Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name HNRNPH1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name heterogeneous nuclear ribonucleoprotein H1
Also known as HNRPH|HNRPH1|NEDCDS|hnRNPH
Coordinate chr5:179614178-179634784
Strand -
Gene summary This gene encodes a member of a subfamily of ubiquitously expressed heterogeneous nuclear ribonucleoproteins (hnRNPs). The hnRNPs are RNA binding proteins that complex with heterogeneous nuclear RNA. These proteins are associated with pre-mRNAs in the nucleus and appear to influence pre-mRNA processing and other aspects of mRNA metabolism and transport. While all of the hnRNPs are present in the nucleus, some may shuttle between the nucleus and the cytoplasm. The hnRNP proteins have distinct nucleic acid binding properties. The protein encoded by this gene has three repeats of quasi-RRM domains that bind to RNA and is very similar to the family member HNRPF. This gene may be associated with hereditary lymphedema type I. Alternatively spliced transcript variants have been described [provided by RefSeq, Mar 2012]

Retrocopy(s) from HNRNPH1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
HNRNPH1P7 chrX:101411988-101413341 + Intergenic
N/A UCSC
HNRNPH1P6 chr10:70351632-70352410 + Intragenic
N/A UCSC
HNRNPH1P5 chr10:43386787-43387035 - Intergenic
N/A UCSC
HNRNPH1P4 chr2:225992856-225993084 - Intergenic
ENSG00000230621 UCSC
HNRNPH1P2 chrX:143676394-143678371 - Intergenic
ENSG00000213924 UCSC
HNRNPH1P3 chr5:55837982-55840064 - Intergenic
ENSG00000248854 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001364231.2_2
CATTTCGTCTTAGCCACGCAGAAGTCGCGTGTCTAGTTTGTTTCGACGCCGGACCGCGTAAGAGACGATGATGTTGGGCACGGAAGGTGGAGAGGGATTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCTTGCTCGGCCGATGAAGTGCAGAGGTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCCTGAAAAAAGACAGAGAAACTATGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACGGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTTCCCTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTATATTGAAATCTTTAAGAGCAGTAGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGATCCACCACGAAAGCTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCTTATGACAGACCTGGGGCTGGTAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGCTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGGCTATGGAGGCTATGATGATTACAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGGTCAGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCACAGATACGGGGATGGTGGCTCTACTTTCCAGAGCACAACAGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCTTACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATTTTTTTTCACCGCTCAACCCTGTGAGAGTACACATTGAAATTGGTCCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTCGAGTTCGCAACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGTCAAAAGACAAAGCAAATATGCAACACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGAACACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGCATGGGCTTGTGTAAATATCCAAACCAGTCCAGCTACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGGGGTTACGGAGGCGGCTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGTGGATACGACCAAGTTTTACAGGAAAACTCCAGTGATTTTCAATCAAACATTGCATAGGTAACCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAGTGGAAGCCGTGCATCTATGGGCGTGAACGGAATGGGAGGGTTGTCTAGCATGTCCAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATCGATCCTGATCACTGACTCTTGGTCAACCttttttttttttttttttttttctttAAGAAAACTTCAGTTTAACAGTTTCTGCAATACAAGCTTGTGATTTATGCTTACTCTAAGTGGAAATCAGGATTGTTATGAAGACTTAAGGCCCAGTATTTTTGAATACAATACTCATCTAGGATGTAACAGTGAAGCTGAGTAAACTATAACTGTTAAACTTAAGTTCCAGCTTTTCTCAAGTTAGTTATAGGATGTACTTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTAAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCCCTTTGCCACGTTAAATTGAACACTGTTTTGGATGCATGTTGAAAGACATGCTTTTATTTTTTTGTAAAACAATATAGGAGCTGTGTCTACTATTAAAAGTGAAACATTTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGTTTCATTTAATAACCTGTAAGGCACGTAAGTTTAAGCTTTTTTTTTTTTTAAGTTAATGGGAAAAATTTGAGACGCAATACCAATACTTAGGATTTTGGTCTTGGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAATCTTTCATTGTATTGTGATTTCCTTTTAGGTATATTGCGCTAAGTGAAACTTGTCAAATAAATCCTCCTTTTAAAAACtgca
>NM_001364236.2_2
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>NM_001364240.2_2
CATTTCGTCTTAGCCACGCAGAAGTCGCGTGTCTAGTTTGTTTCGACGCCGGACCGCGTAAGAGACGATGATGTTGGGCACGGAAGGTGGAGAGGGATTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCTTGCTCGGCCGATGAAGTGCAGAGGTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCCTGAAAAAAGACAGAGAAACTATGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACGGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTTCCCTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTATATTGAAATCTTTAAGAGCAGTAGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGATCCACCACGAAAGCTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCTTATGACAGACCTGGGGCTGGTAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGCTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGGCTATGGAGGCTATGATGATTACAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGGTCAGATAGATTTGGAAGAGGAATGTCTGATCACAGATACGGGGATGGTGGCTCTACTTTCCAGAGCACAACAGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCTTACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATTTTTTTTCACCGCTCAACCCTGTGAGAGTACACATTGAAATTGGTCCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTCGAGTTCGCAACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGTCAAAAGACAAAGCAAATATGCAACACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTACGGTAGCCAAATGCTAGGAGGCATGGGTTTGTCAAACCAGTCCAGCTACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGGGGTTACGGAGGCGGCTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGTGGATACGGTAACCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAGTGGAAGCCGTGCATCTATGGGCGTGAACGGAATGGGAGGGTTGTCTAGCATGTCCAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATCGATCCTGATCACTGACTCTTGGTCAACCttttttttttttttttttttttctttAAGAAAACTTCAGTTTAACAGTTTCTGCAATACAAGCTTGTGATTTATGCTTACTCTAAGTGGAAATCAGGATTGTTATGAAGACTTAAGGCCCAGTATTTTTGAATACAATACTCATCTAGGATGTAACAGTGAAGCTGAGTAAACTATAACTGTTAAACTTAAGTTCCAGCTTTTCTCAAGTTAGTTATAGGATGTACTTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTAAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCCCTTTGCCACGTTAAATTGAACACTGTTTTGGATGCATGTTGAAAGACATGCTTTTATTTTTTTGTAAAACAATATAGGAGCTGTGTCTACTATTAAAAGTGAAACATTTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGTTTCATTTAATAACCTGTAAGGCACGTAAGTTTAAGCTTTTTTTTTTTTTAAGTTAATGGGAAAAATTTGAGACGCAATACCAATACTTAGGATTTTGGTCTTGGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAATCTTTCATTGTATTGTGATTTCCTTTTAGGTATATTGCGCTAAGTGAAACTTGTCAAATAAATCCTCCTTTTAAAAACtgca
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CATTTCGTCTTAGCCACGCAGAAGTCGCGTGTCTAGTTTGTTTCGACGCCGGACCGCGTAAGAGACGATGATGTTGGGCACGGAAGGTGGAGAGGGATTCGTGGTGAAGGTCCGGGGCTTGCCCTGGTCTTGCTCGGCCGATGAAGTGCAGAGGTTTTTTTCTGACTGCAAAATTCAAAATGGGGCTCAAGGTATTCGTTTCATCTACACCAGAGAAGGCAGACCAAGTGGCGAGGCTTTTGTTGAACTTGAATCAGAAGATGAAGTCAAATTGGCCCTGAAAAAAGACAGAGAAACTATGGGACACAGATATGTTGAAGTATTCAAGTCAAACAACGTTGAAATGGATTGGGTGTTGAAGCATACTGGTCCAAATAGTCCTGACACGGCCAATGATGGCTTTGTACGGCTTAGAGGACTTCCCTTTGGATGTAGCAAGGAAGAAATTGTTCAGTTCTTCTCAGGGTTGGAAATCGTGCCAAATGGGATAACATTGCCGGTGGACTTCCAGGGGAGGAGTACGGGGGAGGCCTTCGTGCAGTTTGCTTCACAGGAAATAGCTGAAAAGGCTCTAAAGAAACACAAGGAAAGAATAGGGCACAGGTATATTGAAATCTTTAAGAGCAGTAGAGCTGAAGTTAGAACTCATTATGATCCACCACGAAAGCTTATGGCCATGCAGCGGCCAGGTCCTTATGACAGACCTGGGGCTGGTAGAGGGTATAACAGCATTGGCAGAGGAGCTGGCTTTGAGAGGATGAGGCGTGGTGCTTATGGTGGAGGCTATGGAGGCTATGATGATTACAATGGCTATAATGATGGCTATGGATTTGGGTCAGATAGATTTGGAAGAGACCTCAATTACTGTTTTTCAGGAATGTCTGATCACAGATACGGGGATGGTGGCTCTACTTTCCAGAGCACAACAGGACACTGTGTACACATGCGGGGATTACCTTACAGAGCTACTGAGAATGACATTTATAATTTTTTTTCACCGCTCAACCCTGTGAGAGTACACATTGAAATTGGTCCTGATGGCAGAGTAACTGGTGAAGCAGATGTCGAGTTCGCAACTCATGAAGATGCTGTGGCAGCTATGTCAAAAGACAAAGCAAATATGCAACACAGATATGTAGAACTCTTCTTGAATTCTACAGCAGGAGCAAGCGGTGGTGCTTATGGTAGCCAAATGATGGGAGGCATGGGCTTGTCAAACCAGTCCAGCTACGGGGGCCCAGCCAGCCAGCAGCTGAGTGGGGGTTACGGAGGCGGCTACGGTGGCCAGAGCAGCATGAGTGGATACGACCAAGTTTTACAGGAAAACTCCAGTGATTTTCAATCAAACATTGCATAGGTAACCAAGGAGCAGTGAACAGCAGCTACTACAGTAGTGGAAGCCGTGCATCTATGGGCGTGAACGGAATGGGAGGGTTGTCTAGCATGTCCAGTATGAGTGGTGGATGGGGAATGTAATTGATCGATCCTGATCACTGACTCTTGGTCAACCttttttttttttttttttttttctttAAGAAAACTTCAGTTTAACAGTTTCTGCAATACAAGCTTGTGATTTATGCTTACTCTAAGTGGAAATCAGGATTGTTATGAAGACTTAAGGCCCAGTATTTTTGAATACAATACTCATCTAGGATGTAACAGTGAAGCTGAGTAAACTATAACTGTTAAACTTAAGTTCCAGCTTTTCTCAAGTTAGTTATAGGATGTACTTAAGCAGTAAGCGTATTTAGGTAAAAGCAGTTGAATTATGTTAAATGTTGCCCTTTGCCACGTTAAATTGAACACTGTTTTGGATGCATGTTGAAAGACATGCTTTTATTTTTTTGTAAAACAATATAGGAGCTGTGTCTACTATTAAAAGTGAAACATTTTGGCATGTTTGTTAATTCTAGTTTCATTTAATAACCTGTAAGGCACGTAAGTTTAAGCTTTTTTTTTTTTTAAGTTAATGGGAAAAATTTGAGACGCAATACCAATACTTAGGATTTTGGTCTTGGTGTTTGTATGAAATTCTGAGGCCTTGATTTAAATCTTTCATTGTATTGTGATTTCCTTTTAGGTATATTGCGCTAAGTGAAACTTGTCAAATAAATCCTCCTTTTAAAAACtgca