Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Eif4e
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Mus musculus
Full Name eukaryotic translation initiation factor 4E
Also known as EG668879|Eif4e-ps|If4e|eIF-4E
Coordinate chr3:138231952-138265457
Strand +
Gene summary This gene encodes a component of the eukaryotic translation initiation factor 4F complex, which recognizes the 7-methylguanosine cap structure at the 5' end of messenger RNAs. The encoded protein aids in translation initiation by recruiting ribosomes to the 5'-cap structure. Association of this protein with the 4F complex is the rate-limiting step in translation initiation. This gene acts as a proto-oncogene, and its expression and activation is associated with transformation and tumorigenesis. It has also been associated with autism spectrum disorders. Consistently, knockout of this gene results in increased translation of neuroligins, postsynaptic proteins linked to autism spectrum disorders. Pseudogenes of this gene are found on other chromosomes. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Sep 2015]

Retrocopy(s) from Eif4e

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Eif4eP2 chr4:74582070-74582939 + Intergenic
ENSMUSG00000081438 UCSC
Eif4eP1 chr1:169419093-169419693 - Intergenic
ENSMUSG00000103526 UCSC
Eif4eP3 chr12:61626268-61628336 + Intragenic
ENSMUSG00000113456 UCSC
Eif4eP5 chr16:70082151-70082568 + Intergenic
ENSMUSG00000116650 UCSC
Eif4eP6 chrX:60828965-60830596 + Intragenic
Intragenic
Intragenic
ENSMUSG00000050900 UCSC
Eif4eP4 chr13:109300373-109302006 + Intragenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001313980.1
GAGCGGTTGTGCGATCAGATCGATCTAAGATGGCGACTGTGGAACCGTGGGAGATTTTAATGCTTTGTCAATGTACTAGTATTGCCGCGTGAACTCTTAGGGACAGTGGCTTGCCACTGTAATGTCTGTTCTCTTCATTTCAAGTGTCACTGAAGGCAGGGATATCTGACTCCTTATAGAAAGGAAACCACCCCTACCACTAATCCCCCACCTGCAGAAGAGGAAAAAACAGAGTCTAATCAGGAGGTTGCTAACCCAGAGCACTATATTAAACACCCTCTACAGAACAGGTGGGCActctggttttttaaaaatgataaaagcaaaacTTGGCAAGCAAACCTTCGATTGATCTCTAAGTTTGATACTGTTGAAGACTTTTGGGCTCTATACAACCATATCCAGTTGTCTAGTAATTTAATGCCTGGCTGTGACTACTCACTTTTTAAGGACGGGATTGAGCCTATGTGGGAAGATGAGAAAAACAAACGAGGAGGACGGTGGCTGATCACACTGAACAAGCAGCAGAGACGGAGTGACCTCGATCGCTTCTGGCTAGAGACActgCTGTGCCTTATTGGAGAATCTTTCGATGACTACAGTGATGATGTGTGTGGAGCTGTTGTTAATGTTAGAGCTAAAGGTGATAAGATAGCAATATGGACTACTGAGTGTGAAAACAGAGATGCAGTCACACACATAGGGAGGGTATACAAGGAAAGGTTAGGACTTCCTCCGAAGATAGTGATTGGTTATCAGTCCCACGCAGACACAGCTACAAAGAGCGGCTCCACCACTAAAAATAGGTTTGTTGTTTAAGAAGACACCTTCTGAGTATTCTCACAGGAGACTGCGTCACGCAATCGAGATTGGGAGCTGAACCAAAGCCTCATCAAAGCAGAGTGGACTGCACTGAAGTTGATTCCATCCAAGTGTTGCTAAGATATAAGAGAAGTCTCATTCGCCTTTGTCTTGTACTTCTGTGTTcattctcctcccccacccccaatttttgCTAGTGTGTCCACTATCCCAATCAAAGAATTACAGTATACGTCACCCCAGAACCCGCAGATGTGTTCCTGGCCCGCTCTGTAACAGCCGGTTAGAATTACCATGACACACACATTTGCCTTTCCACAGTATTCGAAAAAGAACTTGCATTTCTATTACCTTAGCAGGAAAGATCTGGTTTTGCTCCACTCCATGCAGGAGCGGACTTTGCTGGTGTGAGAGTCTGAGTACAGCTTTCTAGCAACCTTCTGTTTCCTTTCACAGCATTGTCCTTGCTGTCCTCTTGCTGATGGCTGCTAGATTTAATTTATTTGCTTCCCTCCTTGATAACATTAGTGATTCTGATttcagtttttcatttgttttgcttttgtttttttcctcgtGTAACATTGGTGAAGGATCCAGGAATATGACAGAAAGGTGGAATAAACATTAAATTTGTGCATTCTTtggtaatttttttgttttttgtaactaCAAAGCTTTGCTACAAATTTATGCATTTCATTCAAATCAGTGATCTATGTCTGTGTGATCCCTAAACATAATTGTGGACTATAAAAATGTAACACCATAATTACATTCCTAACTAGAATTAGTATGTCTGCCTTTGTATCTCTATGCTGTACTTTAACACTTTGTATTCTTAGGTTATTTTGCTTTGGTTACAATGGCTCAAGTAGAAAAGCGGTCCCATCCATATTAAGACAGTGTACAAAACTGTAAATAAAATGTGTACAGTGAATTGTCTTTTAGACAACTAGATTTGTCCTTTATTTCTCCATCTCTAGAAGGAATCTGTACTTCGTATTGCAAGGCAGTCTCTTGTGTCTTCTTAGAGTGTCTTCCCCATGCACAGCCTCAGTTTGGAGCACTAGTTTATTATGTTTATTACAATTTTTAATAAATTGACTAGGTAGTATCACATGTAATTACACTGATGTGGCTATCTTTTTAATAAAGTTAAGGCACAGTTGCTCAGTCCTAGGTTGAGTGATGGACTTTGACTATGTTACAGTTGATGAGGATTGGGGTTTTGGTGCATCACCATTCGGTAGGAACAGCGGCTAGAAACTGATTGTTGGGTTTAAGATGTTTTTACTTAATGGCCAGAAAATTAGCGTAAGGAAAGTATATAGAGAAACATGCGTTAGGGACATTAGTGTTACTATCTGaataaaacacaataaacaaGTATTAAGAACTACTTATATTGGTCAATTGTTGCAGTATGGTTTTCTGTAAACTTGAAACCTTGATCTATTCTTTGTATCATTTAAAGCAAACATGAAGACATTTTGTCTGCAGTACGTAATTGTATAGTTCAGATCCTGTGAGATGAGGTGTGGCTGTTAACGCCGAAGGGTAAGCTGAACTGTGGGTAGCAGAGTGGAAACCATTGGCTGAGAGAAAAATGCTCTTTAAGTGGTGGTTGTTATGAATTCACACTGATAACTTGATAAAGATCCTTATAAAATACATACGGAATTAATAGCATTGCTCTTATTATGTACGTCAAGAATGTATAACCGCCTGCTCTTGTTGTCACAGATAACTCCCTGTTCAGTGCTTTGGAAATAGCGATGCTCACGATCTCAGCATTCTGTACCCTACATCTACTGTGTGGATCATTGAGAGATCTTTTGACATTGCAACATGATATGGTCTATGTTGGGCTGCATTCCTGGCTGTCTTGTATGAGACCCCGGTTGGCTCCCTGAAGCTGATTGATACAGTGTACAGGCATGAAGGTGGCTGATGAGGCTTTCTTACCAACATGTGGGATTCTAGTAGTTGTATCTATTAGAGATTAATTCTCATATTCCTTTTCATTCATTTGTAAGAAGTATCAACTTTAGAAGTGAAAAAAGAATcataaaatacagtttttaaagttaaaaacttTGAGTAGGATGTATCTTTGTTATAGAAAGTTGAAATAATTTGTAATGGATGAATAATtataatggaaaaatgaaaaaactgGACAGAAAGATTTAGCATATACTATATAGGAATTAATAACTACAGCACTTACATAATAAGTTAGGCAGTGTTTTATTCTTGTCACGTGTTCATAATATATGTAGGTAtttctcccttttataaatgaatgAGAATTGGGATTTGGTGTATCACCATTTGATACATTAAGATTTAAATAATTTCATAGCTTCTGTCAGATACAGAGTATGAACTTGTGAATAATTCTTAATCACATAAATCACACACTCCCTGAAGATGTAATAAATAGGTTGTAGTACATTAGATTCTAAATTCCAGTTAGACTCAGCTACAAGCTAGGCATATAAACAGCCAGCAAAGCTAGTCACAAATAACCATGGAGACTAAGGTACAGGGTTAAAGTATGAATGTTTTTATTGGTGCTCTAAATCACCATCTAAGATAGATGGTAGTGTTCAACTTGACAGAAATAGACGTTCTTGAATGCTGCTGGAGTTGCATTTAAAAGGTTAAATTTAGTAAATGGCCTGTATGGTGGGTACATATCTGTAATCACAGTGCTGAGATGGAATGACCataaggccaacctgggttacgTAAACCctttatcaaaaagacaaggaccAGGAATGTGCTTCATTGAGAGTGCTTGCCAAGCATGTACTATGTTCTGTGTGTGATTGCCAGCACTGTCAGGAAGATGAGGTGTAGTGTTGGGTCTCTGTGTATCACGTTTCTCATGACACCCAGCTTTGTATTCTCAGTGTGGAGTATTATGGGGCAAGTGGATAGATATTCTCATTTGGCACCAGCCCTCTAAATACACATCAAATTGATGAGTAtaccttgaggccagcctggtccataatGCTAGTTCTAGGACAACTAAGGCtacacaaaccctgtctcgaaacattGAATCCAAATGAATCCCACTGTGGGAGGATGCCTGAAAGCCAGTGCATACAAATGCCACTTTGTAacatcccctcccctccagctGTGGTCATGCCAGTcgtgggtttggtttggtttggttttttaatgtgtatgcatgcatgttttgTATCGTGTGGTGCCTGAGGTGGTCAGCAGAGGGCATGAAATCCCTGCAACTGAAGTTAATTACTTagcacagttgtgagccaccatgtgagtgctgggagtcAACTGGATCTTACACAAAACCAACGACTCTGCTTACTGCAGAGCCATTACTCCAGCCCCATGGCTCTTGTTTATGTGATGGtatgttcatttgtttttcatgACAGGCTTTCTAtaagcccaggctgtcctggaactcactgtagactaggctgggcaCCAgaataagtgctgggattaaaggttgtgCCCCCAACACTGCCCGGTAgtactttgattttctttctttgggggagaggggagcttGGTGTagtggtgcctgcctttaatcccagcactcaggaggtagaaacaggcacagcctgatctacagaggctagcctgatctacagagctatatctaggacagccagggctatacacagattatataaattttgttattttgagacaggttttctctgtagccttggctgttctggaactcattctgtagaccaggctgagcaactgcctctgcctccagagtgctgggattaaaggtgttcaccaccactaCCCCTACCCAGTTTTGTATTCTCAGATTAAGACTCCATGGTCTAAATGTCTAGAtggcaataaatatttaaatcaatGTAAAAATCACTTGTAGAAAAAACGAAAAACACCGTCTTAAAACTCAAATGGGAGAACTTGCTTATTACCTgtattttttgtgggtttttctttttcttttgagcttAGGTTCTACACAGCCCAGAATGGCTttaaacctgcctcagcctcccaaatgttgggattacagctgtgtgccTGCTTGTTTGTTCCTTTTGAGACCTGGTGTCGTTTCATATCTCCGGCTGTAATGGAAGTCAGATCCATCTTATTGCAGAGGATTGGAATTAAATGCG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>NM_007917.4
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