Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name RLIM
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chrX) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name ring finger protein, LIM domain interacting
Also known as MRX61|NY-REN-43|RNF12|TOKAS
Coordinate chrX:74582976-74614624
Strand -
Gene summary The protein encoded by this gene is a RING-H2 zinc finger protein. It has been shown to be an E3 ubiquitin protein ligase that targets LIM domain binding 1 (LDB1/CLIM), and causes proteasome-dependent degradation of LDB1. This protein and LDB1 are co-repressors of LHX1/LIM-1, a homeodomain transcription factor. Multiple alternatively spliced variants, encoding the same protein, have been identified. [provided by RefSeq, Feb 2009]

Retrocopy(s) from RLIM

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
RLIMP2 chr15:49794023-49799156 + Intergenic
ENSG00000259388 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_016120.4
GCAGTCGTTTCCTGTCGCTGCTTGGTAACAATGGGGAAGATAATGGCTGCCTGAGCAACGTCTCCGAGCAGGCGCTGGGCTAGAGGCGGGTCTCAACCAGCTACTCATTGGAGGCGGGCTTGAGAGCGGCGGCCAGGGAGGTGCGGAGCAGCCTCGGCGGCGGCGGCCGAACCAACCGAGTCGGATCCTGACCCTAAAACCTAGTATTTTCCACTTGTTCATCAATATGGAAAACTCAGATTCCAATGACAAAGGAAGTGGTGATCAGTCTGCAGCACAGCGCAGAAGTCAGATGGACCGATTGGATCGAGAAGAAGCTTTCTATCAATTTGTAAATAACCTGAGTGAAGAAGATTATAGGCTTATGAGAGATAACAATTTGCTAGGCACCCCAGGTGAAAGTACTGAGGAAGAGTTGCTGAGACGACTACAGCAAATTAAAGAAGGCCCACCACCGCAAAACTCAGATGAAAATAGAGGAGGAGACTCTTCAGATGATGTGTCTAATGGTGACTCTATAATAGACTGGCTTAACTCTGTCAGACAAACTGGAAATACAACAAGAAGTGGGCAAAGAGGAAACCAATCTTGGAGAGCAGTGAGTCGGACTAATCCAAACAGTGGTGATTTCAGATTCAGTTTAGAGATAAATGTTAACCGTAATAATGGGAGCCAAAATTCAGAGAATGAAAATGAGCCATCTGCAAGACGTTCTAGTGGAGAAAATGTGGAAAACAACAGCCAAAGGCAAGTGGAAAACCCACGATCTGAATCAACATCTGCAAGGCCATCTAGATCAGAACGAAATTCAACTGAAGCGTTAACAGAGGTCCCACCTACCAGAGGTCAGAGGAGGGCAAGAAGCAGGAGCCCAGACCATCGGAGAACCAGAGCAAGAGCTGAAAGAAGTAGGTCACCTCTGCATCCAATGAGTGAAATTCCACGAAGATCTCATCATAGTATCTCATCTCAGACTTTTGAACATCCTTTGGTAAATGAGACGGAGGGAAGTTCTAGAACCCGGCACCATGTGACATTGAGGCAGCAAATATCTGGGCCTGAGTTGCTAAGTAGAGGTCTTTTTGCAGCTTCTGGAACAAGAAATGCTTCTCAAGGAGCAGGTTCTTCAGACACAGCTGCCAGTGGTGAATCTACAGGATCAGGACAGAGACCTCCAACCATAGTCCTTGATCTTCAAGTAAGAAGAGTTCGTCCTGGAGAATATCGGCAGAGAGATAGCATAGCCAGCAGAACTCGGTCTAGGTCTCAGACACCAAACAACACTGTCACCTATGAAAGTGAACGAGGAGGTTTTAGGCGTACATTTTCACGTTCTGAGCGGGCAGGTGTGAGAACCTATGTCAGTACCATCAGAATTCCCATTCGTAGAATCTTAAATACTGGTTTAAGTGAGACTACATCTGTTGCAATTCAGACCATGTTAAGGCAGATAATGACAGGTTTTGGTGAGTTAAGCTATTTTATGTACAGTGATAGCGACTCAGAGCCTACTGGCTCAGTCTCAAATCGAAATATGGAAAGGGCAGAGTCACGGAGTGGAAGAGGAGGTTCTGGTGGTGGTAGTAGTTCTGgttccagttcgagttccagttccagttcgagttccagttccagttcaagttccagttccagtcctagttccagttccGGTGGTGAAAGTTCAGAAACTAGCTCAGATTTATTTGAAGGCAGTAATGAAGGAAGCTCATCATCAGGCTCATCAGGTGCCAGGCGAGAGGGTCGACATAGGGCCCCAGTCACATTTGATGAAAGTGGCTCTTTGCCCTTCCTTAGCCTGGCTCAGTTTTTCCTCTTAAATGAGGATGATGATGACCAACCTAGAGGACTCACCAAAGAACAGATTGACAACTTGGCAATGAGAAGTTTTGGTGAAAATGATGCATTAAAAACCTGTAGTGTTTGCATTACAGAATATACAGAAGGCAACAAACTTCGTAAACTACCTTGTTCCCATGAGTACCATGTCCACTGCATCGATCGCTGGTTATCTGAGAATTCTACCTGTCCTATTTGTCGCAGAGCAGTCTTAGCTTCTGGTAACAGAGAAAGTGTTGTGTAATTAAGATCTGAACTCTCAGCTATGTAGCTGATATAGTGATGGGCAAACAGGAATCACTTGCTTTTATGTCCACTTTTTGAGTGGTACTTAAATGTAAAGTAACAACCTGAATTGAGTCATTGCTTTCTGAAGGAATCATTGTCCTTTCTCCAGTTTTTGTTCCAGAATAAAAGGAAATATTTTAAAAGCCACGTTATAGGACCTAAAAATCTGATTTCCGTACCAGTTAAATTGGTAGCATCACTGTTACTGATAATTTATCATATACACTTGTCAATTTTTCCTTTGTTATCTTAAAAGATCTGCCTTAGCAATGGCTCCTTTTTCATGTTGATCTTTAAATTTTCCCACACCATAAGAGAGGAGCAAAGGAAATTACCAGTTTAGACTAAGTTACAGTATGTGTTTCATAAGTGATTAAAGCTATATCATTCCCAGTTATTAGTTAACACAAATTCAGCCACATTCTGAGTATTGTTTGTTCACCTTTCAGACTTGGTGATACTGGACATGTCAGTGTAAATAACACTAAGGTTAGGATCTTCTAAGTGTATAACTGTCTCCTAAGCCCATCACTGTGGCACACTGTAGAGTGAGCTTATAGTTTAATTGAGATATTTATCTTGTGGAAATATTAAAAAGCCTATGCTTGTGTAAGTGAAAAAAAATCACATTCATTTGTTTAAAAATGTAAAGCTATTTTGTAGAGGCTCAGTACTTTTCCAATGCACTGTTGTATGAATGCATTAAAAATTGTAAAGTACCATGCTTAGAACTGAGAAAACTGCTTTTTGTGAGCCAACATAGTAACAAACACACCAAACAAAGTACAAAGCTGCTTTTGTAAGTGTGTAGATGTCAAGAGCAGAACATATCTATAATATTTAATGTGTGAACAGCTACTGTGACATGCAAAGGAAAGGACAGTGCAGAATTAAACCGTGTTGAAGACCAGTGGAAATTGTATAATTTAACTTGGATTTAGGCAGGAAGTGAAATATGGGAGGAGTAAAGAAAACTGAAGAATTTAAAGTTTTCCTGAAGACAGTAATAATGCAGACACAAACTGGTTTCATATGGTGAGAGCAGCCACAGCAGCAGCTTGACCTGGTATTCTACCTGAGTAGATGAAGCAGAAGATCAGCAAGTTTGGCAGAGTTTTGGTTTAAGAAAAACAAACCACTACTACCTAGCACAAGTTAAATTTACAAGTCTGCTCCTCAAAAATGAAAAAATGGAGGAAAGAGACTATAAAACCACTTTTAGCATATGAATTGCAGTTGGTACACATGTGTGTGTTAATAGGAAAGTCTCGAATTTGTGTTGTTTTTGAGATTTGTCATTTAAGGTACCAGTGCACACTTGATCATATTTCATTACTATCTCTAACACAGTCCTAACATCTCAAATTTAAAGACCAGTTGAAGATTAAGGGATTTTTATCCTTTGTTGAAAGTCATGTTGGGTTATTTGAAATTCAAATTTTAATtgtgctgcccatatatgaaaatgagactgctgactcgctatctatggacatgcactttatgttggtttcttagtagtaagagtaacttcatgataaccccagtcttcttgcctaatttcttttttgagactagctggggttaggattagaatgactatggagcagatatttgttcttctgggaaaagctttaacaggccaaaatagggattgaacttgtccttggcctTTATCAAAGCAAGCTAGCTACCCAGACGTAGTCAAATACTCTACAAAATAAACAAGTCTGCTTTAGGAATTGTCTGGGTACCTTCACTGTTACCAACTTAGCTGTAAAGATTATTTCAAAGCTCACTCTTCCATGATTTCTTCTGGCTTTCAATCCTATCTAAGTATCAAGGAAATTAACTTGTAAATATGGTAGTTGTTTACTAAGGATATGTACTGCTCTTGCAAGGAAATAATGTCCAAACAAAGCTTCACTTATTTTTTTTAATATAAGCAGATTTCACTGTTTATGGCGCTTATGTAATACATTTTATCTTTTTAAAAATTTGTCCGTGTAAAAGTCAGGATTCCTTTATATTTGTGAGCCTCCTTTTCTCCTTTCCTAAGGATGTAATCTACAGTTTTCAGATCTGCAGGGTAGTCTTGATTGGCTAAAAACAAATCAATTTTCTTCTTGGCATAAAGTGTTTCATTATTATAGGGGTGTTCATTTTAAATAGTTTAAAAACAATTGCAGCACATTCTAAGCATAAGAGAAAGTTATTGACAACAGGTACCTTCCTAATCTCCCAAGACGTACTTACTCATTTGTGAAGTATTAAAGTAAGAGGTAACTCAAGCAGAATGCTGGCTATGAATGTAGATATTGAAGCTATTCATAAACACTGGAAATAGAATTTTAAGCTTTTAGCCTTCAGTGGAATGCACATATTGGACATGTGCATGTGAACACCTTTTTCAGTAGCACTCACGGATTTCCATTCGATTGTATAGAATGAATACAAGTGTTTTAGTGGAATTTGCTACTTAATTTTTAATCTTGCGATGTCCGTGATTATTACATGCTTACTAGTGTTGTGGACATTGAAGACAAGGTCATTCGTAGGTGTCAGATTACAATGGAGAACAAAAATCGTTTTCCCCCCACCCACATCCAAACACCATTCTCGAGGGAGCATTTCTTGCAAAACACCTTACATTTCATTTTCTATCTTTGCACTTTTTCTTAAGTACAGAAAAGTTGTCTTTAAGACCTAGTTTGAACTTCATGCAGTAAGAGGAACAAGGATAAACAATGTTGGGAGTTCACATTGTTCAGAGCATAAGGAAAAGTACCAAAACCCAAATTTTCTTGAATATTTCAGATGTTTTTAAAAACTCACTTCTAGTCTGAAACATTTGA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