Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Advanced Search

Summary

Gene Name SUB1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr16) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Sus scrofa
Full Name N/A
Also known as -
Coordinate chr16:18758886-18779421
Strand +
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from SUB1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SUB1P1 chr15:17576852-17580221 + Intergenic
 ENSSSCG00000040294 UCSC
SUB1P2 chrX:70173632-70174230 - Intergenic
 ENSSSCG00000036557 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_021076608.1
CACGCCCCATCACGTGTCCGCGGTCCCAGCGGGGCGGGGCCGGAGACTCTTAGCTGCCGTCAGTTCCGGTTCTCTGTCAGTCGAGAGCAAGCGAGCCAGCAGGAGGTGGTTCGCCTACCCGAGCGGAGCAATGCCGAAGTCAAAGGAACTTGTTTCTTCAAGCTCTTCTGGCAGCGATTCTGACAGTGAAGTTGACAAAAAGTTAAAGAGGAAAAAGCAAGTTGCTCCAGAAAAACCTGTAAAGAAGCAAAAGACTGGTGAAACTTCAAGAGCACTGTCGTCCTCCAagcagagcagcagcagcagAGATGATAACATGTTTCAGATTGGGAAAATGAGGTATGTCAGTGTTCGGGACTTTAAAGGGAAAGTCTTAATTGATATTAGAGAATATTGGATGGATCCAGAAGGTGAAATGAAACCAGGAAGAAAAGGTATTTCTTTAAATCCTGAGCAGTGGAGCCAGCTGAAAGAACAGATATCTGACATTGATGATGCAGTAAGAAAACTGTAAAATCAGAGCCATATTAAAACTTGTACTGTCCTAGTTGTTTTATCTGTCTTTCTACATTGGCTTTTGTTTTCTAAATGTTGTTTTCCAAGCTATTGTATATTTGGATTGCAGAACAGTTTGTAAGATGAATACTTTTTTTTTAAATGTGCATTATTAAAAATGTTCTGAGTGGAGCTAATTGTCAGTTTTATTAAGGAGGATTGCTTTTGTGTCTACCACCTGGTGTGAAATAAAATCAAGTAATACAATCTTAACTGTTGTGGCCTTCTTTGATCAAAAGAGTTGGTATTAAGGCCAAAAATTAACAGTTTATAGACCTTTTAGTTTCAACTCAGCTTTTACATTCAAAAGAATGTACATTGTGTTGAATTGACTTTTGGTTTGTGAAATTCATAGTGGATCTATAGTCTTCTAACCAAATGTCTGGACTGGTTTGGTTTTTTTTTTTCCCCAACCCCAATGATACTTCTCTTTCCCCTTTTTCTTTTACTTCTAATAACTTATCTTGTCATGTTCAGCTTTTATTTTGCTTTTTGCTCTTTTTCTTGAATATATTATGCTAATTTGGAAAGTCCGAAACTGTCAAAATGTTAGTTAATAAGGTACTTGTAATTAAAATATGAGACTACAATCACTAATTCTACTGTATTAAATATTAGAAGATATAGTTTGATAAACAACATGGCTTGTATGAAAACTGAGCAAGTAAGTGTATGTCATTAACTGTAGTGTTCTGTGTAGTTACTGCTTAGTCTGCAGAAATTAATGACTTCGATGTCTGATTTGCTTTCACTTATATTCACCATGGGATGATGTCTATAAAATCAGATACTGTTAAATTAGATTAGGATTTAATAAAAATTATGAAAGCTTACTGGCCTAACATTTTATTTTATAACATTGAGTATGGATTATATATATAGCCAGAGATATCACTGAGCTTTATTCTCATGGTAGATGTTGTGGTCAGTTTTTAGAGGAAAGAACATATAGAGCATATACTTGTGTTTTTTGGCCTTTGCTTCAGTAGACTTGGTTCTTTTGCAGTTAATCTACTGAACGATGGCATTCTAGACTTAATGTTACTAAGTTTTAGCACTCTGAAGTGGTTTTCATTGAACCATAATGATGAAGCAGACACAGATTGAGGCACAGATTTCAGGGGCTTTGCAGCAATAAATAGGGCATGGCGTGCCTTAGGAAAAGAGTGTAGGTAGGGGAACTATAACAAATTAAAGAAAGTGGCAGTGAAGAAGGAATTGTCTTCACACTAAATGATATCACATGATATTTTGATCACATTGTAAGACACAGTTCTAGATAGAATAGTAAAAAGAGAGGTTTAACGACATGTAAAAAAATTCTTGATGACTTTATTTTTGGTAGTTAATCTCAGTGGTTACTGCCGTATCAGAGAGTTGCGCTGTTATGCCAAGTTTGATTGCTATATCTAAAACATTTTGTGGTAGAATTGTCAAGGGCTTGATTTCAAAACCATCTGCCAGGGCATGTAGTTAGCAGTTGTTTTCTGGCAGCTGTTCTAAGTATTTCTTTCACGTTTTTAAGATTTTTGAAAGTTTTTTTTTTAGCAGTAACCCTAATATGTGCTTAATTGGGAAAATAAATCCTCTTTTCTGTTATTTTAGCCTTCATTAAATAATAGGTACCAAAGTGTTCAGAATATGTATTTTAGACAAATCATACTTGATTGAAAACTTTCCCCTTATTTTGGGAACATAGTATATGTCCCAGTTAACTGAATTGGGTAGATTTGTAAAGTATTCCTTATTATATATACAGAAAGGGTAGTTAGAACACAGAACTTTGATTTTGGTATAGATGAAGAGGGAGTAATGAGTAAATTTCCTAGGTTTATGTGAAATTAGGAGGTGTACGCTTTCTGAAGCAATCTAATACAGAGATGGTGCTGAAATCTGTTACCAAGGCATTCTCTAGTTGTTTAGCATCATGTCATTAAAACTTTCACACAAGGAGTGTTTCTCTGGCAGATTTTAAGGTTACTACTAAATTCATTTCAATTCATTACTGAAATGAAATATACAAAAATTAATGATCTCTTAGAAAAGGGTAGAAAAGGATGAGAACTGGGTTGAAAGAAGAGACAAAGTAACTTGTACTGGAAAGAAAAGATATAGGGTACTTCTCTTTTCTGTTTAAACTTTATCTTCTTGGTAAGATTTCTTGAGGAGACAGTGGTTTCTTACCTTGTAATGCCAGGATGAATTTAATTCTTGCCAGCCCTTGGGTGTGCTCAGTAGCAGGGCCTTTCTAATGGGTTCTTCCTCTTTGTCTTATTAAAGTACAAGCAGCATTTGACCAATTTCCAATGCTCTTGGCATTTTAAAGAACAACCGCTAAAAAAAAAACTTTATAATTTTATTATCTTTTGCTTCATAAAATGCTGAAGAATTTATTTTAAAGAAAACGCCTACCTCATTAGCTAGTCAAGATGCTGTGATGGTCAACCTATCCTACCTAATGTGTTTAGGAAAAAAGAATGAGCAAGAAAAGTATGTACGTCCTGGCTTGGCTATTGAGGGAAAAAAGAGGAAGAGTTGAGTATTAATTATTTAAGTATTCCTGATGGTGGGAGTATGTTGGAAGAGTACTGTAAAAGTTTGAATTTTTTAAAAAGCGCTAATATTTAGGTATCTCTCCTGAAGTTCTTTGCAACTCACTTTTTATGGAAATTAACCCAGTGAAACACTCAAAAGTTTTTGCTTTTTTTTTTTTTTAAGTGGTGTTTTTCCAGATAAACTCTAGGGGTAAACATTCACATAGTAACAAAAATGTAATTCTGTAATTGTGTAATACCTGTCTGCTTTGTTTGGTACATCTTCCATGGAGATGTCAATGAATATAATACTGCATCTGTGAATATTTTAAATGTTGAAATAAAAATAAGAAATGTG