Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SINHCAF
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr12) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name SIN3-HDAC complex associated factor
Also known as C12orf14|FAM60A|L4|TERA
Coordinate chr12:31280584-31326218
Strand -
Gene summary Involved in negative regulation of cell migration. Part of Sin3 complex. [provided by Alliance of Genome Resources, Apr 2022]

Retrocopy(s) from SINHCAF

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SINHCAFP4 chr12:98317605-98320526 + Intergenic
ENSG00000257580 UCSC
SINHCAFP1 chr18:26254354-26256465 - Intragenic
ENSG00000263829 UCSC
SINHCAFP3 chr8:23632143-23635633 - Intergenic
ENSG00000253488 UCSC
SINHCAFP2 chr18:60014643-60017580 - Intergenic
ENSG00000267742 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001135812.2
AGAACTGCAGGAGACTATCTTTCTAGACAAGGCAGTTGAGGAGGAGGGAGCGCTTGAGGGGGACTGGCCTGGCGTGCACTCCGCACCTCGGGGACATTATTGCGCGTGGAACGGCTGCTTTTGGAAGACTATTGCCCAGAAGAAAAGATGTTTGGTTTTCACAAGCCAAAGATGTACCGAAGTATAGAGGGCTGCTGTATTTGCAGAGCTAAGTCCTCCAGTTCTCGATTCACTGACAGTAAACGCTATGAAAAGGACTTCCAGAGCTGTTTTGGATTGCATGAGACTCGTTCAGGAGACATCTGCAATGCCTGTGTCCTGCTTGTGAAAAGATGGAAGAAGTTGCCAGCAGGATCAAAAAAAAACTGGAATCATGTGGTAGATGCAAGGGCTGGACCCAGTCTAAAGACTACATTGAAACCAAAGAAAGTGAAAACTCTATCTGGGAACAGGATAAAAAGCAACCAGATCAGTAAACTGCAGAAGGAATTTAAACGTCATAATTCTGATGCTCACAGTACCACCTCAAGTGCCTCCCCAGCTCAATCTCCTTGTTACAGTAACCAGTCAGATGACGGCTCAGATACAGAGATGGCTTCTGGTTCTAACAGAACACCAGTTTTTTCCTTTTTAGATCTCACTTACTGGAAAAGACAGAAGATATGTTGTGGGATCATCTATAAAGGCCGTTTTGGGGAAGTCCTCATTGACACACATCTCTTCAAGCCTTGCTGCAGCAATAAGAAAGCAGCTGCTGAGAAGCCAGAGGAGCAGGGGCCAGAGCCTCTGCCCATCTCCACTCAGGAGTGGTGACTGAGGTTTTTATGTAGAAGGGGAACAAAAAAAAAAATATCTGAATTTTGAAAAACCACAAAGCTACAAACTGACCCTCttttttttttgagacggagttttgctcttgttacccaggctggagtgcagtggcgtgatcttggctcactgcaacttccgtctcccgggttcaagtgattctcctgcctcagcctcccaagtagctgggtttataggtgcccgccaccagacccggctaattttttagttttagtagagacggggtttcaccacgttggccaggctggtcttaaaTGACCCTCTTATTTTTAACTTGGATACCTGCTATTCTGCCAAAAGACAATTTCTAGAGTAGTTTTGAATGGGTTGATTTCCCCCACTCCCACAAACTCTGAAGCCAGTGTCTAGCTTACTAAAAAAAGAGTTGTATATAATATTTAAGATGCTGAGTATTTCATAGGAAAGCTGAATGCTGCTGTAAAGTGCTCTTTAAGTCTTTTTTTTTTTTAATCCCCTTCTAATGAATGAAACTAGGGGAATTTCAGGGGACAGAGATGGGATTTGTTGTATGATAAACTGTATGTAGTTTTTAGTCTTTCTGTTTTGAGAAGCAGTGGTTGGGGCATTTTTAAGATGGCTGGCTACTCTTGTTTTCCCTCATGATAATAAATTTGTCATAACTCAGTAACATGAACTTGCCCCTAGAGGTAGTTGTTAATAATTTTGAAATATTAAGGTCTTGCCAAGCTTCTGATGATTCACACCTGTACTACTGATTATTAAGCAGGACAGACTGAGCTTTCTGTTGCAAATACCTTGGAGGAGAAAGTAATTTCTAAATATACAGAGAGGTAACTTGACTATATATGTTGCATCCTGTGCCTCCCTTCATATTAATATTTGATAAAGATTTTAATTTATGTAAAACTTCTAAAGCAGAATCAAAGCTCCTCTTGGGGAAATGGCAAGTCTTTAGGATAGGCAAGACCCTGTATGAATAGTACCAAAGCATTACCGCATGGTAGAGAACACACTCGATTAAAAATGTTAAGCTATCTGAAAAATAAAATGTGCAAGTCTTCAGGATGGCACAAAACAAAGGTTAATGCTTCTTGGGGCACATTTCTTAGAGGGCTTGCTGAGTGTGTAAATATAATCGACTTTTGTTTGTGTTACATGACTTCTGTGACTTCATTGAAAATCTGCACAATTCAGTTTCAGCTCTGGATTACTTCAGTTGACCTTTGTGAAGGTTTTTATCTGTGTAGAATGGGTGTTTGACTTGTTTTAGCCTATTAAATTTTTATTTTCTTTCACTCTGTATTAAAAGTAAAACTTACTAAAAGAAAAGAGGTTTGTGTTCACATTAAATGGTTTTGGTTTGGCTTCTTTTAGTCAGGCTTTCTGAACATTGAGATATCCTGAACTTAGAGCTCTTCAATCCTAAGATTTTCATGAAAAGCCTCTCACTTGAACCCAAACCAGAGTACTCTTACTGCCTCTTTTCTAAATGTTCAGGAAAAGCATTGCCAGTTCAGTCTTTTCAAAATGAGGGAGAAACATTTGCCTGCCTTGTAATAACAAGACTCAGTGCTTATTTTTTAAACTGCATTTTAAAAATTGGATAGTATAATAACAATAAGGAGTAAGCCACCTTTTATAGGCACCCTGTAGTTTTATAGTTCTTAATCTAAACATTTTATATTTCCTTCTTTTGGAAAAAACCTACATGCTACAAGCCACCATATGCACAGACTATACAGTGAGTTGAGTTGGCTCTCCCACAGTCTTTGAGGTGAATTACAAAAGTCCAGCCATTATCATCCTCCTGAGTTATTTGAAATGATTTTTTTTGTACATTTTGGCTGCAGTATTGGTGGTAGAATATACTATAATATGGATCATCTCtacttctgtatttatttatttattACTAGACCTCAACCACAGTCTTCTTTTTCCCCTTCCACCTCTCTTTGCCTGTAGGATGTACTGTATGTAGTCATGCACTTTGTATTAATATATTAGAAATCTACAGATCTGTTTTGTACTTTTTATACTGTTGGATACTTATAATCAAAACTTTTACTAGGGTATTGAATAAATCTAGTCTTACTAGAAAATAAAA
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>XM_011520803.2
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