Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name C4orf3
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr4) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name chromosome 4 open reading frame 3
Also known as ALN|HCVFTP1
Coordinate chr4:119296419-119304445
Strand -
Gene summary Predicted to act upstream of or within negative regulation of ATPase-coupled calcium transmembrane transporter activity and negative regulation of calcium ion binding activity. Predicted to be located in endoplasmic reticulum membrane. Predicted to be integral component of membrane. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from C4orf3

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
C4orf3P2 chr9:86132647-86135321 + Intergenic
 ENSG00000233713 UCSC
C4orf3P3 chr11:14667874-14668878 - Intragenic
 N/A UCSC
C4orf3P1 chr7:98796076-98796436 + Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001001701.4
GCACTGCGCAGGCGGCCGGACTCCGCTCAGTTTCCGGTGCGGCGAACACCAAAGTCCGGGAACTTAAGCATTTTCGGTTTCTAGGGTTGTTACGAAGCTGCAGGAGCGAGATGGAGGTGGACGCACCGGGTGTTGATGGTCGAGATGGTCTCCGGGAGCGGCGAGGCTTTAGCGAGGGAGGGAGGCAGAACTTCGATGTGAGGCCTCAGTCTGGGGCAAATGGGCTTCCCAAACACTCCTACTGGTTGGACCTCTGGCTTTTCATCCTTTTCGATGTGGTGGTGTTTCTCTTTGTGTATTTTTTGCCATGACTTGTTCGCTGATATCTAAATTAAGAAGTTGGTTCTTGAGTGAATTCTGAAAATGGCTACAAACTTCTTGAATAAAGAAGACAGGACTCTCAATAGAAGAATTTCACATCTCCAAGGGACCCTTCCTTTCATTTTACACTTTGTTACTAATTTGCAGAACTCTATTAATTGGGTAGGATTTCACCCATTCCTAGCTAAGTTCTTAAAATTAAACCCTTTGGTTCGTGTTTAAAAACTTTCAAACATCTGATGGCTTTACAGGGGCTGAATATAAAAGCATTTGTACTTAAAGGTCTTGTGTATTCATTAAGAAATATAGTAATGTCTTTTAATGTTTTAAGAGTTGATCAGGGTTTACTATGATGCAAGTAATAGGATGATTAATAAGGGAAGGTTTTTATGAATTCAAAAGTCAATTATTCAAAAGCAGGGAAAGATTTTGAGAGAGGGAACAAAGTATTCTTAGATTGCGTAGAAGCTGCTAGGTTCCAGTTTTAATTTTTAGGTTTAGTTGGACTCTGTTATGAAAAGATAGGTTATGGGTGGGCGACAGGTTGATACAGTCTTAGAAAAAGCAGGTAATATCAAAGTATTGGAAAGCTAGCATGCATGCCCTCTTACCTGGGTATCTTCCCCCTTTTTTCCTTTTAAACTCTTGAGCCTCCTATAACGAAGGATTATGTGTTTCAAACCTATTTTTTTTTTACTGTTTCATTAAGTGTGCTTGTGCCCAAAATATTTACTTGTATAATATCTGTAACTTGCTTAAATACTTCAGCAAAGTCAGCATatttactcattcaacaaatatttgagccaggcattattttagacacagcagtgaacaaaacaaaaaggcattcttgccttcatggagcttacattctTATTGTTATTTAAATCTAAATGTTATAAAAcaagaatttatattctagggttgatcagctagtatttaatcaaaaaggccacactcccatagcagctactctaagcTGTAGTAGCTAATAAAAAATATTAATGTTggccgggcacagtggctcacgcctataatcccagcactttgggaggccaagggtggtagatcacttgaggtcaagagttgtgacaccagcctggccaacctggtgaaaccctatctctattaaaaaatacaaaaaaatacaaaaaaattagctgggcatgttggcatgcacctgtagtcccagctatttgggaggctgaggcacgagaattgcttgaatccgggaggtggaggttgcagtgagccaagatggggccactgcactctaacgtgggcaacagagaccctgtctcaaaaagaaaaTATTCCTGTTAGCCCTAAAGGCTTTAcatgaggaatggtagaagtggtcttttgtttaaattagttgcattcagcatatatgaattgtcttaaatattttggggatactcccccgccttttaaacagggcataagatctggtaaactctctgtatatcttcctacctttcaaaatcgttcttagggttagtcaagtctggaatataattgctgactataaagttagcaattatgcttttaaggtgttgtcacatcaacctaaagagaaccatctatggaaggtatggttgaaacatctgtaggaacacagaactgggatttcactgagtttaccaaatcaactgtgtgaactgtttctgcactgcttgctaatggtttcatctaataaatgtttacttatatagctgagtttggttttattctaacaaattacctggtggtgtgattgtgaggtgattaacagttctcacATAGTTTACTGTTAGGTCACACACAGACTTCCGATCATAATCCATACTGCCTTTTTGAGCCTAAAATCAGCCTACTACCACAATTACCAAATATTCTGAAAATTTCTAGTATGGTGAAGATGGAGAGATCTTGGtgtgaaggttaattttatatgtcatcttgattatgctaggagatgcccagatttctgggtttgtccatgagggtgtttccagaagagattagcatttgaatcagtagactgaataaaaaagagccacccactccactgcgggtgggccaaccccttgagggcctagctggaataaaaaggcagaggaagggcaaattctgtcttctctctgcttgaacagggacatccatgttctatccttggacattggttctcctgattctctggctttcagacatggaccagggcccctggttctcagacctttgggtttggactggaactacaccattggctttcctgggcttactgtctgcggaaagcagattgtgggacttctcagcctccataatcacaagagccaatccctcataataaatttatttctatata
>NM_001170330.1
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