Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name MTHFD2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name methylenetetrahydrofolate dehydrogenase (NADP+ dependent) 2, methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase
Also known as NMDMC
Coordinate chr2:74198591-74217565
Strand +
Gene summary This gene encodes a nuclear-encoded mitochondrial bifunctional enzyme with methylenetetrahydrofolate dehydrogenase and methenyltetrahydrofolate cyclohydrolase activities. The enzyme functions as a homodimer and is unique in its absolute requirement for magnesium and inorganic phosphate. Formation of the enzyme-magnesium complex allows binding of NAD. Alternative splicing results in two different transcripts, one protein-coding and the other not protein-coding. This gene has a pseudogene on chromosome 7. [provided by RefSeq, Mar 2009]

Retrocopy(s) from MTHFD2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
MTHFD2P7 chr3:179464319-179465321 + Intergenic
ENSG00000181260 UCSC
MTHFD2P4 chr4:162322865-162324380 + Intergenic
ENSG00000251253 UCSC
MTHFD2P6 chr5:41964383-41968063 - Intragenic
ENSG00000249266 UCSC
MTHFD2P2 chr6:86999338-87000291 - Intragenic
ENSG00000217169 UCSC
MTHFD2P5 chr7:82588769-82590763 - Intergenic
ENSG00000213530 UCSC
MTHFD2P1 chr3:95654183-95655747 - Intergenic
ENSG00000244681 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_006636.4
CTCCCGGCGCAGTCACCGGCGCGGTCTATGGCTGCGACTTCTCTAATGTCTGCTTTGGCTGCCCGGCTGCTGCAGCCCGCGCACAGCTGCTCCCTTCGCCTTCGCCCTTTCCACCTCGCGGCAGTTCGAAATGAAGCTGTTGTCATTTCTGGAAGGAAACTGGCCCAGCAGATCAAGCAGGAAGTGCGGCAGGAGGTAGAAGAGTGGGTGGCCTCAGGCAACAAACGGCCACACCTGAGTGTGATCCTGGTTGGCGAGAATCCTGCAAGTCACTCCTATGTCCTCAACAAAACCAGGGCAGCTGCAGTTGTGGGAATCAACAGTGAGACAATTATGAAACCAGCTTCAATTTCAGAGGAAGAATTGTTGAATTTAATCAATAAACTGAATAATGATGATAATGTAGATGGCCTCCTTGTTCAGTTGCCTCTTCCAGAGCATATTGATGAGAGAAGGATCTGCAATGCTGTTTCTCCAGACAAGGATGTTGATGGCTTTCATGTAATTAATGTAGGACGAATGTGTTTGGATCAGTATTCCATGTTACCGGCTACTCCATGGGGTGTGTGGGAAATAATCAAGCGAACTGGCATTCCAACCCTAGGGAAGAATGTGGTTGTGGCTGGAAGGTCAAAAAACGTTGGAATGCCCATTGCAATGTTACTGCACACAGATGGGGCGCATGAACGTCCCGGAGGTGATGCCACTGTTACAATATCTCATCGATATACTCCCAAAGAGCAGTTGAAGAAACATACAATTCTTGCAGATATTGTAATATCTGCTGCAGGTATTCCAAATCTGATCACAGCAGATATGATCAAGGAAGGAGCAGCAGTCATTGATGTGGGAATAAATAGAGTTCACGATCCTGTAACTGCCAAACCCAAGTTGGTTGGAGATGTGGATTTTGAAGGAGTCAGACAAAAAGCTGGGTATATCACTCCAGTTCCTGGAGGTGTTGGCCCCATGACAGTGGCAATGCTAATGAAGAATACCATTATTGCTGCAAAAAAGGTGCTGAGGCTTGAAGAGCGAGAAGTGCTGAAGTCTAAAGAGCTTGGGGTAGCCACTAATTAACTACTGTGTCTTCTGTGTCACAAACAGCACTCCAGGCCAGCTCAAGAAGCAAAGCAGGCCAATAGAAATGCAATATTTTTAATTTATTCTACTGAAATGGTTTAAAATGATGCCTTGTATTTATTGAAAGCTTAAATGGGTGGGTGTTTCTGCACATACCTCTGCAGTACCTCACCAGGGAGCATTCCAGTATCATGCAGGGTCCTGTGATCTAGCCAGGAGCAGCCATTAACCTAGTGATTAATATGGGAGACATTACCATATGGAGGATGGATGCTTCACTTTGTCAAGCACCTCAGTTACACATTCGCCTTTTCTAGGATTGCATTTCCCAAGTGCTATTGCAATAACAGTTGATACTCATTTTAGGTACCAAACCTTTTGAGTTCAACTGATCAAACCAAAGGAAAAGTGTTGCTAGAGAAAATTAGGGAAAAGGTGAAAAAGAAAAAATGGTAGTAATTGAGCAGAAAAAAATTAATTTATATATGTATTGATTGGCAACCAGATTTATCTAAGTAGAACTGAATTGGCTAGGAAAAAAGAAAAACTGCATGTTAATCATTTTCCTAAGCTGTCCTTTTGAGGCTTAGTCAGTTTATTGGGAAAATGTTTAGGATTATTCCTTGCTATTAGTACTCATTTTATGTATGTTACCCTTCAGTAAGTTCTCCCCATTTTAGTTTTCTAGGACTGAAAGGATTCTTTTCTACATTATACATGTGTGTTGTCATATTTGGCTTTTGCTATATACTTTAACTTCATTGTTAAATTTTTGTATTGTATAGTTTCTTTGGTGTATCTTAAAACCTATTTTTGAAAAACAAACTTGGCTTGATAATCATTTGGGCAGCTTGGGTAAGTACGCAACTTACTTTTCCACCAAAGAACTGTCAGCAGCTGCCTGCTTTTCTGTGATGTATGTATCCTGTTGACTTTTCCAGAAATTTTTTAAGAGTTTGAGTTACTATTGAATTTAATCAGACTTTCTGATTAAAGGGTTTTCTTTCTTTTTTAATAAAACACATCTGTCTGGTATGGTATGAATTTCTGAAATTCTGTCTTCCTATGACTCCTAGTTGTGACCTAACCAGTTTTTTTCTCATTTAATCAATGTAGCTATTCCTATATTCAGTAACACTTACTTCTATAGCCTTAAATAGATAATTTTTTTTCTTCTATTTttttttttttttttgtagagatggggtcttgctatgttgcctgggctggtattgaactcctggcctcaagcaatcaatcctcttgcctcagcttcccagagggctgggattacaggcctgggccacccacacccAAACAGAGGTTTAAAGAGCTTTGGAGAAACCAGCCTCGTCCTCCAGTCTCtttgtttgtttgttttgagactgagtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcatgatctcgggtcactgcaacctctgcctctcgggttcaaacaattcttgtgcctcagcctcctgagtagctgggattacaggtgcatgccaccatgcctggctaatttttgtgtttttagtagagatggggtttcatcacattggccaggctggtctcaaactcctgacctcaagtgatccacctgcctcggcctcccaaaatgctaggattacaggcgtgagccactgcacctggccTGTCCTACAGTCTTATATCACAACAGGTTGTGCCAAGCTAGGAGCTTAATCTGTAAAATACTTGAGGCAGGGATAGGTTTGTCTGTTTTGGCTTTTGGCTTTCATGCGAGCAGAAGTAGCTCCTGCTCTAGGCAGCTTGAGGCAGAAAGAGAAGAAACAATTGAGTTGACCTACCTCCGTCCTCGTTCTTCTGCCAGCTGGCGTTATTCTTTTGATAGTTCTCTGGAGTTTAAAGAAGTTTAGATAGTTTGCTGGAGATGTTTTTGTAAGTGACGTATAGCTTATGTCTCTAATCCATGCCTGCTTACCTAGATTATTAAATGTGGAGCAAGATGACCAGACAGGATTAAATTTTATTGAATTACAGTTACAAGTGGAAAAAATGACTGACTTACTGCATGGAGAAGTATTATGTCAACCTGTTAAAAGCTATGGAAATTAAAATGTTCATGTATATACAAAATATAAATGACATGTAAGGTAAAATTACAGTGATCAATTTACAACAAAGAAATTAACAGTAGTTTTCCAGCTTGTTTGATTAATCAAGCAGGTTTACTCTTGAATCCATAGCATTTCTACAATTTAATTTGGACAAAGTTCTATTCCAGATCAGCCAGGTTTTAAAACTGAAATGTGTTAAGGGTGGATTGTTAGCTTCCCCAGGATTGGTGTGGATGATAAATACTTTTTTTAAAAATTAATTATTATTGTTTATAAGACATGGATTCCAGctgtctccctggctggagtgcagtggcatgattatagctcactgcagccttgaactcctggacttaaacgatcctcctgcatcagcctctgaaatggctgggactacaggtgtgtgccagcatgcctagctaatttttaaacatttgtttagagatgggtctcactatgttgcccaggctggtcttgacctcctgacctctgctgattccccccacctctgcctcccaagtagcgggattacaggtgtgagccactgtgtctgacAAGAATTTATACTTAAGCATAGGAGATGGTTCTGGAAATTCTAAGAAATTCTGCTCTCAGTAAGAGTAGAGGTTTGGAGCTTTACCTCTTGGCAGTATCCCTTGGAAGGGAGCTCTGAGATTAAATGTAATcaaacacttattgagagctttctatggaccaggcactacactagacgctgggaattacagaggcaattacctgtcctatactcaaggtgttaatgatctagtgTCATTTTTCTTTAAAAAAGAAAGCACCTGCATTTGTCATCTTGAGCAAATATAGTAACTCTAACCTCAAGGTTCAAGTGATTTACTCAAGGTTTAAATCATAGTTGTTTTGGAGAAAGTAAGTGTCAGATGCACTGTGGCTGTCAGGGTCATAGTAGGCATTAAATCAACATGGTTGGTGTTCATTAAATGTGGATTGAAGATAAAATGACTGATCTTAAGTTTCATGAGGAATAGGTTTGCTTCATTGAAACTGGTTTTTATCTTCCCAAATAGTTTTCAATCATTCCTTTAAAGTACTAGGTTGATTAATATTGCAAAGTTGTAATGTAAAATGTGACCTTACCTCTGTCTAACCTGTATTGTTCACATGAATGGGAGTTTGACTTTGGGAATAAACATTGAAAATTTGCAGGGAGGACCCA
>XM_006711924.2
CGCGTGGCCCGCGCGCGCGCTTCCCTCCCGGCGCAGTCACCGGCGCGGTCTATGGCTGCGACTTCTCTAATGTCTGCTTTGGCTGCCCGGCTGCTGCAGCCCGCGCACAGCTGCTCCCTTCGCCTTCGCCCTTTCCACCTCGCGGCAGTTCGGAATCAACAGTGAGACAATTATGAAACCAGCTTCAATTTCAGAGGAAGAATTGTTGAATTTAATCAATAAACTGAATAATGATGATAATGTAGATGGCCTCCTTGTTCAGTTGCCTCTTCCAGAGCATATTGATGAGAGAAGGATCTGCAATGCTGTTTCTCCAGACAAGGATGTTGATGGCTTTCATGTAATTAATGTAGGACGAATGTGTTTGGATCAGTATTCCATGTTACCGGCTACTCCATGGGGTGTGTGGGAAATAATCAAGCGAACTGGCATTCCAACCCTAGGGAAGAATGTGGTTGTGGCTGGAAGGTCAAAAAACGTTGGAATGCCCATTGCAATGTTACTGCACACAGATGGGGCGCATGAACGTCCCGGAGGTGATGCCACTGTTACAATATCTCATCGATATACTCCCAAAGAGCAGTTGAAGAAACATACAATTCTTGCAGATATTGTAATATCTGCTGCAGGTATTCCAAATCTGATCACAGCAGATATGATCAAGGAAGGAGCAGCAGTCATTGATGTGGGAATAAATAGAGTTCACGATCCTGTAACTGCCAAACCCAAGTTGGTTGGAGATGTGGATTTTGAAGGAGTCAGACAAAAAGCTGGGTATATCACTCCAGTTCCTGGAGGTGTTGGCCCCATGACAGTGGCAATGCTAATGAAGAATACCATTATTGCTGCAAAAAAGGTGCTGAGGCTTGAAGAGCGAGAAGTGCTGAAGTCTAAAGAGCTTGGGGTAGCCACTAATTAACTACTGTGTCTTCTGTGTCACAAACAGCACTCCAGGCCAGCTCAAGAAGCAAAGCAGGCCAATAGAAATGCAATATTTTTAATTTATTCTACTGAAATGGTTTAAAATGATGCCTTGTATTTATTGAAAGCTTAAATGGGTGGGTGTTTCTGCACATACCTCTGCAGTACCTCACCAGGGAGCATTCCAGTATCATGCAGGGTCCTGTGATCTAGCCAGGAGCAGCCATTAACCTAGTGATTAATATGGGAGACATTACCATATGGAGGATGGATGCTTCACTTTGTCAAGCACCTCAGTTACACATTCGCCTTTTCTAGGATTGCATTTCCCAAGTGCTATTGCAATAACAGTTGATACTCATTTTAGGTACCAAACCTTTTGAGTTCAACTGATCAAACCAAAGGAAAAGTGTTGCTAGAGAAAATTAGGGAAAAGGTGAAAAAGAAAAAATGGTAGTAATTGAGCAGAAAAAAATTAATTTATATATGTATTGATTGGCAACCAGATTTATCTAAGTAGAACTGAATTGGCTAGGAAAAAAGAAAAACTGCATGTTAATCATTTTCCTAAGCTGTCCTTTTGAGGCTTAGTCAGTTTATTGGGAAAATGTTTAGGATTATTCCTTGCTATTAGTACTCATTTTATGTATGTTACCCTTCAGTAAGTTCTCCCCATTTTAGTTTTCTAGGACTGAAAGGATTCTTTTCTACATTATACATGTGTGTTGTCATATTTGGCTTTTGCTATATACTTTAACTTCATTGTTAAATTTTTGTATTGTATAGTTTCTTTGGTGTATCTTAAAACCTATTTTTGAAAAACAAACTTGGCTTGATAATCATTTGGGCAGCTTGGGTAAGTACGCAACTTACTTTTCCACCAAAGAACTGTCAGCAGCTGCCTGCTTTTCTGTGATGTATGTATCCTGTTGACTTTTCCAGAAATTTTTTAAGAGTTTGAGTTACTATTGAATTTAATCAGACTTTCTGATTAAAGGGTTTTCTTTCTTTTTTAATAAAACACATCTGTCTGGTATGGTATGAATTTCTGAAA