Imagem 1

Example: RPL12P6, GAPDH, ENSG00000237984

Summary

Gene Name SCAMP1
Plot displaying the genomic locations of a parental gene (in chr5) and its retrocopy(ies). Each line represents a retrocopy.
Specie Homo sapiens
Full Name secretory carrier membrane protein 1
Also known as SCAMP|SCAMP37
Coordinate chr5:78360530-78480739
Strand +
Gene summary This gene product belongs to the SCAMP family of proteins, which are secretory carrier membrane proteins. They function as carriers to the cell surface in post-golgi recycling pathways. Different family members are highly related products of distinct genes, and are usually expressed together. These findings suggest that these protein family members may function at the same site during vesicular transport rather than in separate pathways. A pseudogene of this gene has been defined on chromosome 1. Alternative splicing results in multiple transcript variants. [provided by RefSeq, Mar 2014]

Retrocopy(s) from SCAMP1

Retroname Coord Strand Genomic Region ENSG
SCAMP1P1 chr1:96390650-96391230 + Intergenic
ENSG00000225923 UCSC
SCAMP1P2 chr5:63023197-63023362 - Intergenic
ENSG00000249579 UCSC

Expression

Transcript Sequences

>NM_001290229.2
GCCTCGTCTCTCTCTCTGCGCCTGGGTCGGGTGGGTGACGCCGAGAGCCAGAGAGATGTCGGATTTCGACAGTAACCCGTTTGCCGACCCGGATCTCAACAATCCCTTCAAGCCTCCACCAGGCGGTGTGAAGATGCCTAATGTACCCAATACACAACCAGCAATAATGAAACCAACAGAGGAACATCCAGCTTATACACAGATTGCAAAGGAACATGCATTGGCCCAAGCTGAACTTCTTAAGCGCCAGGAAGAACTAGAAAGAAAAGCCGCAGAATTAGATCGTCGGGAACGAGAAATGCAAAACCTCAGTCAACATGGTAGAAAAAATAATTGGCCACCTCTTCCTAGCAATTTTCCTGTCGGACCTTGTTTCTATCAGGATTTTTCTGTAGACATTCCTGTAGAATTCCAAAAGACAGTAAAGCTTATGTACTACTTGTGGATGTTCCATGCAGTAACACTGTTTCTAAATATCTTCGGATGCTTGGCTTGGTTTTGTGTTGATTCTGCAAGAGCGGTTGATTTTGGATTGAGTATCCTGTGGTTCTTGCTTTTTACTCCTTGTTCATTTGTCTGTTGGTACAGACCACTTTATGGAGCTTTCAGGAGTGACAGTTCATTTAGATTCTTTGTATTCTTCTTCGTCTATATTTGTCAGTTTGCTGTACATGTACTCCAAGCTGCAGGATTTCATAACTGGGGCAATTGTGGTTGGATTTCATCCCTTACTGGTCTCAACCAAAATATTCCTGTTGGAATCATGATGATAATCATAGCAGCACTTTTCACAGCATCAGCAGTCATCTCACTAGTTATGTTCAAAAAAGTACATGGACTATATCGCACAACAGGTGCTAGTTTTGAGAAGGCCCAACAGGAGTTTGCAACAGGTGTGATGTCCAACAAAACTGTCCAGACCGCAGCTGCAAATGCAGCTTCAACTGCAGCATCTAGTGCAGCTCAGAATGCTTTCAAGGGTAACCAGATTTAAGAATCTTCAAACAATACACTGTTACCTTTTGACTGTACCTTTTTCTCCAGTTACTGTATTCTACAAATATTTTTATGTTCAAAACACACAGTACAGACAGCATGGATATTTCCTGTTCACTTGTGCATGGGCTAAAACCAGGAAAACTTCCTTGTCTTATTACTTTACCTAATAGTTTCTTAATATTTCAGTGCCCCTTGCAGAAAAAATATTACATGCTAAATAAATATTCTCCATATTTTTGGGGGATGACATTCAGTGAATTATTTCAGTGGTGACCCACTGAAAATTAATAATGGTACTTATGATTAAAAACGCATTTAATACTAACTGCAGTAGTTCTTTCAAGAATCTTTAGAGATAAGGATTGCACATTGGAAAAGTAAACCATGTTTCATTCCTTTTTCCCTATTTATATTGAAAGAAATAGGCCAGCAGAGACTTAGGGATTTTAAATTGGCTTGCTTTTTAGCTGTTTCAGTCACCAGTGAAGAGCCTATGTGCATTTTGTAGTAGATAATGTAAAATTTGTCATCTTTTTCTTTTCTTTTTTTTAGAATAGCTGATATTTTGATAACAATCTCTAATTTGCATGGGCACCACATTTCTTATATTAAAAGAATTAGTGTTTTGGCTTCTGTACTGCTTATGGTTGTAGGATTCAGGGGTTAATGGAATCACAGAAATGATATTCTGCAAGAATTTCTTTTAAATAAAAAGTTTGGGGGTGCAATATAAGAAGTTTATATAATATGCAGTACATTATCCAAAAGAGAAGGTAGTTAATGCAGTAGAAAGTAGTGGTAATAATTCCTTTTTAAAAAAATTTCGGTAGTCATATAGTAACATTTTGCTATATGAAAACTTTGGTATATTCTGTGGTTACAACTAAGATTGTGTCTGGCAGCTCTTTTTTGGGGATGTGTGTGTGTGATTTTTAACAGAGGTATTAAAGGCTAGCCTAACTGTTGTCTAAAAAGATTGTACAGTATTTAAGGGATTTTCCTTTTAGCTTTTCATCTCCAGTGGCATTAAACATAAAAAGACCCTGGCATTTTTTCACATACTTGAATCCCTAAATGCACCTGTCTTTCACTTTTTGAGACAGACTGAATATATCTAAAATTTCCAGCAATAAAAAAAAAAGCATTTAACTTGCACCAAGCAAGAAAATATAAATACAGTTAACTGCATTAAGATAATCACGTTAAAATTGTTACTATGCAGCACAGAACTTCATTCTTATAGTATTCTTGGGTTCAACCTTTGAATCAATTTTACCACTGATTAAATAAATGACTCAAAGACATCTGTAAGTCATGCTGCTGTGTTTTGAAAGTCTTTAACTAAATTAAGATTGCAGAATGATAGTGATTATTCAATTAGATTTTAAGTAAGGATTGTGATATTAGAGGCTGGAAATCCTTATTTTTTAAAAAATCAGATAGGCATAAATAGTTAAATCACTTTCATTCTCCCCAAACCTGTAGTTACAGAAAAAGTTTTATGCTAGAGGTGGGATGCCAAGTTTTCACTATCCATGAAGCAGCGCTGCATGTCACTAGGTAACACAGATCCATCCAGATGGTGTTTACATTTGATTTATTTGGGATCTTATTGACATCAGGTATACTTGGAAGACATTTCTTTTATTCTTCAGCGTATGAATTTAAAGCTATTTTTTGTAAATATTTCTAATCAGCGATAATTTCTACCTATGTTCTCAACCAACTTAGCCAGTTTGTTTTTCAGAGCCTGTAGTCTTATTGGAAATCTATTTTATCAGTGTGCTTTATTGAGTGTGGATTTTGCATACATTCAAAACATTAACCACAAAATACAGCAAGTGCACCTATATTCACCATTAACTTATATCCCAAGTCCATTTTTTCCTGTACACTACAAACAAAAGATATATTAGAGACTTTTGAAAAATGCTGAAATACTTTGCTTCAGAATTGGAATGTTTATATTATGTAGAAATCTTCAAAGGTAGCATTATTAAATAGCAAAGAATAATTAGAACCCACATATCTTTTTTTGTGTGGATGGGGAAAATGTTTTAAAATCCAGTTATTTAATATGAGTTTGAGAGAGAAAATTGTTTTTTAAAAATATATGTGCATTGAAATGATGGCAATGCTTATAGTATGATCAAGTATGAAAGGAACTTTAAATTCTTATATTTACTTTTCTCTCAGTAAATTGTTAAATTTTCACTCAGCAAAAGATTGGCATTTGTTAAGTGTTCTATATTTAGTACTAAAATCACAGTCATGAAATCATAGTCATAAAATGGTCTTCACACAGCAGTCATCCGTGTCATTTATCATTTTGTAATATTAAATTATGGCAATTTTATTTCAAACTAAAGTTTGAACACCGGAAAGTCATTACTCAGTGATTTGTAATTTGGGACTTGGATTATTTATCTAGAGATGTTTGTATATTTTGTCAGTAACTAATACTGCGCTGCCATCATGGTGACTGTCATGGTTCTACAGAAATGCCCTCCATGTGTCCCTCTAATGTTGCATGTTTCAGTGGGTTGGAAGTTTTGTATATTTATTGTATTAACACAGAGTGTCATAAAATAAAATGCTGTTTACTGGATGTTTGTTTGTATAATTTTGAACACTATAATAGCAATTCAGAGACAGACATTGTTAAAGGTTTGATGTATATAGAAATTCCATGTTTGATTTTTTAAAATATGTGTATAAGTCTGTCATGTGCTAAACAAAATAATATGAAAGACCTAGTTAAAAATTCTAACCAATGTAAAATGACCATTTTTCTGTTGCATTAGACCTTTACAGGTAATGGAACATGAGCTTCACCCATATTAAATATTTTGGCCCCTTTAAGGTCAAAATACAGATCATCTAGAAGTTAGATTCAAAATGGAAAACCTATTCATGGCTCAGATTTTTCATTGTGGGTTAAAAATGGGTGTCTCTGTACTAGTATTGTATTTATTCAATTGAACTTGTATTCTGATTTCTATCCTTGCTACCTATTGCTGTTTTATGTACTGATGAAAGTACCTATTTGTGTATATTGGATTTTTCACTTGGTTAGCTAAAGAAGATGTAAAAATATCTAAAATAATGTTCATGGTGAATCTTATTTTGAGAAATACATGTTAAAAAAGGAACAGTATTCTTTATTTTCTGGGTGTTATATTTAAAAAAGCAAGTTTGGATTTTTACACCTAATTTACTAGGAAAATATTTTATTCTGTAATTCATGTTAAGATTATGTATGGTTTGCATTTTAAGGGGATTTATGTTAGGTTAATTAGTTGTTTCTGTAAATCATTTGTAATAGCATAGTGCTTTTTACTCATTGCTGTATCTTTTTCTGAAAACACTGTTGTTAACATCTAATTCAGTATCCTTATTGGTACAAATCTGTGTTTGGCATGACTGTTTATATACAGAATTTGTTACATTTTGAGCATTTTTTCCCCTGCTTATGTATACCTTAGAGTTACCATGGCTGTCATATACCATTTCACTATATCTCCTTTCAGTTTTTCCTTAAGGAAAATGTTTAGAGGAATTTGTTCATTTCATGTGATTAAGCCCTTTAGAGATGAAATAAGATTGGTTAATTTTAAAAAAATTGAGGATGGTTAAAAAATAGAAAACACCTTACTTTGATACATTTTAAAGTACAATAGTATACATTTATTTAGAGTAGACTAATGTGTTTAAAACATGAGTTGTTTTAAATACTTTTTTATTGAGCTAAAAAGTTTTATCTCACATATTAAGTATTACAGAAAGTGAAGTATTTTGGCTAGAATTTTAGGGCATATTTTATAAAGCAGCATGCCTGTAATATTGGTGGGTATTTTTAAACTTTAGGACTTTATCACAGTATGTAGAGAGCTAGAAATAAATCTAGAAACTTTCTAAGCCAGGTATTGCCACTAACCTGTCTTATATAAGCAGATACCTCTTATTTGAAGATTGTAGGAAAATAGAGAAAGACTGTTCTC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