Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name Pcbp2
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr7) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Rattus norvegicus
Full Name poly(rC) binding protein 2
Also known as -
Coordinate chr7:144077901-144103723
Strand +
Gene summary Predicted to enable C-rich single-stranded DNA binding activity; mRNA binding activity; and ubiquitin protein ligase binding activity. Predicted to be involved in several processes, including IRES-dependent viral translational initiation; negative regulation of defense response to virus; and proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process. Predicted to act upstream of or within positive regulation of transcription by RNA polymerase II. Is active in postsynaptic density. Orthologous to human PCBP2 (poly(rC) binding protein 2). [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from Pcbp2

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
Pcbp2P2 chr4:118327215-118328567 - Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P3 chr6:110596259-110597285 + Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P6 chr8:20132846-20135481 + Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P10 chrX:119209084-119210817 - Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P4 chr6:82719911-82720670 + Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P7 chr11:19816266-19817459 + Intragenic
N/A UCSC
Pcbp2P1 chr3:131918525-131920074 + Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P9 chr16:68390295-68391752 - Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P5 chr8:130569169-130570250 - Intergenic
N/A UCSC
Pcbp2P8 chr15:99192097-99192816 - Intergenic
N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_006242417.3
TCTCTTtcccccttcctcctcctccaccccccctcctccgccCGCTAGCGGGGCCCCCCTCGCCTTCCCGCCCGCCCCTATTGTTCCGCCCCCGGCCTCCCGCCCTTCCCCTTCCCGCCCGCTCCCCTTTTCCCCTCAGTCGACTCGCGCCTCCAGTTTTTGGCTTTCACTCTCACCAGTGACCAAAGACTTGACCACTCAAAGTCCAGCTCCCTGTAACTGCTAGACATGGACACCGGTGTGATTGAAGGTGGATTAAATGTCACTCTCACCATCAGGCTACTTATGCACGGAAAGGAAGTTGGCAGTATCATCGGAAAGAAAGGAGAATCTGTTAAGAAGATGCGCGAGGAGAGTGGTGCACGTATCAACATCTCAGAAGGGAATTGTCCTGAGAGAATTATAACTTTGGCTGGACCGACTAATGCCATCTTCAAAGCCTTTGCTATGATCATTGACAAACTGGAAGAGGACATAAGCAGCTCTATGACCAATAGCACAGCTGCCAGTAGACCCCCGGTTACCTTACGGCTGGTGGTTCCTGCTAGTCAGTGTGGCTCTCTTATTGGAAAAGGTGGTTGCAAGATCAAGGAAATAAGAGAGAGTACAGGGGCTCAGGTCCAGGTGGCAGGGGATATGCTCCCCAACTCAACTGAGCGAGCAATCACTATTGCTGGCATTCCGCAGTCCATCATTGAGTGTGTCAAACAGATCTGCGTGGTCATGTTGGAGACTCTCTCCCAGTCCCCCCCGAAGGGCGTGACCATCCCGTACCGGCCCAAGCCCTCCAGTTCTCCAGTCATCTTTGCAGGTGGTCAGgacaggtacagcacaggcagcgacagtgcgagctttccccacaccaccccgtccatgtgcctcaaccctgacctggagggaccacctctagagGCCTATACCATTCAAGGACAGTATGCCATTCCACAGCCAGATTTGACCAAGCTGCACCAGTTGGCAATGCAACAGTCTCATTTTCCCATGACCCATGGCAACACCGGATTCAGTGGCATTGAATCCAGCTCTCCAGAGGTGAAAGGCTATTGGGCAGGTTTGGATGCATCTGCTCAAACTACTTCTCATGAACTCACCATTCCAAATGATTTGATTGGCTGCATAATTGGGCGTCAGGGCGCCAAAATCAATGAGATCCGTCAGATGTCTGGGGCGCAGATCAAAATTGCAAACCCAGTGGAAGGATCTACTGATCGGCAGGTTACCATCACTGGATCTGCTGCCAGCATTAGTCTGGCTCAGTATCTAATCAATGTCAGGCTTTCCTCGGAGACAGGTGGCATGGGGAGCAGCTAGAACAGAGCAGATTCATCCATAATCCCTTTCTGCTGTTCACCACCACCCATGATCCATCTGTGTAGTTTCTGAACAGTCAGCGATTCCAGGTTTTAAATAGTTTGTAAATTTTCAGTTTCTACACACTTTATCATCCACTCATGATTTTTTAATTAAAGTGTTTTAATTCTTTTCTCTGTTCAGCAGTTACGCTGAGATATCCATATTTAGTTTTATAAGCTTCTCCCCCttttttgttttgttttgttttttttttttGGCTCATGAATTTTTGTTTGTCATGGAAATGTAAGAGTGGATTATTAATACATTTCAGTTTAGTTCTGTAATGTCAGGAATTTTTCAAAAAAAGAATTAAAAGATGGACTGGAGCTTTTTCTTTGTGAATAGAAACTGGATGCCACAGTGACTTATGCGGGTGTTATTCCTGTCTGATACTATTTTTATAGAGCCCTGATTCCATTTAAATAGAATTAGTGGACTTCCTTTTTTACCACTCCCtttttttttttttttttttttttttttttGTAATTTGCCCTCAATCTTTTCCCCCCCATGATCCTGGGTGGCCTCTGAAGACTGACAGTCACACTTACCCTGGGATTGTACAGCAGCATTGTACAGTGCATTTATGGAGCTGGGACAGGAAGGTGTCGATTGGAAGCTTGAGAATCACTGCCTCGTGCATACTTTAATTTTAAAGTCTAGTAATCATTTAGTTTTCTCCACAGGTGTTGTGAGACCTTGTGTTCTTGTCCTGAAATCATTTAGAAAAGTTTACCTGCTGCCATTTATGTTAACTTAGAAAGTAACTTATCCAAATTCCTCAGGTAAAATCTTAAATCCAAGACTTAATCCATGTATTACCACTCCACTCATTCACCAAGAAAACCCTCGACAGTTGGGCCTGCATGGAGTGGTTATATTTCAGGGTTGTTCACAGGGGTTACAATATGACAGTCCCCACCCCTACCAGGCACCAGATAACAGCGGGGACTTAACCAGCACCCAGTTCTTCAGCCTGAGCCATCACATGCTATTAATCTTCTAACTTGCCTCTGGGCCCAAAGCCAGGGCTTTGGCAGAGAAACAGGAACAAAGAAATGAGTTACATTGCCACCTGAGAAACCTCAGAGGGAGGACCTAGGACCCAGCCTTAGTTTCCCTCCTCCCAAGTGCAAAATGTGTAAACAGTAAACGGAAAATAAAAGTGCAGTTTTAAGTGAATCCTCTTCCTGCCCCCCATGTTTAGGGACAGACAGTGTAGAGACAAGCCTGGCTTTTCTATGCCTACTTGCTTGTTCAACATAAGGAATGGGGTGAAGCAAGAAGGGACCGGTGTCCTTTCCTTACAGCTCTAGGGTAGTACTTGGAGTCATTTCCACAGCTGCCAGTGTCCCTAGAACTTAATTGGTCAGGGGCGTCGTTCACTCTGAAGCCTGACTTACGGCTAAGAAAGCCCCGTCTATCTGTTGATTATGTGGCGCatatatattatttatataaatatttctctatgtaCAAGGAATAAGAGTGTCTTTCATGGAGGAAGGGAGGCTGGGGGCCGCAAGGCATCAATGCTGTTGGAGTTGTCCAATTCAGTGCTGTCACAGTCTGAGTCCTCAGGATTGGGGCCCTGTGAAGAGTAGAAATGCAGTGAAGTGGGGGAGCTCAGCATCTTTTAGCATTACAGATTCTTTGAGGGCCCTCAGTGGGGTGCTTTTACATTATCAGTGGAGGTGAGGTTTTTTTCTTTTTTTAAAATCTCACTGTTGATAGGTCATGCTCCAAGGCACTAGGCAGACTCCTTTTAGGATACTCTGACTGCAGTGTATTGCTGTCATACAAGTTAAACCTCTGGCACTATATACTTGGATATTTGTTTTAATGGTTCTGGAAAAAATTGGTGGCTTGAAGGCTAAATAAATACCTTTTGTAGGTTAGTCA
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