Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name AK4
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr1) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name adenylate kinase 4
Also known as AK 4|AK3|AK3L1|AK3L2
Coordinate chr1:65147342-65232145
Strand +
Gene summary This gene encodes a member of the adenylate kinase family of enzymes. The encoded protein is localized to the mitochondrial matrix. Adenylate kinases regulate the adenine and guanine nucleotide compositions within a cell by catalyzing the reversible transfer of phosphate group among these nucleotides. Five isozymes of adenylate kinase have been identified in vertebrates. Expression of these isozymes is tissue-specific and developmentally regulated. A pseudogene for this gene has been located on chromosome 17. Three transcript variants encoding the same protein have been identified for this gene. Sequence alignment suggests that the gene defined by NM_013410, NM_203464, and NM_001005353 is located on chromosome 1. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from AK4

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
AK4P7 chr12:31613245-31616583 - Intergenic
N/A UCSC
AK4P1 chr17:31345315-31348726 + Intragenic
ENSG00000263535 UCSC
AK4P6 chr4:151027089-151027877 + Intergenic
ENSG00000235606 UCSC
AK4P2 chr5:55546932-55552660 - Intergenic
ENSG00000249410 UCSC
AK4P5 chr6:80077077-80078516 - Intergenic
ENSG00000217377 UCSC
AK4P4 chr9:5855784-5856378 - Intragenic
ENSG00000223621 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_013410.4
AGTCCGCCTGCTACTCGGTCCCGGCGCTGGGCTGAGGGGAGGGGTTGTCTTAAAAGTCTCTCCTTCCCCCTGTAGGGGCGGCCGGCGAGTCCCAGTGAGAGCGGAGGGTGCCAGAGGTAGGGGGCCGAGAAACAAAGTTCCCGGGGCTTCCTCCGGGGCCGCGGTCGGGGCTGCGCGTTTGACCGCCCCCCTCCTCGCGAAGGCAATGGCTTCCAAACTCCTGCGCGCGGTCATCCTCGGGCCGCCCGGCTCGGGCAAGGGCACCGTGTGCCAGAGGATCGCCCAGAACTTTGGTCTCCAGCATCTCTCCAGCGGCCACTTCTTGCGGGAGAACATCAAGGCCAGCACCGAAGTTGGTGAGATGGCAAAGCAGTATATAGAGAAAAGTCTTTTGGTTCCAGACCATGTGATCACACGCCTAATGATGTCCGAGTTGGAGAACAGGCGTGGCCAGCACTGGCTCCTTGATGGTTTTCCTAGGACATTAGGACAAGCCGAAGCCCTGGACAAAATCTGTGAAGTGGATCTAGTGATCAGTTTGAATATTCCATTTGAAACACTTAAAGATCGTCTCAGCCGCCGTTGGATTCACCCTCCTAGCGGAAGGGTATATAACCTGGACTTCAATCCACCTCATGTACATGGTATTGATGACGTCACTGGTGAACCGTTAGTCCAGCAGGAGGATGATAAACCCGAAGCAGTTGCTGCCAGGCTAAGACAGTACAAAGACGTGGCAAAGCCAGTCATTGAATTATACAAGAGCCGAGGAGTGCTCCACCAATTTTCCGGAACGGAGACGAACAAAATCTGGCCCTACGTTTACACACTTTTCTCAAACAAGATCACACCTATTCAGTCCAAAGAAGCATATTGACCCTGCCCAATGGAAGAACCAGGAAGATGTGGTCATTCATTCAATAGTGTGTGTAGTATTGGTGCTGTGTCCAAATTAGAAGCTAGCTGAGGTAGCTTGCAGCATCTTTTCTAGTTGAAATGGTGAACTGATAGGAAAACAAATGAGTAGAAAGAGTTCATGAAGAGGCCCTCCTCTGCCTTTCAAAAGGCTGGTCACCTACACATGTTTAAGGTGTCTCTGCACATGTCTCAAGCCCATCACAAGAAAGCAAGTACAGTGTGGATTTCAAATGGTGTGTAACTTCAGCTCCAGCTGGTTTTTGACAGCTGTTGCTGTGGTAATATTTTTGACATGTGATGGTGATAGTCTCTGGTTCTCCCCATCCCCACAAAGGCTGTTGAACCACAGCACCAGGAAGCCTGAGAATGAATCCTGAGGGCTCTAGCCCAGGCTTTGTCCCAGGCTTTCTGGTGTGTGCCCTCCTGGTAACAGTGAAATTGAAGCTACTTACTCATAGTGGTTGTTTCTCTGGTCTTGAGTGACTGTGTCCACAGTTCATTTTTTTCCGGTAGGAATAACTCCTTTTCTACATCCACGCTCCATAGAGTCTCTCCTTTTCAGACATCCTGGGATGAAAGAATTTGGCttttttttttctttttttttttGGACATCTGTTTTCACTCTTAGGCTTTTAAACAATAGTTATTGCTTTTATCCCTCTCAGATTCTAATAACTGAGAGCGATGGGGCTATATTGAATCTCTGTATGCACTGAGAACTGAGCTATGAAGAGGATCTTATTAAACTGCTGGTCTGACTTTATGGATTGACACTGTTCCTTTCTTTTATTGTGAAAAAAAAAAAAAACCCTGAAAGTCTTGGGAACCCCCTAAAGTCTTTTGGGAATCCTCAAAAAGCATGGGAAGTTAAGTATTTAGCTACATAAATGTTGTAAGATCATATCTTATGTATAGAAGTAATAAGACCATTTGGAATTACTGGACTAATTGAATAGTTAAGGTTTCTATTCGGGACAATAAAATGTATTTTGAAAGTGCTGCTAACTATTGATGCTGACAGTGTTTCACTCCTATGAGTGACCCAAACATATTATAAATATGTGGTAAAGGGAATGGAGCCTGTGGGGTTGAGCAGAATGTTGTACTAGCTGTGCCTGGACTGAGTATAACAGCTTTATGATTATGAGAAAACAAATTCTTTATTTTTTTTTTCTGTTCCAAAGATTCATCCTATGGGGTGGCCATAAAGTCTAGAATTAGATACTAATATTTTGTCATTCATTATAACATATCAATAAACCATTTGTTAAAAGATTTGCCTGGTTTCCAGACTTGGTGGCCACCTTGAATAATTCTTGCTGTCTTCTGGGAAGGATGATGAAATTTATTCCTGCTGCCTTAAAAATATGTATCCCTTCTTCACCCATCATGACTGTCCCCAGTGAGTGTCCTTTACTATTCTTGGGAGTGACTCCTGTCTAACTTTTCATACTGGCGAGAAGAAAAGAAGCCTATTTTAACACTTTAGTGGTGTTGAAACACATTACTTACTTTCTGAAGATGTCCCAGTGAATCCTCTGTCAATTCACTGCCATATGTAATCTATATGATAAGGAATGCATCTTCCTTCTAAGTACTGCCCAAACTCTTGCCAGCTCCTCTCCCATTGTCCCTTCATGTGAATATTTCTTGGCTACCTTAGTGGAAATATAGATCAGTTTTCTCCCCATCCATCCTCTCAAACATAATGAGATTGTTTACTTTTTAGATTTATGCAGTGAAAATGCCCAGTCAGGTCTGAATCGTCAGTGCATTATATTGACTCTGAGCACTTTAGAATTTAGAGTTGCAATTGAATGCCAGCTGTGGAGATGGGGTGCATATCAGATATATAAATAAAGCTCAGGTTTGCTAGGGAACCAGGTATAGAGAAAAATAAGTCTGATATGAGGAAAATTGCACAATTTAGAGTAGTTATGCCGTAGAGAAAATTTCCACAAACTAGGAAATGTAGAGAGTTATTCTATAGAATACTCAAAAGAGGAAAGTATGTGATTTTTGGAAACAGGAAAATCTTCAAACTTCTTTCTTCACTTCCCTTTGTGTTTAGCTGACCCTCCAATGTGATCATTGCCTTTGGAGTTTGGGAGAGGTACGGGAAGTGGCCTGAtccctgcttccatacttcactcctccatccatccttccctccctcttcccctccAGCTAAATGGACAATTCTAGCCAACATTGAGTCACTCAATAAGTCTCAACAGTGGGTGTGTTTGCTGAGATTGTCCAGCGGTTGAGCAGTTTGGTCTCACCTCCCTCGCTAGTTGAGACCAAAAAGAGACAAATAACTTTTTCATGGTCTTTGAAACATAATGCTTATTTCGTGGTCAATGGCTTTAAAAAAATCTGTTTCTTGTTTTCTTCAACAAACTCACTAGTTTTCCCTTAAATGATATTGTAAAAATTAAAGTAATCTTGAAAATGTTTTGACAAAAGTAAAATTAAAGGGACATCttttcttgttttgttttttttttttCTATTGCCACACATGACCgttccttcacctttaagcaaagagagtggttcagatggtttctaagatgccaacctgacctcgcattctgtcattctaCCCAGCTCTTAATTCAATTTGCTTCCATTATCCTAACAGGCTTCTTTCTTACTTAGAACTTGGAAAGGCTGCTGTATTTAATACCCTCCAACACTAACGCAGACTtaagataggtactgtttattgaaaacctactgagtgaaatgtgcggttttaggaccttcataaacatctcatttaatctttctagcatcctgtgaaacagccatgatttcacgttgataaacaaagaagacaggggtcccagggatgtgaagcatcttgcccaggcttctgctgctggtgaccagtgtagccaggactccagcccaggttttcctgactcagaagactgagctttttccTGGATGTTATTAATAGCTAATTGTGTCCAAGCAACCAAGGGCCTTGAGTCTGCTTGGTTCTGCTTATGGCCTCACATCAAGAAATGGAGCTAGTCcatgtctgtagtcccaatgctttgggaagccatgatgggaaggttgtcggaggccaaaagttcaagaccaggctgggcaatatcacaagactccatctctacggaaaagtaaaaaattagccagtcatggtggtgtacacttatggtcctagttactcaggagacttaggcaggaggattgcttgatcctaggaattcgaggctgcagtgagctatgattgcacctctgcacccaagcctgggcgacacagcgagaccctctctcttaaaaaaaaaaaaTAGCAGAGCTCACCAAAGTGATGTTCACCTTTTTATGACATTCCTTTTTCTTAGCTTAAGAAAAGAAAGCTGCTAGATGAGAGTCTTAGTTTTCCTGCATAAGACCTCCTTTATGAATAGAATAAAAGACTGTCAAAGTAGGCTGGGCTTGGGCCCAGGCTAATCTATGAAGGAAGCAAGCTCGTGTTCCTTACCTATCCTTTTGGTGTCCATTGGATTGTGCCCCGAAGTGGCCTTTACCCTTGAGCCGTCCCCAGCCATGGTGCTCACACATAGGCTTTTGAGCTCCTTGGAGCTATCCAGATCCTGCTCACTTTTCCTTCCTGAGATCAGAACAAATCACCCCCTTACTCCCACTCCAAACAAGGCCTTGATGATAAACTAATCCTTCCTAAAATGCTGGTAGGTAAACAAGCAATGATGAAGCATTGAACACAGGTTAACTCCTGACTTTTGTACCATTGTCTATTCCATTACACATTAACATGACTCTGAATGCCAGATCCAAACCTTTGCCCACCATCTGCTTGTCGTGCAACAGTTGAGGCAGTAACCAGGGGAGATTCACTTCCTGTCTTGTCCTTCCCCAGGGATCACCCCCCTGCTGCCCTCTAGCAGCCAAACTCAGATGAGTTCCATTGTTACCCTAGGTGTGCCCATCTCTTTGGTAGGGAAGGAGAAAGGTAAGAATAGCCATCAGTGAGGAAGGATTCTTGGAGCGAGGAGCCACTGTGGTTTTTCCTGCTATTTAAG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>NM_203464.3
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