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Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name ARL5A
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr2) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name ADP ribosylation factor like GTPase 5A
Also known as ARFLP5|ARL5
Coordinate chr2:151798797-151828421
Strand -
Gene summary The protein encoded by this gene belongs to the ARF family of GTP-binding proteins. With its distinctive nuclear/nucleolar localization and interaction with HP1alpha, the protein is developmentally regulated and may play a role(s) in nuclear dynamics and/or signaling cascades during embryonic development. Alternative splicing results in multiple transcript variants encoding different isoforms. This gene has multiple pseudogenes. [provided by RefSeq, Jul 2008]

Retrocopy(s) from ARL5A

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
ARL5AP2 chr10:99011778-99014127 - Intragenic
 ENSG00000236818 UCSC
ARL5AP4 chr22:24685904-24693136 + Intergenic
 ENSG00000224806 UCSC
ARL5AP1 chrX:119184557-119186862 - Intergenic
 ENSG00000227864 UCSC
ARL5AP7 chrX:146537515-146537917 + Intergenic
 ENSG00000234748 UCSC
ARL5AP5 chrX:76029562-76031929 + Intergenic
 ENSG00000232332 UCSC
ARL5AP3 chr1:68049415-68049745 - Intragenic
 ENSG00000228431 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_012097.4
GCAGACAACgcggcggcgatgtccgcgagccaggcgagtgccgcggcggcagcggcggggccttgcgcgcggcagggcggcCTGGGCTTCGGCCTCCCTCCGGTTCCCTGGAAGCGGGCCCGCGACCAGCGCGGGAGCAGCAGCAGAGGCGGAGGCTCCAGCGCGTCTCTCTCCTCCCCCTCAGCCTGAGCCGGGGGAAGCCAGGCGGCCCGGGTGTCTGGAGGGGGGGGGTCCGCTGCCCGAGAATGGGAATTCTCTTCACTAGAATATGGAGACTGTTCAATCACCAGGAGCACAAAGTTATCATTGTTGGGCTGGATAATGCAGGGAAAACTACCATTCTTTACCAATTTTCTATGAATGAAGTTGTACATACATCTCCTACAATAGGAAGTAATGTAGAAGAGATAGTGATTAATAATACACGTTTCCTAATGTGGGATATTGGTGGCCAAGAATCTCTTCGTTCTTCCTGGAACACTTACTATACTAACACAGAGTTTGTAATAGTTGTTGTGGACAGTACAGACAGAGAGAGGATTTCTGTAACTAGAGAAGAACTCTATAAAATGTTAGCGCATGAGGACCTAAGAAAAGCTGGATTGCTGATTTTTGCTAATAAACAAGATGTTAAAGAATGCATGACTGTAGCAGAAATCTCCCAGTTTTTGAAGCTAACTTCTATTAAAGATCACCAGTGGCATATCCAGGCATGCTGTGCTCTAACTGGCGAGGGATTGTGCCAAGGACTTGAATGGATGATGTCACGACTTAAGATTAGATGATCTCTACTGACCTCTTCTCATAGATTTTGTATAAATGAAGTGCTGGACTTTACCTGAAAGCTGCAAAAATTAATGGTTTAGATATATTTATAATAAACTGATTTAAACTTTTTCTATAAGAAGAAAAATTAAGACCACTTATTTGAAAACAAAGATGAAGTCTCACCTTCCAGTTTGCTTTCTCATTAGTTTTTTCCAAAGTAAGTTATTGAAGCTGTGATTGACATTTTTCTCATAATGAATCCTCTCAGGACATTGTGTAGCCTATGGTAAGTACAAAGGGAGAGGAAGACATTTTGAATTTTAAGAGCTTTATTATCAGTTTAACCCTCCCTAGTTGAATGTTATTTTCTTCTTGTTCCATTAAGTCAGAATACAAATCAGCACAGATATTCGAATGTTTCCAATATTTTAAAATGTAATGTTACTTATGAAAAGTATTTTGCTTAAGGTTGTGTGTGTATTGTGTATATACCTCAAGTTCAAGTTAATGGCATTGATTTATGTTCCAGACAAAAATAACACAAATAATAATATCCTTCGTTATAACCACAATGAGATAAGTATTGGCATTAGTGTTCAGTGCCATTTTATACTTTCTCTCTGTGTTCTCTGTATTGTACTAACCAACCTCCCAAATCGCTGAGCTGCTTGTTTaaaaaaaaaaaaaaggaaaaggaaaaaGCATGACATTGTGTATCGATTTTTTGTTGTTGACCAAAATCACACACATGGAAACATGTAATTCAACAGAGTGGGAAAGCTAGCAGATTCTTGGCTTAGTATTACTAATAGGCAGGATTGTACAATGAGCAACTATCAGATTATTCCTTTCAGTGGTTCTTATGGCATCTAAATTACTGAATAAATTATTAATCCATTAATCAGTGAATCAAATTATGATTACAATTATCAAATGAATGCTCAGCATTAATTGAAAACTGTTTTGTGAAACATGTCTACCCAGAAAAGTAGCATTCTATAAATACTATTAAACAACTTAGCTATATTATTTTTAAGTATTAAATTATATGTCAAGCAGTTAAAGTGAATTTCAGAGTAAAAGTAAGGCATGTTTCTGAGCAACATTGATAATTTCTTAATTTGCAAATTTCTTCTTATTTTGGTACTTGGAATATAGTGTGAGATTTTTTATTTCTAAATTTTGTTGTATCTTCTATTACATAAATGCATTGACAATTATAAAATGCAAGTGTTTTTTGAATGATTTTAAGAATTTGGCTTAAAAATTGATTGATACAACGTATTATTTGTACTAAGAAGTAACTTGACCCAAAACACCTTTTATGTTTGCTTAGGGTATATTTTTTCAGTGTCTGAAAGTCAAAGGTATTCCTGTCACAACTGTAAACAAACTTATCCTAAATGTGTTAAAACATATTCTTGGGTACTCTATTTATGTATCTTTCATGCCTTGAAAATCTGAAGGTTAATCCAAACTCACATGTTTTAGCATATTTGAGAAAAAAAAACTACCTTCAATATCAGCCTTTTAAATTTCATGAAGATTTTGGTGAGGAATAATAGTATATAGTTTAAGTATTGACAAAACTTTGAAAGTTTCTTTCTTTAAAATGGGAAATACTCAATATCTAAATCCAGGTCAGGCATGGGATATCAGtatttaacattggatgttttatgttttatatttataatgttcaaaatgcaagcataacatttaatatttGTCCACATGGTTTTACAAAAGTAAATCTTAAATTACTAAGCTTTTCCCATATGTTCTCGTACTTTCTCAAATCCCTATAAAGAATTACTTGTTATCTATTAAAAATCTCCTTTACCCAAATCTGTATTATGGTTTCGCCAGACAAATATTATGTGATGTAGCCCAGAAAATCCACACCTTTTGTCCTTTTTATGTTTTAATTTGAATAATCATGTGCTTAGTCCCTTGGATTACTGCCACATCAGTTTAACACGATATCAGCACATTCCCTTGTCATCATCAAGGTGTTGGCTCAGATTTATTCTTAATTGGATGTTTAAAGCATGTACTACCTTGTTACAGTTGGTTTAGTGTAGTGGATTATTGACATGACATCATGAGAAGATGTGTAATTTTATACCACATTTATAAAACATGATTTTGTTTTCTACCCTTCAAGGTAAACATTAAAAATAAGGTGGTACTTGTGTACTTGTACATAAAACCAAAATTATAGTTGGGAAAAAAATAAATTTATATATGAAAATGTCAAAATCATTTTAAAAGTATTATTTTCAAATAAAATGGAGAAGCTGGTGAAAAGTCATATTGGCAATTTTTATGTAGTTTAAGTGGAATTAAGCAGAGGGAGatgcttttgggtttttaatatgccacttctgagtgaaaacatctcgtggagtcattgtgttcagctctgagaagaACAAAGATTCATAGTTCTGTACATGTGGCTGGATTTAAATATCCTGTTTTTGATACTAATTTTGAAAGTCATGTAACTTCTTTTGATATCTGGGCAAAAGTAACCATATGCTATAAGCATTTGAATATGTTTAATTTTATCATAATAGCATCTGTAAAAGTACATCTTACACATTATATAGAGGGTTCTTGTTTGAAATTTTCAGTTCTCTTTATCTTCCCAGTACCTCTTGGTCCTCATAATGGGCAAAGGATACAACGAAGGCAGGTTGTATAGGGGTTATAGTGGGGAAGTGGATAGGGGATTCATTTTCTTATGTGACATTTTGCCTTAAGAATATAAAAGTGCTTTAGCACTGATGGCTGGCATTTTTAATATAGGCAGTGAAAGTGACTTTAGAAGCATGGGATGAAATAGAGGGAAGAAGAGTTTTTATTTTCTGGCCTTTAAAAAGTGCCTAGTAGGTCATTTGAGACCCAGAGAAATGCACAGAGCTTGAGCAAAGGCATGAAGTCCCTGACATTGTTTTCCTTTTTGTCTCAGCATATAGTATTAAGATGCCTAGAAATAGGACTCTATTGTTCCCTCTTGTATAGGCACTTTACATTTCTTGTCACTACAGCAACCACATACAGTACAGACAACCTCCAAACCTGTTTATATTAGTGTAAATAGAAAATCTATAGACAACTTTCTAGTTTTCTCTGGAGGCATTTTTGGGAATGTACGTGTAATAGGCTCTGCTTTGTATACAGGAGATAATACCACATCATCGGTTATCTCCAAACTCCAGTCTTCTCTCAACTGCCCAGTTGTATGTTGTCATCAATCACTTTTTCAAGGCTGGGTAGAGACAAGTTTCTCCTCGTAACTTTGACCTCTCCCACTCTCCAAATGTAATCTGGACCTCATTGCTTTCAAGGTCAGCTTCCCCATAGCTCAGGTATCCTTTGCTCTCCTGTATCTTCATTTACTATTAGTGAAGAGATCTCTGTCCTGGAGGTTATTCTAAACTTTCTTTGTAACTATTGTTATAGACAATGGTTTCCAAACCAGTGGTTTCTATGTAGCTTTTCTAGTTCCTTGCTATCTTCTCACCACTGGCTTGAGGTAGTGATTTGGACTTTGCTCATTAGAGAGCATTATCAGAGATGTGGAGTCCATCAGAAGACCAGCTTGCAGTGTGTATAGCATATAGATGCCAATATTAGAATTCTTTAAATTATATTTAACATTTTCATGCTTCTTAATTTAACTTCACATGTTGGGAAGTAGATTCAGAAAGATAGGAGAAATACCCAGACTCTACCACTTCCGTGAGCTACTAGTTAGGCATGGGCAGGATTAAGTTTTATGTGTATTATCTTCCCACTACCAAGAATGGTTATGTTTCACAGAATACCAGTTCAGTTTGATTTGGAAAAAGATGCCAAACCAAATTTATATGTAGTCTATAATCTAAGGGCATTCTTGAAACTATTGCCCACATCCCATTTTTTTTTTCATGTTTACTTACAAAACAGAGATAAACATTAGATGTCTAAAGGAGTTAGTAATGAAAAGCCTATCCTTAAAAAATAAACCTGTTGAAATGGGCTTTAAAGACATCGAAATAATCACTTGTCATGCATTGACTGTAAATGCAGATAGAGAAATATGTCTTTGAAGCTCCACTTACACAAAAATAAAACTTGTATATCATGCTCCCTCAAAGAATGTGCGATAGATTATTTTAAGACCATGATAATAGAGTAAAAAGGAAAGAAAGCCAGAAATTACAATTTTGGATGCTAAAAAG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>NM_177985.3
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