Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name APOOL
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chrX) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name apolipoprotein O like
Also known as CXorf33|FAM121A|MICOS27|Mic27|UNQ8193
Coordinate chrX:85003852-85093315
Strand +
Gene summary This gene encodes a protein which contains an apolipoprotein O superfamily domain. This domain is found on proteins in circulating lipoprotein complexes. [provided by RefSeq, Sep 2011]

Retrocopy(s) from APOOL

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
APOOLP2 chr16:68939819-68939993 - Intragenic
N/A UCSC
APOOLP1 chr5:145997216-145998374 + Intragenic
ENSG00000248493 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_198450.6
CTCCGTCTGAAAACCTTGGCCGAAAGGGTTGTAGACATGGCGGCCATCAGGATGGGAAAACTGACAACCATGCCTGCAGGTCTGATATATGCATCTGTAAGTGTACATGCAGCCAAACAAGAGGAATCCAAAAAGCAGCTAGTGAAACCAGAGCAGCTCCCCATATATACTGCACCACCGCTCCAGTCTAAATATGTTGAAGAGCAGCCTGGTCATTTACAAATGGGCTTTGCTTCCATCCGCACTGCAACTGGTTGTTACATTGGCTGGTGCAAGGGTGTTTATGTCTTTGTGAAAAATGGGATAATGGATACAGTACAATTTGGAAAAGATGCTTATGTCTATCTGAAGAATCCTCCTCGAGATTTTCTTCCGAAAATGGGAGTTATTACAGTTTCAGGATTGGCGGGCTTGGTTTCAGCGAGAAAAGGTTCCAAGTTTAAGAAAATTACTTATCCTCTGGGACTGGCCACTTTAGGAGCAACTGTTTGCTACCCAGTTCAGTCCGTAATAATTGCTAAGGTAACAGCAAAAAAGGTATATGCTACAAGCCAGCAAATTTTTGGAGCAGTTAAATCATTGTGGACAAAAAGCAGCAAAGAAGAGTCACTCCCTAAACCTAAAGAAAAAACTAAGCTAGGATCCTCTTCCGAAATAGAAGTACCTGCAAAAACAACTCACGTCTTGAAACACTCAGTGCCCTTGCCAACAGAACTCAGCTCTGAAGCAAAGACCAAATCAGAATCCACTTCAGGTGCAACCCAGTTTATGCCTGACCCCAAGCTCATGGATCACGGGCAGTCCCACCCAGAAGATATAGATATGTACAGCACTAGAAGCTGAAGTAGACTGCATGCAGAGACTACACAGAAAACTACAAGATGTGTGGCGTTGCAAATAATGATGAAAATAAATCATGTAATGGGTAACTGATACATAGAGTATTACCTAAACCAAGTTTCTCCCTTACATTTCCAAATATGCCATTTGATAAATTACATAAGTGGTTAACACACAAACTGTGAATGCAGTGTAAACAATATTAAATGATTGATGAGGAGACTTAGGTAGAAGTATTAGCTTGCATTTGATGACCTTTAAGGGCACTTAAAAAAAAATGAAGACATGAATTCTAGTGAGATTAAAATCTAAAAATACatatatatatatgtatgtataaatacatacatatttatacatgtataaatacgtatttatacatatatgtataaatacatatacatatatgtataaatacatatacatatttatacatatatgtataaatacatacatatttatacatatatgtataaatacatacatatttatacatatatgtataaatacatacatatttatacatatatatgtataaatacatacatatttatacatataAACATATATTTCTGCTCTAGCTTTCCCAGATTAATGCTAGTTAAATTAGAATGGTGTATGGAAAGGTGTGTTTCCCTCTGtttttttttttttttttttttttttttttCCCATTTCCTAGAGCTGGAATAAAATATCCATGTTTTATGGGACTTGAGCTTGGCTTTGTCCCTTGGTTTTGTTAATGTTAATTCCTCTTAAATATCTAAAAACATCTCTACCTATTTGAGAGGGCCATATGCTACACAggcttcctaatactgcttagcaatccttctactggttcctaagtggtttactattgtgttccctggaagaggtattacaaacgttttattcttctcaagcctcttagaactgtcaaagttgactgtgcctcctatttcatagagaaaaaactaaattattagatatgaccattcccaaaacttcttcccatctaccttcaagacttacctcttttcagccatgcatcccccttttctaagacatgcttctctttgtgttcttgacctcattccttcccatctaAGACCATATTCCACCCTGTTTAATTTCTAGTCTTCGGTTTCTCTTTTTACAGTGAGCAAATTAGAAGAATAGGTTAGAAGAATAGGGTAGTAGATACTGTAGTTTCTTTCCTCCACCTCTACATAGCTGCAGGTCTTCTCTGTCTTAAATCAACAATAACAAAACAAGACAAAAACCTTTCCTTAACTTGGCCTCTTCCCTTGAACTATTTTTTCTCTCTCCTTCCTATAATTGTTATACTTCTTTAAAAAGTAATTGTTACTTTTTGACAAAAGTAAATATTGTCCCTTTTTTCCCTACTTTCAAGTCCTCTCTGTCTTGTGACATTCTGGCCTCCATACCTGCTTAAttttttttgagatggggtcttgctctgttgcccaggctggagtgcagtggcacaaacacagctcactgcaacctccacctcccaggatcaagcaatcctcccatctcaccctcccaagtagctgggactataggcacccgccaccatgcctaattttttgtatttttggtagtgacagggtttcaccatgttgtccaggctggtctcgaactcctgagctcaagcatctgtccgactcagcctaccacagtgttgggattacaggcgtgagccaccgcacccagccCCTACTTGAATTTTTATGTCATTATTGACTCTTCACCACTCTCTCCTTGAGACTCACTTATCCCTTTGCTCTCTATTTTTCCTGCTTTTGTTATTCTTCATTTTTCTTCTCTTGCTCTGAATCCCTTAAATGCTGAGGCTGCTCAAGTTTCATCCCTAGTCCTATTTTCTCATTCTATATGCACACTCATTTTTCATTTAACAGACTTCACTGGCTTCAGGCACCATTTGTTTTATTATTCATATTTTCAACCCCCATATCTCTCTAGTGCTGTAGACCTTTATTTCTACTTACTAGTTATATTCACCTAACATCCCATAGATATGCCAATGTCAATGTGCCTAAAACAAAATTGTCTCTACCTCCCGCTCCTTCAAATCTATTCTGTCTTCTCTAATCCTATAATTACTCTCCCTCAAGTCATCATCATCACTTTTCTGGGTTACTGTAATAGCCTTCAGGCTAATTTGCTCACTGTCAATCTTGCTGTCTCTCATTTCAGAATATGTTCTGCTTGCAGGTGACAGTAAACTAGTTAAACAAATATTTAATATTAGCTTAAGCAAAAAAAAAAAAAAAGGCCTATCCTATTTATagcctagaattaggcagtatagggttgggacagtggctcattggtgctatcaaggacgtagactttttctctttccactctgtcctctacagcatgctggtttgtcacctcatggtcacaagatgtctgctgtacctccagggagcagatacacattcaaagtaggaaatagcagataaaaatgtacacaagatgcgtctgactcccttttaccagaaaagtaaatgctttcttagaatctcctcagaagacctctgtgtatatctcaaccagtacttgtcatatagccacacacttagctcaaggaagatagggaaTAGGGAAATCATGTTTCTTTTCCCCTGTGGTGAGGAAGGCAAGGGGTAAGGGGTTGGGAACAGGTGCTGAATTAAAGCTAACATACAGTATCTACTACCCTATTCTTCTAACCCATTTGTCTATTATGATATAGTTGTCTTGACAACTATAATGAATAGCTGTCTTTCTGaaatctttagtggctcatcattgcctgcagaatcaaaactccttagtctgatatacaaggcccttcatatctgattccagcttaccttctaatcctatcttccctctccttacccaccctactgctaatgtgtattatattgtctttatgacataccatttgtttcttgaacatgctttgctcattattgcctctttctctgcctgtgctagtgtgtcctcttagaatgttcttccatcttatcctgctctacattctaacttctacccatcctacaagtccaattccagtgtcatgttccctttctcaatcctccagggtagaatttagatgttctGTCttttagagataggtattgctatgttgcccaggctggtctcaaactcatggcctcaagcgatcctcccacctcagccaaccagacatgagtgactgtgctcagccTTTTTTAAAAAAATGAAGGTATTTGGTATggccgggtatggtggctcacacctataatcccagcactttgggaggccaaggtgggtgaatcacctgaggtcaggagtttgagaccagcctgaccaacatagtgaaaccctgtctctactaaaaacacgcaaaaagtgcaaaattagctaggcgtggtggctcatgcctgtaattccagctacttgggaggctgaggcaggagaatcacttgaatccgggaggtggaggctgcagtgagccgagatcgtgccattgcacttcagcctgggcacaagaacaaaactcagtctcaaaaaataaataataaaaaataaaGGTATATAATATGTcttagatttgatgaaatatgagtgtgtttgagatctgatccaaggttttaaaaaattcatttcaaatcctggagataaattctgaggagcttacttatgaaaaactagcaagTGATAGCTGGTATTTACAGATATGGTACTTTACACAATTTATGTAATTAATATTTTCTCACAGACAAGGTTCCTTGTGGATATCACTGAATAATTTTTGTGTAGTTTCTATGCCCATGAAGTGCCTGGTAGGTAGTAGGAACTCACACGTTCTGCTATGCTGGTTGCAGCACAGGACACAAAAGTTAGAATTATTTCAAAGGACTTATACTCTACTAGGAAAGAGAGAAACATAGAAATATAGTGTTGTATGTGGTATCTTCCCTAAGATAAGTACAACCAAAGAGCTATGGATGTTCAGAGATAGAATGTAGTACTGGGATGATGTCAAGGAGGCAGTGGTACTTAAGCTGCTcaaggtagggaagcagtttacttgctagtttttcataagtaagctcttcagaatttatctccagtatttgaaatgaattttt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