATATTGGGTTGAATTCCGACTCTTTCCCTCTCTAGCTATTTAACCTTAACAAATCACCCAAacttttttgtgcttttcttaaCTCACTTATACATTGAATGTAATTATAACAACTCTGAGGTGGTGTTGAGGATTTAAAAAGGTAATAGCATATATGTGAAGTTTCTAGTACTATTCCTAGAATTTAGAAGATGCTCAATACAAAGTGGCTAGAATCatataagtttatattttgtGGGCTATAAAGTTCTTTGATATTTGCttattaaatctataaatcactcTTGTAAGTGGTAGTAAGGCAggtatttttgttgtcattttaaaaatgaagaaactaaagctcagcAATAGGATGGTACCATGGAAAGGATCCTACTGGCATAGGATTTCTGATCTGTACTCTTACTACAATTAGAACCCATGGGAAGTGGGTTAGGCAAAAgaagcttctttttatttaacattgtcTTATTTCCAGTCTAACTTTATCCTGTAGCAGAATCAGATGgctgaaaatattctggaactaTGGATCTTGACCCcaaggatatatattttataccaaGAAAGACCAGGTAGGCTAAAAGATGATAGGGTCTAGAGTTAATctataaactaaatatttataactGTGTTTGAAATTATAGAGACTACAAATATGTGTCGGCTActtgtatttcttataaatactCTTGCTATATAATAAATGCAGCCAAAAAAATAACAGGACCAATATCATTAAACTTCTGGGGTATTATGagttttgagaaataaagtttgcaAAATAAGAATGCTAACACTTAAGCATAGAATAGAGTTTGCTTGGgttttttcttacattattaggtaataatttgtttcttaatgtttatttttattttggcttagGAAAGGTTTATACCAGGAATAGGTGGTATTTAATCAAATCAGACAACACAAGGCATATAGaaataactttaattaaaaaatttacatagaaGATTATAATATGAGACATGACAAAGATTTGAATTTATTTGCCTGgacaatttgggtttgtctggcttttgtttttttttattttttgttttgtttttttttttctttaaaaataaatgtacagtaAAACTACCAGCAAAAGTTTGTCAGTattgaatttgaatttattttttccctaaaaggaCCAGTATAATTTCTAATGCCTGGCTAAAACTTAGTGTCAAACCCCATAGAGTAGGCCAGATGGCCACGATTTTCAGTTGTATGGGTACTACAACTTGAATAACTTTTTTTACATGACAAAAGTGATTTATATAAATTGTCCTCAACTTTCACATAGAAAAAATGGTATAATAGCTTCTAAAGGAATTTTTATTAATGTCTACTCTTCAGTATCTAATAATGAAGCATCatcctttgaaaaattttaattctcaATGTAGGATGCAAGGAGGAATAGATGCTTATTTGAATAGAGTAAGCGATGTCGAGGAATGACCACATTAGCTAGAAATacaaccattttaaaaaaattttatactgaTAGGACTTTCCTATTTGTTGCTCATTTTAACTCTAATATGCTTGCTTATTCTGTTAGGAGTGAACAGAAAGCCTGTGGTTAGTCCAACAGATATCAGTGATTTTTGAATAAAGGAATATTGTGTTATCTGG
>XM_012751461.2
GACTCGTGAGGTAACCTGCTCTTAGGAACCAGCAGTATGGCGTCGGGCTGCAAGATTGGCCCGTCTATCCTCAACAGCGACCTGGCCAATTTAGGGGCCGAGTGCCTCCGGATGCTAGACTCTGGGGCGGATTATCTGCACCTGGATGTAATGGACGGGCACCCTGCTCTTCAGGGAGGTCAGTTTTTTGCATTTTGTTCCCAACATCACCTTTGGTCACCCTGTGGTAGAAAGCCTCCGAAAGCAGCTAGGCCAGGACCCTTTCTTTGACATGCACATGATGGTGGCCAGGCCGGAACAGTGGGTAAAGCCAATGGCTGTAGCAGGAGCCAATCAGTACACCTTTCATCTTGAGGCGACTGAGAACCCAGGGGCTTTAATTAAAGACATTCGGGAGAATGGAATGAAAGTTGGCCTTGCCATCAAACCAGGAACTACGGTTGAGTATTTGGCACCATGGGCTAATCAAATAGATATGGCCTTGGTTATGACAGTGGAACCTGGGTTTGGAGGGCAGAAATTCATGGAAGATATGATGCCAAAGGTTCACTGGTTGAGGACCCAGTTCCCATCTTTGGATATAGAGGTCGATGGTGGAGTAGGTCCTGACACTGTCCATAAGTGTGCAGAGGCAGGAGCTAACATGATTGTGTCTGGCAGTGCCATTATGAGGAGTGAAGACCCCAGATCCGTGATCAACCTGTTAAGAAATGTTTGCTCAGAAGCTGCTCAGAAACGTTCTCTTGATCGATGAAACCATAAGGAGCCCAGTGTTTCTGCTCATGAATTCTCTAttgtaaaacaggaatattgactaCCAAATCATATTGCAGTTGAGGCAGTACTGTTTTTCAAAGCAATTATTCATTCCAGTGATTAAAATCTATTGTGCAGAATGTTCTAAGAGGTTAGCAATTGGTGTGTATAACTGCATTTTTAGTCATGCAATTTAAAGATTAATGTAGTGAAATACTCAGTTTTTACTGGGAGACTTGATTTTTATGAAGAGTAAAAATAGTCTGTATTAAGGTTACAAATAGAAATGTGTCTTAATGCCTAAGGGAGGGCATATTagctatatgaaaaaaatttttttgtatttctaagaaaaattttctgtttctcagctGTTTTCCAAATGCAAAGGAAATCcttatgtttttcctatttcatgTCATTTGTGATTTGTTTATATGCTTGATAATATGAGaagaatggaatttaaaaatataagcttgGGTGGGATGGCATACCATATTATTGcatctaaaacatttatttttaccttatacTTGActcataaaaagtataaaaacaaatatatgaagcCCAGGGGTTCTAAAATACAAGCATAGATTTTATCAGGGTGTTTTCTTTGTCAAAAGCAGGTTATTCGGTGATTCCTCACCCCTGGTTTTCTCTAATCTCACCCACCATTCTTAAGAACATTGAATAACGCTGTTGTGTTAGCTCTACgtagaaaggagaaaagtaaagcCTCTATCTGGAAATAATATTGGGTTGAATTCCGACTCTTTCCCTCTCTAGCTATTTAACCTTAACAAATCACCCAAacttttttgtgcttttcttaaCTCACTTATACATTGAATGTAATTATAACAACTCTGAGGTGGTGTTGAGGATTTAAAAAGGTAATAGCATATATGTGAAGTTTCTAGTACTATTCCTAGAATTTAGAAGATGCTCAATACAAAGTGGCTAGAATCatataagtttatattttgtGGGCTATAAAGTTCTTTGATATTTGCttattaaatctataaatcactcTTGTAAGTGGTAGTAAGGCAggtatttttgttgtcattttaaaaatgaagaaactaaagctcagcAATAGGATGGTACCATGGAAAGGATCCTACTGGCATAGGATTTCTGATCTGTACTCTTACTACAATTAGAACCCATGGGAAGTGGGTTAGGCAAAAgaagcttctttttatttaacattgtcTTATTTCCAGTCTAACTTTATCCTGTAGCAGAATCAGATGgctgaaaatattctggaactaTGGATCTTGACCCcaaggatatatattttataccaaGAAAGACCAGGTAGGCTAAAAGATGATAGGGTCTAGAGTTAATctataaactaaatatttataactGTGTTTGAAATTATAGAGACTACAAATATGTGTCGGCTActtgtatttcttataaatactCTTGCTATATAATAAATGCAGCCAAAAAAATAACAGGACCAATATCATTAAACTTCTGGGGTATTATGagttttgagaaataaagtttgcaAAATAAGAATGCTAACACTTAAGCATAGAATAGAGTTTGCTTGGgttttttcttacattattaggtaataatttgtttcttaatgtttatttttattttggcttagGAAAGGTTTATACCAGGAATAGGTGGTATTTAATCAAATCAGACAACACAAGGCATATAGaaataactttaattaaaaaatttacatagaaGATTATAATATGAGACATGACAAAGATTTGAATTTATTTGCCTGgacaatttgggtttgtctggcttttgtttttttttattttttgttttgtttttttttttctttaaaaataaatgtacagtaAAACTACCAGCAAAAGTTTGTCAGTattgaatttgaatttattttttccctaaaaggaCCAGTATAATTTCTAATGCCTGGCTAAAACTTAGTGTCAAACCCCATAGAGTAGGCCAGATGGCCACGATTTTCAGTTGTATGGGTACTACAACTTGAATAACTTTTTTTACATGACAAAAGTGATTTATATAAATTGTCCTCAACTTTCACATAGAAAAAATGGTATAATAGCTTCTAAAGGAATTTTTATTAATGTCTACTCTTCAGTATCTAATAATGAAGCATCatcctttgaaaaattttaattctcaATGTAGGATGCAAGGAGGAATAGATGCTTATTTGAATAGAGTAAGCGATGTCGAGGAATGACCACATTAGCTAGAAATacaaccattttaaaaaaattttatactgaTAGGACTTTCCTATTTGTTGCTCATTTTAACTCTAATATGCTTGCTTATTCTGTTAGGAGTGAACAGAAAGCCTGTGGTTAGTCCAACAGATATCAGTGATTTTTGAATAAAGGAATATTGTGTTATCTGG