Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name RBPJ
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name recombination signal binding protein for immunoglobulin kappa J region
Also known as AOS3|CBF-1|CBF1|IGKJRB|IGKJRB1|KBF2|RBP-J|RBP-J kappa|RBP-JK|RBPJK|RBPSUH|SUH|csl
Coordinate chr4:26163458-26435131
Strand +
Gene summary The protein encoded by this gene is a transcriptional regulator important in the Notch signaling pathway. The encoded protein acts as a repressor when not bound to Notch proteins and an activator when bound to Notch proteins. It is thought to function by recruiting chromatin remodeling complexes containing histone deacetylase or histone acetylase proteins to Notch signaling pathway genes. Several transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene, and several pseudogenes of this gene exist on chromosome 9. [provided by RefSeq, Oct 2013]

Retrocopy(s) from RBPJ

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RBPJP6 chr9:42495529-42499315 - Intergenic
 ENSG00000227924 UCSC
RBPJP2 chr9:66635586-66639375 + Intergenic
 ENSG00000274181 UCSC
RBPJP7 chr9:62601059-62604850 + Intergenic
 ENSG00000234217 UCSC
RBPJP5 chr9:39737572-39741359 - Intergenic
 ENSG00000232239 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001374401.1
ATTCTGACATTTTTACTTCCTTTGTTGCCAGGCAAAGTGGCCACCAGATTGGGTGGAAGGGGCTCTTTCTACGGCATTTCATGACTGAGCCTCCAAGAACAACCTGTATTGAGTTTCTCTTTGAGATGATTGGACTGCTCTATCCAGCATCATTGAGTCATTGAAATTATGAGACTATCATTCAAATGGAAGCATTATAGTTCTTCGGAACCATTATGATCTCAAAACGAAAGGAGAATGATACAGATACACTGGCTGAGGTGTTTTGAGGTGCATCGAAGTGTTCCAAGCTGTGACTTACCTTAACATGTTCTTGAAGTACCATGGCGTGGATTAAAAGGAAATTTGGTGAGCGGCCTCCACCTAAACGACTTACTAGGGAAGCTATGCGAAATTATTTAAAAGAGCGAGGGGATCAAACAGTACTTATTCTTCATGCAAAAGTTGCACAGAAGTCATATGGAAATGAAAAAAGGTTTTTTTGCCCACCTCCTTGTGTATATCTTATGGGCAGTGGATGGAAGAAAAAAAAAGAACAAATGGAACGCGATGGTTGTTCTGAACAAGAGTCTCAACCGTGTGCATTTATTGGGATAGGAAATAGTGACCAAGAAATGCAGCAGCTAAACTTGGAAGGAAAGAACTATTGCACAGCCAAAACATTGTATATATCTGACTCAGACAAGCGAAAGCACTTCATGTTGTCTGTAAAGATGTTCTATGGCAACAGTGATGACATTGGTGTGTTCCTCAGCAAGCGGATAAAAGTCATCTCCAAACCTTCCAAAAAGAAGCAGTCATTGAAAAATGCTGACTTATGCATTGCCTCAGGAACAAAGGTGGCTCTGTTTAATCGACTACGATCCCAGACAGTTAGTACCAGATACTTGCATGTAGAAGGAGGTAATTTTCATGCCAGTTCACAGCAGTGGGGAGCCTTTTTTATTCATCTCTTGGATGATGATGAATCAGAAGGAGAAGAATTCACAGTCCGAGATGGCTACATCCATTATGGACAAACAGTCAAACTTGTGTGCTCAGTTACTGGCATGGCACTCCCAAGATTGATAATTAGGAAAGTTGATAAGCAGACCGCATTATTGGATGCAGATGATCCTGTGTCACAACTCCATAAATGTGCATTTTACCTTAAGGATACAGAAAGAATGTATTTGTGCCTTTCTCAAGAAAGAATAATTCAATTTCAGGCCACTCCATGTCCAAAAGAACCAAATAAAGAGATGATAAATGATGGCGCTTCCTGGACAATCATTAGCACAGATAAGGCAGAGTATACATTTTATGAGGGAATGGGCCCTGTCCTTGCCCCAGTCACTCCTGTGCCTGTGGTAGAGAGCCTTCAGTTGAATGGCGGTGGGGACGTAGCAATGCTTGAACTTACAGGACAGAATTTCACTCCAAATTTACGAGTGTGGTTTGGGGATGTAGAAGCTGAAACTATGTACAGGTGTGGAGAGAGTATGCTCTGTGTCGTCCCAGACATTTCTGCATTCCGAGAAGGTTGGAGATGGGTCCGGCAACCAGTCCAGGTTCCAGTAACTTTGGTCCGAAATGATGGAATCATTTATTCCACCAGCCTTACCTTTACCTACACACCAGAACCAGGGCCGCGGCCACATTGCAGTGCAGCAGGAGCAATCCTTCGAGCCAATTCAAGCCAGGTGCCCCCTAACGAATCAAACACAAACAGCGAGGGAAGTTACACAAACGCCAGCACAAATTCAACCAGTGTCACATCATCTACAGCCACAGTGGTATCCTAACTACCGTCTTTTTGCTAGGACTTAAACTGACTTGAGTGTGGCAAAAAGTTAACAAAAAAGGAGAAAAAATGAACAATCGTTTGTGGTTTCTTGGGAAAACTTTTCATACCAGGTGATACTATTCAAAAACCCCGTTGTCTCCCTGCAAGTGCTGATTTGAAATGCAGAAGCCACAGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaaatcaaaaTGTATAAATATTGGAAATCAAGTTTTTCAGCtgttttgttggttggttggttggtttttgtttggttTTGTTTAAATGGGCAAGAAGTAAATAATGTGGCTGGAATACAAGTTGAACAAACTAGAAGACACAAATCTAACATAGTTTTTATGGACCAAGGAACTTGTATATTGTATAAGCTTTAGTAAAAGGTACATTTTCACCATACCTTTTTTTATATCACGGTATTATAGTACACCTTGTTACCAAATAGGTTGTTCTCTTCCCCACCCACCTTTGAGCTTTTGCTCTAAAATACATTCAGGTTCCAAGCCTGACCATCCTTGTTTAATCTATCATACTCTTCCAGGTTTTTTTTTTTTGGTCTAAGGCTGGAACTTTTTTCTTTTTTTTCAGCTGAAGTCTTATGACTTTTCATGAGTCAAAATTGTTTGGATTTCAGCAAGTCAAATCTTGCAAAGGCCTGCATATTTTTTTTAAGATTATATGAAGTCTGTGCAAAAGCTTTAAAAAAATGCCTCTGCCTTGCCTGCAATACATGCAATGTATGTTAACTTAGTCTCTCTTCTCAGACACTGTTGGTAGTTATTTCTGTGTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAATATGGACTTATTGTGGTTATCTGAGAGGTTCTAACATTCACATGCAATTTGGTGTGGCCATTTAGCTATTAATGAGTTAATGGCGCAGAACTTGTTGATATTTGAAGTGTTCTCTCCCCTTTTCCCATGACGTAAATACATAGGTGTGTTCCAGGATTTGTTCAGGTTTTTCCCCCCTCCTAATCTTGTACATAACTTGTATTATGTGTAAGTTAAACATTTTATTTTGAACTTGGAATGTTCCCAGTGATTTCATTCAGCAGGGTATTTTCTGCCTTGTTGGCAAGTGACAAAAAATATGGGAAGTATTTGCTACCAGTTGGTAGATGGTGCCCTTAATGGTAGAATGAGGAAAATGTCCGCAAAAGCATGTTTTATTATCTTTACTTTTTTGGGGGGTTGGAGGGGGTAGCCTAGCCAGAACATCATTGTAATCTTAAAACATAAGATGCTTTTATTAGATGATCAACTAAAATAGCTGGAAGACAGTACTTTAGAAACAGATAGTTGTAAGATTATAAAATGCAAATGTAACTTATGTTTTCATTTTTTTCTCTGCCTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTCTTTTCCAGTACTGAGCATCTCCACAAATGTCTCCTAACTCAGAAAATGTTTCTTTTCTTTTCAGTTGAGATTTGGTTGCATTCAGGGTTGTAGGTTGGCCTTGCTTGCTAACCCCGCCGGTTTTACCGTGCTTTCATTCCTGAACTTTGTTTATGCCTTTGTTTGGTTTCTTCGAAATTGCAGCAGACTCATTGGGCTACATTTAGTACAGGAACCACGTGTGTAATGTTATACAACACAGTCTAGTAATACAATCATCCCTCTTAGAGTAAAAACTACCTCTAGATTGTGGTAAGCTTTTACTGTCCCATAAAACAGGAGCCACAGTACCTTATGAATGCAAAACTGTAACTTCCTACAGTGTTTCCCTACAGAACATTGTCTTTCTGGTGTCCTGGGCTGTTTTGAAAAAGTTTCCATTAATAGACTTTTTAGAAATTATTATTAGTAGCATTTTTTTTCCAGCTTTGCTGTCTTCATCACTCACTCTATGCTCAGACTATGCCACTGTAAATATTCTTCCTAACATCTTTAAATCGCCTTTTCCTCAGTTTTCAAGGGGAAGGTCATTTGTAAAGCACGTTAGGTGGTTAAATCAGTTATTGCGGTTTTCTCTTACTGCAAGCCTTTTTAATCACCCCCAGGCTGCATTTTATTCTATATCGCCTTTTTTCTTCAAATCTGCTCCAATCACTCACTTCTCTCTTATAAGCTAATCCTGCCTCACACCTTAAATCTGTTTCAGTGATCAAGGGCAGAACTCATTGTGGCCTTATCTTTCTTTGTTGTAATTGTTCACTGTCTCTTTCTTACAGACCACTTATTTCTGAGTAGTAGTTATTCCTCTCTATGGAGTCATGGCAGGAATCATTACACAGTGCTTTTGTTCAGAGCATGGACATGTTCCTAGTGCTGCTTTGCTTTAACGGCCACAAGTTTCCTCCACTTCCTAGGTTTGGTATTTAGTTAAGGAATCATATTAAATTAACCAATAACAAAAGAGATACTTTTGAAGAACAAACTATTCCTTACCCATTTTTGTAGCTCAAAAATAATTTTTCAAGTTCATGACCTTATTAAAATGAACTTGTGTTTTTTTAACAAACATGTATGTTTTATTTTGATAGTTTCTTTCCGTAAGATAATTGAAATATTATACTGTAAACCCTTTTCTTTTCTTTTTTTGAAAAGTCCAAGAATGTACTTATACAGGCATTTTTCCCCACCTATTTTTGGCCATTCTCATACCACAGACTAAAGAGTGAAATGATTTGTCCATTGTAGCTTATTGTTTATCAGTAGTTCTTTTGTCAGCTGCTTACATTTTTTCTTTCATGGTTTTGTGAATCATTTTCAGTATGTAATTTATAGGAACCTTGTCCTCTGGTTATAGTAGACTGTGTGCCCTCCTCCAGTGATGGCATTATTAGACATGCTGGTCATTTACCCTCAGAAAGACTCTCTTATTAGAATGGTGAGTGCTTCAGTTATAGTATGTTTGAATTTTTAAAAAATTCTGTTTTAGAAATGTATCTTATGCTCTCATGACTATGCAGTTTCTAAACATACACATAGAAGCTGAGTCTCTGATCCAATATGTTTTTATTTGTTCCATTTAATTTATCACATAGATTGGGAAGGCAAGCTAAAAGCCTTAAAAATGCCCTTTATATTTTGAGTGATTTCAGCGTTGAACACTAGTATACTATCTAAATTTGCTGCTCACTTTCTTTAAACTGTGGCAATTAAAGGCATGTTTATACATGACTTAATCGTGAAATGTTTGTCACTCTTAC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>NM_001374402.1
GCCGTGGCTCAGGCTCCAGCGCGTGAGGGCGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGAGGCCGGCGGTCATTGAAATTATGAGACTATCATTCAAATGGAAGCATTATAGTTCTTCGGAACCATTATGATCTCAAAACGAAAGGAGAATGATACAGATACACTGGCTGAGGTGTTTTGAGGTGCATCGAAGTGTTCCAAGCTGTGACTTACCTTAACATGTTCTTGAAGTACCATGGCGTGGATTAAAAGGAAATTTGGTGAGCGGCCTCCACCTAAACGACTTACTAGGGAAGCTATGCGAAATTATTTAAAAGAGCGAGGGGATCAAACAGTACTTATTCTTCATGCAAAAGTTGCACAGAAGTCATATGGAAATGAAAAAAGGTTTTTTTGCCCACCTCCTTGTGTATATCTTATGGGCAGTGGATGGAAGAAAAAAAAAGAACAAATGGAACGCGATGGTTGTTCTGAACAAGAGTCTCAACCGTGTGCATTTATTGGGATAGGAAATAGTGACCAAGAAATGCAGCAGCTAAACTTGGAAGGAAAGAACTATTGCACAGCCAAAACATTGTATATATCTGACTCAGACAAGCGAAAGCACTTCATGTTGTCTGTAAAGATGTTCTATGGCAACAGTGATGACATTGGTGTGTTCCTCAGCAAGCGGATAAAAGTCATCTCCAAACCTTCCAAAAAGAAGCAGTCATTGAAAAATGCTGACTTATGCATTGCCTCAGGAACAAAGGTGGCTCTGTTTAATCGACTACGATCCCAGACAGTTAGTACCAGATACTTGCATGTAGAAGGAGGTAATTTTCATGCCAGTTCACAGCAGTGGGGAGCCTTTTTTATTCATCTCTTGGATGATGATGAATCAGAAGGAGAAGAATTCACAGTCCGAGATGGCTACATCCATTATGGACAAACAGTCAAACTTGTGTGCTCAGTTACTGGCATGGCACTCCCAAGATTGATAATTAGGAAAGTTGATAAGCAGACCGCATTATTGGATGCAGATGATCCTGTGTCACAACTCCATAAATGTGCATTTTACCTTAAGGATACAGAAAGAATGTATTTGTGCCTTTCTCAAGAAAGAATAATTCAATTTCAGGCCACTCCATGTCCAAAAGAACCAAATAAAGAGATGATAAATGATGGCGCTTCCTGGACAATCATTAGCACAGATAAGGCAGAGTATACATTTTATGAGGGAATGGGCCCTGTCCTTGCCCCAGTCACTCCTGTGCCTGTGGTAGAGAGCCTTCAGTTGAATGGCGGTGGGGACGTAGCAATGCTTGAACTTACAGGACAGAATTTCACTCCAAATTTACGAGTGTGGTTTGGGGATGTAGAAGCTGAAACTATGTACAGGTGTGGAGAGAGTATGCTCTGTGTCGTCCCAGACATTTCTGCATTCCGAGAAGGTTGGAGATGGGTCCGGCAACCAGTCCAGGTTCCAGTAACTTTGGTCCGAAATGATGGAATCATTTATTCCACCAGCCTTACCTTTACCTACACACCAGAACCAGGGCCGCGGCCACATTGCAGTGCAGCAGGAGCAATCCTTCGAGCCAATTCAAGCCAGGTGCCCCCTAACGAATCAAACACAAACAGCGAGGGAAGTTACACAAACGCCAGCACAAATTCAACCAGTGTCACATCATCTACAGCCACAGTGGTATCCTAACTACCGTCTTTTTGCTAGGACTTAAACTGACTTGAGTGTGGCAAAAAGTTAACAAAAAAGGAGAAAAAATGAACAATCGTTTGTGGTTTCTTGGGAAAACTTTTCATACCAGGTGATACTATTCAAAAACCCCGTTGTCTCCCTGCAAGTGCTGATTTGAAATGCAGAAGCCACAGTaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaagaaaaaaaaatcaaaaTGTATAAATATTGGAAATCAAGTTTTTCAGCtgttttgttggttggttggttggtttttgtttggttTTGTTTAAATGGGCAAGAAGTAAATAATGTGGCTGGAATACAAGTTGAACAAACTAGAAGACACAAATCTAACATAGTTTTTATGGACCAAGGAACTTGTATATTGTATAAGCTTTAGTAAAAGGTACATTTTCACCATACCTTTTTTTATATCACGGTATTATAGTACACCTTGTTACCAAATAGGTTGTTCTCTTCCCCACCCACCTTTGAGCTTTTGCTCTAAAATACATTCAGGTTCCAAGCCTGACCATCCTTGTTTAATCTATCATACTCTTCCAGGTTTTTTTTTTTTGGTCTAAGGCTGGAACTTTTTTCTTTTTTTTCAGCTGAAGTCTTATGACTTTTCATGAGTCAAAATTGTTTGGATTTCAGCAAGTCAAATCTTGCAAAGGCCTGCATATTTTTTTTAAGATTATATGAAGTCTGTGCAAAAGCTTTAAAAAAATGCCTCTGCCTTGCCTGCAATACATGCAATGTATGTTAACTTAGTCTCTCTTCTCAGACACTGTTGGTAGTTATTTCTGTGTTTTCCTTTTTTTAAAAAAAAATATGGACTTATTGTGGTTATCTGAGAGGTTCTAACATTCACATGCAATTTGGTGTGGCCATTTAGCTATTAATGAGTTAATGGCGCAGAACTTGTTGATATTTGAAGTGTTCTCTCCCCTTTTCCCATGACGTAAATACATAGGTGTGTTCCAGGATTTGTTCAGGTTTTTCCCCCCTCCTAATCTTGTACATAACTTGTATTATGTGTAAGTTAAACATTTTATTTTGAACTTGGAATGTTCCCAGTGATTTCATTCAGCAGGGTATTTTCTGCCTTGTTGGCAAGTGACAAAAAATATGGGAAGTATTTGCTACCAGTTGGTAGATGGTGCCCTTAATGGTAGAATGAGGAAAATGTCCGCAAAAGCATGTTTTATTATCTTTACTTTTTTGGGGGGTTGGAGGGGGTAGCCTAGCCAGAACATCATTGTAATCTTAAAACATAAGATGCTTTTATTAGATGATCAACTAAAATAGCTGGAAGACAGTACTTTAGAAACAGATAGTTGTAAGATTATAAAATGCAAATGTAACTTATGTTTTCATTTTTTTCTCTGCCTTTTTTGTTTGTTTGTTTTCTCTTTTCCAGTACTGAGCATCTCCACAAATGTCTCCTAACTCAGAAAATGTTTCTTTTCTTTTCAGTTGAGATTTGGTTGCATTCAGGGTTGTAGGTTGGCCTTGCTTGCTAACCCCGCCGGTTTTACCGTGCTTTCATTCCTGAACTTTGTTTATGCCTTTGTTTGGTTTCTTCGAAATTGCAGCAGACTCATTGGGCTACATTTAGTACAGGAACCACGTGTGTAATGTTATACAACACAGTCTAGTAATACAATCATCCCTCTTAGAGTAAAAACTACCTCTAGATTGTGGTAAGCTTTTACTGTCCCATAAAACAGGAGCCACAGTACCTTATGAATGCAAAACTGTAACTTCCTACAGTGTTTCCCTACAGAACATTGTCTTTCTGGTGTCCTGGGCTGTTTTGAAAAAGTTTCCATTAATAGACTTTTTAGAAATTATTATTAGTAGCATTTTTTTTCCAGCTTTGCTGTCTTCATCACTCACTCTATGCTCAGACTATGCCACTGTAAATATTCTTCCTAACATCTTTAAATCGCCTTTTCCTCAGTTTTCAAGGGGAAGGTCATTTGTAAAGCACGTTAGGTGGTTAAATCAGTTATTGCGGTTTTCTCTTACTGCAAGCCTTTTTAATCACCCCCAGGCTGCATTTTATTCTATATCGCCTTTTTTCTTCAAATCTGCTCCAATCACTCACTTCTCTCTTATAAGCTAATCCTGCCTCACACCTTAAATCTGTTTCAGTGATCAAGGGCAGAACTCATTGTGGCCTTATCTTTCTTTGTTGTAATTGTTCACTGTCTCTTTCTTACAGACCACTTATTTCTGAGTAGTAGTTATTCCTCTCTATGGAGTCATGGCAGGAATCATTACACAGTGCTTTTGTTCAGAGCATGGACATGTTCCTAGTGCTGCTTTGCTTTAACGGCCACAAGTTTCCTCCACTTCCTAGGTTTGGTATTTAGTTAAGGAATCATATTAAATTAACCAATAACAAAAGAGATACTTTTGAAGAACAAACTATTCCTTACCCATTTTTGTAGCTCAAAAATAATTTTTCAAGTTCATGACCTTATTAAAATGAACTTGTGTTTTTTTAACAAACATGTATGTTTTATTTTGATAGTTTCTTTCCGTAAGATAATTGAAATATTATACTGTAAACCCTTTTCTTTTCTTTTTTTGAAAAGTCCAAGAATGTACTTATACAGGCATTTTTCCCCACCTATTTTTGGCCATTCTCATACCACAGACTAAAGAGTGAAATGATTTGTCCATTGTAGCTTATTGTTTATCAGTAGTTCTTTTGTCAGCTGCTTACATTTTTTCTTTCATGGTTTTGTGAATCATTTTCAGTATGTAATTTATAGGAACCTTGTCCTCTGGTTATAGTAGACTGTGTGCCCTCCTCCAGTGATGGCATTATTAGACATGCTGGTCATTTACCCTCAGAAAGACTCTCTTATTAGAATGGTGAGTGCTTCAGTTATAGTATGTTTGAATTTTTAAAAAATTCTGTTTTAGAAATGTATCTTATGCTCTCATGACTATGCAGTTTCTAAACATACACATAGAAGCTGAGTCTCTGATCCAATATGTTTTTATTTGTTCCATTTAATTTATCACATAGATTGGGAAGGCAAGCTAAAAGCCTTAAAAATGCCCTTTATATTTTGAGTGATTTCAGCGTTGAACACTAGTATACTATCTAAATTTGCTGCTCACTTTCTTTAAACTGTGGCAATTAAAGGCATGTTTATACATGACTTAATCGTGAAATGTTTGTCACTCTTACTGCACAGACTTATCTGCAATCATAACTGGTTAGtttttttgttttgttttgttttattgtttttAATGAAACTGGTACCATCTGTGCTTTCACAAAA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