Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name TBL1XR1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr3) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name TBL1X/Y related 1
Also known as C21|DC42|IRA1|MRD41|TBLR1
Coordinate chr3:177019344-177197482
Strand -
Gene summary This gene is a member of the WD40 repeat-containing gene family and shares sequence similarity with transducin (beta)-like 1X-linked (TBL1X). The protein encoded by this gene is thought to be a component of both nuclear receptor corepressor (N-CoR) and histone deacetylase 3 (HDAC 3) complexes, and is required for transcriptional activation by a variety of transcription factors. Mutations in these gene have been associated with some autism spectrum disorders, and one finding suggests that haploinsufficiency of this gene may be a cause of intellectual disability with dysmorphism. Mutations in this gene as well as recurrent translocations involving this gene have also been observed in some tumors. [provided by RefSeq, Mar 2016]

Retrocopy(s) from TBL1XR1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
TBL1XR1P1 chr6:127658608-127659906 - Intergenic
ENSG00000219699 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001374327.1
GAACCGTTTGGCTCTTTCCCTTAGTAACAGCTTTTACCTTCTGCCTCAATTCCTCTCCCCGCTCGCGCCCTTCCCCCGCGCGCCGCCTCCCCCCGCCGCCGGCCGCGTGCGCCCCCGCCCCTCCCCCCGCGGCGGGAGCACCTCCGCTCGCCACCTGGGGACCCGCGCCGCGCTCCCCGCCCCCGCCCGCCCGGCGCCCATCCCCCGCGCCCTCCGCTCGCTGGGGTTATAATTGCCTCTCACCCCCCGGAGGGGTTATTTTGGGGGTGGTTggaggcggtggcggcggcggcgAGGAGGGGAATTTCCTTGTGCCTCCATTCCCGGGAGGGGGGAGCGGCGTTGGAGGCCACCGTTTCCAGGGTTATATCCTGTGTTGTGACCTCATGGTTTAAGTGGGAATAAAGATGAGTATAAGCAGTGATGAGGTCAACTTCTTGGTATATAGATACTTGCAAGAGTCAGGATTTTCTCATTCAGCATTTACCTTTGGTATAGAAAGCCATATCAGTCAGTCCAATATAAATGGTGCCCTCGTCCCACCCGCTGCATTGATTTCTATCATCCAGAAAGGTCTACAGTATGTAGAAGCAGAAGTTAGTATTAATGAGGATGGTACCTTGTTTGATGGTCGACCAATAGAGTCTCTGTCCCTGATAGATGCCGTAATGCCTGATGTAGTACAAACAAGACAACAAGCTTATAGAGATAAGCTTgcacagcaacaggcagcagctgctgcagctgccgcagctgcagccagcCAACAAGGATCTGCAAAAAATGGAGAAAACACAGCAAATGGGGAGGAGAATGGAGCACATACTATAGCAAATAATCATACTGATATGATGGAAGTGGATGGGGATGTTGAAATCCCTCCTAATAAAGCTGTTGTGTTGCGGGGCCATGAATCTGAAGTTTTTATCTGTGCCTGGAACCCTGTTAGTGATCTCCTAGCATCAGGGTCTGGAGACTCAACAGCAAGAATATGGAATCTTAGTGAGAACAGCACCAGTGGCTCTACACAGTTAGTACTTAGACATTGTATACGAGAAGGAGGGCAAGATGTTCCAAGCAACAAGGATGTCACATCTCTAGATTGGAATAGTGAAGGTACACTTCTAGCAACTGGTTCCTATGATGGGTTTGCCAGAATATGGACTAAAGATGGTAACCTTGCTAGCACCTTAGGGCAGCATAAAGGCCCTATATTTGCATTAAAATGGAATAAGAAAGGAAATTTCATCCTAAGTGCTGGAGTAGACAAGACTACAATTATTTGGGACGCACATACTGGTGAAGCCAAGCAACAGTTTCCTTTTCATTCAGCACCAGCATTGGATGTTGATTGGCAGAGCAACAACACCTTTGCTTCTTGTAGTACAGATATGTGCATTCATGTCTGTAAATTAGGACAAGACAGACCTATTAAAACATTCCAAGGACATACGAATGAAGTAAATGCTATCAAATGGGACCCAACTGGCAATCTCTTGGCCTCCTGTTCTGACGACATGACTTTAAAGATATGGAGTATGAAACAAGACAATTGTGTCCATGATTTGCAAGCACATAATAAAGAAATTTATACTATCAAATGGAGTCCAACAGGACCAGGGACTAATAATCCAAATGCCAACCTTATGTTAGCAAGTGCATCCTTTGATTCTACTGTTAGGTTATGGGATGTAGACCGAGGGATATGCATCCATACCTTGACAAAACACCAAGAGCCTGTGTACAGTGTAGCTTTCAGTCCTGATGGCAGGTATCTGGCAAGTGGTTCTTTTGACAAATGTGTACACATCTGGAACACGCAGACAGGTGCTCTAGTTCACAGCTATAGGGGAACAGGTGGAATATTTGAAGTTTGCTGGAATGCAGCAGGAGACAAAGTTGGAGCCAGTGCATCAGATGGTTCAGTTTGTGTATTAGACCTTCGGAAATAGCGCTACTAGTTGGAAGCCATGGACCGACTATGAATGTGTACATAGCCAAAATGACTGTCCCTGACCCATGTACTGCTATAGTCCCACTTGAACCATGGCCAGTCCACTACAGCCAAATCTAAAAGAAATATATACATACAGTGTATATAAACAAAATTGCACCCTGAAGATGACAGAGTTTTGTCACAGCTTGTGAATTCTGTTCACCAAGTGCTGGAATCTAATCTGCTGTGCCCCTAAAATAGCATTTAGAAGTTTTGGATATGAAAAACAGAAGAGAGAAAAATATACATTATAAAAGCAGAACATACATGTACCAGTTTTTGGATACTAAATGACAGCCTTGTTTCTCCCCTTTGAATCAGCAGACACCATGGATTATATTCTTTTTTTCCCTTCAGTAGTGAGCAGTTTGTATGTACAGAGAAAATGGACTTACAAAAACTTGCAGCAGTAGTTTGTTCTTGCTTTAAAATTTCGTTTTTGGTTTAGATTATGGATGCATGAAGTAAGGGAGTGAATCAGTTTCTTGTTTATATTTTTTTCACCTTTTAAACAAAAAATTCTTTAAAATATTTTAATGCATTCTTTTGAAGAGGTAGATGTTTGGTACATTTTATGGCTCCCAGAGCATATATTCAGTTGGTGCATGTTGTGGAAGGGGGAATTGGAAATTAAATGAAAACCTATGACTTTGGTCATGTCAATCTGTAAGACACATCAGTAAAAGGGTATTATGCTCTGTTGGttttgtttttttgttttgctttttttttttttttttcttttttgttttttgGTGATGTGGCTTAAATGCAATAGTTTCTTTTTTGGGACATATTTCTGCCAATTAAAGACTAGAAGGGCACAACTTTTTTTTTAATTACCATAGAGAAGATACATTAAAAAAAATCTTCTGATGTTTTGTAGCCATAACTAAATTATGGTAAAAATGTGCACTATTGTGAAAAGGAGCAACGTAgttttgggttttttgttgtttgtttgttttgctttgttttttAAGAGATTAAAATGTTTCTGGATAAGGATTAGCTTCTCGAAGTGTCCATCATTCTGTGTAGAAGCTTAAATATGTAATGTAACCAAACTCCAGTATTAAAAATCTCTCATGTTGTTTTCTTTATACAAAGCAAGATAACGGCATATAACACTGCCATTACATGGCAAAATGTTTGCTACCTTAGTTTAAAAAACAATCTCAAACAAAAGACTTGCTTCAAGGTGTTTTTAAATAGCAGTGATTCAGAATTTTTTTTAATGAAAGTATAATTGCACTAACCTTCTTCCTGCTGCTCTGATTCTGCATTTGTGGTACTTGTGACTACGTTTTTTCAAATATAGATAGATTTAAGCTGCTAATTTTTTTTTTTTTAGTAATCACTACTATATCATGTCTTTTACTCTGTTTATAATATCAAGTATTTTCTTAAAGATATAGATATTAAACCTTGTGCTCATGCAACTTAGAGTAACATATACAGACAAATGATTGCATGAGGCCATGTTTATATGTGTGACTAATAAGGCTTGTCATGATTAACATAATCCAGGTATGTCATTTCTGAAGAGAATAGTCATCAAATTTATATCTCGAAGATTTTAATTAAGGAATTGCTTATTGTTGAGCTTAGCAAATTAATAACACTATTTCTGTCACTAATTATTTTGAGGCCTTTTAGTACTAAAATTTTAACCTGTGTTCTAAGTAGAAACTGATTTAACCCAAGTAATGCAGCTTTGATTGATTTCAGCATTCGTTGCTTTGCTATTTTTACAAAACAGCATTGATTGAAGCAAGTCTTGGTTTTACTAAGGTAGGGTAGCATTTGCTATTGGTAAAGAGAATAAATACACTTAATTTCACAATACATTGTTATATGTACCCCAGTTGTTGTTAGTGGGGACTATGATACTGTAATAATATTTTTAAAAATTTACATCAAGAGAGGCAGTCATTCACGATGGTTTTGTGCCAGCTCTTTTTAGGGTTTTGGATCACATTAGAGATATTTAGAACATATTACCCTGTGACTTACGTAGGAAACCTAATATGCTGAGTATCTGGCACTTGAATTCCTGCTTTTATTGCTGGAGGTCCACATCTGTGGTTGACCTCTGTTATTGTTTaaaaaaaataaataaaaattaaaaaaaTCTGTGCAATAATTTTAAAATGTGCTCCCAGGAATAGACACAAATGTTTTGAGTATCTTTTAAGCTGCATTTTCCTTTAGTGATGCATTTGTCAATTGCACTGAATTTAAATCTGAAAGTCAGAGGTGATTATTGATAGTACTTTTGTATTTTGATATGGACAGTTTATTCATTTGCATACAGTTATTGACTTTTTCCCAGCTGATTAAAAGATAGTCAAGAAATTCTGCAATATAGCTGCCAAAATAGACAGCTACATTTTTATGATATTGTCATCttttctgttttttttttcttttttttctttAGCTATTTTACTTAAGCATAATAGCCACAATAGGACATATAAAAGATTATAAATACAGAGCTTTATTATCCTGACGTCTTGGGTCTTTTAAGTATATACTTTTCTGAAAGGTATCCATTTTGTAGGCTTGGGTTCttcatgagcatacgattgtttatttttgctgctgttctcaacatcatcattgcctgctgatgtgccacgatgcTGCTCCAATAGACAGCAATAAGATTGTCTCTAATTTGAGCAGTAACATGATTGCAAGAGACCAAGTTTCACAGCTTGTAAAGTTCTGTATTTGGGATTCTTGCTTATTTTTCCGCCTGTGTTTTTCTGAGAACTTATTCCTGATGATCAATTGAATCCAGTAGTTTTTCTATGCTATTTGTTGTTGTATAAGCTACTGTAAGAAACTTATCATAAGGAAAAATAGAAAGGAAAACTTGAATCAATACTCATTGATTAAAATGGAATAAAGAAAGAGCAGCTGCCACTTTTAAACAACATAAAGGAATATCTTTTTTTGTCTCCGTGTAGGAAATCCCATAAGTTCTTATATTTGT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