Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

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Summary

Gene Name FXN
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr9) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Pan troglodytes
Full Name frataxin
Also known as -
Coordinate chr9:57441963-57505485
Strand -
Gene summary N/A

Retrocopy(s) from FXN

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
FXNP1 chr3:27696216-27696512 + Intergenic
 N/A UCSC
FXNP2 chr9:97232261-97234463 - Intragenic
 N/A UCSC
FXNP3 chr14:58841615-58842159 - Intergenic
 N/A UCSC

Expression

Transcript Sequences

>XM_016960930.1
ACCCAACTGCTGTAAACCCATACCGGCGGCCAAGCAGCCTCAATTTGTGCATGCACCCACTTCCCAGCAAGACAGCAGCTCCCAAGTTCCTCCTGTTTAGAATTTTAGAAGCGGCGGGCCACCAGGCTGCAGTCTCCCTTGGGTCAGGGGTCCTGGTTGCACTCCGTGCTTTGCACAAAGCAGGCTCTCCATTTTTGTTAAATGCACGAATAGTGCTAAGCTGGGAAGTTCTTCCTGAGGTCTAACCTCTAGCTGCTCCCCCACAGAAGAGTGCCTGCGGCCAGTGGCCACCAGGGGTCGCCGCAGCACCCCGCGCTGCAGGGCGGAGCGGGCGGCAGACCCGGAGCAGCATGTGGACTCTCGGGCGCCGCGCAGTAGCCGGCCTCCTGGCGTCCCCCAGCCCGGCCCAGGCCCAGACCCTCACCCGGGTCCCACGGCCGGCAGAGTTGGCCCCACTCTGCGGCCGCCGGAGCCTGCGCACCGGCATCGATGCGACCTGCACGCCCCGCCGCGCAAGTTCGAACCTCCGTGGCCTCAACCAGATTTGGAATGTCAAAAAGCAGAGTGTCTATTTGATGAATTTGAGGAAATCCGGAACTTTGGGCCACCCAGGCTCTCTAGATGAGACCACCTATGAAAGACTAGCAGAGGAAACGCTGGACTCTTTAGCAGAGTTTTTTGAAGACCTTGCAGACAAGCCATACACGTTTGAGGACTATGATGTTTCCTTTGGGAGTGGTGTCTTAACTGTTAAACTGGGTGGAGATCTAGGAACCTACGTGATCAACAAGCAGACGCCAAACAAGCAAATCTGGCTATCTTCTCCATCCAGGTATGTAGTGGACCTAAGCGTTATGACTGGACTGGGAAAAACTGGGTGTACTCCCACGACGGCGTGTCCCTCCATGAGCTGCTGGCCGCAGAGCTCACTAAAGCCTTAAAAACCAAACTGGACTTGTCTTCCTTGGCCTATTCCGGAAAAGATGCTTGATGCCCAGCCCCGTTTTAAGGACATTAAAAGCTATCAGGCCAAGACCCCAGCTTCATTATGCAGCTGAGGTCtgttttttgttgttgttgttgttgttTATTTTTTTTATTCCTGCTTTTGAGGACAGTTGGGCTATGTGTCACAGCTCTGTAGAAAGAATGTGTTGCCTCCTACCTTGCCCCCAAGTTCTGATTTTTAATTTCTATGGAAGATTTTTTGGATTGTCGGATTTCCTCCCTCACATGATATCCCTTATCTTTTATAATGTCTTATGCCTATACCTGAATATAACAACCTTTAAAAAAGCAAAATAATAAGAAGGAAAAATTCCAGGAGGAAAAATGAATTGTCTTCACTCTTCATTCTTTGAAAGATTTACTGCAAGAAGTACATGAAGAGCAGCTGGTCAACCTGCTCACTGTTCTGTCTCCAAATGAGACACATTAAAGGGTAGCCTACAAATGTTTTCAGGCTTCTTTCAAAGTGTAAGCACTTCTGAGCTCTTTAGCATTGAAGTGTCGAAAGCAACTCACACGGGAAGACCATTTCTTATTTGTGCTCTGTGACTGCCAAGGTGTGGCCTGCACTGGGTTGTCCAGGGAGACCTAGTGCTGTTTCTCCCACATATTCACATATGTGTCTGTGTGTATATATATTTTTTCAATTTAAAGGTTAATATGGAATCAGCTGCTACAAGAATGCAAAAAATCTTCCAAAGACAAGAAAAGAGGAAAAAAAGCCGTTTTCATGAGCTGAGTGATGTAGCGTAACAAACAAAATCATGGAGCTGAGGAGGTGCCTTGTAAACATGAAGGGGCAGATAAAGGAAGGAGATACTCATGTTGATAAAGAgagccctggtcctagacatagttcagccacaaagtagttgtccctttgtggacaagtttcccaaattccctggacctctgcttccccatctgttaaatgagagaatagagtatggttgattcccagcattcagtggtcctgtcaagcaacctaacaggctagttctaattcCCTTTGGGTAGATGAGGGGATGACAAAGAACAGTTTTTAAGCTATATAGGAAACATTGTTATTGGTGTTGCCCTATCGTGATTTCAGTTGAATTCATGTGAAAATAATAGCCATCCTTggcctggcgcggtggctcacacctgtaatcccagcacttttggaggccaaggtgggtggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatgatgaaaccccgtctctactaaaaatacaaaaaattagccgggcatgatggcaggtgcctgtaatcccagctactcgggaggctgaggcagaagaatcgcttgaacccagaggtggaggttgcagtgagccgagatcgtgccattgcactgtaacctgggtgactgagcgaaactctgtctcaaaataataataacaataaaaTAATAATAATAGCCATCCTTTATTGTACCCTTACTGGGTTAATCGTATTATACCACATTACCTCATTTTAATTTTTACTGACCTGCACTTTATACAAAGCAACAAGCCTCCAGGACATTAAAATTCATGCAAAGTTATGCTCATGTTATATTATTTTCTTTAAGAAGGATTTATTAGTGgctgggcatggtggcgtgcacctgtaatcccaggtactcaggaggctgagacgggagaattgcttgacgccgggcggaggaggttacagtgagtcgagatcgtacctgagcgacagagcgagactccgtctcaaaaaaaaaaaaaaaGGAGGGTTTATTAATGAGAAGTTTGTATTAATATGTAGCAAAGGCTTTTCCAATGGGTGAATAAAAACACATTCCATTAAGTCAAgctgggagcagtggcatatacctatagtcccagctgcacaggaggctgagacaggaggattgcttgaagccaggaattggagatcagcctgggcaacatagcaagatcctatctcttaaaaaaagaaaaaaaAAACCTATTAATAATAAAACAGTATAAACAAAAGCTAAATAGGTAAAATATTTTTTCTGAAATAAAATTATGTTTTGAGTCTGATGGAAATGTTTAAGTGCAGTAGGCCAGTGCCAGTGAGAAAATAAATAACATCATACATGTTTGTATGTGTTTGCATCTTGCTTCTACTGAAAGTTTCAGTGcaccccacttacttagaactcggtaacatgatgtactcctttatctgggacacagcacaaaagaggtatgcagtggggctgctctgacatgaaagtggaagttaaggaatctgggctcttatggggtccttgtgggccagcccttcaggcctattttactttcattttacatatagctctaattggtttgattatctcgttcccaagGCAGTGGGAGATCCCCATTTAAGGAAAGAAAAGGggcctggcacagtggctcatgcctgtaatcccagcactttgggaggctgaggcgagtggatcacctgaggtcaggagttcaagaccagcctggccaacatggcaaaatcccatctctactaaaaatattaaaaaattggctgggcatggtggttcgtgcctataatttcagctactcaggaggctgaggcaggagaatcgctgtaacctggggggtggaggttgcagtgagacgagatcatgccacttcactccagcctggccaacagagccgtactccgtctcaaataaataaataaataaataaataaaGGGACTTCAAACACATGAACAGCAGCCAGGGGAAGAATCAAAATCATATTCTGACAAGCAAACTGGAAAAGTACCACtgtgtggaccaatagcctccccactgcagaccctgggagcatcgcctcatttatggtgtggtccagtcatccatgtgaaggatgagtttccaggaaaaggttattaaatattcactgtaacatactggaggaggtgaggaattgcataatacaatcttagaaaACttctttttcccctttctattttttgagacaggatctcactttgtcactcaggctggaggacggtggtacaatcaaagctcatggcagcctcgacctccctgggcttgggcaatcctcccacaggtgtgcacctccatagctggctaatttgtgtattttttgtagagatggggtttcgccatgttgcccaggctggtctctaacacttgggctcaagtgatccacctgcctcgtcctcccaagatgctgggattacaggtgtgtgccacAGGTGTTCATCAGAAAGCTTTTTCTATTATTTTTACCTTCTTGAGTGGGTAGACCCTCAGCCACATAGAAAATAAAATGTTCTGGCATGACTTATTTAGCTCTCTGGAATTAcaaagaagcaatgaggtgtgtaaaagagaacctggatttttgaatcacaaatttagaatttaatcgaaactctgcctcttacttgtttgtagacactgacagtggcctcatgtttttttttttttttaaatctataaaatggagataTCTAACATGTTGAGCCTGGGCCCACAGGCAAAGCACAATCCTGATGTGAGAAGTACTCAGTTCACGACAACTATTGTTTTCACATGCATAGCATAATTTCATATTCACATTGGAGGACTTCCCCCAAAATATGGATGACGTTCCCTACTCAACCTTGAACTTAATCAAAATACTCAGTTTACTTAACTTCGTATTAGATTCTGATTCCCTGGAACCATTTATCGTGTGCCTTACCATGCTTATATTTTACTTGATCTTTTGCATACCTTCTAAAACTATTTTAGCCAATTTAAAATTTGACAGTTTGCATTAAATTATAGGTTTACAATATGCTTTATCCAGCTATACCTGCCCCAAATTCTGACAGATGCTTTTGCCACCTCTAAAGGAAGACCCATGTTCATAGTGATGGAGTTTGTGTGGACTAACCATGCAAGGTTGCCAAGGAAAAATCGCTTTACGCTTCCAAGGTACACACTCAGATGAAAGTAATTTTAGTCCGTGTCCAGTTGGAT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