| Gene Name | C1GALT1 |
|
| Specie | Homo sapiens | |
| Full Name | core 1 synthase, glycoprotein-N-acetylgalactosamine 3-beta-galactosyltransferase 1 | |
| Also known as | C1GALT|T-synthase | |
| Coordinate | chr7:7182544-7248616 | |
| Strand | + | |
| Gene summary | The protein encoded by this gene generates the common core 1 O-glycan structure, Gal-beta-1-3GalNAc-R, by the transfer of Gal from UDP-Gal to GalNAc-alpha-1-R. Core 1 is a precursor for many extended mucin-type O-glycans on cell surface and secreted glycoproteins. Studies in mice suggest that this gene plays a key role in thrombopoiesis and kidney homeostasis.[provided by RefSeq, Sep 2010] |
| Retroname | Coord | Strand | Genomic Region | ENSG | |
|---|---|---|---|---|---|
| C1GALT1P1 | chr12:69284223-69285884 | + |
Intergenic |
ENSG00000257818 | UCSC |
| C1GALT1P2 | chr5:56192377-56196253 | + |
Intragenic |
ENSG00000251435 | UCSC |
| C1GALT1P3 | chr8:61909813-61910160 | - |
Intergenic |
ENSG00000253544 | UCSC |
| >NM_020156.5 |
| AGGAGACTTCGGGTGGCGGCTGCGCCATAGGCGGGCCACGGCCTGGACGCGCTGCGGGGAGGGGCGGAGCGAGCGGGCGGGAGCGCGCGCTGGGCCCGCCTTGGCCGCCGCCGCTGTGCTGCCGCTGCCGGGGAATAATCTGGGCGGCAGCGGGCGGCCTCGGCTAGCGGCCACGAGCCACTTCTGCGGCTGCCCAGAGAAGCAAAGGTCACCAGTCCCAAGTCGTCCCCCTCTCCGCCCCCCAGGAGGGGCGAGAGGGAGCCGCAGCTGATGTCAGAAATACACTTTCGGGAAATGGCCTCTAAATCCTGGCTGAATTTTTTAACCTTCCTCTGTGGATCAGCAATAGGATTTCTTTTATGTTCTCAGCTATTTAGTATTTTGTTGGGAGAAAAGGTTGACACCCAGCCTAATGTTCTTCATAATGATCCTCATGCAAGGCATTCAGATGATAATGGACAGAATCATCTAGAAGGACAAATGAACTTCAATGCAGATTCTAGCCAACATAAAGATGAGAACACAGACATTGCTGAAAACCTCTATCAGAAAGTTAGAATTCTTTGCTGGGTTATGACCGGCCCTCAAAACCTAGAGAAAAAGGCCAAACACGTCAAAGCTACTTGGGCCCAGCGTTGTAACAAAGTGTTGTTTATGAGTTCAGAAGAAAATAAAGACTTCCCTGCTGTGGGACTGAAAACCAAAGAAGGCAGAGATCAACTATACTGGAAAACAATTAAAGCTTTTCAGTATGTTCATGAACATTATTTAGAAGATGCTGATTGGTTTTTGAAAGCAGATGATGACACGTATGTCATACTAGACAATTTGAGGTGGCTTCTTTCAAAATACGACCCTGAAGAACCCATTTACTTTGGGAGAAGATTTAAGCCTTATGTAAAGCAGGGCTACATGAGTGGAGGAGCAGGATATGTACTAAGCAAAGAAGCCTTGAAAAGATTTGTTGATGCATTTAAAACAGACAAGTGTACACATAGTTCCTCCATTGAAGACTTAGCACTGGGGAGATGCATGGAAATTATGAATGTAGAAGCAGGAGATTCCAGAGATACCATTGGAAAAGAAACTTTTCATCCCTTTGTGCCAGAACACCATTTAATTAAAGGTTATCTACCTAGAACGTTTTGGTACTGGAATTACAACTATTATCCTCCTGTAGAGGGTCCTGGTTGCTGCTCTGATCTTGCAGTTTCTTTTCACTATGTTGATTCTACAACCATGTATGAGTTAGAATACCTCGTTTATCATCTTCGTCCATATGGTTATTTATACAGATATCAACCTACCTTACCTGAACGTATACTAAAGGAAATTAGTCAAGCAAACAAAAATGAAGATACAAAAGTGAAGTTAGGAAATCCTTGAAAGAAAATCATGAATGAACAAAGGTAATATGTCTAGCACTGCACTGAAAAAGGACTTCTGCATTTCTGACATAGAACACTGGAATCCCAGTGAGGAATTCTAAGTGAACATTCCTTATAGAAACCTTTCACATGAATGACTATAAACTGAAGCTTTAAATGAGCTGTGAAGTGTGTTAAAATGTGTTTTGATACAGTAatatataaatatgtctatatatatGAGGAACTTGTGTTTTTTAAATGGTGGCCAGGTAGAGGAACTAGAAAAGAGATTTTGTTGCCTGTTTTCTGACCATCTGTGTTATTGTCACTGAGAAACTAAAATAGTAAATTTACTAAAACTACACTGCACCATGTTAGTAATAAACAGATCTGCCTTAAAGAAAAGAAAATTTTAGAAAGAAATATTGTTGCTCAGTGTTGTTAATATAGCTCAAGAATTGAGTTTATATTTGCAGTATGCTATAAATGATACCCCCCTACCACACCCACACACACAGTTTTTGTCTAATGAAAATGTTGCTGTGATTATTTATAATTGGTAGTATTTCTTCCAGAAGAAGCTAAAATAAGACTGGCACTTACCCTGAAGTGCATTAATAAAACCACACTTTAAAATTATCATGGGCCTTGACTATATTATATACTTGATTCTAATTAGTCATCTTTTACGCAATCTCTGTTGTCTCTTTTCTAAATGTGTTTAGCCACTCTTGAATACCATTCTCCACTATTAACATTAATTTACTCAAACCGTTCATAGCATTCTGTAAACATGTATTTTACATATTTGTTCCCAAATTTGCCCATTGTTCATTATGGGTAACTAATAATAAATTTAATGCTGTTTCAGGATGCTTTTCTTATAACAGTGCCACTCTCAGGAATTACTAAGTGACATTTTAAATTGATATTTTAAACTCTTTCCAACTACATAGTTATGGTTTATTTCATTCTCATCCTGTTGGGATGAGAACTTGTTTGTGCCTTTCATAACTTGTTTAAAGCAGAGTTTTAAAATTAGTTTATAGGATCTGAGGTGGCTATTAGTTACAGTGGCAAGATTATTTAGAAAGCAAGATTTTGATGAGAATTAAAAACAATAGAAAATGTAGAGTGCTTAAACAAAAATGTTATATTTTGAAAGAGTAGATACTTAATTTATAAATAACAGTCTGAAGGTTGGTGCTATTTTGGGATAATTGTTTTGCTAATGGATAATTCTAACAATGCAGAATACCTAGTCAAGACTGTCATCAAAAACATTCACAAATGTTTCATTCTATTTTTAGTGACTCTGTTTAAAGAGTTTCTGAAAGGAAAGAAATTTTTTATTTTTATTATCTTTAGCAGTACTGAGTGTCATAGCAGAATATTTTACAGACTTTCTATGAGATTATTTTTATGGTACAAAGTATTTACATTTCCCTCATGTTTATCATTATGCCAATTTTACATGGCAGTCATGCCACTGACTCTGCTATTTAGCTAAGTAAtttcttttttcggagactgtctcactctgtctcccaggctggactgcagtggtgcgattctcctgcctcagcctcccgagtagcggggattacaggcacgcgctgccacgccccgccagttttcatatttttagtagagacagggttttgccgtgttggccaggctggtcttgaactcctgacctcaggtgatccacccaccttggcatcccaaagtgctgggattacgagcgtgagtcacagcacccggcTAAGTAATTTCTATTTATTGTGCCAAAACATGTCAAAATCATGACCTCTTTGAATGGTATATTTGAGAGGATGTTCATTTCATTGGTTAACCATGGACTACTCTGTCCACGTAGTGAAAACATGCACCAGTTTTTACCTATTATCATGGTAGTATCATCTGCCAAAATTTCAAGGCATTCATTTTATTCTTTGAACAACTCTTCACCATGGTGTGGACATGAATTTTCATATGTGTTACTTGACTAGAAGTATAAATGGTTTACTATAGATATCCAAAAACCTTGAGATTTGCTCATAGGAAATGAATATTGTGATGAATCCTgggctctagagtcagacttgcttgggtttaaattcttgctctaacacttactgtttttgtaaccttgagcaattttaatctctctgtgtctcaatttcctcatcttttaattagggatgataatactacctacctcacaggatttttatgaggattaaataaatgtaaggtttttagaacattgatagggagcaataaatagaagattgtattattattCTGTTACCTTGGAGTGTAAGTACTGCATTTAAGTGAATGAAAAATTTGCTTTGACCAGATACTGAAGGAAATAagtaatagctagtatttatccaatgccaactgtatgctaggtactgtgcttagataatctgtgtataatagtgttaatcctcaaaatttgggtgttatacccctattatagataaggaaactgaggctcagagacaaagtaactttgtcactgtcacaaagctagtaagtaacagaggtaggatttatattcaAAACCCTGTGTGTTCATTGGAACCGTATCAGGCTTGGGGCTATTCATGTAGCATTATTTCCATTTTTATGTATATGATATATGACGTCTGATGCATTGGCCAGTAATAGTCAAATTAACCCAGCCAAATTGTCAcagtgattcttaaactgtggttctcacacttgcccaggatgttgttaaatgcagatctgaagaccccaatctcagaaattcaaatttaagcatggggcccaagagtatgcattcttaccagataccttgggcagtgactgtcaaaagtctggtcccaacaaacagcattaacgtcacctgggaacttgttggaaatgcagcctctctcggggcctcatctcagatcagatctactaaatcagatactctaggggcaggggcaggggcaggggctagcagttgtgtttaagcaaactctgcaggtgtctttcttatcctagtttgagaaccaatacccaacaacctacgtgattttggtgcaagtagtgtttgaaacacactgAAGATTACTGCCCAATTACTAAGACATTTTTCAAAAAGCATGTTTTAAATCAGTGTAGTCCAGGATCACACTATATTAAATATAAAGATAACTTAAAGGATCATTGGATCATTCATTTTGGCCAAATTTTTAGCTTCTCCAAAGTGACTAACATCAGGGCCTACAATAAAATCTGTAATTCTCCAAGTTTAGTAATTTTATATTGAGGCAGGAAGGGCTCATTAAGTACTAATAAGTACATAATTTATTAAAAACATACATAAGTGTCATCAAAAAGGTCCACAATTGTTAGTAAAAAAAATTAAATTGAAGTAGTAAATGCTGTTTTATAACATACATTTTTCTGCTAATTCATTCTGTTTTGTGTGACCTAATAAAGCAAAAGAAAAATAAAAAAGCAATTCTCCAAGTACTTCATAGAGCACATAAAACCAGATTTCATGATGATGATGTATTCACTATCTTTTAGATTAAGATCTTTGTTATTTGGTAAATGATTTCAGTATGGTTTTAAAACATAAGGCTTTTGATGTCTTATGTT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