Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name GYG1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name glycogenin 1
Also known as GSD15|GYG
Coordinate chr3:148991515-149031775
Strand +
Gene summary This gene encodes a member of the glycogenin family. Glycogenin is a glycosyltransferase that catalyzes the formation of a short glucose polymer from uridine diphosphate glucose in an autoglucosylation reaction. This reaction is followed by elongation and branching of the polymer, catalyzed by glycogen synthase and branching enzyme, to form glycogen. This gene is expressed in muscle and other tissues. Mutations in this gene result in glycogen storage disease XV. This gene has pseudogenes on chromosomes 1, 8 and 13 respectively. Alternatively spliced transcript variants encoding different isoforms have been identified.[provided by RefSeq, Sep 2010]

Retrocopy(s) from GYG1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
GYG1P2 chr13:82823070-82824740 + Intergenic
ENSG00000237099 UCSC
GYG1P3 chr1:55222284-55224072 + Intergenic
ENSG00000231095 UCSC
GYG1P1 chr8:73904664-73905857 - Intergenic
ENSG00000251633 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001184720.2
TCCCCGCCGTGCCTCCTCGCTGGCCGCGCTCCCTCCCGGTGCCGGCTTCTCTGAGTCACCAACCTGAGGCTGCCCCGGCCGCCTGCGCACCCGGCAGCACCATGACAGATCAGGCCTTTGTGACACTAACCACAAACGATGCCTACGCCAAAGGTGCCCTGGTCCTGGGATCATCTCTGAAACAGCACAGGACCACCAGGAGGCTGGTCGTGCTCGCCACCCCTCAGGTCTCAGACTCCATGAGAAAAGTTTTAGAGACAGTCTTTGATGAAGTCATCATGGTAGATGTCTTGGACAGTGGCGATTCTGCTCATCTAACCTTAATGAAGAGGCCAGAGTTGGGTGTCACGCTGACAAAGCTCCACTGCTGGTCGCTTACACAGTATTCAAAATGTGTATTCATGGATGCAGATACTCTGGTCCTAGCAAATATTGATGATCTTTTTGACAGAGAAGAATTGTCAGCAGCACCAGACCCAGGGTGGCCTGACTGCTTCAATTCCGGAGTCTTCGTTTATCAGCCTTCAGTTGAAACATACAATCAGCTGTTGCATCTTGCTTCTGAGCAAGGTAGTTTTGATGGTGGGGACCAAGGCATACTGAACACATTTTTTAGCAGCTGGGCAACAACAGATATCAGAAAACACCTGCCGTTTATTTATAACCTAAGCAGCATCTCTATATACTCCTACCTCCCGGCATTTAAAGTGTTTGGTGCAAGTGCCAAAGTTGTGCATTTCCTGGGACGAGTCAAACCATGGAATTATACTTATGATCCCAAAACAAAAAGTGTCAAAAGTGAGGCCCATGATCCCAACATGACTCATCCAGAGTTTCTCATCCTGTGGTGGAACATCTTTACCACCAACGTTTTACCTCTGCTTCAACAATTTGGCCTTGTCAAAGACACCTGCTCATATGTAAATGTGGAAGATGTCTCAGGAGCCATATCACATCTGTCCCTTGGGGAGATCCCAGCTATGGCACAGCCGTTTGTATCCTCGGAAGAACGGAAGGAACGATGGGAACAGGGCCAGGCTGATTATATGGGAGCAGATTCCTTTGACAACATCAAGAGGAAACTTGACACTTACCTCCAGTAGAAACACTGCATTTTTCTGTGAACACATCCACTTCACAAGCCTTGTTTCTGATACTTAGTATCTAGAGCTGGGTTGAGAAAAGTCTGTTACAGTTGCTAGAGGTTTTCATTAAAACTTATCAGATGAGAGGCTTTTTTAGGATAAGAGGTGAGAACTGGGCAAAAGTTGTGAAGCAGCAATTCTGTTATATGGACAGTGTTCTGCTTTTTAATCCTATTTAGCTTGTTTCAGAAATTCTCACTTTTGTTGACTGCCAACATACAAAGTAAGGGAAACTCAAGATATTAAGATGGCTGTATCAGTTCTTAAAATCTGCAGAGCCTGGTTCAAAATCAGTCACTCCCTTCAGAAGCAGACATGGCATCTGTTCCTTGCTTGCTTGTTGGTTGTGTACCTTTCACGAGACCTGAATTTTAGAATTGCCCAGTGCTGCCAGAGTGAGTGAGTGTAATTCTCCTTTCAGGTAAAGATAGGCTATCTCAACACTGCTGAGTGATTCATAAACATATCAACCAATAGCATTAACCCATTTTATTTCCTGTCCTTAGTGTCTGAAGATGCTCACCAGTTTTCTGTGTACAGTAAGGCAGCATGCTAAAATGCTTTTGTTCAGTTCTGTATATTTGAAAATAGCAGTGTGTTCTCTGATGGTTACCTGCAGTGGCACCCTGTACAAAAAATAAAAGACTTATTGCTGTATCTTGGTTGTTTAATTAAATTAAGGAATTTCACCATACACCCTTGAACAAATCTATTAGGGAATTTTTCACAATTTTTGGAATTTGTCATAGTTTTAAAAAAGTGTAAAGCTTGACATTGGGATATATGCTTTAAAAACTGGTATCTATGATTTCAATCTAATTGTTTTTCTGTGATGGTGATGGATCTGACAGATCAGAACAAACCGAGATCAAACTTACATAGTGTCATCCACACTGCACCTCTCTATTAAGTGGGTATTTAGCTATTTAGAATATTTTAACCTTAAAGTCATTCCTAACTGTCAGAATCAATActgggtccagtccctactagtattttatctatgatttaaaatgatagaatggaaaagcgtatttattaaatttatagatcattctaggttgtaagagatggcaagctaaagaagggtaggatccaagatgaccttttaaaactaaaatgagtggtcagaaaTGATTCTATGGAAGAAAACAGGACAGTTAACCATGACAGGAAGAAACTTTAGAGGTTTGATTGggcaaaagctgcaaagcttttgtgacttagccttcaaagtcacCCTCCTTATTCATATTGATGTGAATTAATATACAAGCATATAGACAGCTTAAGTCAAGAATGGTTGGGGCCACCTTGAAGGCTGTTACCATAGGAGCTCAATAAGAACCTGAGGATTTACCTAGAATTATAAAATATTAAATGATAAATGACTTCTGAAACTAGCTATTTGGACTGGTGAAGAATGAGTCGCTATTGATCTTCAAGTACAATGAAGcatttaccaaagatttatttaagtgcctccatgtgtcagatgctgtggtacaaagaAGGACTTCTCAAAATTTTAGCTAGTCAGAGGTCTTTCTGGCTTCCGAGTCCCTGGTTAAGATGAACAGAAACACAGTCTTCAGATATAAAATGTCTTATTTTTGTGGCCATTCAGTTGCATTCAACGTTAATTTTTTCTATTTACTACCGTTCATTCTCTATTTTTTACACAGTAGCATAACAAAGCTCTAAGGTGGAAAAGCTGACATAGTTTTAAAtttttttttttttttttttttttcttgaggcagagtcttgctctgtcagtcagtcaccaggctggagtgcagtggtgcagtctcggctcactgcaacctctgcctcctggattcaagagattctcctacctcagcctcctgagtagctgggactacaggcacgcaccaccacgcccagctaaattttgtatttttagtagagacaggtttcaccatgttgccaggatggtctcaatctcttgacctcgtgatccaccggccttggcctcccaaagtgctgggattacaggcgtgagccactgcacccagcAAATTTTTAAATTTCAAATAAGTAGTGAAGGCTATTATTAACTTTTGGAATCAGAAAGAATGACAAGCTTACCATAAGACATAGCATATAATGCTGTCAAGTTATTTGGCTAGAAAATCACTGAACTAAACATTCTTTTCCTTCTATGATCTATGTCTTAAGGTGAAGTATTAACTAACTTTTCCATGTAAAGCTATACAAATATTGGAAAATCTTTTCTAGGGAGTCCAGAATACTAAGGGTTACTTAGTAAAATGTATAAAAAGGCAACAGTAATTCAAATTACAAGATTTATATTTGCAGAGGTGATCCATATATACTTATCCCCTTGCAGTGGCTGGTATGACCTTTGGTTgtaagacaaacttgcccacaacagaggtcaaatccatgcctttggagattagctccatgGTGGATGGAGCTATGGTTTATGCATAAAGTAAATGTTTGTTTACCTTAATTCTCCTTATACCCATATTGTCCTGCTGTATAACACATTTTGCAGATATTTTGAAGTTAATGTGTTAAAAACTTGAGGTTAAACATTTGAGTTTTTGTTAAGAGCCAAACATCAAATGTGCCCTTATATTTTTAATGAATCTCATCCAAATGCTAATGCATAAACCTTGACAAGTAGTATAAATAAAACAAGAAAAAAATACAGCAATGTCTTTGCCATTCCCCAAAACAAAGCACACACTGCCGAAGATCATTAGTACTCACTGGTAACAAACTACATAGGGTTAGTTTGTATTTCCAATTCTAGAGCTGTAATTTTAAGGACAAAATGTACAATGATTGATTAAGAGTGCTATCTGTGTATATATAGGTATTATCACAACTCCTTTTTTTCTTCCAGATGAAGAAATTAATTGGGACCAATGTTTTTAGATCAAGGCATTTTAAATAAGCACTCTTGATTTCTGAACAAGAATTTCAACCAGCTAAATTGAGCAAAATAAAGTTAGTTAGGATATGAGGACATTATTCTGTTACAGTAATCTTCATGTACTCTCAAAAAAATGTAACACTTGCATAGAAATGTCACAATTAATGAAGGATTTTATTTGAAGATAAAGTCAAAATTATGGCACCGAGGAAGGTAATAAACATTTGAAATTTTTATTGATTTTTAAATTTAAAATCCAGTTTTAACCACAAAATTGTTTGAATCACAAGTGGTAATACAATGTCTTCAATATTTTTCTAAAGTTATTTTTCTATATAATAATAAGACAACAGCATAGCATATAGGAAGTTTTCATTCCAGTGGCTTTTTTATATATTTATCCTTCTTAGGAAGGACAAATTAAATTTTTTAAATTAAACTTTTAAAATATAACAACATCTAACAGAACTGTACAAAACAAAGAGACATTTTTTAAACAACTTGCCAAACTTACTTATGAGTGTGTTTTAAAAACAACTTTGTAAATGTCTGGGCAAAGAAGCAAGCTGTCCTCCCTTTACCTTCATAGTGAGTTTGTAAGGCTTTGTCTTTGTAAGCAGAAAGAGTAGACTGTGTTGTTTTTTGCCAAAAACTGTTTATACTTAATCTCACTGAAGTATTGCTATATGGAGAACCCATACTCTGATCAACTTGATTTTTTGTGTGTAATGCTTGATCTACCAGGTAACTTCCCAACTGCTCCTAATGCTAGCGGGCTAATCCCACATTATTATTCCACTATCATCCCTGCAGAAAGGTCTTGGTTTTGATGAAAATCAGCCCTTTCCTTACCTGCTACTGCCTCAAAAAGGGACCAGGAAGATTCTAGCTGGCTAATTCACTGTTCCCTTTGAGCAAGAAAA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