Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name TNPO1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name transportin 1
Also known as IPO2|KPNB2|MIP|MIP1|TRN
Coordinate chr5:72816650-72914388
Strand +
Gene summary This gene encodes the beta subunit of the karyopherin receptor complex which interacts with nuclear localization signals to target nuclear proteins to the nucleus. The karyopherin receptor complex is a heterodimer of an alpha subunit which recognizes the nuclear localization signal and a beta subunit which docks the complex at nucleoporins. Alternate splicing of this gene results in several transcript variants encoding different proteins. [provided by RefSeq, Jun 2018]

Retrocopy(s) from TNPO1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
TNPO1P1 chr10:84390905-84393707 + Intragenic
ENSG00000225423 UCSC
TNPO1P2 chr17:18460273-18463331 + Intergenic
ENSG00000230662 UCSC
TNPO1P3 chr17:20481059-20484120 - Intergenic
ENSG00000229586 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001364294.3
CCTTGCGCTcggcggccgcggcggcagcagcagcagacgctggcggccgggctgcCAGGAGCAGTTCCGCCGGGTTTCACTGTCCGTGACTTCCTTCGGGGCACCTCAGGCAGCAAACCAAGATGGAGTATGAGTGGAAACCTGACGAGCAAGGGCTTCAGCAAATCCTGCAGCTGTTGAAGGAGTCCCAGTCCCCAGACACCACCATCCAGAGAACCGTGCAACAAAAACTGGAACAACTTAATCAGTATCCAGACTTTAACAACTACTTGATTTTTGTTCTTACAAAATTAAAATCTGAAGATGAACCCACAAGATCATTGAGTGGTCTTATCTTGAAGAATAATGTGAAAGCACACTTTCAGAACTTCCCAAATGGTGTAACAGACTTTATTAAAAGTGAATGTTTAAATAATATTGGTGACTCCTCTCCTCTGATTAGAGCCACTGTTGGTATTTTGATCACAACTATAGCCTCCAAGGGAGAATTGCAGAATTGGCCTGACCTCTTACCAAAACTCTGTAGCCTGTTGGATTCTGAAGATTATAATACCTGTGAGGGAGCATTTGGTGCCCTTCAGAAGATTTGTGAAGATTCTGCTGAGATTTTAGACAGTGATGTTTTAGATCGTCCTCTCAACATCATGATTCCCAAATTTTTACAGTTCTTCAAGCATAGTAGTCCAAAAATAAGGTCTCACGCTGTTGCATGTGTCAATCAGTTTATCATCAGTAGGACTCAAGCTCTAATGTTGCACATTGATTCTTTTATTGAGAATCTCTTTGCATTAGCTGGTGATGAAGAACCAGAGGTACGGAAAAATGTGTGCCGAGCACTTGTGATGTTGCTCGAAGTTCGAATGGATCGCCTGCTTCCTCACATGCATAATATAGTTGAGTACATGCTACAGAGGACTCAAGATCAAGATGAAAATGTGGCTTTAGAAGCCTGTGAATTTTGGCTAACTTTAGCTGAACAGCCAATATGCAAAGATGTACTCGTAAGGCATCTTCCTAAGTTGATTCCTGTGTTAGTGAATGGCATGAAGTACTCAGACATAGATATTATCCTACTTAAGGGTGATGTTGAAGAAGACGAAACGATTCCTGATAGTGAACAGGATATACGGCCACGTTTTCACCGATCGAGGACGGTGGCTCAGCAGCatgatgaagatggaattgaagaggaagatgatgatgatgatgaaattgatgatgatgatACAATTTCTGACTGGAATCTAAGAAAATGTTCTGCTGCTGCCCTGGATGTTCTTGCAAATGTGTATCGTGATGAACTGCTGCCACATATTTTGCCCCTTTTGAAAGAATTACTTTTTCATCATGAATGGGTTGTTAAAGAATCAGGCATTTTGGTTTTAGGAGCAATTGCTGAAGGTTGCATGCAGGGCATGATTCCATACTTGCCTGAGCTTATTCCTCACCTTATTCAGTGCCTCTCTGATAAAAAGGCTCTTGTGCGTTCCATAACATGCTGGACTCTTAGCCGCTATGCACACTGGGTGGTCAGCCAGCCGCCAGACACGTACCTGAAGCCATTAATGACAGAATTGCTAAAGCGCATCCTGGACAGCAACAAGAGAGTACAAGAAGCTGCCTGCAGTGCCTTTGCTACCCTAGAAGAGGAGGCTTGTACAGAACTTGTTCCTTACCTTGCTTATATACTTGATACCCTGGTCTTTGCATTTAGTAAATACCAGCATAAGAACCTGCTCATTCTTTACGATGCCATAGGAACATTAGCAGATTCAGTAGGACATCATTTAAACAAACCAGAATATATTCAGATGCTAATGCCTCCACTGATCCAGAAATGGAACATGTTAAAGGATGAAGATAAAGATCTCTTCCCTTTACTTGAGTGCCTATCTTCAGTTGCCACAGCACTGCAGTCTGGATTCCTTCCGTACTGTGAACCTGTGTATCAGCGTTGTGTAAACCTAGTACAGAAGACTCTTGCACAAGCCATGCTAAACAATGCTCAACCAGATCAATATGAAGCTCCAGATAAAGATTTTATGATAGTGGCTCTTGATTTACTGAGTGGCCTGGCTGAAGGACTTGGAGGCAACATTGAACAGCTGGTAGCCCGAAGTAACATCCTGACACTAATGTATCAGTGCATGCAGGATAAAATGCCAGAAGTTCGACAGAGTTCTTTTGCCCTGTTAGGTGACCTCACAAAAGCTTGCTTTCAGCATGTTAAGCCTTGTATAGCTGATTTCATGCCAATATTGGGAACCAACCTAAATCCAGAATTCATTTCAGTCTGCAACAATGCCACATGGGCAATTGGAGAAATCTCCATTCAAATGGCAATAACAATTGGTCGTCTTGGTTACGTTTGTCCTCAAGAGGTGGCCCCCATGCTACAGCAGTTTATAAGACCCTGGTGCACCTCTCTGAGAAACATAAGAGACAATGAGGAAAAGGATTCAGCATTCCGTGGAATTTGTACCATGATCAGTGTGAATCCCAGTGGCGTAATCCAAGATTTTATATTTTTTTGTGATGCCGTTGCATCATGGATTAACCCAAAAGATGATCTCAGAGACATGTTCTGTAAGATCCTTCATGGATTTAAAAATCAAGTTGGCGATGAAAATTGGAGGCGTTTCTCTGACCAGTTTCCTCTTCCCTTAAAAGAGCGTCTTGCAGCTTTTTATGGTGTTTAATCTAATACACTTAAGCTGCAGTCCCAAAATTAGGGGTCCTTCAGTCTTGGAGACTATAAGGGAGCCTCTGCACCCAGGGAAAATGTTACCCTTTACAGGGGGGAAGGGTAAACCAGTAGGGAATACAGTACAATCCCAACCCTACTGGGAGGGGCGGGAGGGAGGTGTTGCCGTCACTGTATTAAGTCGATGTTGGGAAACGTTTTAACATCTGGAGCCTTTGTGGGTGGAAATATGTCTCCAGTTACAACTCCGCAGTGGATGTGAAGAAGCAAAAAAAAAAAAATCTATTCAGTCTACTCACAAAACAGTACATTGTGGAATATTATGGGGAATTGTACCAAAACAAGAACCATATAAATGATGCCTAGGGACAAGAAAGAGGAACAATTCTATAGCGCACAATAAAGGAAACCTAAGAATGGGAGTTACAAATAGTAAAGAAGCTTTTTTTTTTTTTTTAATTTAAAGTTTTTTTATGTAAGTTTTCCCACATGATGGGGCCTTGTTTTGCATGTTGATGAAGAACTACACAAAGAAAACTAATATAGTTAAAAGTCAGCTTGCCTTCCCGTAGTAGAAGCAGGTTCTTGGAAGTTACAATTTAAGGTACCCCAAAAAAGTTGGaaataaaacaaaacaaacataaacaaTGAAGCACCCTGTGAAATGCCAAATGAGTCACTCCTTTTACCTTTTTTGGGGTGGGCAGGGAGGGAGGAATAAATGGGGTTGGGCATATCAAACTAAAGATGACATCTTAATTTTGCATTGAACATTAATGTAGCGGATATAATTTGATGATTATACTTCATTAGATTTAATTTCTAGGCCAAGATGTTACTTTTTAAAGTGCAGTTTAAGGTTCAGGCATGCATTCTGGCTCATAGTGGTTGAAAGTAATTTAAATTAGTGGGAAAGTAGCATGCTTGCATCACATAGAGTGAGATTGGTATTCATTTACCTATGTTGCGCCAGTTTGTGTTGCAGTTTACCAATTCAATATAGCCCTGCATTTAAAGTTCCTTTTTAAGATTTGTGGATTTTATTTTTATTAAGAACATAGATATATAAAGTACTGTAGTTTACAGGTAGGCCTTGAAATATCTTTTTTAGGATCTGTTAGGAATAAGATTGATATTGTATTGTGTGTAACCTGCACAATGTGGAAAGCTGATATACCTGTGCAAAATCTTTGCCTCTGTGCTGTCAGTGTGATGTGCTTTCTGCATGGTTATATACTACTAGTGATTTTATCAAAACTTCTAAAATTTAAATTACGTGGTAAAAGATCTGTAAAAGGCTGCATAAATGTTAGTTGGCACATAAAGACAATTGTAGAAGTTGAAAAATGATTGCTATATTTCAATGTTTATTCCCACTCAACATACTGCCTTCTAAGCTTCCCTTTTTTTGTTCAAAGCATGATCTTAAAGATATGTTTAAGTTAATGGATGTAATGCAGGGTTCCTACACTGTATTTTGGCGCATGTTGGTGGCCCTCTGTGCCCTAGATATATGCACACAGGGTGCAAGTTAAAAGCTACAGAGTGAAAGTTGGTTTGGATCCTCTTCATTTCATTTGTTTAGCTTTTCTGTTATTTTTCTCTACTTACATGTATTCCTGTGAATAAATCCTTGTTAAGTTAACCCTTTACTTTTCCTTCCATGTGTATTTTCTTATATACTGTGAATGTGAAAACCTAACTGGTACACTTGATCTTGTGTTCATATGAAAGTGCAAGTCTTTATTAATTTGGATTGCCTGAACAGTGTATCCCATGATGATGAAGGAAAATGGAGAGATTTTTCTTTTTAACTCTGCTGGTCAGAGATGAAGCCACGCCTTTCCATTTTTCAATGCTGCATATTTAATCTGCAACAAAAATGTTAAGCCATAACAGCCTTTTTATATTTTAGTTTGTCACCTTTGCATTGCAGAATAAATACTGAATAACCATTTTTATAAGCAGTTGCTCCTCTTTGCATGGTTCTATTCTCTAAAAGTGTTGAATGATACAGCCATTGCACTGAAGTTTGAGCTGTGTGCGTGTGAATTTATACTGTTTCAAAAATTTCAAATGCATGGTAGCATGTAGAAAGgtttttgttactatgtgtgtgtgtgtgttttgttttgttttgttctgttttttAACGTTCTTTCACCTTTCCTCTACTTTGGCTTTGCAAATTTCAGTCTGTAGAGCCTGAAATTAAATTATTTTATAGTGCCTGATATTTTTAATATTATAAGTTGGATTCAAAGGGTATACAGCATTTTGTTTTCTAGTACCATTG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